Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | AP012306 | 2,714,555 | 0 | T | G | 24.1% | 686.2 / 28.1 | 291 | T175P (ACC→CCC) | ygjV | conserved inner membrane protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (101/119); new base G (70/0); total (172/119) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.30e-20 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 336 total aligned reads displayed.
CGTATTGCAGGACTCTTGCGAAACCGCGCTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACTACCCTCAATCATCGTGCCGCCTATCGACCCCGCCCAGAAGTTGTGAATCACCCAGCAACACGTTG > AP012306/2714407‑2714704 | cGTATTGCAGGACTCTTGCGAAACCGCGCTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGtt < 1:2922386/150‑1 (MQ=255) gTATTGCAGGACTCTTGCGAAACCGCGCTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGgtt > 2:4167143/1‑150 (MQ=255) tATTGCAGGACTCTTGCGAAACCGCGCTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGtttt < 2:3908177/150‑1 (MQ=255) aTTGCAGGACTCTTGCGAAACCGCGCTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGGTTtc > 2:2589231/1‑150 (MQ=255) cAGGACTCTTGCGAAACCGCGCTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCaa > 2:683332/1‑150 (MQ=255) ggACTCTTGCGAAACCGCGCTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACt < 2:1887205/150‑1 (MQ=255) ctctTGCGAAACCGCGCTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAAGGGTGTTCTTCACtttt > 2:2970862/1‑149 (MQ=255) tctTGCGAAACCGCGCTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTaa > 1:3788802/1‑150 (MQ=255) ctTGCGAAACCGCGCTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGCTTTCTTCACCTTaaa > 2:105274/1‑150 (MQ=255) ttGCGAAACCGCGCTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAAc < 2:2377596/150‑1 (MQ=255) tGCGAAACCGCGCTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGGAGGGGGTTTCTTAACTTTTAACg > 1:2377947/1‑150 (MQ=255) tGCGAAACCGCGCTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACg < 2:3999119/150‑1 (MQ=255) gCGAAACCGCGCTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACgg < 2:2179666/150‑1 (MQ=255) gCGAAACCGCGCTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACgg < 2:3661954/150‑1 (MQ=255) gCGAAACCGCGCTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAAAgg > 2:1287684/1‑150 (MQ=255) cGAAACCGCGCTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGa < 2:3492948/150‑1 (MQ=255) gAAACCGCGCTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGGTTTCTCAACTTTAAACGGAt > 1:3135888/1‑150 (MQ=255) gAAACCGCGCTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGGTTTCTCAACTTTAAACGGAt > 2:1184241/1‑150 (MQ=255) aCCGCGCTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGCTTTCTCAACTTTAAAAGGATCaa > 1:37300/1‑150 (MQ=255) ccGCGCTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCCGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGAAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGCAGGGGTTTTTTCCACTTTAAAAGGATccac > 2:1270440/1‑147 (MQ=255) ccGCGCTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAAt < 2:3706100/150‑1 (MQ=255) cgcgCTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAAtt > 1:2731819/1‑150 (MQ=255) cgcgCTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAAtt < 2:3478129/150‑1 (MQ=255) gcgcTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGGAAGGGGTTTT‑TCCACTTTTAACGGATCAAttt > 1:1000490/1‑149 (MQ=255) gcgcTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTc > 1:2533361/1‑150 (MQ=255) gcgcTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTc < 1:2978133/150‑1 (MQ=255) cgcTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAAACGATCAATTcc > 2:1944633/1‑150 (MQ=255) gcTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTccc > 1:405999/1‑150 (MQ=255) cTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTcccc > 1:4138852/1‑150 (MQ=255) tGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTTAACGGATCAATTCCCCt > 1:3996719/1‑150 (MQ=255) aCTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGGTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCtttt > 1:3050740/1‑150 (MQ=255) tctTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCt < 2:2101826/150‑1 (MQ=255) tctTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCt > 1:1270692/1‑150 (MQ=255) ctTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTg < 1:463961/150‑1 (MQ=255) tCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCa < 1:748209/150‑1 (MQ=255) tCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCa < 1:2507512/150‑1 (MQ=255) tCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGGTTTCTCAACTTTTAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCa > 2:2348792/1‑150 (MQ=255) gACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGcc < 2:332048/150‑1 (MQ=255) aCGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCa < 1:3601135/150‑1 (MQ=255) cTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAAc < 1:1725475/150‑1 (MQ=255) gTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGa < 1:3192204/150‑1 (MQ=255) ttCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAAAGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCCGAAACGaa > 1:1448548/1‑150 (MQ=255) tCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGGTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCCGAAACGAAt > 2:2081416/1‑150 (MQ=255) cTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGGTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGat > 2:4067524/1‑150 (MQ=255) gCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCAtt > 2:3950697/1‑150 (MQ=255) gCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGGTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCAtt > 1:2434276/1‑150 (MQ=255) ccAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGGTCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTc < 1:3360491/150‑1 (MQ=255) ccAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTc < 2:2232168/150‑1 (MQ=255) cAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGGTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCa > 2:410966/1‑150 (MQ=255) cAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGCCTACGGC‑GGAAGTGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCa < 2:3422565/150‑1 (MQ=255) aGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCAt < 1:1053227/150‑1 (MQ=255) aGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCAt < 1:808331/150‑1 (MQ=255) ggCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATa < 2:3051754/150‑1 (MQ=255) gCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATaa < 1:2237607/150‑1 (MQ=255) cAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAg > 1:3476779/1‑150 (MQ=255) cAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGGTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCCTTTCTGCATCCGCCAGAAAAGAATGATATTCAGGCCATTCATAAg > 2:4182515/1‑150 (MQ=255) agaagaCGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTTCCCCTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTTAGGCCATTCATAAGc > 2:2021286/1‑150 (MQ=255) agaagaCGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGGTTTCTCAACTTTAAACGGGTCAATTCCCCTTTTCTGAATCCCCCAGAAACGAATGATATTCCGGCCATTCCTAAGc > 2:1416280/1‑150 (MQ=255) gaagaCGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGGTTTCTCAACATTAAAAGGATCAATTCCCCCTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATAATCAGGCCCTTCATAAGCa > 2:943883/1‑150 (MQ=255) aCGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGGTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGaaa > 2:1977034/1‑150 (MQ=255) cGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGaaaa < 2:570510/150‑1 (MQ=255) gATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAAc < 2:3147965/150‑1 (MQ=255) aTCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGGTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACt > 2:3001766/1‑150 (MQ=255) tCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGGTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACTa > 1:3431179/1‑150 (MQ=255) gTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTTTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACTAcc > 2:619062/1‑150 (MQ=255) tCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACTAccc < 1:2901771/150‑1 (MQ=255) tGGCAAATAGCGCCGTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACTACCCTc < 1:3551888/150‑1 (MQ=255) tGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACTACCCTc < 2:3128602/150‑1 (MQ=255) tGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACTACCCTc > 1:1553886/1‑150 (MQ=255) ggCAAATAGCGCCCTGCTTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCCCCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACTACCCTCa < 2:233996/150‑1 (MQ=255) gCAAGTAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAAGGGGTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACTACCCTCaa > 1:1419772/1‑150 (MQ=255) cAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACTACCCTCAat > 1:1396285/1‑150 (MQ=255) aaTAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTCCGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACTACCCTCAatca < 2:1521376/150‑1 (MQ=255) aaTAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACTACCCTCAatca < 2:1477576/150‑1 (MQ=255) aaTAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGGTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACTACCCTCAatca > 2:2501911/1‑150 (MQ=255) cccTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACTACCCTCAATCATCGTgcc > 1:1567926/1‑150 (MQ=255) gCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACTACCCTCAATCATCGTGCCGCCt > 2:1708093/1‑150 (MQ=255) cGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACTACCCTCAATCATCGTGCCGCCTa > 1:2812013/1‑150 (MQ=255) gTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGGTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACTACCCTCAATCATCGTGCCGCCTAt > 1:4183254/1‑150 (MQ=255) taattaatTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACTACCCTCAATCATCGTGCCGCCTATc > 1:2094970/1‑150 (MQ=255) taattaatTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACTACCCTCAATCATCGTGCCGCCTATc < 1:838350/150‑1 (MQ=255) aattaattGTTTACCCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACTACCCTCAATCATCGTGCCGCCTATCg < 2:3799061/150‑1 (MQ=255) aattaattGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACTACCCTCAATCATCGTGCCGCCTATCg > 1:892070/1‑150 (MQ=255) aattaattGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACTACCCTCAATCATCGTGCCGCCTATCg < 1:131218/150‑1 (MQ=255) taattGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGGTTTTTCAACTTTAAAAGGATCAATTCCCCCTTTCTGCATCCGCCAGAAAAGAATGATATTCAAGCCATTCATAAGCAGAAAACTACCCCCAATCATCGTTCCGCCTATCCAcc > 2:232250/1‑150 (MQ=255) aattGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACTACCCTCAATCATCGTGCCGCCTATCGAccc > 1:2058917/1‑150 (MQ=255) ttGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAAGGGGTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACTACCCTCAATCATCCTGCCGCCTATCGAACCCg > 1:3890941/1‑150 (MQ=255) ttAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACTACCCTCAATCATCGTGCCGCCTATCGACCCCGCCCa < 1:2558834/150‑1 (MQ=255) aaCCCCTTTCGTCTACGGC‑GGGAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACCGAGCAATTCCCCTTTTCCGCCTCCGCCAGAAACGGATGATATTGAGGGCATTCATAAGCAGAAAACTACCCTCAATCATCGTGCCGCCTACCGACCCCGccccgc > 2:1626201/1‑147 (MQ=255) cTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACTACCCTCAATCATCGTGCCGCCTATCGACCCCGCCCAGAAGTtg > 1:2155378/1‑150 (MQ=255) cTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACTACCCTCAATCATCGTGCCGCCTATCGACCCCGCCCAGAAGTtg < 2:848155/150‑1 (MQ=255) tCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACTACCCTCAATCATCGTGCCGCCTATCGACCCCGCCCAGAAGTTGTGa > 1:1197551/1‑150 (MQ=255) cTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACTACCCTCAATCATCGTGCCGCCTATCGACCCCGCCCAGAAGTTGTGAATCa > 2:2714980/1‑150 (MQ=255) cggc‑ggAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACTACCCTCAATCATCGTGCCGCCTATCGACCCCGCCCAGAAGTTGTGAATCAccc > 1:1970145/1‑150 (MQ=255) gc‑ggAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACTACCCTCAATCATCGTGCCGCCTATCGACCCCGCCCAGAAGTTGTGAATCACCCAg > 1:1143260/1‑150 (MQ=255) ggAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACTACCCTCAATCATCGTGCCGCCTATCGACCCCGCCCAGAAGTTGTGAATCACCCAGCa < 1:3281154/150‑1 (MQ=255) ggAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACTACCCTCAATCATCGTGCCGCCTATCGACCCCGCCCAGAAGTTGTGAATCACCCAGCa < 2:1802565/150‑1 (MQ=255) gAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACTACCCTCAATCATCGTGCCGCCTATCGACCCCGCCCAGAAGTTGTGAATCACCCAGCaa > 1:1846216/1‑150 (MQ=255) ggggTTTTCTCAACTTTAAACGGATAAATCCCCCTTTCCTGCTTCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTGATAAGCAGAAAACTACCCGCAATCAACGTGCCCCCTATCGACCCCGCCCAGAAGTTGTGAATCACCCAGCAacac < 2:4242128/150‑1 (MQ=255) ttttCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACTACCCTCAATCATCGTGCCGCCTATCGACCCCGCCCAGAAGTTGTGAATCACCCAGCAACACGTTg < 2:2798090/150‑1 (MQ=255) | CGTATTGCAGGACTCTTGCGAAACCGCGCTGAACTCTTCAACTGACGTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGC‑GGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACTACCCTCAATCATCGTGCCGCCTATCGACCCCGCCCAGAAGTTGTGAATCACCCAGCAACACGTTG > AP012306/2714407‑2714704 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |