| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AP012306 | 644036 = | 511 (1.570) | 5 (0.020) | 5/258 | 14.8 | 1.2% | intergenic (+81/‑66) | lysY/lysZ | tRNA‑Lys/tRNA‑Lys |
| ? | AP012306 | = 644159 | 377 (1.340) | noncoding (58/76 nt) | lysZ | tRNA‑Lys | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
GTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTT‑TTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AP012306/644204‑644036‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑attggtgggtcgtgcaggatTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTACGGGC < AP012306/644159‑644011 GTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTT‑TTACTCGGGGCCAATCTTTAAGA > 1:465951/1‑150GTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTT‑TTACTCGGGGCCAATCTTTAAGA > 1:560894/1‑150GTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTT‑TTACTCGGGGCCAATCTTTAAGA > 1:3761906/1‑150GTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTT‑TTACTCGGGGCCAATCTTTAAGA < 1:3638057/150‑1GTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTT‑TTACTCGGGGCCAATCTTTAAGA < 1:3411986/150‑1 tgCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTT‑TTACTCGGGGCCAATCTTTAAGAT < 1:3966663/148‑1 TTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTT‑TTACTCGGGGCCACTCTTTAAGAT > 1:4368675/1‑150 TTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTT‑TTACTCGGGGCCAATCTTTAAGAT < 1:1036150/150‑1 TTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGATACCTGAAAGATTT‑TTACTCGGGGCCAATCTTTAAGAT > 2:1622982/1‑150 TCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTT‑TTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATT > 1:3107042/1‑150 TCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGGGTTACCTGAAGGATTT‑TTACTCGGGGCCAATCTTTAAGAgt > 2:806249/1‑148 TCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGAGTTACCTGAAAGATTT‑TTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATT > 2:3616538/1‑150 CTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTT‑TTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTG > 1:4266975/1‑150 CTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTT‑TTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTG > 1:853581/1‑150 CTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTT‑TTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTG < 2:1407242/150‑1 CTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTT‑TTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTG > 1:2453340/1‑150 CTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGGGTTACCTGAAAGATTT‑TTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTG > 2:4419543/1‑150 TCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTT‑TTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGG > 2:3289122/1‑150 TCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTT‑TTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGG < 1:685438/150‑1 CTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTT‑TTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGT > 2:1588602/1‑150 ACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTT‑TTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGG > 2:278516/1‑150 ACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTT‑TTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGG > 1:505834/1‑150 CCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTT‑TTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGG > 1:334878/1‑150 CCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGCGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTT‑TTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGG > 1:3459178/1‑150 CAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGTTCGGGGGTGACCTG‑AGGATTTAATACTCGGGGCCCATCTTTAAGGTTGGGGGGT > 2:2969143/1‑150 CAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTT‑TTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGT > 1:2099961/1‑150 AGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTT‑TTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTC < 1:1941447/150‑1 GTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTT‑TTACTCGGGGCCAATCTTTAATATTGGTGGGTCG < 2:3591277/150‑1 GTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTT‑TTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCG > 1:483115/1‑150 GTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTT‑TTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCG < 1:4357359/150‑1 TAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTT‑TTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGT < 1:3411075/150‑1 TAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTT‑TTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGT < 1:4267933/150‑1 TAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTT‑TTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGT > 1:3498026/1‑150 TAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGGGTTACCTGAAAGATTT‑TTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGT > 2:3483689/1‑150 AACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTT‑TTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTG < 2:4139407/150‑1 AACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTT‑TTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTG > 1:1324683/1‑150 ACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTTATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTT‑TTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGC > 1:2113086/1‑150 ACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTT‑TTACTCGGGGCCAATCTTTTAGATTGGTGGGTCGTGC > 2:2246142/1‑150 ACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTT‑TTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGC < 2:844418/150‑1 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ATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGGGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCCATCTTTAAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTag > 2:3091892/1‑148 ATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAA > 1:2139100/1‑63 ATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAA < 2:2139100/63‑1 TGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCT < 2:3743729/150‑1 TGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCT < 2:2177946/150‑1 TGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTA < 1:4063760/57‑1 GGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTT < 1:491977/150‑1 GGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTT < 2:3058381/150‑1 GGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTT < 2:1772120/150‑1 TGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTTCG < 1:2636172/150‑1 TGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTTCG > 1:1387878/1‑150 TGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGGGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAAATGGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTTCc > 2:1997933/1‑149 TGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAA < 1:2472235/40‑1 TGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAA > 2:2472235/1‑40 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GCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCC < 2:1366241/65‑1 GCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCC > 1:1366241/1‑65 CAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTA < 1:3132576/150‑1 CAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTA > 1:2686440/1‑150 CAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTA > 1:931953/1‑150 CAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTA > 2:1932118/1‑150 CAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCC > 1:1296154/1‑64 GGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTACG > 2:3246004/1‑150 GGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACG > 2:4105943/1‑58 GGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACG < 1:4105943/58‑1 GGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACT < 2:4301053/37‑1 GGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACT > 1:4301053/1‑37 GATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTACGG > 1:2940281/1‑150 GATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTACGG < 1:1767872/150‑1 GATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTACGG < 2:1727280/150‑1 TTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTACGGGC < 1:2841599/150‑1 TTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTACGGGC < 2:709572/150‑1 GTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTT‑TTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AP012306/644204‑644036‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑attggtgggtcgtgcaggatTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTACGGGC < AP012306/644159‑644011 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |