Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | AP012306 | 2,376,612 | 0 | T | G | 23.9% | 449.4 / 26.0 | 180 | V326G (GTA→GGA) | ygbN | predicted transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (36/101); new base G (43/0); total (79/101) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.00e-20 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 253 total aligned reads displayed.
CCAATGGTAGCTCTAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATTTATTATTTCACTGGCGCTGCGTGCATCGCAGGGGTCAGCAACCGTAGCAATACTGAC > AP012306/2376464‑2376759 | ccAATGGTAGCTCTAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTTCTTGGGCTGGGGGGGTa > 1:1076617/1‑150 (MQ=255) cAATGGTAGCTCTAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTTGTTACTGGTGCTGGAGGGGGAt > 1:2860403/1‑150 (MQ=255) aaTGGTAGCTCTAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGGAtt > 1:2677412/1‑150 (MQ=255) aTGGTAGCTCTAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTAttt < 2:2916857/150‑1 (MQ=255) gTAGCTCTAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGc < 1:2376326/150‑1 (MQ=255) tAGCTCTAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGGATTTGGCa > 1:3706029/1‑150 (MQ=255) tAGCTCTAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGGGCTGGGGGGGGATTTGGCa > 2:208169/1‑150 (MQ=255) gCTCTAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTTGTTACTGGTGCTGGGGGGGGATTTGGCaaa > 1:3223926/1‑150 (MQ=255) gCTCTAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGGATTTGGCaaa > 2:2662824/1‑150 (MQ=255) ctctAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAg < 1:1036476/150‑1 (MQ=255) ctctAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTACTGATTTTTGTTACTAGGGGTTGAGGGGGGTTTggtagaa > 1:1521616/1‑145 (MQ=255) tctAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGt < 1:1608166/150‑1 (MQ=255) ctAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTg < 1:1127458/150‑1 (MQ=255) aaTGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCt < 2:224353/150‑1 (MQ=255) tGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCtgg < 1:4237847/150‑1 (MQ=255) tGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGAGTTTTGGTACTGGTGCTGGAGGGGGATTTTGCAAAGTGCtgg > 2:863890/1‑150 (MQ=255) tGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGGGGTTTTTGTTACTGGTGCTGGGGGGGGATTTGGCAAAGtggtgg > 2:3841186/1‑150 (MQ=255) ttGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCtggtgg < 1:409160/150‑1 (MQ=255) ttGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCtggtgg < 1:775147/150‑1 (MQ=255) tGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGa < 2:1103604/150‑1 (MQ=255) cgcTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAAt < 2:625843/150‑1 (MQ=255) cTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGGATTTGGCAAAGTGCTGGTGGGATCg > 2:3421190/1‑150 (MQ=255) tGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGGAGGGATTTTTGTTACTGGTGGTGGAGGGGGATTTTGCAAAATGCTGGTGGGATCgg > 2:2735238/1‑150 (MQ=255) gTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGc < 2:4223719/150‑1 (MQ=255) gTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGGGATTTTTGTTACTGGTGCTGGAGGGGGATTTGGCAAAGTGCTGGTGGGATCGGGc > 1:1665652/1‑150 (MQ=255) cTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCGCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTTGTTACTGGTGCTGGAGGGGGATTTTGCAAAGTGCTGGTGGGATCGGGCggc > 2:3222648/1‑148 (MQ=255) ggCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTTGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCgg > 1:1200583/1‑150 (MQ=255) ggCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCgg < 2:1162156/150‑1 (MQ=255) gCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGc < 2:3788285/150‑1 (MQ=255) gCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGc < 1:3413112/150‑1 (MQ=255) aTTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGGGGGGGATTTTGCAAAGTGCTGGGGGGATCGGGGGTCGGCaa > 2:1419566/1‑150 (MQ=255) tCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAg < 2:1325928/150‑1 (MQ=255) cTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGGGGGGGATTTGGCAAAATGCTGGTGGGATCGGGCGGCGGCAAAGc > 2:3528466/1‑150 (MQ=255) tGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGcc < 2:533737/150‑1 (MQ=255) gTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGGGCTGGAGGGGGATTTTGCAAAGGGCTGGGGGGATCGGGCGTCGGCAAAGCCCt > 2:4088097/1‑150 (MQ=255) ttATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCAGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCtt < 2:3988527/150‑1 (MQ=255) tATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTg < 2:2400126/150‑1 (MQ=255) tATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTg < 2:1518536/150‑1 (MQ=255) 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tttACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGGATTTGGCAAAGTGCTGGTGGGATCGGGCGGCGGCAAAGCCCTTGCCAACaa > 2:775502/1‑149 (MQ=255) ttACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATg < 1:1249482/150‑1 (MQ=255) tACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGc < 2:2733562/150‑1 (MQ=255) cGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGGAGGGATTTTTGTTTCTGGTGGTGGGGGGGGATTTTGGCAAGGGCTGGGGGGATCGGGGGTCGGCCAAACCCTTTCCAACATGCTa > 2:3357803/1‑150 (MQ=255) cgcgGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACaa < 1:444520/150‑1 (MQ=255) cgGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGGGCTGGGGGGGGATTTGGCAAAGGGCTGGTGGAATCGGGCGGCGGCAAAGCCCTTTCCAACATGCTACAAAt > 2:503133/1‑150 (MQ=255) ggCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATg > 1:689537/1‑150 (MQ=255) ggCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGGATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATg > 1:3651605/1‑150 (MQ=255) tGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGAtt < 2:4100932/150‑1 (MQ=255) tGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGGATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGAtt > 1:3976767/1‑150 (MQ=255) 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aTGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAACCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCAttt < 2:79625/150‑1 (MQ=255) ggCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGGGCTGGGGGGGGATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCCCTGTTACCAGCCGCATttatt > 2:1043480/1‑150 (MQ=255) gcgaaGCGCTTCATACTGCGCAGGTAGTGATTTTGGTTATTGGTCCTGGAGGGGTATTTGGAAAAGTGCTGGTGGAACCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTAAAAATGATTGCCCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATttatta < 2:2861693/146‑1 (MQ=255) gCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTTGTTACTGGGGCTGGGGGGGGATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATttatta > 2:755071/1‑150 (MQ=255) gCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATttatta < 2:2580123/150‑1 (MQ=255) gCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATttatta < 2:3630652/150‑1 (MQ=255) tCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTAAAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCAtttgtagca < 2:1546253/150‑7 (MQ=255) ttttCCTACGGCGGGGTTAGGGATTTTGGTTACTGGTGCGGGAGGGGTATTTGGAAAGGTTCGGGGGGAATCGGGCGTCGGAAAGGCCCTTGCCAACATCCTAAAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATTTATTATTTCACt < 2:2052343/148‑1 (MQ=255) ggttCCTTCTGGGGCGGTGTTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAGTTGTTGGTGGAAGCGGGCGTCGCCAAGCCCCTTGCCAACATGCTACAAATAATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATTTATTATTTCACt < 2:2186441/148‑1 (MQ=255) gcTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGGGGGGGATTTTGCAAAGTGCTGGTGGGATCGGGCGGCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATTTATTATTTCACt > 2:3046123/1‑150 (MQ=255) ttCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATTTATTATTTCACTgg < 1:1969753/150‑1 (MQ=255) ccTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATTTATTATTTCACTGgcg < 1:3794083/150‑1 (MQ=255) cTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATTTATTATTTCACTGGCGCTGc < 1:212075/150‑1 (MQ=255) gTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATTTATTATTTCACTGGCGCTGCGTGCATCg > 2:1407930/1‑150 (MQ=255) gATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATTTATTATTTCACTGGCGCTGCGTGCATCGCAggg > 2:3589801/1‑150 (MQ=255) aTTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATTTATTATTTCACTGGCGCTGCGTGCATCGCAgggg < 2:3364893/150‑1 (MQ=255) aTTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATTTATTATTTCACTGGCGCTGCGTGCATCGCAgggg > 2:3955906/1‑150 (MQ=255) ttACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATTTATTATTTCACTGGCGCTGCGTGCATCGCAGGGGTCAGCaa > 1:1318426/1‑150 (MQ=255) ttACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATTTATTATTTCACTGGCGCTGCGTGCATCGCAGGGGTCAGCaa > 2:1750822/1‑150 (MQ=255) aCTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATTTATTATTTCACTGGCGCTGCGTGCATCGCAGGGGTCAGCAAcc > 1:2528071/1‑150 (MQ=255) gCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATTTATTATTTCACTGGCGCTGCGTGCATCGCAGGGGTCAGCAACCGTAGCa > 1:1899053/1‑150 (MQ=255) tGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATTTATTATTTCACTGGCGCTGCGTGCATCGCAGGGGTCAGCAACCGTAGCAAt > 1:739788/1‑150 (MQ=255) gAGGGTTATTTGGCAAAGTGCTGGTGAAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATTTATTATTTCACTGGCGCTGCGTGCATCGCAGGGGTCAGCAACCGTAGCAATAc < 2:986141/150‑1 (MQ=255) gggggTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTAAAAATGATTGCCCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATTTATTATTTCACTGGCGCTGCGTGCATCGCAGGGGTCAGCAACCGTAGCAATACt < 2:667238/149‑1 (MQ=255) gggggTATTTGGAAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAGGCCTTTGCCAACAGGCTAAAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATTTATTATTTCACTGGCGCTGCGTGCATCGCAGGGGTCAGCAACCGTAGCAATACt < 2:1006453/149‑1 (MQ=255) ggggTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATTTATTATTTCACTGGCGCTGCGTGCATCGCAGGGGTCAGCAACCGTAGCAATACTg > 2:1248709/1‑150 (MQ=255) ggTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATTTATTATTTCACTGGCGCTGCGTGCATCGCAGGGGTCAGCAACCGTAGCAATACTGAc > 1:803580/1‑150 (MQ=255) | CCAATGGTAGCTCTAATGATTGCGCTGGTGCTGGCATTCTGGTTATTGGCTTTACGTCGCGGCTGGAGCTTACAACACACCAGCGACATTATGGGCTCAGCGCTTCCTACTGCGGCGGTAGTGATTTTGGTTACTGGTGCTGGAGGGGTATTTGGCAAAGTGCTGGTGGAATCGGGCGTCGGCAAAGCCCTTGCCAACATGCTACAAATGATTGACCTGCCTCTGTTACCAGCCGCATTTATTATTTCACTGGCGCTGCGTGCATCGCAGGGGTCAGCAACCGTAGCAATACTGAC > AP012306/2376464‑2376759 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |