New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NZ_CP009273 | = 725138 | 77 (0.710) | 5 (0.050) | 4/416 | 11.4 | 6.8% | coding (100/4194 nt) | rhsC | rhs element protein RhsC |
? | NZ_CP009273 | = 725297 | 64 (0.630) | coding (259/4194 nt) | rhsC | rhs element protein RhsC | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
CAAATAACCCGATAAAACAAGGATGAGCAGATGAGCGGAAAACCGGCGGCGCGTCAGGGCGACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTCCAGGGTTCAGCCGGGGTACGCATCGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGG‑TGTGCCCCGGCGGGGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCGCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCGGTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTACAGCTGCGCGATAACACACTGATACTCAGTGATAACGGCGGCAGAAGCCTGTATTTTGAGCACCTGTTTCCCGGTGAGGACGGTTACAGCCGCAGCGAGTCACTGTGGCTGGTGCGCGGCGGCGTGGCGAAACTGGATGAAGGTCACCGGCTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAA > NZ_CP009273/725009‑725543 | cAAATAACCCGATAAAGCAAGGATGGGCGGATGAGCGGAAAACCGGCGGCGCGTCAGGGCGACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTCCAGGGTTCAGCCGGGGTACGCATCGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGG‑TGTGCCCCGGCGGGGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCGCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCcg < 2:826127/289‑1 (MQ=255) aGCAGATGAGCGGAAAACCGGCGGCGCGTCAGGGCGACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTCCAGGGTTCAGCCGGGGTACGCATCGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGG‑TGTGCCCCGGCGGGGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCGCTGCTCGGTGCAAAGGTTCTTCCCGGTTAAACCGCCATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTGCTTCTCTCCCGCACCGACAGCCGTTACCGGACCAACAACCCCGCGCCGGTgtgggtggcccaccccgg > 2:540036/1‑275 (MQ=14) cAGGGCGACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTCCAGGGTTCAGCCGGGGTACGCATCGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGG‑TGTGCCCCGGCGGGGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCGCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCGGTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTa < 1:592589/288‑1 (MQ=37) gaccggACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTCCAGGGTTCAGCCGGGGTACGCATCGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGG‑TGTGCCCCGGCGGGGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCGCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCGGTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTACAGCTg < 1:540036/283‑1 (MQ=37) gACAGGACGCGGTGTGGGGGTAGGATTGTCCAGGGTTCAGCCGGGGTACGCATCGGTGCCTCCACCGGCGTGGCCTGTTCGG‑TGTGCCCCGGCGGGGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCGCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCGGTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTACAGCTg < 2:1032612/288‑1 (MQ=255) cATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTCCAGGGTTCAGCCGGGGTACGCATCGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGG‑TGTGCCCCGGCGGGGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCGCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCGGTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGaa < 1:327386/258‑1 (MQ=38) agtggcGCAGTATGGCGGTAGCATTGTCCAGGGTTCAGCCGGGGTACGCATCGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGG‑TGTGCCCCGGCGGGGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCGCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCGGTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTACAGCTgcg < 2:385022/283‑1 (MQ=37) gtcgTATGGCGGTAGCATTGTCCAGGGTTCAGCCGGGGTACGCCTCGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGG‑TGTGCCCCGGCGGGGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCGCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCGGTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTACAGCTGCGCGATaa < 1:620394/285‑1 (MQ=37) aggaTGGCGGTAGCATTGTCCCGGGTTCAGCCGGGGTACGCATCGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGG‑TGTGCCCCGGCGGGGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCGCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCGGTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTACAGCTg < 1:756420/275‑1 (MQ=37) tGGCGGTAGCATTGTCCAGGGTTCAGCCGGGGTACGCATCGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGG‑TGTGCCCCGGCGGGGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCGCTGCTCGGTGCCACGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACACCAGTTCCCGGACAAAAACGCCCGCGCCTGTTGGGAGCCTCCGCCCCGGCGGGAACATTCCTGCCGATATGCGCCTCCGGCTGCGCCACAacaccacg > 2:693644/1‑285 (MQ=11) 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aGCCGGGGTACGCATCGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGG‑TGTGCCCCGGCGGGGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCGCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCGGTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGatat < 1:278401/237‑1 (MQ=37) aGCCGGGGTACGCATCGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGG‑TGTGCCCCGGCGGGGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCGCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCGGTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTACAGCTGCGCGATAacaca > 1:291401/1‑262 (MQ=35) aGCCGGGGTACGCATCGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGG‑TGTGCCCCGGCGGGGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCGCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCGGTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTACAGCTGCGCGATAACACACTTAAACTCAGTGATAACGGCGGCAgc > 2:173365/1‑288 (MQ=25) aGCCGGGGTACGCATCGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGG‑TGTGCCCCGGCGGGGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCGCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCGGTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTACAGCTGCGCGATAACACACTGATACTCAGTGATAACGGCGGCAGa > 1:503395/1‑289 (MQ=35) aGCCGGGGTACGCATCGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGG‑TGTGCCCCGGCGGGGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCGCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCGGTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCCGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTACAGCTCcgcg > 1:713012/1‑254 (MQ=25) gggTCCGCATCGGTGCCCCCTCCGGCGTGGCTTGTTCGG‑TGTGCGCCGGCGGGGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCGGCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTTCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCGGTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTACAGCTGCGCGATAACACACTGATACTCAGTGATAACGGCGGCAGAAGcc < 2:1145016/288‑1 (MQ=255) 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ggTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGG‑TGTGCCCCGGCGGGGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCGCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTACCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCGGTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTACAGCTGCGCGATAACACACTGATACTCAGTGATAACGGCGGCa < 1:869931/271‑1 (MQ=18) ggTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGG‑TGTGCCCCGGCGGGGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCGCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTACCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCGGTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTACAGCTGCGCGATAACACACTGATACTCAGTGATAACGGCGGCa > 2:869931/1‑271 (MQ=18) ccACCGGCGTGGCCTGTTCGG‑TGTGCCCCGGCGGGGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCGCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCGGTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTACAGCTGCGCGATAacacac > 2:408194/1‑240 (MQ=33) ccACCGGCGTGGCCTGTTCGG‑TGTGCCCCGGCGGGGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCGCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCGGTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTACAGCTGCGCGATAacacac < 1:408194/240‑1 (MQ=33) aacGGCGTGGCCTGTTCGG‑GGTGCCACGGCGGGGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCGCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCTCTGCCGTTCATTCTCTCCCCCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCGGTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTACAGCTGCGCGATAACACACTGATACTCAGTGATAACGGCGGCAGAAGCCTGTATTTTGAGCACCTGTTTc < 1:992777/287‑1 (MQ=18) aCCGGCGTGGCCTGTTCGG‑TGTGCCCCGGCGGGGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCGCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCGGTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTACAGCTGCGCGATAACACACTGATACCCAGTGATAACGGCGGCAGAAGCCGTGATTTTGAGCACCTGttt > 2:514316/1‑288 (MQ=18) 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tgtgCCCCGGCGGGGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCGCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCGGTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTACAGCTGCGCGATAACACACTGATACTCAGTGATAACGGCGGCa > 2:1070445/1‑243 (MQ=33) cccGGCGGGGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCGCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCGGTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTACAGCTGCGCGATAACACACTGATACTCAGTGATAACGGCGGCAGAAGCCTGTATTTTGAGCACCTGTTTCCCGGTg > 1:1014894/1‑271 (MQ=33) cccGGCGGGGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCGCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCGGTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTACAGCTGCGCGATAACACACTGATACTCAGTGATAACGGCGGCAGAAGCCTGTATTTTGAGCACCTGTTTCCCGGTg < 2:1014894/271‑1 (MQ=33) 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ccGCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCGGTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTACAGCCGCGCGATAACACACTGATACTCAGTGATAACGGCGGCAGAAGCCTGTATTTTGAGCACCTGTTTCCCGGTGAGGACGGTTACAGCCGCAGCGAGTCACTGTGGCTGGTGCGCGGCGGCGTgg < 1:1107221/289‑1 (MQ=17) ggTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCGGTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTACAGCTGCGCGATAACACACTGATACTCAGTGATAACGGCGGCAGAAGCCTGTATTTTGAGCACCTGTTTCCCGGTGAGGACGGTTACAGCCGCAGCGAGTCACTGTGGCTGGTGCGCGGCGGCGTGGCGAAACTgg < 1:514316/289‑1 (MQ=31) tGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCGGTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTACAGCTGCGCGATAACACACTGATACTCAGTGATAACGGCGGCAGAAGCCTGTATTTTGAGCACCTGTTTCCCGGTGAGGACGGTTACAGCCGCAGCGAGTc < 1:299772/252‑1 (MQ=31) tGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCGGTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTACAGCTGCGCGATAACACACTGATACTCAGTGATAACGGCGGCAGAAGCCTGTATTTTGAGCACCTGTTTCCCGGTGAGGACGGTTACAGCCGCAGCGAGTc > 2:299772/1‑252 (MQ=31) aGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCGGTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTACAGCTGCGCGATAACACACTGATACTCAGTGATAACGGCGGCAGAAGCCTGTATTTTGAGCACCTGTTTCCCGGTGAGGACGGTTACAGCCGCAGCGAGTCACTGTGGCTGGTGCGCGGCGGCGTGGCGAAACTGGATGAAgg > 1:1178121/1‑289 (MQ=31) cTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCATCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCGGTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTACAGCTGCGCGATAACACACTGATACTCAGTGATAACGGCGGCAGAAGCCTGTATTTTGAGCACCTGTTTCCCGGTGAGGACGGTTACAGCCGCAGCGAGTCACTGTGGCTGGTGCGCGGCGGCGTGGCGAAACTGGATGAAGGCCAcc > 2:1124171/1‑289 (MQ=14) cTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCGGTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTACAGCTGCGCGATAACACACTGATACTCAGTGATAACGGCGGCAGAAGCCTGTATTTTGAg < 1:560127/201‑1 (MQ=31) cTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCGGTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTACAGCTGCGCGATAACACACTGATACTCAGTGATAACGGCGGCAGAAGCCTGTATTTTGAg > 2:560127/1‑201 (MQ=31) cTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCGGTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTACAGCTGCGCGATAACACACTGATACTCAGTGATAACGGCGGCAGAAGCCTGTATTTTGAGCACCTGTTTCCCGGTGAGGACGGTTACAGCCGCAGCGAGTCACTGTGGCTGGTGCTCGGCGGCGTGGCGAAACTGGATGAAGGTCAcc > 1:479765/1‑289 (MQ=14) cccGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCGGTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTACAGCTGCGCGATaa > 2:123092/1‑152 (MQ=31) cccGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCGGTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTACAGCTGCGCGATaa < 1:123092/152‑1 (MQ=31) cccggcccgCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCGGTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTACAGCTGCGCGATAACACACTGATACTCAGTGATAACGGCGGCAGACGCCTGTATTTTGAGCACCTGTTTCCCGGTGCGGACGGTTACAGCCGCAGCGAGTCACTGTGGCTGGTGGGCGGCGGCTTGGGGAAATTGAATGAAGGTCACAGGCTGGCCGCACTCGGGCAGGGGCTg > 2:798519/1‑288 (MQ=11) ggcccgCGGCGGTTCCTTCCCGCCCGCACCTCCCGCAGTTACCGGACAAAAACGCCGGGGCCGGTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTACAGCTGCGCGATAACACACTGATACTCAGTGATAACGGCGGCAGAAGCCTGTATTTTGAGCACCTGTTTCCCGGTGAGGACGGTTACAGCCGCAGCGAGTCACTGTGGCTGGTGCGCGGCGGCGTGGCGAAACTGGATGAAGGTCACCGGCTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCgg < 2:1188272/289‑1 (MQ=255) gCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCGGTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTACAGCTGCGCGATAACACACTGATACTCAGTGATAACGGCGGCAGAAGCCTGTATTTTGAGCACCTGTTTCCCGGTGAGGACGGTTACAGCCGCAGCGAGTCACTGTGGCTGGTGCGCGGCGGCGTGGCGAAACTGGATGAAGGTCACCGGCTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGgaagaa < 1:798519/289‑1 (MQ=31) atccccccccGCCCCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCGGTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTACAGCTGCGCGATAACACACTGATACTCAGTGATAACGGCGGCAGAAGCCTGTATTTTGAGCACCTGTTTCCCGGTGAGGACGGTTACAGCCGCAGCGAGTCACTGTGGCTGGTGCGCGGCGGCGTGGCGAAACTGGATGAAGGTCACCGGCTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTaa < 2:1178121/282‑1 (MQ=1) | CAAATAACCCGATAAAACAAGGATGAGCAGATGAGCGGAAAACCGGCGGCGCGTCAGGGCGACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTCCAGGGTTCAGCCGGGGTACGCATCGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGG‑TGTGCCCCGGCGGGGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCGCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCGGTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTACAGCTGCGCGATAACACACTGATACTCAGTGATAACGGCGGCAGAAGCCTGTATTTTGAGCACCTGTTTCCCGGTGAGGACGGTTACAGCCGCAGCGAGTCACTGTGGCTGGTGCGCGGCGGCGTGGCGAAACTGGATGAAGGTCACCGGCTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAA > NZ_CP009273/725009‑725543 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |