New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP002094 | 592381 = | 106 (1.060) | 3 (0.040) +GCTCATGATGGAGGATACAGGGC |
3/150 | 12.1 | 3.6% | noncoding (5/76 nt) | LLNZ_t13323 | tRNA‑Lys |
? | CP002094 | 2131656 = | NA (NA) | noncoding (58/73 nt) | LLNZ_t13355 | tRNA‑Val | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
TTGAATAAAAAATAGAAAAATTACAGTTGAGACTAGAAATTTGCGAAAGTCTGTGTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGTCGCTGGTTCGAGCCCAGCACGGGTCACTAAATTTATTGAAGAAAAGATTGTGGGGA > CP002094/592283‑592479 | ttGAATAAAAAATAGAAAAATTACAGTTGAGACTAGAAATTTGCGAAAGTCTGTGTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTc < 2:951290/99‑1 (MQ=255) gAATAAAAAATAGAAAAATTACAGTTGAGACTAGAAATTTGCGAAGGTCTGTGTCATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCGTAAGTCTGACTCGt > 2:187837/1‑99 (MQ=255) tAAAAAATAGAAAAATTACAGTTGAGACTAGAAATTTGCGAAAGTCTGTGTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAg < 1:1218169/99‑1 (MQ=255) tAAAAAATAGAAAAATTACAGTTGAGACTAGAAATTTGCGAAAGTCTGTGCTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGtttt > 1:783048/1‑97 (MQ=255) aaaaaaTAGAAAAATTACAGTTGAGACTAGAAATTTGCGAAAGTCTGTGTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGc < 1:1275232/99‑1 (MQ=255) aaaaaTAGAAAAATTACAGTTGAGACTAGAAATTTGCGAAAGTCTGTGTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCt < 2:1507142/99‑1 (MQ=255) aaaaaTAGAAAAATTACAGTTGAGACTAGAAATTTGCGAAAGTCTGTGTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCt < 2:535583/99‑1 (MQ=255) aaaaTAGAAAAATTACAGTTGAGACTAGAAATTTGCGAAAGTCTGTGTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTc < 2:1618826/99‑1 (MQ=255) aaTAGAAAAATTACAGTTGAGACTAGAAATTTGCGAAAGTCTGTGTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAg < 2:754319/99‑1 (MQ=255) aaTAGAAAAATTACAGTTGAGACTAGAAATTTGCGAAAGTCTGTGTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAg > 2:840879/1‑99 (MQ=255) aaTAGAAAAATTACAGTTGAGACTAGAAATTTGCGAAAGTCTGTGTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAg < 2:225363/99‑1 (MQ=255) aaTAGAAAAATTACAGTTGAGACTAGAAATTTGCGAAAGTCTGTGTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAg < 1:1367450/99‑1 (MQ=255) aTAGAAAAATTACAGTTGAGACTAGAAATTTGCGAAAGTCTGTGTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGt > 2:1486946/1‑99 (MQ=255) aTAGAAAAATTACAGTTGAGACTAGAAATTTGCGAAAGTCTGTGTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGt > 1:123231/1‑99 (MQ=255) aTAGAAAAATTACAGTTGAGACTAGAAATTTGCGAAAGTCTGTGTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGt > 2:1595798/1‑99 (MQ=255) tAGAAAAATTACAGTTGAGACTAGAAATTTGCGAAAGTCTGTGTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGtt > 1:810263/1‑99 (MQ=255) aaaaaTTACAGTTGAGACTAGAAATTTGCGAAAGTCTGTGTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCCGTTGGt > 2:483476/1‑99 (MQ=255) aaaaaTTACAGTTGAGACTAGAAATTTGCGAAAGTCTGTGTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGt > 1:1474662/1‑99 (MQ=255) aaaaaGTAGATTTGAGACTAGAAATTTGCGAAAGTCTGTGTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGt < 1:1455696/99‑1 (MQ=255) aaaTTACAGTTGAGACTAGAAATTTGCGAAAGTCTGTGTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTag < 1:753339/99‑1 (MQ=255) aTTACAGTTGAGACTAGAAATTTGCGAAAGTCTGTTTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTagag < 2:380969/99‑1 (MQ=255) aTTACAGTTGAGACTAGAAATTTGCGAAAGTCTGTGTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTagag > 1:904319/1‑99 (MQ=255) aTTACAGGTGAGACTAGAAATTTGCGAAAGTCTGTGTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTagag < 2:1015897/99‑1 (MQ=255) ttACAGTTGAGACTAGAAATTTGCGAAAGTCTGTGTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGc > 1:534588/1‑99 (MQ=255) tACAGTTGAGACTAGAAATTTGCGAAAGTCTGTGTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCa > 1:605508/1‑99 (MQ=255) cAGTTGAGACTAGAAATTTGCGAAAGTCTGTGTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAtt < 1:328283/99‑1 (MQ=255) aGTTGAGACTAGAAATTTGCGAAAGTCTGTGTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAttt < 2:914843/99‑1 (MQ=255) ttGAGACTAGAAATTTGCGAAAGTCTGTGTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGa < 2:1149787/99‑1 (MQ=255) agaCTAGAAATTTGCGAAAGTCTGTGTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACtt > 2:1404927/1‑99 (MQ=255) gaCTAGAAATTTGCGAAAGTCTGTGTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACttt < 2:1286262/99‑1 (MQ=255) gaCTAGAAATTTGCGAAAGTCTGTGTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACttt < 2:728791/99‑1 (MQ=255) cTAGAAATTTGCGAAAGTCTGTGTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTa > 2:1117029/1‑99 (MQ=255) cTAGAAATTTGCGAAAGTCTGTGTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTa > 2:911344/1‑99 (MQ=255) tAGAAATTTGCGAAAGTCTGTGTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTaa < 2:1024801/99‑1 (MQ=255) tAGAAATTTGCGAAAGTCTGTGTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTaa > 2:924895/1‑99 (MQ=255) tAGAAATTTGCGAAAGTCTGTGTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTaa > 2:539397/1‑99 (MQ=255) gAAATTTGCGAAAGTCTGTGTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATc < 1:384840/99‑1 (MQ=255) gAAATTTGCGAAAGTCTGTGTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATc > 1:1226275/1‑99 (MQ=255) gAAATTTGCGAAAGTCTGTGTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATc < 1:1253032/99‑1 (MQ=255) gAAATTTGCGAAAGTCTGTGTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATc > 1:992126/1‑99 (MQ=255) aaTTTGCGAAAGTCTGTGTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCaa < 1:1209292/99‑1 (MQ=255) aaTTTGCGAAAGTCTGTGTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCaa > 2:56379/1‑99 (MQ=255) tttGCGAAAGTCTGTGTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAg > 2:121866/1‑99 (MQ=255) tttGCGAAAGTCTGTGTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAg > 1:1165466/1‑99 (MQ=255) tGCGAAAGTCTGTGTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAggg < 2:393029/99‑1 (MQ=255) gCGAAAGTCTGTGTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGt < 1:1643002/99‑1 (MQ=255) gCGAAAGTCTGTGTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGt < 2:397592/99‑1 (MQ=255) aaaGTCTGTGTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGTCGc < 2:123231/99‑1 (MQ=255) aaaGTCTGTGTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGTCGc > 1:869515/1‑99 (MQ=255) aaaGTCTGTGTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGTCGc < 1:112204/99‑1 (MQ=255) aaGTCTGTGTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGTCGCt > 2:301953/1‑99 (MQ=255) gTCTGTGTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGTCGCTgg > 1:972906/1‑99 (MQ=255) gTCTGTGTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGTCGCTgg > 1:552687/1‑99 (MQ=255) gTCTGTGTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGTCGCTgg > 2:1596394/1‑99 (MQ=255) tgtgTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTTAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGTCGCTGGTTc > 2:167922/1‑99 (MQ=255) tgtgTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGTCGCTGGTTc > 2:608636/1‑99 (MQ=255) gtgtTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCCGTTGGTAGAGCATTTGATTTTTAATCAAAGGGTCGCTGGTTCg > 1:751615/1‑99 (MQ=255) tgtTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGTCGCTGGTTCGa > 1:1315789/1‑99 (MQ=255) gtTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGTCGCTGGTTCGAg < 2:362233/99‑1 (MQ=255) tataATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGTCGCTGGTTCGAGcc < 1:685330/99‑1 (MQ=255) ataataTATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTGAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGTCGCTGGTTCGAGccc < 1:694089/99‑1 (MQ=255) ataataTATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGTCGCTGGTTCGAGccc < 2:438042/99‑1 (MQ=255) ataataTATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGTCGCTGGTTCGAGccc > 2:1340661/1‑99 (MQ=255) taataTATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGTCGCTGGTTCGAGCCCa > 2:1458580/1‑99 (MQ=255) aataTATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGTCGCTGGTTCGAGCCCAg < 2:114265/99‑1 (MQ=255) atatatTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGTCGCTGGTTCGAGCCCAGc > 2:339757/1‑99 (MQ=255) tttatTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGTCGCTGGTTCGAGCCCAGCa < 1:1626253/97‑1 (MQ=255) tatatTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGTCGCTGGTTCGAGCCCAGCa < 2:153283/99‑1 (MQ=255) tatTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGTCGCTGGTTCGAGCCCAGCACg > 2:1591793/1‑99 (MQ=255) tttCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGTCGCTGGTTCGAGCCCAGCACggg < 1:1586091/99‑1 (MQ=255) tttCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGTCGCTGGTTCGAGCCCAGCACggg < 2:1142144/99‑1 (MQ=255) gTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGTCGCTGGTTCGAGCCCAGCACGGGTCAc < 1:499396/99‑1 (MQ=255) gTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGTCGCTGGTTCGAGCCCAGCACGGGTCAc < 1:593779/99‑1 (MQ=255) gTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGTCGCTGGTTCGAGCCCAGCACGGGTCAc < 1:1099988/99‑1 (MQ=255) ttGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGTCGCTGGTTCGAGCCCAGCACGGGTCACt > 2:484858/1‑99 (MQ=255) ttGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGTCGCTGGTTCGAGCCCAGCACGGGGCACt > 2:590408/1‑99 (MQ=255) tgtgAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGTCGCTGGTTCGAGCCCAGCACGGGTCACTa > 1:1222913/1‑99 (MQ=255) tgAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGTCGCTGGTTCGAGCCCAGCACGGGTCACTaaa > 1:1394183/1‑99 (MQ=255) aaaaTGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGTCGCTGGTTCGAGGCCAGCACGGGTCACTAAAtt > 1:913854/1‑99 (MQ=255) aaaaTGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGTCGCTGGTTCGAGCCCAGCACGGGTCACTAAAtt < 2:155159/99‑1 (MQ=255) aaTGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGTCGCTGGTTCGAGCCCAGCACGGGTCACTAAATTTa > 1:372895/1‑99 (MQ=255) aTGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGTCGCTGGTTCGAGCCCAGCACGGGTCACTAAATTTAt > 2:684063/1‑99 (MQ=255) tGACGCCTTAAGTATGACTCGGTTGCTCAGTTGGTAGAGGATTTGACTTTTAATCAAAGGGTCGCTGGTTCGAGCCCAGCACGGGTCACTAAATTTAtt > 2:1244677/1‑99 (MQ=255) cGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGTCGCTGGTTCGAGCCCAGCACGGGTCACTAAATTTATTgaa < 2:696523/99‑1 (MQ=255) cGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGTCGCTGGTTCGAGCCCAGCACGGGTCACTAAATTTATTgaa > 1:460323/1‑99 (MQ=255) cGCCTTAAGTACGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGTCGCTGGTTCGAGCCCAGCACGGGTCACTAAATTTATTgaa < 1:1096719/99‑1 (MQ=255) ccTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGTCGCTGGTTCGAGCCCAGCACGGGTCACTAAATTTATTgaaga > 1:761629/1‑99 (MQ=255) ttAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGTCGCTGGTTCGAGCCCAGCACGGGTCACTAAATTTATTGAAGaaa > 2:490033/1‑99 (MQ=255) tAAGTATGACTCGTTAGTTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGTCGCTGGTTCGAGCCCAGCACGGGTCACTAAATTTATTGAAGaaaa > 2:598885/1‑99 (MQ=255) aGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGTCGCTGGTTCGAGCCCAGCACGGGTCACTAAATTTATTGAAGAAAAGa > 2:549533/1‑99 (MQ=255) aGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGTCGCTGGTTCGAGCCCAGCACGGGTCACTAAATTTATTGAAGAAAAGa < 2:740490/99‑1 (MQ=255) gTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGTCGCTGGTTCGAGCCCAGCACGGGTCACTAAATTTATTGAAGAAAAGAt < 1:127405/99‑1 (MQ=255) tATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGTCGCTGGTTCGAGCCCAGCACGGGTCACTAAATTTATTGAAGAAAAGAtt > 1:1012919/1‑99 (MQ=255) tATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGTCGCTGGTTCGAGCCCAGCACGGGTCACTAAATTTATTGAAGAAAAGAtt > 1:1133913/1‑99 (MQ=255) aTGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGTCGCTGGTTCGAGCCCAGCACGGGTCACTAAATTTATTGAAGAAAAGATtg > 1:1126790/1‑99 (MQ=255) tGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGTCGCTGGTTCGAGCCCAGCACGGGTCACTAAATTTATTGAAGAAAAGATtgt < 1:970476/99‑1 (MQ=255) tGACCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGTCGCTGGTTCGAGCCCAGCACGGGTCACTAAATTTATTGAAGAAAAGATtgt < 1:830889/99‑1 (MQ=255) aCTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGTCGCTGGTTCGAGCCCAGCACGGGTCACTAAATTTATTGAAGAAAAGATTGTgg > 1:218128/1‑99 (MQ=255) tCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGTCGCTGGTTCGAGCCCAGCACGGGTCACTAAATTTATTGAAGAAAAGATTGTgggg > 1:1414176/1‑99 (MQ=255) cGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGTCGCTGGTTCGAGCCCAGCACGGGTCACTAAATTTATTGAAGAAAAGATTGTGGGGa < 1:1307720/99‑1 (MQ=255) | TTGAATAAAAAATAGAAAAATTACAGTTGAGACTAGAAATTTGCGAAAGTCTGTGTTATAATATATTTCGTTGTGAAAATGACGCCTTAAGTATGACTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGGGTCGCTGGTTCGAGCCCAGCACGGGTCACTAAATTTATTGAAGAAAAGATTGTGGGGA > CP002094/592283‑592479 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |