New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NZ_CP009273 | = 2871515 | 74 (0.690) | 3 (0.030) | 3/378 | 11.4 | 4.6% | noncoding (456/763 nt) | CRISPR | repeat region |
? | NZ_CP009273 | 2871640 = | 62 (0.670) | noncoding (581/763 nt) | CRISPR | repeat region | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
CCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTTATAAAGCTGACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGCAGG‑CGGCGACGCGCA‑GGGTATGCGCGATTCGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTC‑GCGACCGCTCAGAAATTCCAGACCCGATCCAAACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTCAACATTATCAATTACAACCGACAGGGAGCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAGCGTGTTCGGCATCACCTTTGGCTTCGGCTGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGCGTGAGCGTATCGCCGCGCGTCTGCGAAAGCGG > NZ_CP009273/2871227‑2871796 | ccTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTTATAAAGCTGACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTc > 1:916533/1‑289 (MQ=255) aTGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCCGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGCGTCCGGTTTCTCCCCGCTGGCTCGGGGAACTTCAGTTCCCGTATCTCCGGATTTATAAAGCTGACGGTTTCTCCCCCCTGGCCCGGCGAACTCGcc > 2:707624/1‑288 (MQ=255) aTGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTTATAAAGCTGACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGCa > 1:720786/1‑289 (MQ=255) tGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGCACGCTCGCTTCCTTCTCCCCGGATTTATAAAGCTGACTGCTTATCCCCGCTGTCGCGGGGCACTccccg > 2:728007/1‑285 (MQ=255) tGAACTCCCGGTTTATCCCCGCGGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCCTGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGCTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGCCTGGCAATCTCCTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACGCGAGTTTCCGTATCTCCGGAGTAATAAAGCTCACCGGTTATCCACTCTCGCGCGGGGAACTCGCAgg‑cgg > 2:233149/1‑289 (MQ=255) cTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTTATAAAGCTGACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGCAGG‑CGGCGACGCGCA‑GGGTATGCGCGa > 1:241463/1‑289 (MQ=255) ggCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTTATAAAGCTGACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGCAGG‑CGGCGACGCGCA‑GGGTATGCGCGAtt < 1:677133/289‑1 (MQ=255) gcgGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTTATAAAGCTGACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGCAGG‑CGGCGACGCGCA‑GGGTATGCGCGATTcg < 1:1190503/288‑1 (MQ=255) gcgGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTTATAAAGCTGACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGCAGG‑CGGCGACGCGCA‑GGGTATGCGCGATTcg < 2:720786/288‑1 (MQ=255) ggggATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTTATAAAGCTGACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGCAGG‑CCGCGACGCGCA‑GGTTCTGCGCGATTCGGGGTTTCTccgc > 2:493944/1‑284 (MQ=255) aTAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCGGGCGGCTTGCCTCGCAGCCAGCACCAGCAGCGGCTTCTCCCCCCTGGCGCGGGGAACTCCCGCTGGCTGGCAATCTCTTTCCGGGTCAGTCCGGTTTACCCCCGCTGGCCCGGGGATCTCCAGTTCCCGTATCCCCGGATTCATAAACCCTACGGCTTATCCCCGCTTGCGCGGGGTACTCGCAGGTCGGC‑AC‑CGCATGGGCATTCGCCACTCGCGGTTCATtccccccgcc > 2:1050999/1‑282 (MQ=255) tAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTTATAAAGCTGACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGCAGG‑CGGCGACGCGCA‑GGGTATGCGCGATTCGCGGTTTATCCCCGCTGgcgc > 1:1057216/1‑289 (MQ=255) aaTGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCGCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTTATAAAGCTGACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGCAGG‑CGGCGACGCGCA‑GGGTATGCGCGATTCGCGGTTTATCCCCGCTGGcgcg < 1:494059/289‑1 (MQ=255) cATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTTATAAAGCTGACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGCAGG‑CGGCGACGCGCA‑GGGTATGCGCGATTCGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTC‑GCGa < 1:473949/289‑1 (MQ=255) aTGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTTATAAAGCTGACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGCAGG‑CGGCGACGCGCA‑GGGTATGCGCGATTCGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGCACTC‑GCGa > 1:320720/1‑288 (MQ=255) cccGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTTATAAAGCTGACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGCAGG‑CGGCGAcgcg > 1:717750/1‑229 (MQ=255) cccGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTTATAAAGCTGACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGCAGG‑CGGCGAcgcg < 2:717750/229‑1 (MQ=255) aTCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTTATAAAGCTGACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGCAGG‑CGGCGACGCGCA‑GGGTATGCGCGATTCGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTC‑GCGACCGCTCAGAAATTCCAg > 1:851099/1‑289 (MQ=255) aTCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCGTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTTATAAAGCTGCCGGTTTATCCCCGCCGGCGCCGGGAACTCCCAGG‑CCGCCACCAGCA‑GGGTATCCGCGATTCGCGGTTACTCCCCGCTGGC‑CGTGGGACACACCGGCCGCTCACAAATTCCac > 2:989123/1‑288 (MQ=255) tCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTT‑GGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTTATAAAGCTGACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGCAGG‑CGGCGAcg < 1:244319/217‑1 (MQ=255) ccccGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGGACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTTATAAAGCTGACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGCACTCGCAGG‑CGGCGACGCGCA‑GGGAATGCGCGATTCGCGGTTTATCCCCGCTGGCGAGGGGAGCTC‑AGGAACTCTCCGGAATTCCAGa > 1:534422/1‑288 (MQ=255) gcgGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTTATAAAGCTGACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGCAGG‑CGGCGACGCGCA‑GGGTATGCGCGATTCGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTC‑GCGACCGCTCAGAAATTCCAGACCCGATCCaaa < 1:493944/289‑1 (MQ=255) cttgccttgcAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTTATAAAGCTGACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGCAGG‑CGGCGACGCGCA‑GGGTATGCGCGATTCGCGGttt < 2:153193/215‑1 (MQ=255) cttgccttgcAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTTATAAAGCTGACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGCAGG‑CGGCGACGCGCA‑GGGTATGCGCGATTCGCGGttt > 1:153193/1‑215 (MQ=255) cttgccttgcAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTTATAAAGCTGACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGCAGG‑CGGCGACGCGCA‑GGGTATGCGCGATTCGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGGACTC‑GCGAGCGCTCAGACATTCCACACCCGATCCAAACGTGTTATCCCCGCTGgc > 2:303551/1‑289 (MQ=255) cttgccttgcAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTTATAAAGCTGACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGCAGG‑CGGCGACGCGCA‑GGGTATGCGCGATTCGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTC‑GCGACCGCTCAGAAATTCCAGACCCGATCCAAACGGTTTATCCCCGCTGgc > 1:984244/1‑289 (MQ=255) gccttgcAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTTATAAAGCTGACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGCACTCGCAGG‑CGGCGACGCGCA‑GGGCATTCGCGATTCGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCCGGGAACTC‑GCGACCGCTCAGACATTCCAGACCCGATCCAAACGGCTTCTCCCCTCTgccccg > 2:971368/1‑284 (MQ=255) cttgcAGCCAGCTCAAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGGGCGGTGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTTATAAAGCTGACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGCAGG‑CGGCGACGCGCA‑GGGTATGCGCGATTCGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTC‑GCGACCGCTCAGAAATTCCAGACCCGATCCAAACGGTTTATCCCCGCTGGCGCggg < 1:849826/289‑1 (MQ=255) 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agcTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTTATAAAGCTGACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGCAGg‑cggcg > 1:1134956/1‑172 (MQ=255) gcGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTTATAAAGCTGACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGCAGG‑CGGCGACGCGCA‑GGGTATGCGCGATTCGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTC‑GCGACCGCTCAGAAATTCCAGACCCGATCCAAACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTCAACATTATCaa > 2:457991/1‑289 (MQ=255) ggTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTTATAAAGCTGACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGCAGG‑CGGCGACGCGCA‑GGGTATGCGCGATTCGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTC‑GCGACCGCTCAGAAATTCCAGACCCGATCCAAACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTCAACATTATCAAt < 1:728007/288‑1 (MQ=255) gTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTTATAAAGCTGACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGCAGG‑CGGCGACGCGCA‑GGGTATGCGCGATCCGCGGTTTCTCCCCGCTGGCGCGGGCAACTC‑GCGACCGCCCAGAAATTCCAGACCCGATCCAAACGGCTTCTCCCCGCTCGCCCGGGGAACTCTCAACATTCTCAATTa > 2:744945/1‑289 (MQ=255) gCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTTATAAAGCTGACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGCAGG‑CGGCGa > 2:547007/1‑150 (MQ=255) gCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTTATAAAGCTGACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGCAGG‑CGGCGa < 1:547007/150‑1 (MQ=255) tGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTTATAAAGCTGACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGCAGG‑CGGCGACGCGCA‑GGGTATGCGCGATTCGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTC‑GCGACCGCTCAGAAATTCCAGACCCGATCCAAACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTCAACATTATCAATTACAACCGACAgg < 1:342764/288‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) ggctggcAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTTATAAAGCTGACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGCAGG‑CGGCGACGCGCA‑GGGTATGCGCGATTCGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTC‑GCGACCGCTCAGAAATTCCAGACCCGATCCAAACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTCAACa < 2:965625/247‑1 (MQ=255) ggctggcAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTTATAAAGCTGACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGCAGG‑CGGCGACGCGCA‑GGGTATGCGCGATTCGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTC‑GCGACCGCTCAGAAATTCCAGACCCGATCCAAACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTCAACa > 1:965625/1‑247 (MQ=255) ctggcAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTTATAAAGCTGACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGCAGG‑CGGCGACGCGCA‑GGGTATGCGCGATTCGCGGTTTAt > 1:485862/1‑156 (MQ=255) ctggcAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTTATAAAGCTGACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGCAGG‑CGGCGACGCGCA‑GGGTATGCGCGATTCGCGGTTTAt < 2:485862/156‑1 (MQ=255) cggcAATCTCGTTCGGGGTGAGTCCGTTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTTATAAAGCGGACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGCAGG‑CGGCGACGCGCA‑GGGTATGCGCGATTCGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTC‑GCGACCGCTCAGAAATTCCAGACCCGATCCAAACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTCAACATTATCAATTACAACCGACAGGGAGCCCGGTTTATCCCCGCTGgc < 1:215056/287‑1 (MQ=255) cGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTTATAAAGCTGACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGCAGG‑CGGCGACGCGCA‑GGGTATGCGCGATTCGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTC‑GCGACCGCTCAGAAATTCCAGACCCGATCCAAACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTCAACATTATCAATTACAACCGACAGGGAGCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAGCGTGTTCGGCAt < 1:989123/289‑1 (MQ=255) aTCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTTATAAAGCTGACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGCAGG‑CGGCGACGCGCA‑GGGTATGCGCGATTCGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTC‑GCGACCGCTCAGAAATTCCAGACCCGATCCAAACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTCAACATTATCAATTACAACCGACAGGGAGCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAGCGTGTTCGGCATCACCtt > 1:34476/1‑289 (MQ=255) ccccGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTTATAAAGCTGACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGCAGG‑CGGCGACGCGCA‑GGGTATGCGCGATTCGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTC‑GCGACCGCTCAGAAATTCCAGACCCGATCCAAACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGCACTCTCAACATTATCAATTACAACCGACAGGGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGGCTCGGGGACACAAGCGTGGTCGGCCTACCCTTTg > 2:377432/1‑289 (MQ=255) ccccGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTTATAAAGCTGACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGCAGG‑CGGCGACGCGCA‑GGGTATGCGCGATTCGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTC‑GCGACCGCTCAGAAATTCCAGACCCGATCCAAACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTCAACATTATCAATTACAACCGACAGGGAGCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAGCGTGTTCGGCATCACCTTTg > 1:1126115/1‑289 (MQ=255) ccGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTTATAAAGCTGACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGCAGG‑CGGCGACGCGCA‑GGGTATGCGCGATTCGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTC‑GCGACCGCTCAGAAATTCCAGACCCGATCCAAACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTCAACATTATCAATTACAACCGACAGGGAGCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAGCGTGTTCGGCATCACCTTTGGc < 1:341498/289‑1 (MQ=255) gcgGGGAACTCTGGTTTCCGTATCTCCGGATTTATAAAGCTGACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGCAGG‑CGGCGACGCGCA‑GGGTATGCGCGATTCGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTC‑GCGACCGCTCAGAAATTCCAGACCCGATCCAAACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTCAACATTATCAATTACAACCGACAGGGAGCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAGCGTGTTCGGCATCACCTTTGGCTTCGGCTg < 1:233149/289‑1 (MQ=255) gcgGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTTATAAAGCTGACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGCAGG‑CGGCGACGCGCA‑GGGTATGCGCGATTCGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTC‑GCGACCGCTCAGAAATTCCAGACCCGATCCAAACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTCAACATTATCAATTACAACCGACAGGGAGCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAGCGTGTTCGGCATCACCTTTGGCTTCGGCt < 1:303551/288‑1 (MQ=255) gcgGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTTATAAAGCTGACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGCAGG‑CGGCGACGCGCA‑GGGTATGCGCGATTCGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTC‑GCGACCGCTCAGAAATTCCAGACCCGATCCAAACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTCAACATTATCAATTACAACCGACAGGGAGCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAGCGTGTTCGGCATCACCTTTGGCTTCGGCTg < 1:377432/289‑1 (MQ=255) gggggaatagtAGTTTGCGTTACTGCGGGTTTATACAGCTGACGGTTTATCGCCGGTGGCGCGGGGAAAGCGCAGG‑CGGCGACGCGAA‑GGGGAGGCGCGATTGGCGGTTTATCCCCGCGGGGGCGGGGAACTC‑GCGACCGCTCAGAAATTCCAGACCCGATCCAAACGGTTTAGCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTCAACATTATCAATTACAGCCGACAGGGGGCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAGCGTGTTCGGCATCACCTTTGGCTTCGGCTg < 2:675426/278‑1 (MQ=255) gggAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTTATAAAGCTGACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGCAGG‑CGGCGACGCGCA‑GGGTCTGCGCGATTCGCGGTTTATcc > 1:1015828/1‑112 (MQ=255) gTTTCCGTTTCTCCGGATTTATATAGCTGACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGCAGG‑CGGCGACGCGCA‑GGGTATGCGCGATTCGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTC‑GCGACCGCTCAGAAATTCCAGACCCGATCCAAACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTCAACATTATCAATTACAACCGACAGGGAGCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAGCGTGTTCGGCATCACCTTTGGCTTCGGCTGCGGTTTATCCCCg < 1:977409/289‑1 (MQ=255) tCCGTATCTCCGGATTTATAAAGCTGACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGCAGG‑CGGCGACGCGCA‑GGGTATGCGCGATTCGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTC‑GCGACCGCTCAGAAATTCCAGACCCGATCCAAACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTCAACATTATCAATTACAACCGACAGGGAGCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAGCGTGTTCGGCCTCACCTTTGGCTTCGGCTGCGGTTTATCCCCGCTg > 1:949402/1‑289 (MQ=255) tcCGGATTTATAAAGCTGACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGCAGG‑CGGCGACGCGCA‑GGGTATGCGCGATTCGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTC‑GCGACCGCTCAGAAATTCCAGACCCGATCCAAACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTCAACATTATCAATTACAACCGACAGGGAGCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAGCGTGTTCGGCATCACCTTTGGCTTCGGCTGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCgggg < 1:971368/289‑1 (MQ=255) cGGATTAATAAAGCTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGCAGG‑CGGCGACGCGCA‑GGGTATGCGCGATTCGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTC‑GCGACCGCTCAGAAATTCCAGACCCGATCCAAACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTCAACATTATCAATTACAACCGACAGGGAGCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAGCGTGTTCGGCATCACCTTTGGCTTCGGCTGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGaa < 1:1050999/289‑1 (MQ=255) 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cGCTGGCGCGGGGAACTCGCAGG‑CGGCGACGCGCA‑GGGTATGCGCGATTCGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTC‑GCGACCGCTCAGATATTCCAGACCCGATCCAAAAGGTTTATCCCCGCTTGCTCGGGGAACTCTCaa > 2:266226/1‑146 (MQ=255) cTGGCGCGGGGAACTCGCAGG‑CGGCGACGCGCA‑GGGTATGCGCGATTCGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTC‑GCGACCGCTCAGAAATTCCAGACCCGATCCAAACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTCAACATTATCAATTACAACCGACAGGGAGCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAGCgtgt > 2:250393/1‑208 (MQ=255) cTGGCGCGGGGAACTCGCAGG‑CGGCGACGCGCA‑GGGTATGCGCGATTCGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTC‑GCGACCGCTCAGAAATTCCAGACCCGATCCAAACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTCAACATTATCAATTACAACCGACAGGGAGCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAGCgtgt < 1:250393/208‑1 (MQ=255) cTGGCGCGGGGAACTCGCAGG‑CGGCGACGCGCA‑GGGTATGCGCGATTCGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTC‑GCGACCGCTCAGAAATTCCAGACCCGATCCAAACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTCAACATTATCAATTACAACCGACAGGGAGCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAGCGTGTTCGGCATCCCCTTTGGCTTCGGCTGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGCGTGAGCGTATCGCCGCTCGTCTGc > 2:586592/1‑289 (MQ=255) 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CCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTTATAAAGCTGACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGCAGG‑CGGCGACGCGCA‑GGGTATGCGCGATTCGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTC‑GCGACCGCTCAGAAATTCCAGACCCGATCCAAACGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTCAACATTATCAATTACAACCGACAGGGAGCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAGCGTGTTCGGCATCACCTTTGGCTTCGGCTGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGCGTGAGCGTATCGCCGCGCGTCTGCGAAAGCGG > NZ_CP009273/2871227‑2871796 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |