Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | AP012306 | 1,309,914 | 0 | A | C | 32.7% | 289.4 / 11.1 | 150 | L23F (TTA→TTC) | lsrC | AI2 transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (58/43); new base C (0/49); total (58/92) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.59e-14 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 224 total aligned reads displayed.
CTCTGCACTGACCGAGCGCGATATTAATGTCGAGACTATTATGCGCGTTGCCTTCGGCGATAGTCAGCGTCAGGAGGCGTCATGCTGAAGTTTATTCAGAACAACCGTGAAATCACGGCACTGCTGGCGGTGGTGCTGCTGTTTGTATTACCCGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAGCGCGCAAATCCTGATCCTGCTGGCAATGGGCGCGACGCTGGTAATGCTTACGCGCAATATTGATGTTTCAGTGGGTTCGATTACCGGAAT > AP012306/1309765‑1310063 | ctctGCACTGACCGAGCGCGATATTAATGTCGAGACTATTATGCGCGTTGCCTTCGGCGATAGTCAGCGTCAGGAGGCGTCATGCTGAAGTTTATTCAGAACAACCGTGAAATCACGGCACTGCTGGCGGTGGTGCTGCTGTTTGTATTa > 2:230632/1‑150 (MQ=255) ctctGCACTGACCGAGCGCGATATTAATGTCGAGACTATTATGCGCGTTGCCTTCGGCGATAGTCAGCGTCAGGAGGCGTCATGCTGAAGTTTATTCAGAACAACCGTGAAATCACGGCACTGCTGGCGGTGGGGCTGCTGTTTGTATTa > 2:171025/1‑150 (MQ=255) ctGCACTGACCGAGCGCGATATTAATGTCGAGACTATTATGCGCGTTGCCTTCGGCGATAGTCAGCGTCAGGAGGCGTCATGCTGAAGTTTATTCAGAACAACCGTGAAATCACGGCACTGCTGGCGGTGGTGCTGCTGTTTGTATTAcc < 1:802213/150‑1 (MQ=255) gCACTGACCGAGCGCGATATTAATGTCGAGACTATTATGCGCGTTGCCTTCGGCGATAGTCAGCGTCAGGAGGCGTCATGCTGAAGTTTATTCAGAACAACCGAGAAATCACGGCACTGCTGGCGGTGGTGCTGCTGTTTGTATTACCCg < 2:4200090/150‑1 (MQ=255) aCCGAGCGCGATATTAATGTCGAGACTATTATGCGCGTTGCCTTCGGCGATAGTCAGCGTCAGGAGGCGTCATGCTGAAGTTTATTCAGAACAACCGTGAAATCACGGCACTGCTGGCGGTGGTGCTGCTGTTTGTATTACCCGGTTTtc > 1:2550820/1‑150 (MQ=255) ccGAGCGCGATATTAATGTCGAGACTATTATGCGCGTTGCCTTCGGCGATAGTCAGCGTCAGGAGGCGTCATGCTGAAGTTTATTCAGAACAACCGTGAAATCACGGCACTGCTGGCGGTGGTGCTGCTGTTTGTATTACCCGGTTTtct < 2:2867806/150‑1 (MQ=255) cGAGCGCGATATTAATGTCGAGACTATTATGCGCGTTGCCTTCGGCGATAGTCAGCGTCAGGAGGCGTCATGCTGAAGTTTATTCAGAACAACCGTGAAATCACGGCACTGCTGGCGGTGGTGCTGCTGTTTGTATTACCCGGTTTtctc < 2:754195/150‑1 (MQ=255) cGAGCGCGATATTAATGTCGAGACTATTATGCGCGTTGCCTTCGGCGATAGTCAGCGTCAGGAGGCGTCATGCTGAAGTTTATTCAGAACAACCGTGAAATCACGGCACTGCTGGCGGGGGTGGTGCTTTTTGTATTTCCCGGTTTtttc > 2:4586344/1‑150 (MQ=255) gAGCGCGATATTAATGTCGAGACTATTATGCGCGTTGCCTTCGGCGATAGTCAGCGTCAGGAGGCGTCATGCTGAAGTTTATTCAGAACAACCGTGAAATCACGGCACTGCTGGCGGTGGTGCTGCTGTTTGTATTACCCGGTTTTCTCg < 1:2164236/150‑1 (MQ=255) gAGCGCGATATTAATGTCGAGACTATTATGCGCGTTGCCTTCGGCGATAGTCAGCGTCAGGAGGCGTCATGCTGAAGTTTATTCAGAACAACCGTGAAATCACGGCACTGCTGGCGGTGGGGCTGCTGTTTGTATTACCCGGTTTTCTCg > 2:1905165/1‑150 (MQ=255) cgATATTAATGTCGAGACTATTATGCGCGTTGCCTTCGGCGATAGTCAGCGTCAGGAGGCGTCATGCTGAAGTTTATTCAGAACAACCGTGAAATCACGGCACTGCTGGCGGTGGTGCTGCTGTTTGTATTACCCGGTTTTCTCGACCGc > 2:3236984/1‑150 (MQ=255) cgATATTAATGTCGAGACTATTATGCGCGTTGCCTTCGGCGATAGTCAGCGTCAGGAGGCGTCATGCTGAAGTTTATTCAGAACAACCGTGAAATCACGGCACTGCTGGCGGTGGGGCTGCTGTTTGTATTACCCGGTTTTCCCGACCGc > 2:1645166/1‑150 (MQ=255) cgATATTAATGTCGAGACTATTATGCGCGTTGCCTTCGGCGATAGTCAGCGTCAGGAGGCGTCATGCTGAAGTTTATTCAGAACAACCGTGAAATCACGGCACTGCTGGCGGAGGGGGCGCTGTTTGTATTACCCGGGTTTTTCGAcccc > 1:1125732/1‑148 (MQ=255) gATATTAATGTCGAGACTATTATGCGCGTTGCCTTCGGCGATAGTCAGCGTCAGGAGGCGTCATGCTGAAGTTTATTCAGAACAACCGTGAAATCACGGCACTGCTGGCGGTGGTGCTGCTGTTTGTATTACCCGGTTTTCTCGACCGcc > 2:2759559/1‑150 (MQ=255) atatTAATGTCGAGACTATTATGCGCGTTGCCTTCGGCGATAGTCAGCGTCAGGAGGCGTCATGCTGAAGTTTATTCAGAACAACCGTGAAATCACGGCACTGCTGGCGGTGGTGCTGCTGTTTGTATTACCCGGTTTTCTCGACCGCCa < 1:13648/150‑1 (MQ=255) tatTAATGTCGAGACTATTATGCGCGTTGCCTTCGGCGATAGTCAGCGTCAGGAGGCGTCATGCTGAAGTTTATTCAGAACAACCGTGAAATCACGGCACTGCTGGCGGTGGTGCTGCTGTTTGTATTACCCGGTTTTCTCGACCGCCAg > 1:1807607/1‑150 (MQ=255) ttAATGTCGAGATTTTTATTCGCGTTGCCTTCGGCGATAGTCAGCGTCAGGGGGCGTCATGCTGAATTTTATTCAGAACAACCGTGAAATCCCGGCACTGCTGGGGGTGGTGCTGCTGTTTGTATTCCCCGGTTTTCTCGACCGCCAGTa < 2:2773644/150‑1 (MQ=255) tGTCGAGACTATTATGCGCGTTGCCTTCGGCGATAGTCAGCGTCAGGAGGCGTCATGCTGAAGTTTATTCAGAACAACCGTGAAATCACGGCACTGCTGGCGGTGGTGCTGCTGTTTGTATTACCCGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTa > 1:4207309/1‑150 (MQ=255) tCGAGACTATTATGCGCGTTGCCTTCGGCGATAGTCAGCGTCAGGAGGCGTCATGCTGAAGTTTATTCAGAACAACCGTGAAATCACGGCACTGCTGGCGGGGGTGCTGCTGGTTGTATTACCCGGTTTTTTCGACCGCCAGTATTTAAg > 2:2890532/1‑150 (MQ=255) cGAGACTATTATGCGCGTTGCCTTCGGCGATAGTCAGCGTCAGGAGGCGTCATGCTGAAGTTTATTCAGAACAACCGTGAAATCACGGCACTGCTGGCGGTGGTGCTGCTGTTTGTATTACCCGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAgt < 1:1926668/150‑1 (MQ=255) agaCTATTATGCGCGTTGCCTTCGGCGATAGTCAGCGTCAGGAGGCGTCATGCTGAAGTTTATTCAGAACAACCGTGAAATCACGGCACTGCTGGCGGTGGTGCTGCTGTTTGTATTACCCGGGTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAgtgt > 1:59771/1‑150 (MQ=255) aCTATTATGCGCGTTGCCTTCGGCGATAGTCAGCGTCAGGAGGCGTCATGCTGAAGTTTATTCAGAACAACCGTGAAATCACGGCACTGCTGGCGGTGGTGCTGCTGTTTGTATTCCCCGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGc < 1:407668/150‑1 (MQ=255) tattatGCGCGTTGCCTTCGGGGATAGTCAGCGGCAGGAGGCGTCATGCTGAAGTTTATTCAGAACAACCGTGAAATCACGGCACTGCTGGGGGTGGTGCTGCTGTTTGTATTCCCCGTTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCaa < 2:2665976/150‑1 (MQ=255) tattatGCGCGTTGCCTTCGGCGATAGTCAGCGTCAGGAGGCGTCATGCTGAAGTTTATTCAGAACAACCGTGAAATCACGGCACTGCTGGCGGTGGTGCTGCTGTTTGTATTACCCGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCaa > 2:226277/1‑150 (MQ=255) tttatGCGCTTTGCCTTGGGCGATAGTCAGCGTCAGGAGGCGTCATGCTGAATTTTATTCAGAACAACCGTGAAATCACGGCACTGCTGGCGGTGGTGCTGCTGTTTGTATTACCCGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCaaa < 2:2222646/149‑1 (MQ=255) attatGCGCGTTGCCTTCGGCGATAGTCAGCGTCAGGAGGCGTCATGCTGAAGTTTATTCAGAACAACCGTGAAATCACGGCACTGCTGGCGGTGGTGCTGCTGTTTGTATTACCCGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCaaa < 1:29621/150‑1 (MQ=255) attatGCGCGTTGCCTTCGGCGATAGTCAGCGTCAGGAGGCGTCATGCTGAAGTTTATTCAGAACAACCGTGAAATCACGGCACTGCTGGCGGTGGTGCTGCTGTTTGTATTACCCGGGTTTCTCGACCGCCCGTATTTAAGTGTGCaaa > 2:2068682/1‑150 (MQ=255) ttggcgcGTTGCCTTCGGCGATAGTCAGCGTCAGGAGGCGTCATGCTGAAGTTTATTCAGAACACCCGTGAAATCACGGCACTGCTGGGGGTGGTGCTGCTGTTTGTATTCCCCGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACg < 2:3680195/147‑1 (MQ=255) cgTTGCTTTCGGCGATAGTCAGCGTCAGGAGGCGTCATGCTGAAGTTTATTCACAACACCCGTGAAATCACGGCACTGCTGGCGGTGGTGCTGCTGTTTGTATTACCCGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGAcc < 1:178206/150‑1 (MQ=255) gTTGCCTTCGGCGATAGTCAGCGTCAGGAGGCGTCATGCTGAAGTTTATTCAGAACAACCGTGAAATCACGGCACTGCTGGCGGTGGTGCTGCTGTTTGTATTCCCCGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCa < 1:3674339/150‑1 (MQ=255) gTTGCCTTCGGCGATAGTCAGCGTCAGGAGGCGTCATGCTGAAGTTTATTCAGAACAACCGTGAAATCACGGCACTGCTGGCGGTGGTGCTGCTGTTTGTATTACCCGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCa > 2:964076/1‑150 (MQ=255) gCCTTCGGCGATAGTCAGCGTCAGGAGGCGTCATGCTGAAGTTTATTCAGAACACCCGTGAAATCACGGCACTGCTGGCGGTGGTGCTGCTGTTTGTATTCCCCGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATgg < 2:4504300/150‑1 (MQ=255) ctttgggCAATAGCCAGCGTCGGGGGGCGTCTTGCTAAATTTTTTCAAAAACACCCGTAAAACCCCGGCCCTGCGGGCGGGGGTGCTGTTTTTTTTATTCCCCGTTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGt < 2:4748127/145‑1 (MQ=255) tgggCGATAGTCAGCGTCAGGAGGCGTCATGCTGAAGTTTATTCAGAACAACCGTGAAATCACGGCACTGCTGGCGGTGGTGCTGCTGTTTGTATTCCCCGTTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTta < 2:3345337/148‑1 (MQ=255) aGCGTCAGGAGGCGTCATGCTGAAGTTTATTCAGAACAACCGTGAAATCACGGCACTGCTGGCGGTGGTGCTGCTGTTTGTATTACCCGGTTTTCTCGACCGCCAGGATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCCTGGTTTATAGCAGCGCGCa > 2:216468/1‑150 (MQ=255) gTCAGGAGGCGTCATGCTGAAGTTTATTCAGAACACCCGTGAAATCACGGCACTGCGGGCGGTGGTGCTGCTGTTTGTATTCCCCGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAGCGCGCAAat < 2:685817/150‑1 (MQ=255) ggcggCGTCATGCTGATGTTTATTAAAAACAAGCGTGAAATCACGGCTGTGCTGGCGGTGGTGCTGCTGTTTGTTTTACCCTGTTTTCTCGCCCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAGCGCGCAAatcctg < 2:1306420/147‑1 (MQ=255) gaggCGTCATGCTGAAGTTTATTCAGAACAACCGTGAAATCACGGCACTGCTGGCGGTGGTGCTGCTGTTTGTATTACCCGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAGCGCGCAAatcctga < 1:3444438/150‑1 (MQ=255) ggCGTCATGCTGAAGTTTATTCAGAACAACCGTGAAATCACGGCACTGCTGGGGGTGGTGCTGCTGTTTGTATTCCCCGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAGCGCGCAAatcctgatc < 2:3266157/150‑1 (MQ=255) ggCGTCATGCTGAAGTTTATTCAGAACAACCGTGAAATCACGGCACTGCTGGCGGGGGGGCTGCTGTTTGTATTACCCGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTTTAGCAGCGCGCAAatcctgatc > 2:1247876/1‑150 (MQ=255) gCGTCATGCTGAAGTTTATTCAGAACAACCGTAAAATCACGGCACTGCTGGCGGTGGTGCCGCTGTTTGTATTCCCCGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAGCGCGCAAatcctgatcc < 1:3334553/150‑1 (MQ=255) cGTCATGCTGAAGTTTATTCAGAACAACCGTGAAATCACGGCACTGCTGGCGGTGGTGCTGCTGTTTGTATTACCCGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAGCGCGCAAatcctgatcct > 1:1560058/1‑150 (MQ=255) gTCATGCTGAAGTTTATTCAGAACAACCGTGAAATCACGGCACTGCTGGCGGTGGTGCTGCTGTTTGTATTCCCCGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAGCGCGCAAatcctgatcctg < 2:2704610/150‑1 (MQ=255) gCTGAGGTTTATCCAAAACAACCGTGAAATCACGGCCCTGCGGGCGGGGGTGCTGTTTTTTGTATTCCCCGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAGCGCGCAAATCCTGATCCTGCTGGc < 2:4443850/150‑1 (MQ=255) gAAGTTTATTCAGAACAACCGTGAAATCACGGCACTGCTGGCGGTGGTGCTGCTGTTTGTATTACCGGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAGCGCGCAAATCCTGATCCTGCTGGCAAt < 1:889408/150‑1 (MQ=255) gAAGTTTATTCAGAACAACCGTGAAATCACGGCACTGCTGGCGGTGGTGCTGCTGTTTGTATTACCCGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAGCGCGCAAATCCTGATCCTGCTGGCAAt < 1:2660041/150‑1 (MQ=255) ttttATTCAGAACACCCGTGAAATCGGGGCCCTGCTGGGGGGGGTGCTGGTGTTTGTTTTCCCTGTTTTTCGCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAGCGCGCAAATCCTGATCCTGCTGGCAATggg < 2:4686173/149‑1 (MQ=255) gTTTATTCAGAACAACCGTGAAATCAGGGCACTGCGGGGGGGGGTGCTGCTGTTTGTATTACCCGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAGCGCGCAAATCCTGATCCTGCTGGCAATggg < 2:1319482/150‑1 (MQ=255) ttATTCAGAACAACCGTGAAATCACGGCACTGCTGGCGGAGGTTGTGTTGTTTTTATTACCCGGTTTTCTCGATCGCCCGCATTTAAGAGGGCAAACGCTGAGCAATGGTTATAGGAGCGTCCAAATCCTGCTCCTGGTGGAAATGGgcg > 2:3557567/1‑150 (MQ=255) tATTCAGAACACCCGTGAAATCACGGCACTGCTGGCGGTGGTGCTGTTGTTTGTATTACCCGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAGCGCGCAAATCCTGATCCTGCTGGCAATGGgcgc < 1:320366/150‑1 (MQ=255) aTTCAGAACAACCGTGAAATCACGGCACTGCTGGCGGTGGTGCTGCTGTTTGTATTACCCGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAGCGCGCAAATCCTGATCCTGCTGGCAATGGGcgcg > 1:4243647/1‑150 (MQ=255) tCAGAACAACCGTGAAATCACGGCACTGCTGGCGGTGGGGCTGCTGTTTGTATTACCCGGGTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAGCGCGCAAATCCTGATCCTGCTGGCAATGGGCGCGAc > 1:3604835/1‑150 (MQ=255) tCAGAACAACCGTGAAATCACGGCACTGCTGGCGGCGGGGCTGCTGTTTTTCTTACCCGGGTTTCTCGACCGCCCGTATTTAAGGCTGCAAAAGCTGGCCTTGGTTTATAGCAGGGCGCAAATCCTGATCCTGCTGGCAATGGGcgcggc > 2:1958131/1‑148 (MQ=255) aacaacCGTGAAATCACGGCACGGCTGGCGGTGGTGCTGCTGTTTGTATTACCCGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAGCGCGCAAATCCTGATCCTGCTGGCAATGGGCGCGACGCTg < 1:1478708/150‑1 (MQ=255) aacCGTGAAATCACGGCACTGCTGGCGGTGGTGCTGCTGTTTGTATTACCCGGGTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAGCGCGCAAATCCTGATCCTGCTGGCAATGGGCGCGACGCTGGTa > 2:435732/1‑150 (MQ=255) aacCGTAAAATCCGGGCACTGCGGGCGGTGGTGCTGCTTTTTGTATTCCCCGTTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAGCGCGCAAATCCTGATCCTGCTGGCAATGGGCGCGACGCTGGTa < 2:4304066/150‑1 (MQ=255) ccGTGAAATCACGGCACTGCTGGCGGTGGTGCTGCTGTTTGTATTCCCCGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAGCGCGCAAATCCTGATCCTGCTGGCAATGGGCGCGACGCTGGTAAt < 2:2819657/150‑1 (MQ=255) ccGTGAAATCACGGCACTGCTGGCGGTGGTGCTGCTGTTTGTATTCCCCGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAGCGCGCAAATCCTGATCCTGCTGGCAATGGGCGCGACGCTGGTAAt < 1:3264036/150‑1 (MQ=255) 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ctgTTTGTATTACCGGGTTTTCCCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAGCGCGCAAATCCTGATCCTGCTGGCAATGGGCGCGACGCTGGTAATGCTTACGCGCAATATTGATGTTTCAGTGGGTTCg < 1:1187954/150‑1 (MQ=255) ctgTTTGTATTACCCGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAGCGCGCAAATCCTGATCCTGCTGGCAATGGGCGCGACGCTGGTAATGCTTACGCGCAATATTGGTGTTTCAGTGGGTTCg < 1:3149214/150‑1 (MQ=255) tgTTTGTATTACCCGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAGCGCGCAAATCCTGATCCTGCTGGCAATGGGCGCGACGCTGGTAATGCTTACGCGCATTATTGATGTTTCAGTGGGTTCGa > 2:3725377/1‑150 (MQ=255) tgTTTGTATTACCCGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAGCGCGCAAATCCTGATCCTGCTGGCAATGGGCGCGACGCTGGTAATGCTTACGCGCAATATTGATGTTTCAGTGGGTTCGa > 1:3975449/1‑150 (MQ=255) tttGTATTCCCCGTTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAGCGCGCAAATCCTGATCCTGCTGGCAATGGGCGCGACGCTGGTAATGCTTACGCGCAATATTGATGTTTCAGTGGGTTCGAtt < 1:4719470/150‑1 (MQ=255) tttGTATTCCCCGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAGCGCGCAAATCCTGATCCTGCTGGCAATGGGCGCGACGCTGGTAATGCTTACGCGCAATATTGATGTTTCAGTGGGTTCGAtt < 2:3876617/150‑1 (MQ=255) ttGTATTACCCGTTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAGCGCGCAAATCCTGATCCTGCTGGCAATGGGCGCGACGCTGGTAATGCTTACGCGCAATATTGATGTTTCAGTGGGTTCGATTa < 2:1807607/150‑1 (MQ=255) ttGTATTACCCGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAGCGCGCAAATCCTGATCCTGCTGGCAATGGGCGCGACGCTGGTAATGCTTACGCGCAATATTGATGTTTCAGTGGGTTCGATTa < 1:651166/150‑1 (MQ=255) ttGTATTACCCGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAGCGCGCAAATCCTGATCCTGCTGGCAATGGGCGCGACGCTGGTAATGCTTACGCGCAATATTGATGTTTCAGTGGGTTCGATTa > 1:4379380/1‑150 (MQ=255) tGTATTCCCCGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAGCGCGCAAATCCTGATCCTGCTGGCAATGGGCGCGACGCTGGTAATGCTTACGCGCAATATTGATGTTTCAGTGGGTTCGATTAc < 2:854569/150‑1 (MQ=255) tGTATTACCCGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAGCGCGCAAATCCTGATCCTGCTGGCAATGGGCGCGACGCTGGTAATGCTTACGCGCAATATTGATGTTTCAGTGGGTTCGATTAc < 1:380472/150‑1 (MQ=255) aCCCGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAGCGCGCAAATCCTGATCCTGCTGGCAATGGGCGCGACGCTGGTAATGCTTACGCGCAATATTGATGTTTCAGTGGGTTCGATTACCGGAAt > 2:3210446/1‑150 (MQ=255) | CTCTGCACTGACCGAGCGCGATATTAATGTCGAGACTATTATGCGCGTTGCCTTCGGCGATAGTCAGCGTCAGGAGGCGTCATGCTGAAGTTTATTCAGAACAACCGTGAAATCACGGCACTGCTGGCGGTGGTGCTGCTGTTTGTATTACCCGGTTTTCTCGACCGCCAGTATTTAAGTGTGCAAACGCTGACCATGGTTTATAGCAGCGCGCAAATCCTGATCCTGCTGGCAATGGGCGCGACGCTGGTAATGCTTACGCGCAATATTGATGTTTCAGTGGGTTCGATTACCGGAAT > AP012306/1309765‑1310063 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |