New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NZ_CP009273 | = 2320388 | 92 (0.800) | 5 (0.050) | 5/458 | 11.5 | 5.4% | coding (801/1185 nt) | atoB | acetyl‑CoA acetyltransferase |
? | NZ_CP009273 | = 2320423 | 86 (0.780) | coding (836/1185 nt) | atoB | acetyl‑CoA acetyltransferase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
ACAGCGTAAAGCGGCAGCCGCAATTGAGTCCGGTGCTTTTACAGCCGAAATCGTCCCGGTAAATGTTGTCACTCGAAAGAAAACCTTCGTCTTCAGTCAAGACGAATTCCCGAAAGCGAATTCAACGGCTGAAGCGTTAGGTGCATTGCGCCCGGCCTTCGATAAAGCAGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGAT‑TATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGCTGCAACTGGCGGATATTGATCTCATTGAGGCTAATGAAGCATTTGCTGCACAGTTCCTTGCCGTTGGGAAAAACCTGGGCTTTGATTCTGAGAAAGTGAATGTCAACGGCGGGGCCATCGCGCTCGGGCATCCTATCGGTGCCAGTGGTGCTCGTATTCTGGTCACACTATTACATGCCATGCAGGCACGCGATAAAACGCTGGG > NZ_CP009273/2320136‑2320708 | acaGCGTAAAGCGGCAGCCGCAATTGAGTCCGGTGCTTTTACAGCCGAAATCGTCCCGGTAAATGTTGTCACTCGAAAGAAAACCTTCGTCTTCAGTCAAGACGAATTCCCGAAAGCGAATTCAACGGCTGAAGCGTTAGGTGCATTGCGCCCGGCCTTCGATAAAGCAGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGAT‑TATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTAt > 1:28232/1‑289 (MQ=255) cGTAAAGCGGCAGCCGCAATTGAGTCCGGTGCTTTTACAGCCGAAATCGTCCCGGTAAATGTTGTCACTCGAAAGAAAACCTTCGTCTTCAGTCAAGACGAATTCCCGAAAGCGAATTCAACGGCTGAAGCGTTAGGTGCATTGCGCCCGGCCTTCGATAAAGCAGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGAT‑TATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCACCCTGGCTCGTATTAAAAGTTATGCCa > 1:136498/1‑289 (MQ=255) gTAAAGCGGCAGCCGCAATTGAGTCCGGTGCTTTTACAGCCGAAATCGTCCCGGTAAATGTTGTCACTCGAAAGAAAACCTTCGTCTTCAGTCAAGACGAATTCCCGAAAGCGAATTCAACGGCTGAAGCGTTAGGTGCATTGCGCCCGGCCTTCGATAAAGCAGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTCTTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGAT‑TATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCa > 1:970930/1‑288 (MQ=255) gTAAAGCGGCAGCCGCAATTGAGTCCGGTGCTTTTACAGCCGAAATCGTCCCGGTAAATGTTGTCACTCGAAAGAAAACCTTCGTCTTCAGTCAAGACGAATTCCCGAAAGCGAATTCAACGGCTGAAGCGTTAGGTGCATTGCGCCCGGCCTTCGATAAAGCAGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGAT‑TATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCACCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCa > 1:572631/1‑288 (MQ=255) tAAAGCGGCAGACGCAATTGAGTCCGGTGCGTTTACAGCCGAAATCCTCCCGGTAAATGTTGTCACACGAAAGAAAACCTTCGTCTTCAGTCAAGACGAATTCCCGAAAGCGAATTCAACGGCTGAAGCGTTAGGTGCATTGCGCCCGGTCTTCGATAAAGCAGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGAT‑TATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAg < 2:103145/288‑1 (MQ=255) cAGCCGCAATTGAGTCCGGTGCTTTTACAGCCGAAATCGTCCCGGTAAATGTTGTCACTCGAAAGAAAACCTTCGTCTTCAGTCAAGACGAATTCCCGAAAGCGAATTCAACGGCTGAAGCGTTAGGTGCATTGCGCCCGGCCTTCGATAAAGCAGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGAT‑TATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGt > 1:159250/1‑289 (MQ=255) cGCAATTGAGTCCGGTGCTTTTACAGCCGAAATCGTCCCGGTAAATGTTGTCACTCGAAAGAAAACCTTCGTCTTCAGTCAAGACGAATTCCCGAAAGCGAATTCAACGGCTGAAGCGTTAGGTGCATTGCGCCCGGCCTTCGATAAAGCAGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGAT‑TATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGcc < 1:3964/288‑1 (MQ=255) agtgatgtagcccGGTGCTTTTCCAGCCGAAATCGTCCCAGTCAATGTTGGTACTCGAAAGAAACCCTTCGTCTTCAGTGAGGTCGAATGGCCGATAGCGAAGGCAACGGCTGTAGCGTTCGGTGCGTTGCTCCAGGCATTGGATAAAGGAGGCACTGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTTTTACCGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGAT‑TATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCTCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCTGTGGCGTg < 2:1100220/275‑1 (MQ=255) gCAATTGAGTCCGGTGCTTTTACAGCCGAAATCGTCCCGGTAAATGTTGTCACTCGAAAGAAAACCTTCGTCTTCAGTCAAGACGAATTCCCGAAAGCGAATTCAACGGCTGAAGCGTTAGGTGCATTGCGCCCGGCCTTCGATAAAGCAGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGAT‑TATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGcccc < 1:1166750/289‑1 (MQ=255) tcgggccGGTGCTTTTACAGCCGAAATCGTCCCGGTAAATGTTGTAACGCGAACGAACACCTTCGTATTCAGTCAAGACGAATTCCCGAAAGAGAATTCAACGGCTGAAGCGTTAGGTGCAGTGCGCCCGGCCTTCGATAAAGCAGGAACGGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGAT‑TATGGAAGAATCTGCGGCGCGGGCAGCAGGCCTTACCCCGCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCa < 2:970930/284‑1 (MQ=255) 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ccGGTGATTTTACAGCCGAAATCGTCCCGGTAAATGTTGTCACGCGAAAGAAAACCTTCGTCTTCAGTCAAGAAGAATTCCCGAAAGCGAATTCAACGGCTGAAGCGTTAGGTGCATTGCGCCCGGCCTTCGATAAAGCAGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGAT‑TATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGAt < 1:1441/289‑1 (MQ=255) cGGTGCTTTTACAGCCGAAATCGTCCCGGTAAATGTTGTCACTCGAAAGAAAACCTTCGTCTTCAGTCAAGACGAATTCCCGAAAGCGAATTCAACGGCTGAAGCGTTAGGTGCATTGCGCCCGGCCTTCGATAAAGCAGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGAT‑TATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATg < 1:331764/289‑1 (MQ=255) cTTTTACAGCCGAAATCGTCCCTGTAAATGTTGTCACTCGAAAGAAAACCTTCGTCTTCAGTCAAGACGAATTCCCGAAAGCGAATTCAACGGCTGAAGCGTTAGGTGCATTGCGCCCGGCCTTCGATAAAGCAGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGAT‑TATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGACAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGa < 1:1179093/282‑1 (MQ=255) cTTTTACAGACGAAACCGTCCCGGTAAATGTTTGCACTCGCAAGAAAACCGTCGTCTTCAGTCAAGACGAATTCCCGAAAGCGAATTCAACGGCTGAAGCGTTAGGTGCATTGCGCCCGGCCTTCGATAAAGCAGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAGCGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGAT‑TATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTAt < 2:159250/289‑1 (MQ=255) ttttACAGCCGAAATCGTCCCGGTAAATGTTGTCACTCGAAAGAAAACCTTCGTCTTCAGTCAAGACGAATTCCCGAAAGCGAATTCAACGGCTGAAGCGTTAGGTGCATTGCGCCCGGCCTTCGATAAAGCAGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGAT‑TATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTAt < 2:306376/288‑1 (MQ=255) cGAAATCGTCCCGGTAAATGTTCTCACTCGAAAGAAAACCTTCGTCTTCAGTCAAGACGACTTCCCGAAAGCGAATTCAACGGCTGAAGCGTTAGGTGCATTGCGCACGTCCGTCGATAAAGCAGGAACAGTCACCCCTAGGACCGCGTCTGGTATTAACAACGGCTCTGCCGCTCTGGTGAG‑TATGGAAGAATCGGCGACGCTGGAAGCAGGCCTTCCCCACCTGCACCTCTTTAACAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTTGTGGGTAGGGGGcagac > 2:1179093/1‑284 (MQ=255) gttgtCACTCGAAAGAAAACCTTCGTCTTCAGTAAAGACGAATTCCCGAAAGCGAATTCAACGGCTGAAGCGTTAGGTGCATTGCGCCCGGCCTTCGATAAAGCAGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGAT‑TATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGt < 2:28232/289‑1 (MQ=255) tCACTCGACAGAAAACCTTCGTCTTCAGTCAAGACGAATTACCGAAAGCGAATTCAACGGCTGAAGCGTTAGGTGCATTGCGCCCGGCATTCGATAAAGCAGGAACAGTCACCGCTGGGAACGGGTATGGTATTAAAAACGGTGCTGACGCTCTGGTAAT‑TATGGAAGAACCGTCGGAACTGTCAGCAGGCCTTCCCCCACTGGCTCGCAGTAAAGTGTCTGCCAGCTGGTGCGTGCGCCCCGCACTGATGGACATGGGCCAATTCGCTGGCACGCACAGACCGTTaaa > 2:499994/1‑287 (MQ=255) cGAAAGAAAACCTTCGTCTTCAGTCAAGACGAATTCCCGAAAGCGAATTCAACGGCTGAAGCGTTAGGTGCATTGCGCCCGGCCTTCGATAAAGCAGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGAT‑TATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTAt > 2:817122/1‑251 (MQ=255) 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gACGAATTCCCGAAAGCGAATTCAACGGCTGAAGCGTTAGGTGCATTGCGCCCGGCCTTCGATAAAGCAGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGAT‑TATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGAt > 2:1174742/1‑218 (MQ=255) gACGAATTCCCGAAAGCGAATTCAACGGCTGAAGCGTTAGGTGCATTGCGCCCGGCCTTCGATAAAGCAGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGAT‑TATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGAt < 1:1174742/218‑1 (MQ=255) atgcccGAAAGCGAATTCAACGGCTGAAGCGTTAGGTGCATTGCGCCCGGCCGTCGATAAGGCAGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGAT‑TATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGCTGCAACTGGCGGATATTGATCTCAtt < 1:32940/286‑1 (MQ=255) 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cTGAAGCGTTAGGTGCATTGCGCCCGGCCTTCGATAAAGCAGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGAT‑TATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGcccccc > 1:135238/1‑182 (MQ=255) tGAAGCGTTAGGTGCATTGCGCCCGGCCTTCGATAAAGCAGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGAT‑TATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGCTGCAACTGGCGGATATTGATCTCATTGAGGCTAATGAAGCATTTGCTGca < 1:198051/289‑1 (MQ=255) aaGCGTTAGGTGCATTGCGCCCGGCCTTCGATAAAGCAGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGAT‑TATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGCTGCAACTGGCGGATATTGAt < 1:1080456/257‑1 (MQ=255) 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tCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGCTGCAACTGGCGGATATTGATCTCATTGAGGCTAATGAAGCATTTGCTGCACAGTCCCTTTCAGTTGGGCAAAACCTGGGCTTTGATTCTGAGAAAGTGAATGTCACCGGCGGGGCCCTCCCCTCCGGGCCTCCCACCGGTGCCAGTTGTGCTCGTAt > 2:1160314/1‑287 (MQ=255) ggcgCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGCTGCAACTGGCGGATATTGATCTCATTGAGGCTAATGAAGCATTTGCTGCACAGTTCCTTGCCGTTGGGAAAAACCTGGGCTTTGATTCTGAGAAAGTGAATGTCAACGGCGGGGCCATCGCGCTCGGGCATCCTATCGGTGCCAGTGGTGCTCGTATTCTGGt < 1:1079709/288‑1 (MQ=255) ggcgCTGGCAGCAGGCCTTACACCCCGGGCTCGCAGTAAAAGGTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGCTGCAACTGGCGGATATTGATCTCATTGAGGCTAATGAAGCATTTGCTGCACAGTTCCTTGCCGTTGGGAAAAACCTGGGCTTTGATTCTGAGAAAGTGAATGTCAACGGCGGGGCCATCGCGCTCGGGCATCCTATCGGTGCCAGTGGTGCTCGTATTCTGGt < 2:764284/288‑1 (MQ=255) 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ttAGGCCTGCGGTGGCGTTGCCCCCGCATGGAGGGGAATGGGGCCAGGACCAGCCACGCAAAAAGCGGTACAGCTGGAGGGGCTGCAACTGGCGGATATTGATTTCATTGAGGCTAATGAAGCATTTGCTGCACAGTGCCTAGCCGTTGGGAAAGACCTGGGCTTTGATTCTGAGAAAGGGAATGTCAACGGCGGTGCCATCGCGCTCGGGCATCCTATCGGTGCCAGTGGTGCTCGTAGTCTGGTCACACTATTACATGCCATGCAGGCACGCGATAAAACGCTggg < 2:136498/288‑1 (MQ=255) tATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGCTGCAACTGGCGGATATTGATCTCATTGAGGCTAATGAAGCATTTGCTGCACAGTTCCTTGCCGTTGGGAAAAACCTGGGCTTTGATTCTGAGAAAGTGAATGTCAACGGCGGGGCCATCGCGCTCGGGCATCCTATCGGTGCCAGTGGTGCTCGTATTCTGGTCACACTATTACATGCCATGCAGGCACGCGATAAAACGCTggg < 1:388486/287‑1 (MQ=255) gaTGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGCTGCAACTGGCGGATATTGATCTCATTGAGGCTAATGAAGCATTTGCTGCACAGTTCCTTGCCGTTGGGAAAAACCTGGGCTTTGATTCTGAGAAAGTGAATGTCAACGGCGGGGCCATCGCGCTCGGGCATCCTATCGGTGCCAGTGGTGCTCGTATTCTGGTCACACTATTACATGCCATGCAGGCACGCGATAAAACGCTggg < 1:291462/286‑1 (MQ=255) 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ACAGCGTAAAGCGGCAGCCGCAATTGAGTCCGGTGCTTTTACAGCCGAAATCGTCCCGGTAAATGTTGTCACTCGAAAGAAAACCTTCGTCTTCAGTCAAGACGAATTCCCGAAAGCGAATTCAACGGCTGAAGCGTTAGGTGCATTGCGCCCGGCCTTCGATAAAGCAGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGAT‑TATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACAACTGGCGGGGCTGCAACTGGCGGATATTGATCTCATTGAGGCTAATGAAGCATTTGCTGCACAGTTCCTTGCCGTTGGGAAAAACCTGGGCTTTGATTCTGAGAAAGTGAATGTCAACGGCGGGGCCATCGCGCTCGGGCATCCTATCGGTGCCAGTGGTGCTCGTATTCTGGTCACACTATTACATGCCATGCAGGCACGCGATAAAACGCTGGG > NZ_CP009273/2320136‑2320708 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |