| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | AP012306 | 2,555,767 | (GTGAGG)2→3 | intergenic (‑68/+51) | gcvP ← / ← gcvH | glycine decarboxylase, PLP‑dependent, subunit (protein P) of glycine cleavage complex/glycine cleavage complex lipoylprotein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AP012306 | = 2555755 | 14 (0.050) | 281 (0.930) +GTGAGG |
179/262 | 0.1 | 94.5% | intergenic (‑56/+63) | gcvP/gcvH | glycine decarboxylase, PLP‑dependent, subunit (protein P) of glycine cleavage complex/glycine cleavage complex lipoylprotein |
| ? | AP012306 | 2555756 = | 19 (0.060) | intergenic (‑57/+62) | gcvP/gcvH | glycine decarboxylase, PLP‑dependent, subunit (protein P) of glycine cleavage complex/glycine cleavage complex lipoylprotein | |||||
Only 100 of 329 total aligned reads displayed.
TCAGCATTTCTTGCTGTTGCGCGGCGTCCGGTCCGATATGGCGTTCAATAAAAGCGCCGCTGTTTTCAAGCTGGCTTAACGTCTGTGTCATGAGCGATGGTTCCTGAAACGTGCAGTGAATTGTGAACCTCTCTCCTTACGAAGAGAGTGAGGGTGAGGCATAAATTTTCCTCACCCTGATCCTCTCCCGCAGAAGAGGAATAAAGCCGTTACTCGTCTTCTAACAATGCTTCGTATGCGGTCGCATCCAGCAGTGATTCCAGTTCGCTTTCATCGCTGGCTTTGATTTTAAAGATC > AP012306/2555609‑2555905 | tttcttgctgttgcgcggcgtccggtccgatatggcgttcaataaaagcgccgctgttttcaagctggcttaacgtctgtgtcatgagcgatggttcctgaaacgtgcagtgaattgtgaacctctctccttacgaagagagtgagggtg > 2:5758‑M2/148‑150 (MQ=255) ttgctgttgcgcggcgcccggtccgatatggcgttcaataaaagcgccgctgttttcaagctggcttaacgtctgtgtcatgagcgatggttcctgaaacgtgcagtgaattgtgaacctctctccttacgaagagagtgagggtgaggg < 2:4141640‑M2/7‑1 (MQ=255) ttgctgctgcgcggcgtccggtccgatatggcgttcaataaaagcgccgctgttttcaagctggcttaacgtctgtgtcatgagcgatggttcctgaaacgtgcagtgaattgtgaacctctctccttacgaagagagtgagggtgaggg < 1:2756299‑M2/7‑1 (MQ=255) tgctgttgcgcggcgtccggtccgatatggcgttcaataaaagcgccgctgttttcaagctggcttaacgtctgtgtcatgagcgatggttcctgaaacgtgcagtgaattgtgaacctctctccttacgaagagagtgagggtgagggt > 1:1318117‑M2/143‑150 (MQ=255) tgctggtgcgcggcgtccggtccgatatggcgttcaataaaagcgccgctgttttcaagctggcttaacgtctgtgtcatgagcgatggttgctgaaacgtgcagtgaattgtgaacctctctccttacgaagagagtgagggtgagggt < 2:2903575‑M2/8‑1 (MQ=255) gctgttgcgcggcgtccggtccgatatggcgttcaataaaagcgccgctgttttcaagctggcttaacgtctgtgtcatgagcgatggttcctgaaacgtgcagtgaattgtgaacctctctccttacgaagagagtgagggtgagggtg > 1:2986798‑M2/142‑150 (MQ=255) gttgcgcggcgtccggtccgatatggcgttcaataaaagcgccgctgttttcaagctggcttaacgtctgtgtcatgagcgatggttcctgaaacgtgcagtgaattgtgaacctctctccttacgaagagagtgagggtgagggtgagg < 1:326617‑M2/12‑1 (MQ=255) tgcgcggcgtccggtccgatatggcgttcaataaaagcgccgctgttttcaagctggcttaacgtctgtgtcatgagcgatggttcctgaaacgtgcagtgaattgtgaacctctctccttacgaagagagtgaggGTGAGGGTGAGGCa < 2:838511‑M2/14‑1 (MQ=255) tgcgcggcgtccggtccgatatggcgttcaataaaagcgccgctgttttcaagctggcttaacgtctgtgtcatgagcgatggttcctgaaacgtgcagtgaattgtgaacctctctccttacgaagagagtgaggGTGAGGGTGAGGCa < 1:3875071‑M2/14‑1 (MQ=255) cgcggcgtccggtccgatatggcgttcaataaaagcgccgctgttttcaagctggcttaacgtctgtgtcatgagcgatggttcctgaaacgtgcagtgaattgtgaacctctctccttacgaagagagtgaggGTGAGGGTGAGGCATa < 2:615512‑M2/16‑1 (MQ=255) gcggcgtccggtccgatatgccgttcaataaaagcgccgctgttttcaagctggcttcacgtctgtgtcatgagcgatggttcctgaaacgtgcagtgaattgtgaacctctctccttacgaagagagtgaggGTGAGGGTGAGGTATaa > 2:3100304‑M2/134‑150 (MQ=255) gcgtccggtccgatatggcgttcaataaaagcgccgctgttttcaagctggcttaacgtctgtgtcatgagcgatggttcctgaaacgtgcagtgaattgtgaacctctctccttacgaagagagtgaggGTGAGGGTGAGGCATAAAtt < 1:2668275‑M2/20‑1 (MQ=255) cgtccggtccgatatggcgttcaataaaagcgccgctgttttcaagctggcttaacgtctgtgtcatgagcgatggttcctgaaacgtgcagtgaattgtgaacctctctccttacgaagagagtgaggGTGAGGGTGAGGCATAAAttt < 1:3161‑M2/21‑1 (MQ=255) gtccggtccgatatggcgttcaataaaagcgccgctgttttcaagctggcttaacgtctgtgtcatgagcgatggttcctgaaacgtgcagtgaattgtgaacctctctccttacgaagagagtgaggGTGAGGGTGAGGCATAAAtttt < 1:3930479‑M2/22‑1 (MQ=255) gtccggtccgatatggcgttcaataaaagcgccgctgttttcaagctggcttaacgtctgtgtcatgagcgatggttcctgaaacgtgcagtgaattgtgaacctctctccttacgaagagagtgaggGTGAGGGTGAGGCATAAAtttt > 2:338960‑M2/129‑150 (MQ=255) tccggtccgatatggcgttcaataaaagcgccgctgttttcaagctggcttaacgtctgtgtcatgagcgatggttcctgaaacgtgcagtgaattgtgaacctctctccttacgaagagagtgaggGTGAGGGTGAGGCATAAATTTTc > 2:441820‑M2/128‑150 (MQ=255) ccggtccgatatggcgttcaataaaagcgccgctgttttcaagctggcttaacgtctgtgtcatgagcgatggttcctgaaacgtgcagtgaattgtgaacctctctccttacgaagagagtgaggGTGAGGGTGAGGCATAAATTTTcc > 2:3033340‑M2/127‑150 (MQ=255) cggtccgatatggcgttcaataaaagcgccgctgttttcaagctggcttaacgtctgtgtcatgagcgatggttcctgaaacgtgcagtgaattgtgaacctctctccttacgaagagagtgaggGTGAGGGTGAGGCATAAATTTTCCt < 1:1425015‑M2/25‑1 (MQ=255) cggtccgatatggcgttcaataaaagcgccgctgttttcaagctggcttaacgtctgtgtcatgagcgatggttcctgaaacgtgcagtgaattgtgaacctctctccttacgaagagagtgaggGTGAGGGTGAGGCATAAATTTTCCt > 2:3610740‑M2/126‑150 (MQ=255) gtccgatatggcgttcaataaaagcgccgctgttttcaagctggcttaacgtctgtgtcatgagcgatggttcctgaaacgtgcagtgaattgtgaacctctctccttacgaagagagtgaggGTGAGGGTGAGGCATAAATTTTCCTCa > 1:2944105‑M2/124‑150 (MQ=255) cgatatggcgttcaataaaagcgccgctgttttcaagctggcttaacgtctgtgtcatgagcgatggttcctgaaacgtgcagtgaattgtgaacctctctccttacgaagagagtgaggGTGAGGGTGAGGCATAAATTTTCCTCAccc < 2:3878116‑M2/30‑1 (MQ=255) aaccatcgttcaataaaagcgccgctgttttcaagctggcttaacgtctgtgtcatgagcgatggttcctgaaacgtgcagtgaattgtgaacctctctccttacgaagagagtgaggGTGAGGGTGAGGCATAAATTTTCCTCACCCTg < 1:1737147‑M2/32‑1 (MQ=255) tggcgttcaataaaagcgccgctgttttcaagctggcttaacgtctgtgtcatgagcgatggttcctgaaacgtgcagtgaattgtgaacctctctccttacgaagagagtgaggGTGAGGGTGAGGCATAAATTTTCCTCACCCTGATc < 1:3489329‑M2/35‑1 (MQ=255) tggcgttcaataaaagcgccgctgttttcaagctggcttaacgtctgtgtcatgagcgatggttcctgaaacgtgcagtgaattgtgaacctctctccttacgaagagagtgaggGTGAGGGTGAGGCATAAATTTTCCTCACCCTGATc < 1:1807550‑M2/35‑1 (MQ=255) gcgttcaataaaagcgccgctgttttcaagctggcttaacgtctgtgtcatgagcgatggttcctgaaacgtgcagtgaattgtgaacctctctccttacgaagagagtgaggGTGAGGGTGAGGCATAAATTTTCCTCACCCTGATCct < 1:4220616‑M2/37‑1 (MQ=255) caataaaagcgccgctgttttcaagctggcttaacgtctgtgtcatgagcgatggttcctgaaacgtgcagtgaattgtgaacctctctccttacgaagagagtgaggGTGAGGGTGAGGCATAAATTTTCCTCACCCTGATCCTCTccc > 1:2618321‑M2/109‑150 (MQ=255) aaaagcgccgctgttttcaagctggcttaacgtctgtgtcatgagcgatggttcctgaaacgtgcagtgaattgtgaacctctctccttacgaagagagtgaggGTGAGGGTGAGGCATAAATTTTCCTCACCCTGATCCTCTCCCGCag > 2:2010178‑M2/105‑150 (MQ=255) aagcgccgctgttttcaagctggcttaacgtctgtgtcatgagcgatggttcctgaaacgtgcagtgaattgtgaacctctctccttacgaagagagtgaggGTGAGGGTGAGGCATAAATTTTCCTCACCCTGATCCTCTCCCGCagaa > 1:2885231‑M2/103‑150 (MQ=255) aagcgccgctgttttcaagctggcttaacgtctgtgtcatgagcgatggttcctgaaacgtgcagtgaattgtgaacctctctccttacgaagagagtgaggGTGAGGGTGAGGCATAAATTTTCCTCACCCTGATCCTCTCCCGCagaa < 1:2451255‑M2/48‑1 (MQ=255) gccgctgttttcaagctggcttaacgtctgtgtcatgagcgatggttcctgaaacgtgcagtgaattgtgaacctctctccttacgaagagagtgaggGTGAGGGTGAGGCATAAATTTTCCTCACCCTGATCCTCTCCCGCAGAAGAgg > 2:3301546‑M2/99‑150 (MQ=255) ccgctgttttcaagctggcttaacgtctgtgtcatgagcgatggttcctgaaacgtgcagtgaattgtgaacctctctccttacgaagagagtgaggGTGAGGGTGAGGCATAAATTTTCCTCACCCTGATCCTCTCCCGCAGAAGAGGa < 1:3443249‑M2/53‑1 (MQ=255) ccgctgttttcaagctggcttaacgtctgtgtcatgagcgatggttcctgaaacgtgcagtgaattgtgaacctctctccttacgaagagagtgaggGTGAGGGTGAGGCATAAATTTTCCTCACCCTGATCCTCTCCCGCAGAAGAGGa < 1:3616414‑M2/53‑1 (MQ=255) cgctgttttcaagctggcttaacgtctgtgtcatgagcgatggttcctgaaacgtgcagtgaattgtgaacctctctccttacgaagagagtgaggGTGAGGGTGAGGCATAAATTTTCCTCACCCTGATCCTCTCCCGCAGAAGAGGaa > 2:2392964‑M2/97‑150 (MQ=255) gctgttttcaagctggcttaacgtctgtgtcatgagcgatggttcctgaaacgtgcagtgaattgtgaacctctctccttacgaagagagtgaggGTGAGGGTGAGGCATAAATTTTCCTCACCCTGATCCTCTCCCGCAGAAGAGGAAt > 1:888800‑M2/96‑150 (MQ=255) gttttcaagctggcttaacgtctgtgtcatgagcgatggttcctgaaacgtgcagtgaattgtgaacctctctccttacgaagagagtgaggGTGAGGGTGAGGCATAAATTTTCCTCACCCTGATCCTCTCCCGCAGAAGAGGAATaaa > 2:316150‑M2/93‑150 (MQ=255) ttttcaagctggcttaacgtctgtgtcatgagcgatggttcctgaaacgtgcagtgaattgtgaacctctctccttacgaagagagtgaggTTGAGGGTGAGGCATAAATTTTCCTCACCCTGATCCTCTCCCGCAGAAGAGGAATAAAg > 1:1122822‑M2/92‑150 (MQ=255) tttcaagctggcttaacgtctgtgtcatgagcgatggttcctgaaacgtgcagtgaattgtgaacctctctccttacgaagagagtgaggGTGAGGGTGAGGCATAAATTTTCCTCACCCTGATCCTCTCCCGCAGAAGAGGAATAAAGc < 1:209614‑M2/60‑1 (MQ=255) aagctggcttaacgtctgtgtcatgagcgatggttcctgaaacgtgcagtgaattgtgaacctctctccttacgaagagagtgaggGTGAGGGTGAGGCATAAATTTTCCTCACCCTGATCCTCTCCCGCAGAAGAGGAATAAAGCCGtt < 1:579310‑M2/64‑1 (MQ=255) agctggcttaacgtctgtgtcatgagcgatggttcctgaaacgtgcagtgaattgtgaacctctctccttacgaagagagtgaggGTGAGGGTGAGGCATAAATTTTCCTCACCCTGATCCTCTCCCGCAGAAGAGGAATAAAGCCGTTa > 1:1246806‑M2/86‑150 (MQ=255) gctggcttaacgtctgtgtcatgagcgatggttcctgaaacgtgcagtgaattgtgaacctctctccttacgaagagagtgaggGTGAGGGTGAGGCATAAATTTTCCTCACCCTGATCCTCTCCCGCAGAAGAGGAATAAAGCCGTTAc > 2:2232153‑M2/85‑150 (MQ=255) ctggcttaacgtctgtgtcatgagcgatggttcctgaaacgtgcagtgaattgtgaacctctctccttacgaagagagtgaggGTGAGGGTGAGGCATAAATTTTCCTCACCCTGATCCTCTCCCGCAGAAGAGGAATAAAGCCGTTACt < 1:3515154‑M2/67‑1 (MQ=255) ctggcttaacgtctgtgtcatgagcgatggttcctgaaacgtgcagtgaattgtgaacctctctccttacgaagagagtgaggGTGAGGGTGAGGCATAAATTTTCCTCACCCTGATCCTCTCCCGCAGAAGAGGAATAAAGCCGTTACt > 2:3545658‑M2/84‑150 (MQ=255) tggcttaacgtctgtgtcatgagcgatggttcctgaaacgtgcagtgaattgtgaacctctctccttacgaagagagtgaggGTGAGGGTGAGGCATAAATTTTCCTCACCCTGATCCTCTCCCGCAGAAGAGGAATAAAGCCGTTACTc > 2:3982954‑M2/83‑150 (MQ=255) tggcttaacgtctgtgtcatgagcgatggttcctgaaacgtgcagtgaattgtgaacctctctccttacgaagagagtgaggGTGAGGGTGAGGCATAAATTTTCCTCACCCTGATCCTCTCCCGCAGAAGAGGAATAAAGCCGTTACTc < 2:3148682‑M2/68‑1 (MQ=255) tggcttaacgtctgtgtcatgagcgatggttcctgaaacgtgcagtgaattgtgaacctctctccttacgaagagagtgaggGTGAGGGTGAGGCATAAATTTTCCTCACCCTGATCCTCTCCCGCAGAAGAGGAATAAAGCCGTTACTc < 1:516269‑M2/68‑1 (MQ=255) tggcttaacgtctgtgtcatgagcgatggttcctgaaacgtgcagtgaattgtgaacctctctccttacgaagagagtgaggGTGAGGGTGAGGCATAAATTTTCCTCACCCTGATCCTCTCCCGCAGAAGAGGAATAAAGCCGTTACTc > 2:1429381‑M2/83‑150 (MQ=255) aacgtctgtgtcatgagcgatggttcctgaaacgtgcagtgaattgtgaacctctctccttacgaagagagtgaggGTGAGGGTGAGGCATAAATTTTCCTCACCCTGATCCTCTCCCGCAGAAGAGGAATAAAGCCGTTACTCGtcttc < 1:456378‑M2/74‑1 (MQ=255) cgtctgtgtcatgagcgatggttcctgaaacgtgcagtgaattgtgaacctctctccttacgaagagagtgaggGTGAGGGTGAGGCATAAATTTTCCTCACCCTGATCCTCTCCCGCAGAAGAGGAATAAAGCCGTTACTCGTCTTCTa < 1:1000719‑M2/76‑1 (MQ=255) 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gaggGTGAGGGTGAGGCATAAATTTTCCTCACCCTGATCCTCTCCCGCAGAAGAGGAATAAAGCCGTTACTCGTCTTCTAACAATGCTTCGTATGCGGTCGCATCCAGCAGTGATTCCAGTTCGCTTTCATCGCTGGCTTTGATTTTaaa < 2:4201775‑M2/146‑1 (MQ=255) gaggGTGAGGGTGAGGCATAAATTTTCCTCACCCTGATCCTCTCCCGCAGAAGAGGAATAAAGCCGTTACTCGTCTTCTAACAATGCTTCGTATGCGGTCGCATCCAGCAGTGATTCCAGTTCGCTTTCATCGCTGGCTTTGATTTTaaa > 1:3668213‑M2/5‑150 (MQ=255) aggGTGAGGGTGAGGCATAAATTTTCCTCACCCTGATCCTCTCCCGCAGAAGAGGAATAAAGCCGTTACTCGTCTTCTAACAATGCTTCGTATGCGGTCGCATCCAGCAGTGATTCCAGTTCGCTTTCATCGCTGGCTTTGATTTTAAAg < 2:1642673‑M2/147‑1 (MQ=255) gGTGAGGGTGAGGCATAAATTTTCCTCACCCTGATCCTCTCCCGCAGAAGAGGAATAAAGCCGTTACTCGTCTTCTAACAATGCTTCGTATGCGGTCGCATCCAGCAGTGATTCCAGTTCGCTTTCATCGCTGGCTTTGATTTTAAAGAt < 1:1881932‑M2/149‑1 (MQ=255) gGTGAGGGTGAGGCATAAATTTTCCTCACCCTGATCCTCTCCCGCAGAAGAGGAATAAAGCCGTTACTCGTCTTCTAACAATGCTTCGTATGCGGTCGCATCCAGCAGTGATTCCAGTTCGCTTTCATCGCTGGCTTTGATTTCAAAGAt > 1:1564987‑M2/2‑150 (MQ=255) agTGAGGGTGAGGCATAAATTTTCCTCACCCTGATCCTCTCCCGCAGAAGAGGAATAAAGCCGTTACTCGTCTTCTAACAATGCTTCGTATGCGGTCGCATCCAGCAGTGATTCCAGTTCGCTTTCATCGCTGGCTTTGATTTTAAAGAt < 2:3253213/150‑1 (MQ=255) gtgagggtgaggCATAAATTTTCCTCACCCTGATCCTCTCCCGCAGAAGAGGAATAAAGCCGTTACTCGTCTTCTAACAATGCTTCGTATGCGGTCGCATCCAGCAGTGATTCCAGTTCGCTTTCATCGCTGGCTTTGATTTTAAAGATc < 1:2815221/150‑1 (MQ=255) | TCAGCATTTCTTGCTGTTGCGCGGCGTCCGGTCCGATATGGCGTTCAATAAAAGCGCCGCTGTTTTCAAGCTGGCTTAACGTCTGTGTCATGAGCGATGGTTCCTGAAACGTGCAGTGAATTGTGAACCTCTCTCCTTACGAAGAGAGTGAGGGTGAGGCATAAATTTTCCTCACCCTGATCCTCTCCCGCAGAAGAGGAATAAAGCCGTTACTCGTCTTCTAACAATGCTTCGTATGCGGTCGCATCCAGCAGTGATTCCAGTTCGCTTTCATCGCTGGCTTTGATTTTAAAGATC > AP012306/2555609‑2555905 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |