Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | AP012306 | 2,714,555 | 0 | T | G | 24.3% | 745.6 / 17.8 | 304 | T175P (ACC→CCC) | ygjV | conserved inner membrane protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (100/130); new base G (74/0); total (174/130) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.87e-22 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 337 total aligned reads displayed.
CGTATTGCAGGACTCTTGCGAAACCGCGCTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACTACCCTCAATCATCGTGCCGCCTATCGACCCCGCCCAGAAGTTGTGAATCACCCAGCAACACGTTG > AP012306/2714407‑2714704 | gTATTGCAGGACTCTTGCGAAACCGCGCTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGttt > 2:3367729/1‑150 (MQ=255) gTATTGCAGGACTCTTGCGAAACCGCGCTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGgtt > 1:3099315/1‑150 (MQ=255) tATTGCAGGACTCTTGCGAAACCGCGCTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGtttt > 2:2333394/1‑150 (MQ=255) tATTGCAGGACTCTTGCGAAACCGCGCTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGtttt > 1:3776568/1‑150 (MQ=255) aTTGCAGGACTCTTGCGAAACCGCGCTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGgtttt > 2:3008238/1‑149 (MQ=255) aTTGCAGGACTCTTGCGAAACCGCGCTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTtc > 1:426285/1‑150 (MQ=255) aTTGCAGGACTCTTGCGAAACCGCGCTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGGTTtc > 2:3922006/1‑150 (MQ=255) ttGCAGGACTCTTGCGAAACCGCGCTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTtct > 1:1378614/1‑150 (MQ=255) tGCAGGACTCTTGCGAAACCGCGCTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTtctc > 1:110433/1‑150 (MQ=255) tGCAGGACTCTTGCGAAACCGCGCTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTtctc < 1:1778267/150‑1 (MQ=255) gCAGGACTCTTGCGAAACCGCGCTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCa < 2:1054443/150‑1 (MQ=255) cAGGACTCTTGCGAAACCGCGCTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCaa < 1:3462491/150‑1 (MQ=255) aCTCTTGCGAAACCGCGCTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACttt > 2:1324159/1‑150 (MQ=255) tctTGCGAAACCGCGCTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTaa < 2:3566787/150‑1 (MQ=255) tctTGCGAAACCGCGCTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGGGTTCTCAACTTTaa > 2:260713/1‑150 (MQ=255) tGCGAAACCGCGCTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACg < 2:3316301/150‑1 (MQ=255) gCGAAACCGCGCTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACgg < 1:3865772/150‑1 (MQ=255) gCGAAACCGCGCTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACgg > 1:2327721/1‑150 (MQ=255) aaCCGCGCTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCa > 1:2572228/1‑150 (MQ=255) aCCGCGCTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGGTTTCTCCACTTTTAACGGGTCaa > 2:170344/1‑150 (MQ=255) cgcgCTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCGACTTTAAACGGATCAAtt > 1:116462/1‑150 (MQ=255) cgcTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTcc < 1:3995682/150‑1 (MQ=255) cgcTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGGTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTcc > 1:1034215/1‑150 (MQ=255) cTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGGTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTcccc > 2:1067672/1‑150 (MQ=255) gAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGGTTTTTCAACTTTAAAAGGATCAATTCCCCtt > 2:1585957/1‑150 (MQ=255) aaCTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGCCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCttt < 2:2185192/150‑1 (MQ=255) aCTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAACAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCtttt < 1:2168083/150‑1 (MQ=255) tctTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCt < 1:2891099/150‑1 (MQ=255) ttCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGc > 2:589584/1‑150 (MQ=255) tCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGGTTTCTCAACTTTTAACGGATCAATTCCCCCTTTCTGCa > 2:3696973/1‑150 (MQ=255) cAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCAt > 2:1824125/1‑150 (MQ=255) cAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCAt > 2:3557796/1‑150 (MQ=255) cTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGGTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCg > 1:4098080/1‑150 (MQ=255) 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cAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAg < 1:390094/150‑1 (MQ=255) cAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAg > 1:2821087/1‑150 (MQ=255) aGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTTTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTTTGCATCCGCCAGAAACGAATGATAtttaag > 2:1242116/1‑146 (MQ=255) aGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAgg < 1:1567973/150‑1 (MQ=255) tGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGGTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCCGGAACGAATGATATTCAGGCCac > 1:2108690/1‑149 (MQ=255) gCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCAtt > 1:3563875/1‑150 (MQ=255) gCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCAtt < 2:350918/150‑1 (MQ=255) ccAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTc < 1:712998/150‑1 (MQ=255) cAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGGTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCa > 2:823991/1‑150 (MQ=255) cAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGGTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCa > 2:2429706/1‑150 (MQ=255) cAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGGTTTCTCAACTTTAAACGGATCAAATTTCCTTTTCTGCATCCGCCCGAAACGAATGATATTCAAGCCATTCa > 2:4117527/1‑150 (MQ=255) gCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATaa < 1:607697/150‑1 (MQ=255) cAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATg < 2:2807658/130‑1 (MQ=255) cAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAg > 1:1687276/1‑150 (MQ=255) agaagaCGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGc < 2:4148582/150‑1 (MQ=255) agaagaCGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGc < 2:1409475/150‑1 (MQ=255) agaagaCGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGGTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGc > 1:1587212/1‑150 (MQ=255) aCGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGaaa > 1:3196596/1‑150 (MQ=255) cGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGaaaa < 1:2657190/150‑1 (MQ=255) cGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCCTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCTTAAGCAGaaaa > 2:2915415/1‑150 (MQ=255) gATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGGTTTTTTAAATTTTAACGGAACAATTTCCCTTTTCTTCATCCGCCCGAAACGAATGATATTTAGGGCATTTTTCAGGAGaaaaa > 2:3108676/1‑149 (MQ=255) gATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGGTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCCTTCATAAGCAGAAAAc > 1:521902/1‑150 (MQ=255) aTCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACt < 1:148508/150‑1 (MQ=255) aTCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGGTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTTTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACt > 2:4051667/1‑150 (MQ=255) cGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACTAc > 1:1168285/1‑150 (MQ=255) 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ggTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACTACCCTCAATCATCGTGCCGCCTATCGACCCCGCCCAGAAGTTGTGAATCACCCAGCAACACGt < 1:3675897/150‑1 (MQ=255) gTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACTACCCTCAATCATCGTGCCGCCTATCGACCCCGCCCAGAAGTTGTGAATCACCCAGCAACACGtt < 2:1988948/150‑1 (MQ=255) | CGTATTGCAGGACTCTTGCGAAACCGCGCTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACTACCCTCAATCATCGTGCCGCCTATCGACCCCGCCCAGAAGTTGTGAATCACCCAGCAACACGTTG > AP012306/2714407‑2714704 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |