| Predicted mutation | ||||||
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| RA | AP012306 | 2,026,199 | T→C | intergenic (‑186/+495) | yfcV ← / ← sixA | predicted fimbrial‑like adhesin protein/phosphohistidine phosphatase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | AP012306 | 2,026,199 | 0 | T | C | 78.8% | 1470.0 / inf | 610 | intergenic (‑186/+495) | yfcV/sixA | predicted fimbrial‑like adhesin protein/phosphohistidine phosphatase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (60/69); new base C (219/262); total (279/331) | |||||||||||
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Only 100 of 634 total aligned reads displayed.
CATTGCAATACATTGATTCAGTCAATAGCCAATGTTTATACCCAGCCATTGAATACGGCATGCGATCCAAAAAAACAGGTCGTAAAAAATGTATTCGTTGGTGTGGGGTCGAATAGTGATGTTTTCACTCCCCTGATTCAATTTAATTTTACTAATGAGTAAATGTAGATTTAATTAATATATTGATAGGGGAAAGATTATCTTAAGGATCTTCTAAAAAAACACGAAATATATATTTAGAAAAAACAGGAAGCATATCAACAATGAATGCCAATAGCTTAAAAAACAAACAATGAACA > AP012306/2026050‑2026348 | aTTGCAATACATTGATTCAGTCAATAGCCAATGTTTATACCCAGCCATTGAATACGGCATGCGATCCAAAAAAACAGGTCGTAAAAAATGTATTCGTTGGTGTGGGGTCGAATAGTGATGTTTTCACTCCCCTGATTCAATTTAATTTTa > 1:906037/1‑150 (MQ=255) tGCAATACATTGATTCAGTCAATAGCCAATGTTTATACCCAGCCATTGAATACGGCATGCGATCCAAAAAAACAGGTCGTAAAAAATGTATTCGTTGGTGTGGGGTCGAATAGTGATGTTTTCACTCCCCTGATTCAATTTAATTTTACt > 2:4466836/1‑150 (MQ=255) gCAATACATTGATTCAGTCAATAGCCAATGTTTATACCCAGCCATTGAATACGGCATGCGATCCAAAAAAACAGGTCGTAAAAAATGTATTCGTTGGTGTGGGGTCGAATAGTGATGTTTTCACTCCCCTGATTCAATTTAATTTTACTa > 1:2317500/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |