Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | AP012306 | 1,226,557 | 0 | A | G | 25.0% | 458.2 / 85.6 | 200 | G55G (GGA→GGG) | ydcU | predicted spermidine/putrescine transporter subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (15/135); new base G (50/0); total (65/135) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.57e-34 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 234 total aligned reads displayed.
TTGCAATCACCTTCACGTCCAGGTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGACTATGGCTGTGGCAGTCACTATCGCCAGCGCCATTCTGGC > AP012306/1226408‑1226706 | tGCAATCACCTTCACGTCCAGGTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGAt < 1:686639/150‑1 (MQ=255) tGCAATCACCTTCACGTCCAGGTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGAt < 2:121916/150‑1 (MQ=255) gCAATCACCTTCACGTCCAGGTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGAtt < 1:1454684/150‑1 (MQ=255) aaTCACCTTCACGTCCAGGTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGAtttt < 2:3077161/150‑1 (MQ=255) aaTCACCTTCACGTCCAGGTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGAtttt < 1:4086317/150‑1 (MQ=255) cGTCCAGGTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGAc < 1:3593930/150‑1 (MQ=255) tCCAGGTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGa < 1:1167316/150‑1 (MQ=255) ccAGGTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGAt < 1:811472/150‑1 (MQ=255) aGGTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTTTTCTTTTTACGAttt > 1:3472798/1‑150 (MQ=255) gTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTTTACTTTTTACGAttttt > 1:4541085/1‑148 (MQ=255) gTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCa < 1:1942187/150‑1 (MQ=255) tGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGTTTTTTACTTTTTTCGATTTTAccc > 2:382694/1‑149 (MQ=255) tGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCa < 2:3205199/150‑1 (MQ=255) gggTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCAt < 1:1277540/150‑1 (MQ=255) ggTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATTGCAGGGGATTTTTTTTTTTTTCGATTTTACCagt > 2:2097235/1‑148 (MQ=255) gTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGt < 1:2423738/150‑1 (MQ=255) gTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGt < 2:3400826/150‑1 (MQ=255) aaGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCg < 2:3020208/150‑1 (MQ=255) ggTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGTTTTTTTATTTTTGCGATTTTATCCTGTTGGt > 2:4344028/1‑150 (MQ=255) ggTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGTTTTATACTTTTTACGATTTCACCATGTCGGt > 1:3156515/1‑150 (MQ=255) tgtCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTaa < 2:158115/150‑1 (MQ=255) gtCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAAc < 2:3864892/150‑1 (MQ=255) tCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACg < 2:1807027/150‑1 (MQ=255) tCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACg < 2:3111284/150‑1 (MQ=255) ggTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGTTTTTTACTTTTTGCGATTTCTCCCTGTCGGTAACGccc > 1:2859765/1‑149 (MQ=255) ggTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCg < 2:4903025/150‑1 (MQ=255) cttctGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGGTTTTTATTTTTTTCGATTTTACCCTGTCGGGAACGcccggacc > 2:202480/1‑144 (MQ=255) cttctGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACt < 2:680804/150‑1 (MQ=255) cttctGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATCGCAGGGGTTTTTTAATTTTTTTGCTTTCACCAGCTCGGTAAcccccgcacc > 2:1843129/1‑144 (MQ=255) ttctGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGTTTTTTACTTTTTACGATTTTACCATGTCGGGAACGCCGGAACTg > 1:3852501/1‑150 (MQ=255) ttctGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGTTTTTTAATTTTTACGGTTTTACCCTGTCGGGAACGcccggaatg > 2:1627884/1‑143 (MQ=255) ttctGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTTTACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCCGGACTg > 1:2044656/1‑150 (MQ=255) ctGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGAc < 1:1003075/150‑1 (MQ=255) tGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGTTTTTTAATTTTTACGATTTTACCCTGTCCGGAACCCCCGGACTGAcc > 2:828223/1‑149 (MQ=255) gCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCt < 2:3907954/150‑1 (MQ=255) aTAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGGTTTTTAATTTTTTCGATTTTACCATTTCGGGTACGCCGGAACTGACGCCgg > 2:4994894/1‑150 (MQ=255) aTCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGa < 2:915556/150‑1 (MQ=255) aTCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGa < 2:1144044/150‑1 (MQ=255) ccGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAat < 1:2788773/150‑1 (MQ=255) ggggctggggctGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAatat < 1:433129/150‑1 (MQ=255) gggctggggctgTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCGCCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATc < 2:4421952/150‑1 (MQ=255) ggctggggctgTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGTTTTTTTCTTTTTTCGGTTTCACCATGTCGGTAACCCCGGGAATGACGCTGGGGGATATcc > 2:2895066/1‑150 (MQ=255) gctggggctgTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCg < 1:4640487/150‑1 (MQ=255) 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tACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATc < 1:1050818/150‑1 (MQ=255) tACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATc < 1:3313503/150‑1 (MQ=255) tgctgcTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCgg < 2:1727776/150‑1 (MQ=255) gctTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGTTTTTTATTTTTTGTCAGTTTACCATGTCGGGAACGCCCGAAATCGCGCCGGCGAATATACCTGCGCTGGTTATTCCGGCgca > 2:1775507/1‑148 (MQ=255) ctTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCAGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAAt < 1:1521402/150‑1 (MQ=255) ttGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAAtt < 1:3075000/150‑1 (MQ=255) tGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTa < 1:2584252/150‑1 (MQ=255) ggCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTAc < 1:4120868/150‑1 (MQ=255) cGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGTTTTTTACTTTTTTCGGTTTTACCATGTCGGTAACGCCGGGACTGACGCTGGCGAATATTCCTGCGCTGTTTTATTCGGCGAATTACGAca > 2:1668329/1‑150 (MQ=255) cGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGTTTTTTACTTTTTGCGGTTTTACCATGTTGGGGACCCCGGAACTGTCGCTTGCGGATATTCGTGCGCTGGTTTATTCGGCGGAGTAAGAcc > 2:71465/1‑149 (MQ=255) 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ttCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGACTATGGCt < 2:3791706/150‑1 (MQ=255) cGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGACTATGGCtgt < 1:2332330/150‑1 (MQ=255) ggCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGTTTTTTATTTTTGACGATTTCACCCTGTCGGGAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTTATAACGCGAATTTCGCCATCATTCTCCCCACGCTGACCATTGCtttg > 2:1761626/1‑150 (MQ=255) gCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGTTTTTTACTTTTGACGATTTCACCCTTTCGGTAACGCCGGGACTGACGCTGGCGGATATCCGTGCGCTGTTTTATACCGCGAATTACGACCTCATTCTTCGCACGCTGACTATGGCTGTgg > 2:1048800/1‑150 (MQ=255) cTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGACTATGGCTGTGGc < 1:44593/150‑1 (MQ=255) gctgctGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGACTATGGCTGTGGCAGt < 1:4792209/150‑1 (MQ=255) tgctgACACTGTTATGGCAGGGGTTTTTTACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGGAACGCCGGGACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGACTATGGCTGGggcaggca > 2:1881087/1‑150 (MQ=255) tgctgACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGACTATGGCTGTGGCAGTCa < 1:1328677/150‑1 (MQ=255) ctgACACTGTTATGGCAGGGATTTTTTACTTTTTACGATTTTACCATGTCGGTAACGCCGGGACTGACGCTGGCGAATATCCCTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCCCGCTGACTATGGCTGTGGGAGacacc > 2:4528885/1‑149 (MQ=255) tgACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGACTATGGCTGTGGCAGTCACTa < 1:1576438/150‑1 (MQ=255) cacTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGACTATGGCTGTGGCAGTCACTATCg < 1:5013743/150‑1 (MQ=255) ttATGGCAGGGGTTTTATACTTTTTACGATTTCACCCTGTCCGTAACGCCCGAACCGACGCTGGCGAATATCCGTGGGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCCCACACTGACTATGGCTGTGGGAGGGACTATTGCCAga > 2:2274606/1‑149 (MQ=255) tGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGACTATGGCTGTGGCAGTCACTATCGCCAGCGcc < 1:3890494/150‑1 (MQ=255) ggCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTTGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGACTATGGCTGTGGCAGTTACTATCGCCAGCGCCa > 2:1087638/1‑150 (MQ=255) ggCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGACTATGGCTGTGGCAGTCACTATCGCCAGCGCCa > 2:4393355/1‑150 (MQ=255) gCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGACTATGGCTGTGGCAGTCACTATCGCCAGCGCCAt > 2:3796444/1‑150 (MQ=255) cAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGACTATGGCTGTGGCAGTCACTATCGCCAGCGCCAtt > 1:4913169/1‑150 (MQ=255) ggATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGACTATGGCTGTGGCAGTCACTATCGCCAGCGCCATTCTg > 2:2460837/1‑150 (MQ=255) ggATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGACTATGGCTGTGGCAGTCACTATCGCCAGCGCCATTCTg < 2:2795754/150‑1 (MQ=255) ggATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGACTATGGCTGTGGCAGTCACTATCGCCAGCGCCATTCTg < 1:4163233/150‑1 (MQ=255) aTTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGACTATGGCTGTGGCAGTCACTATCGCCAGCGCCATTCTGGc > 1:2514337/1‑150 (MQ=255) aTTTTATACTTTCGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGACTATGGCTGTGGCAGTCACTATCGCCAGCGCCATTCTGGc > 2:3131258/1‑150 (MQ=255) | TTGCAATCACCTTCACGTCCAGGTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGACTATGGCTGTGGCAGTCACTATCGCCAGCGCCATTCTGGC > AP012306/1226408‑1226706 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |