Predicted mutation | ||||||
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JC | AP012306 | 162,220 | +CTGTAAGACTCAATGTAAGCCGTGCCAAAATATGATGGCTAGGACGAGCTA | intergenic (+131/+243) | mrcB → / ← hemL | fused glycosyl transferase and transpeptidase/glutamate‑1‑semialdehyde aminotransferase |
New junction evidence | |||||||||||
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? | AP012306 | 162221 = | 0 (0.000) | intergenic (+132/+242) | mrcB/hemL | fused glycosyl transferase and transpeptidase/glutamate‑1‑semialdehyde aminotransferase |
Only 100 of 417 total aligned reads displayed.
ATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AP012306/162072‑162220 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GAACCCGCCAGCGTTTCGAATATTATCTTATCTTTATAATAATCATTCTCGTTTACGTTATCATTCACTTTACATCAGAGATATACCATTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGACAACGGATGCCC > AP012306/162221‑162368 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCC > 1:3345258/1‑150 ATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCC < 1:3107819/150‑1 TGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCCT > 1:1695181/1‑150 GTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCCTG < 2:4023135/150‑1 TGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCCTGTAA < 2:1123159/150‑1 TAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCCTGTAAGAC > 2:3452918/1‑150 ATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCCTGTAAGACTCAAT > 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CGTCCCGCTTGCCTGTAAGACTCAATGTAAGCCGTGCCAAAATATGATGGCTAGGACGAGCTAGAACCCGCCAGCGTTTCGAATATTATCTTATCTTTATAATAATCATTCTCGTTTACGTTATCATTCACTTTACATCAGAGATATACC < 1:1267345/150‑1 TACCGCTTGCCTGTAAGACTCAATGTAAGCCGTGCCAAAATATGATGGCTAGGACGAGCTAGAACCCGCCAGCGTTTCGAATATTATCTTATCTTTATAATAATCATTCTCGTTTACGTTATCATTCACTTTACATCAGAGATATACCAT < 1:160408/150‑1 GCCTGTAATACTAAAGGTAAGCCGTGCCAAAATATAATGGCTAGGAGGAGCTAGACCCCGCCAGCGTTTCGAATATTATCTTATCTTTATAATAATCATTCTCGTTTACGTTATCATTCACTTTACATCAGAGATATACCATTCCATATA < 2:4087896/150‑1 TGTAAGACTCAATGTAAGCCGTGCCAAAATATGATGGCTAGGACGAGCTAGAACCCGCCAGCGTTTCGAATATTATCTTATCTTTATAATAATCATTCTCGTTTACGTTATCATTCACTTTACATCAGAGATATACCATTCCATATAACG > 1:304454/1‑150 TGTAAGACTCAATGTAAGCCGTGCCAAAATATGATGGCTAGGACGAGCTAGAACCCGCCAGCGTTTCGAATATTATCTTATCTTTATAATAATCATTCTCGTTTACGTTATCATTCACTTTACATCAGAGATATACCATTCCATATAACG > 1:3298532/1‑150 TAAGACTCAATGTAAGCCGTGCCAAAATATGATGGCTAGGACGAGCTAGAACCCGCCAGCGTTTCGAATATTATCTTATCTTTATAATAATCATTCTCGTTTACGTTATCATTCACTTTACATCAGAGATATACCATTCCATATAACGGC > 1:933747/1‑150 TAAGACTCAATGTAAGCCGTGCCAAAATATGATGGCTAGGACGAGCTAGAACCCGCCAGCGTTTCGAATATTATCTTATCTTTATAATAATCATTCTCGTTTACGTTATCATTCACTTTACATCAGAGATATACCATTCCATATAACGGC < 1:2543685/150‑1 ACTCAATGTAAGCCGTGCCAAAATATGATGGCTAGGACGAGCTAGAACCCGCCAGCGTTTCGAATATTATCTTATCTTTATAATAATCATTCTCGTTTACGTTATCATTCACTTTACATCAGAGATATACCATTCCATATAACGGCCCTG > 1:2778720/1‑150 ACTCAATGTAAGCCGTGCCAAAATATGATGGCTAGGACGAGCTAGAACCCGCCAGCGTTTCGAATATTATCTTATCTTTATAATAATCATTCTCGTTTACGTTATCATTCACTTTACATCAGAGATATACCATTCCATATAACGGCCCTG < 1:733757/150‑1 CAATGTAAGCCGTGCCAAAATATGATGGCTAGGACGAGCTAGAACCCGCCAGCGTTTCGAATATTATCTTATCTTTATAATAATCATTCTCGTTTACGTTATCATTCACTTTACATCAGAGATATACCATTCCATATAACGGCCCTGTAC > 1:360022/1‑150 AAGCCGTGCCAAAATATGATGGCTAGGACGAGCTAGAACCCGCCAGCGTTTCGAATATTATCTTATCTTTATAATAATCATTCTCGTTTACGTTATCATTCACTTTACATCAGAGATATACCATTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGG < 1:3710757/150‑1 AGCCGTGCCAAAATATGATGGCTAGGACGAGCTAGAACCCGCCAGCGTTTCGAATATTATCTTATCTTTATAATAATCATTCTCGTTTACGTTATCATTCACTTTACATCAGAGATATACCATTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGA > 1:2906047/1‑150 GTGCCAAAATATGATGGCTAGGACGAGCTAGAACCCGCCAGCGTTTCGAATATTATCTTATCTTTATAATAATCATTCTCGTTTACGTTATCATTCACTTTACATCAGAGATATACCATTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGA < 1:237608/150‑1 AAATATGATGGCTAGGACGAGCTAGAACCCGCCAGCGTTTCGAATATTATCTTATCTTTATAATAATCATTCTCGTTTACGTTATCATTCACTTTACATCAGAGATATACCATTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGC < 2:2300716/150‑1 atgtgGGCTAGGACGTGATAGACCCCGCCAGCGTTTCGAATATTATCTTATCTTTATAATAATCATTCTCGTTTACGTTATCATTCACTTTACATCAGAGATATACCATTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTT < 2:2841085/145‑1 TGATGGCTAGGACGAGCTAGAACCCGCCAGCGTTTCGAATATTATCTTATCTTTATAATAATCATTCTCGTTTACGTTATCATTCACTTTACATCAGAGATATACCATTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTA > 1:4080217/1‑150 GATGGCTAGGACGAGCTAGAACCCGCCAGCGTTTCGAATATTATCTTATCTTTATAATAATCATTCTCGTTTACGTTATCATTCACTTTACATCAGAGATATACCATTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTAC < 1:1826676/150‑1 GCTAGGACGAGCTAGAACCCGCCAGCGTTTCGAATATTATCTTATCTTTATAATAATCATTCTCGTTTACGTTATCATTCACTTTACATCAGAGATATACCATTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGA > 1:3864628/1‑150 GACGAGCTAAAACCCGCCAGCGTTTCGAATATTATCTTATCTTTATAATAATCATTCTCGTTTACGTTATCATTCACTTTACATCAGAGATATACCATTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGACAACG < 1:3692029/150‑1 CGAGCTAGAACCCGCCAGCGTTTCGAATATTATCTTATCTTTATAATAATCATTCTCGTTTACGTTATCATTCACTTTACATCAGAGATATACCATTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGACAACGGA > 2:192574/1‑150 AGCTAGAACCCGCCAGCGTTTCGAATATTATCTTATCTTTATAATAATCATTCTCGTTTACGTTATCATTCACTTTACATCAGAGATATACCATTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGACAACGGATG < 2:3820407/150‑1 CTAGAACCCGCCAGCGTTTCGAATATTATCTTATCTTTATAATAATCATTCTCGTTTACGTTATCATTCACTTTACATCAGAGATATACCATTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGACAACGGATGCC < 2:1211736/150‑1 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AP012306/162072‑162220 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GAACCCGCCAGCGTTTCGAATATTATCTTATCTTTATAATAATCATTCTCGTTTACGTTATCATTCACTTTACATCAGAGATATACCATTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGACAACGGATGCCC > AP012306/162221‑162368 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |