Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | AP012306 | 1,226,557 | 0 | A | G | 23.3% | 450.6 / 66.6 | 193 | G55G (GGA→GGG) | ydcU | predicted spermidine/putrescine transporter subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (19/129); new base G (45/0); total (64/129) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.89e-29 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 223 total aligned reads displayed.
TGCAATCACCTTCACGTCCAGGTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGT‑CGGTAACG‑CCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGACTATGGCTGTGGCAGTCACTATCGCCAGCGCCATTCTGGC > AP012306/1226409‑1226706 | tGCAATCCCCTTCCCGTCCAGGGCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTTTTCTGGCATACGCCGGGGGTGGGGCTTTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCCTTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGCGAt < 2:22143/150‑1 (MQ=255) aTCACCTTCACGTCCAGGTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTta > 1:771794/1‑150 (MQ=255) tCACCTTCACGTCCAGGTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTtat < 1:1787650/150‑1 (MQ=255) tCACCTTCACGTCCAGGTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTtat < 1:3917065/150‑1 (MQ=255) cACCTTCACGTCCAGGTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTtata < 2:3061162/150‑1 (MQ=255) aCCTTCACGTCCAGGTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATAc > 1:2581836/1‑150 (MQ=255) ttCACGTCCAGGTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACttt < 1:445766/150‑1 (MQ=255) gTCCAGGTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGTTTTTTATttttttcg > 2:1421526/1‑146 (MQ=255) ccAGGTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGAt < 1:801460/150‑1 (MQ=255) ccAGGTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGAt < 1:4182917/150‑1 (MQ=255) ccAGGTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGAt < 1:3536364/150‑1 (MQ=255) cAGGTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGAtt < 1:430515/150‑1 (MQ=255) cAGGTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGAtt < 1:2137165/150‑1 (MQ=255) ggggcTGGGTAGGGTTTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCCGGGCTGGGGCGGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTACTGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGAAGGGATTTTATACTTTTGACGAttc < 2:310764/146‑2 (MQ=255) aGGTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGTTTTTTTATTTTTATGAttt > 2:2507612/1‑150 (MQ=255) aGGTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGCTTTATACTTTTTATGAttt > 2:2348466/1‑150 (MQ=255) aGGTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGAttt < 1:3762358/150‑1 (MQ=255) aGGTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGAttt < 2:4158146/150‑1 (MQ=255) ggTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGTTTTTTACTTTTTACGATTTc > 1:2400152/1‑150 (MQ=255) gTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCa < 1:4056669/150‑1 (MQ=255) cTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGTTTTTTAATTTTGACGATTTTAcc > 1:2358186/1‑150 (MQ=255) tGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCa < 2:4251472/150‑1 (MQ=255) tGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCa < 1:451420/150‑1 (MQ=255) gggTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTcatcat < 1:525290/150‑1 (MQ=255) gTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGTTTTATACTTTTGACGATTTTACCATGt > 1:3482435/1‑150 (MQ=255) gTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGt < 2:3193617/150‑1 (MQ=255) gTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGt < 2:150901/150‑1 (MQ=255) tCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGT‑CGGTAACg < 1:2660730/150‑1 (MQ=255) cGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGTTTTTTACTTTTGACGATTTCACCATGT‑CGGGAACG‑cc > 1:1319635/1‑150 (MQ=255) ggTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGGTTTTTTCTTTTTTTGATTTTACCCTTT‑CGGTTACG‑CCg > 2:3017995/1‑150 (MQ=255) gTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGTTTTTTAATTTTTACGGTTTTACCATGT‑TGGGAACG‑cccg > 1:3248865/1‑148 (MQ=255) cttctGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGTTTTTTTCTTTTTTCGATTTTTCCCTTTCCGGAAACC‑CCGGAAc > 2:1008433/1‑150 (MQ=255) cttctGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGGTTTTTTCTTTTTTCGGTTTTTCCCTGT‑CGGGAACGCCCGGAAc > 2:3754884/1‑150 (MQ=255) tctGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTTTACTTTTTACGATTTTACCCTGT‑CGGTAACG‑CCGGGACTGa > 1:483582/1‑150 (MQ=255) ctGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGT‑CGGTAACG‑CCGGAACTGAc < 1:2271672/150‑1 (MQ=255) ctGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGT‑CGGTAACG‑CCGGAACTGAc < 1:2473090/150‑1 (MQ=255) tGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGTTTTTTTCTTTTTTCGATTTTACCATTT‑TGGGTACG‑CCGGGAcctacg > 2:3929777/1‑145 (MQ=255) tGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGT‑CGGTAACG‑CCGGAACTGACg < 1:3843201/150‑1 (MQ=255) cATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGT‑CGGTAACG‑CCGGAACTGACGCTg < 1:2335446/150‑1 (MQ=255) cATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGT‑CGGTAACG‑CCGGAACTGACGCTg < 2:2940072/150‑1 (MQ=255) aTAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGT‑CGGTAACG‑CCGGAACTGACGCTgg < 1:2685427/150‑1 (MQ=255) tAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGT‑CGGTAACG‑CCGGAACTGACGCTGGc < 2:190726/150‑1 (MQ=255) aTCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGGTTTTTACTTTTTTCGATTTTACCCTGT‑CGGGAACG‑CCCGGACTGACGCTGGCgg > 2:3970196/1‑149 (MQ=255) tCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGT‑CGGTAACG‑CCGGAACTGACGCTGGCGaa < 2:3606067/150‑1 (MQ=255) cGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTTTACTTTTTACGGTTTTACCCTGT‑CGGTAACG‑CCGGGACTGACGCCGGCGGata > 1:1936244/1‑150 (MQ=255) ggggctggggctGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGT‑CGGTAACG‑CCGGAACTGACGCTGGCGAatat < 1:161160/150‑1 (MQ=255) ggctggggctgTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGT‑CGGTAACG‑CCGGAACTGACGCTGGCGAATATcc < 2:290598/150‑1 (MQ=255) gTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGT‑CGGTAACG‑CCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGtt < 1:2861652/150‑1 (MQ=255) ttttACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGT‑CGGTAACG‑CCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTa < 1:4217723/150‑1 (MQ=255) tttACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGT‑CGGTAACG‑CCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTaa < 1:2538799/150‑1 (MQ=255) tttACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGT‑CGGTAACG‑CCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTaa < 2:162421/150‑1 (MQ=255) tttACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGT‑CGGTAACG‑CCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTaa < 1:1870633/150‑1 (MQ=255) ttACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGT‑CGGTAACG‑CCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAAt < 2:3788275/150‑1 (MQ=255) ttACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGT‑CGGTAACG‑CCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAAt < 1:1180231/150‑1 (MQ=255) ttACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGT‑CGGTAACG‑CCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAAt < 1:812706/150‑1 (MQ=255) tactacTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTACGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGT‑CGGTAACG‑CCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATc < 1:3517964/150‑1 (MQ=255) ctgctgCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGT‑CGGTAACG‑CCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCg < 1:1017274/150‑1 (MQ=255) tgctTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGT‑CGGTTACG‑CCCGGACTGACGCTGGCGGATATCCGTGCGCTGTTTTATCCCGCGa > 2:2590739/1‑150 (MQ=255) 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aaTGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGTTTTTTACTTTTTTCGATTTTACCCTGT‑CGGTAAAG‑CCCGAACTGACGCTGGCGGATATCCGTGCGGTGTTTTATTCCGCGGAATACCAcatcat > 2:2651848/1‑150 (MQ=255) aTGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGGTTTATACTTTTTGCGGTTTTACCACAG‑CGGGAAAA‑CCGGGACTGAAGCTTGCGCATATCCGTGCGCTTGTTTATCCCGCGAATTACGGCATCAtt > 2:1069343/1‑150 (MQ=255) aTGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGT‑CGGTAACG‑CCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCAtt < 1:1099127/150‑1 (MQ=255) gTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGGTTTTTTTTTTTTTCGATTTTACCCTGT‑CGGGAACG‑CCGGAACTGTCGCTGGCGAATATTCCTGCGCTGTTTTTTACCGCGAATTACGACATCTTTTTCCg > 2:3922447/1‑150 (MQ=255) ttGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGT‑CGGTAACG‑CCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCa < 2:1339807/150‑1 (MQ=255) 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cTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGT‑CGGTAACG‑CCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGACTAt < 1:2453108/150‑1 (MQ=255) tATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATTCTTTTGACGATTTCACCATGT‑CGGTAACG‑CCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGACTATg < 1:1058362/150‑1 (MQ=255) tATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGT‑CGGTAACG‑CCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGACTATg < 2:3663914/150‑1 (MQ=255) tttCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGTTTTTTACTTTTTACGATTTTACCATTT‑CGGTAACG‑CCGGAACTGACGCTGGCGAATAACCGTGCGCTGTTTTATCCGGCGAATTACGACATCCTTCTCCCCCCGCTTGCTATTGc > 2:678988/1‑150 (MQ=255) tCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGGTTTTTTACTTTTGACGATTTCACCATGT‑CGGTAACG‑CCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCCCACGCTGACTATGGCtg > 1:1492404/1‑150 (MQ=255) gctgACACTGTTATGGCAGGGGTTTTATACTTTTTACGATTTCACCATGT‑CGGTAACG‑CCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGACTATGGCTGTGGCAGTCAc > 1:4149056/1‑150 (MQ=255) ctgACACTGTTATGGCAGGGGTTTTATACTTTTTACGATTTTACCAAGT‑CGGTAAAG‑CCCGAACTGACGCTGGCGAAGATTCGTGCGCTGTTTTATTCGGCGTAATACGACATCATTTTCCCCCCCCCGACTCTTGCTGGGGCAggtgac > 2:41028/1‑145 (MQ=255) acTGTTATGGCAGGGGTTTTATACTTTTGACGATTTTACCATGT‑CGGGAACG‑CCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGACTATGGCTGTGGCAGTCACTATCGc > 1:96983/1‑150 (MQ=255) cTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGT‑CGGTAACG‑CCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGACTATGGCTGTGGCAGTCACTATCGcc < 1:2936853/150‑1 (MQ=255) cTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGT‑CGGTAACG‑CCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGACTATGGCTGTGGCAGTCACTATCGcc < 1:249484/150‑1 (MQ=255) tATGGCAGGGATTTTTTACTTTTGACGATTTCACCCTGT‑CGGGAACG‑CCGGGACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGACTATGGCTGTGGCAGGCACTATTGCCCgcc > 2:90970/1‑149 (MQ=255) aTGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGT‑CGGTAACG‑CCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGACTATGGCTGTGGCAGTCACTATCGCCAgcgc > 1:2747359/1‑150 (MQ=255) gCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGT‑CGGTAACG‑CCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGACTATGGCTGTGGCAGTCACTATCGCCAGCGCCAt > 1:3013451/1‑150 (MQ=255) gggATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGT‑CGGTAACG‑CCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGACTATGGCTGTGGCAGTCACTATCGCCAGCGCCATTCt < 1:3584305/150‑1 (MQ=255) ggATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGT‑CGGTAACG‑CCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGACTATGGCTGTGGCAGTCACTATCGCCAGCGCCATTCTg < 2:2426562/150‑1 (MQ=255) gATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGT‑CGGTAACG‑CCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGACTATGGCTGTGGCAGTCACTATCGCCAGCGCCATTCTgg > 1:1523143/1‑150 (MQ=255) aTTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGT‑CGGTAACG‑CCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGACTATGGCTGTGGCAGTCACTATCGCCAGCGCCATTCTGGc > 1:2910695/1‑150 (MQ=255) | TGCAATCACCTTCACGTCCAGGTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCAGGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGT‑CGGTAACG‑CCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGACTATGGCTGTGGCAGTCACTATCGCCAGCGCCATTCTGGC > AP012306/1226409‑1226706 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |