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ATCGGCATTGCCCAGAAGGGGCCGTTTATGTTGCCAGACAGCGCTACTGATTAAGCGGATTTTTTCGCTTTTGTAGGCTGGAGCTGCTTCGAAGTTCCTATACTTTCTAGAGAATAGGAACTTCGAACTGCAGGTCGACGGATCCCCGGAATCATAATGCTCTCCTGATAATGTTAAACTTTTTTAGTAAATCATCTGCTCGAATACGAGAGTATAGTCAGTGCGGTGATGATTTGCTTAACCTATGAAAATCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTT > 1:758895/1‑287 ATCGGCATTGCCCAGAAGGGGCCGTTTATGTTGCCAGACAGCGCTACTGATTAAGCGGATTTTTTCGCTTTTGTAGGCTGGAGCTGCTTCGAAGTTCCTATACTTTCTAGAGAATAGGAACTTCG > 1:93300/1‑125 ATCGGCATTGCCCAGAAGGGGCCGTTTATGTTGCCAGACAGCGCTACTGATTAAGCGGATTTTTTCGCTTTTGTAGGCTGGAGCTGCTTCGA > 2:397708/1‑92 ATCGGCATTGCCCAGAAGGGGCCGTTTATGTTGCCAGACAGCGCTACTGATTAAGCGGATTTTTTCGCTTTTGTAGGCTGGAGCTGCTTCGA < 1:397708/92‑1 CATTGCCCAGAAGGGGCCGTTTATGTTGCCAGACAGCGCTACTGATTAAGCGGATTTTTTCGCTTTTGTAGGCTGGAGCTGCTTCGAAGTTCCTATACTTTCTAGAGAATAGGAACTTCGAACTGCAGGTCGACGGATCCCCGGAA < 1:566875/146‑1 CATTGCCCAGAAGGGGCCGTTTATGTTGCCAGACAGCGCTACTGATTAAGCGGATTTTTTCGCTTTTGTAGGCTGGAGCTGCTTCGAAGTTCCTATACTTTCTAGAGAATAGGAACTTCGAACTGCAGGTCGACGGATCCCCGGAA > 2:566875/1‑146 CCCAGAAGGGGCCGTTTATGTTGCCAGACAGCGCTACTGATTAAGCGGATTTTTTCGCTTTTGTAGGCTGGAGCTGCTTCGAAGTTCCTATACTTTCTAGAGAATAGGAACTTCGAACTGCAGGTCGACGGATCCCCGGAATCATAATGCTCTCCTGATAATGTTAAACTTTTTTAGTAAATCATCTGCTCGAATTCGAGAGTATAGT < 2:763597/208‑1 GGCCGTTTATGTTGCCAGACAGCGCTACTGATTAAGCGGATTTTTTCGCTTTTGTAGGCTGGAGCTGCTTCGAAGTTCCTATACTTTCTAGAGAATAGGAACTTCGAACTGCAGGTCGACGGATCCCCGGAATCATAATGCTCTCCTGATAATGTTAAACTTTTTTAGTAAATCATCTGCTCGAATACGAGAGTATAGTCAGTGCGGTGATGATTTGCTTAACCTATGAAAATCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACAT < 1:1025570/287‑1 GCCGTTTATGTTGCCAGACAGCGCTACTGATTAAGCGGATTTTTTCGCTTTTGTAGGCTGGAGCTGCTTCGAAGTTCCTATACTTTCTAGAGAATAGGAACTTCGAACTGCAGGTCGACGGATCCCCGGAATCATAATGCTCTCCTGATGATGTTAAACTTTTTTAGTAAATCATCTGCTCGAATACGAGAGTATAGTCAGTGCGGTGATGATTTGCTTAACCTATGAAAATCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACT < 2:183576/256‑1 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TGGAGCTGCTTCGAAGTTCCTATACTTTCTAGAGAATAGGAACTTCGAACTGCAGGTCGACGGATCCCCGGAATCATAATGCTCTCCTGATAATGTTAAACTTTTTTAGTAAATCATCTGCTCGAATACGAGAGTATAGTCAGTGCGGTGATGATTTGCTTAACCTATGAAAATCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTA > 2:63408/1‑230 GCTGCTTCGAAGTTCCTATACTTTCTAGAGAATAGGAACTTCGAACTGCAGGTCGACGGATCCCCGGAATCATAATGCTCTCCTGATAATGTTAAACTTTTTTAGTAAATCATCTGCTCGAATACGAGAGTATAGTCAGTGCGGTGATGATTTGCTTAACCTATGAAAATCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCACTTCTGGGTA < 2:11080/288‑1 CTTCGAAGTTCCTATACTTTCTAGAGAATAGGAACTTCGAACTGCAGGTCGACGGATCCCCGGAATCATAATGCTCTCCTGATAATGTTAAACTTTTTTAGTAAATCATCTGCTCGAATACGAGAGTATAGTCAGTGCGGTGATGATTTGCTTAACCTATGAAAATCAAAAGCTTACTCGCGCTCACA > 1:614081/1‑188 CTTCGAAGTTCCTATACTTTCTAGAGAATAGGAACTTCGAACTGCAGGTCGACGGATCCCCGGAATCATAATGCTCTCCTGATAATGTTAAACTTTTTTAGTAAATCATCTGCTCGAATACGAGAGTATAGTCAGTGCGGTGATGATTTGCTTAACCTATGAAAATCAAAAGCTTACTCGCGCTCACA < 2:614081/188‑1 TTCTAGAGAATAGGAACTTCGAACTGCAGGTCGACGGATCCCCGGAATCATAATGCTCTCCTGATAATGTTAAACTTTTTTAGTAAATCATCTGCTCGAATACGAGAGTATAGTCAGTGCGGTGATGATTTGCTTAACCTATGAAAATCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGA < 1:1037215/249‑1 TTCTAGAGAATAGGAACTTCGAACTGCAGGTCGACGGATCCCCGGAATCATAATGCTCTCCTGATAATGTTAAACTTTTTTAGTAAATCATCTGCTCGAATACGAGAGTATAGTCAGTGCGGTGATGATTTGCTTAACCTATGAAAATCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGA > 2:1037215/1‑249 TCTAGAGAATAGGAACTTCGAACTGCAGGTCGACGGATCCCCGGAATCATAATGCTCTCCTGATAATGTTAAACTTTTTTAGTAAATCATCTGCTCGAATACGAGAGTATAGTCAGTGCGGTGATGATTTGCTTAACCTATGAAAATCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTA > 1:643904/1‑203 TCTAGAGAATAGGAACTTCGAACTGCAGGTCGACGGATCCCCGGAATCATAATGCTCTCCTGATAATGTTAAACTTTTTTAGTAAATCATCTGCTCGAATACGAGAGTATAGTCAGTGCGGTGATGATTTGCTTAACCTATGAAAATCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAA > 2:151679/1‑189 TCTAGAGAATAGGAACTTCGAACTGCAGGTCGACGGATCCCCGGAATCATAATGCTCTCCTGATAATGTTAAACTTTTTTAGTAAATCATCTGCTCGAATACGAGAGTATAGTCAGTGCGGTGATGATTTGCTTAACCTATGAAAATCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAA < 1:151679/189‑1 TAGAGAATAGGAACTTCGAACTGCAGGTCGACGGATCCCCGGAATCATAATGCTCTCCTGATAATGTTAAACTTTTTTAGTAAATCATCTGCTCGAATACGAGAGTATAGTCAGTGCGGTGATGATTTGCTTAACCTATGAAAATCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACT < 2:1079463/169‑1 TAGAGAATAGGAACTTCGAACTGCAGGTCGACGGATCCCCGGAATCATAATGCTCTCCTGATAATGTTAAACTTTTTTAGTAAATCATCTGCTCGAATACGAGAGTATAGTCAGTGCGGTGATGATTTGCTTAACCTATGAAAATCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACT > 1:1079463/1‑169 AATAGGAACTTCGAACTGCAGGTCGACGGATCCCCGGAATCATAATGCTCTCCTGATAATGTTAAACTTTTTTAGTAAATCATCTGCTCGAATACGAGAGTATAGTCAGTGCGGTGATGATTTGCTTAACCTATGAAAATCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGA > 1:386573/1‑241 AATAGGAACTTCGAACTGCAGGTCGACGGATCCCCGGAATCATAATGCTCTCCTGATAATGTTAAACTTTTTTAGTAAATCATCTGCTCGAATACGAGAGTATAGTCAGTGCGGTGATGATTTGCTTAACCTATGAAAATCAAAAGCTTACT > 2:225442/1‑152 AGGAACTTCGAACTGCAGGTCGACGGATCCCCGGAATCATAATGCTCTCCTGATAATGTTAAACTTTTTTAGTAAATCATCTGCTCGAGTACGAGAGTATAGTCAGTGCGGTGATGATTTGCTTAACCTATGAAACTCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTAACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGA > 2:1146206/1‑195 AGGAACTTCGAACTGCAGGTCGACGGATCCCCGGAATCATAATGCTCTCCTGATAATGTTAAACTTTTTTAGTAAATCATCTGCTCGAATACGAGAGTATAGTCAGTGCGGTGATGATTTGCTTAACCTATGAAAATCAAAAGCTTACTCG < 2:1134905/151‑1 AGGAACTTCGAACTGCAGGTCGACGGATCCCCGGAATCATAATGCTCTCCTGATAATGTTAAACTTTTTTAGTAAATCATCTGCTCGAATACGAGAGTATAGTCAGTGCGGTGATGATTTGCTTAACCTATGAAAATCAAAAGCTTACTCG > 1:1134905/1‑151 TCGAACTGCAGGTCGACGGATCCCCGGAATCATAATGCTCTCCTGATAATGTTAAACTTTTTTAGTAAATCATCTGCTCGAATACGAGAGTATAGTCAGTGCGGTGATGATTTGCTTAACCTATGAAAATCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGT < 1:1130747/207‑1 TCGAACTGCAGGTCGACGGATCCCCGGAATCATAATGCTCTCCTGATAATGTTAAACTTTTTTAGTAAATCATCTGCTCGAATACGAGAGTATAGTCAGTGCGGTGATGATTTGCTTAACCTATGAAAATCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGT > 2:1130747/1‑207 TCGAACTGCAGGTCGACGGATCCCCGGAATCATAATGCTCTCCTGATAATGTTAAACTTTTTTAGTAAATCATCTGCTCGAATACGAGAGTATAGTCAGTGCGGTGATGATTTGCTTAACCTATGAAAATCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACT > 2:1141703/1‑158 TCGAACTGCAGGTCGACGGATCCCCGGAATCATAATGCTCTCCTGATAATGTTAAACTTTTTTAGTAAATCATCTGCTCGAATACGAGAGTATAGTCAGTGCGGTGATGATTTGCTTAACCTATGAAAATCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACT < 1:1141703/158‑1 CGGAATCATAATGCTCTCCTGATAATGTTAAACTTTTTTAGTAAATCATCTGCTCGAATACGAGAGTATAGTCAGTGCGGTGATGATTTGCTTAACCTATGAAAATCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCACTTCTGGGTACTGATTACGTGATCCAAATCAAATTTTTGCAAAGCTGACACCTTTCAGCATCGCTTTTCGCCATT < 2:136138/289‑1 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CGGCGGCGAACGGTCGCATGAGCAGAAAGCGTCAGGCAGTGTTGTATCCACTCGGTGGGAAGGTGTTCTGCAAATAGTTGTGCAGAGGGCGGAGGCATAAGCGGATGGTCACTGAAATCGAGCAGATCATTGAGAAGTGGCATAAGAAAACGGCTCCCTGTTGTGGAAGCCGTTATAGTGCCTCAGTTTAAGGATCGGTCAACTAATCCTTAACTGATCGGCATTGCCCAGAAGGGGCCGTTTATGTTGCCAGACAGCGCTACTGATTAAGCGGATTTTTTCGCTTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NZ_CP009273/1290636‑1290923‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CATAATGCTCTCCTGATAATGTTAAACTTTTTTAGTAAATCATCTGCTCGAATACGAGAGTATAGTCAGTGCGGTGATGATTTGCTTAACCTATGAAAATCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCACTTCTGGGTACTGATTACGTGATCCAAATCAAATTTTTGCAAAGCTGACACCTTTCAGCATCGCTTTTCGCCATT > NZ_CP009273/1293575‑1293857 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |