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cTTATTGGTAGCGGTTACAATATAATTATATTAGTTACTATGTAAAGGAGTCTGAAATGACTGATACTGTAAGCTTAAAAGTACGAGTTCAAAAACTTGGTACTGCATTATCTAATATGGTAATGCCCAATATTCCTGTTTTAATTGc < 1:1529269/148‑1 (MQ=255) cTTATTGGTAGCGGTTACAATATAATTATATTAGTTACTATGTAAAGGAGTCTGAAATGACTGATACTGTAAGCTTAAAAGTACGAGTTCAAAAACTTGGTACTGCATTATCTAATATGGTAATGCCCAATATTCCTGTTTTAATTGc < 1:11270054/148‑1 (MQ=255) tGGTAGCGGTTACAATATAATTATATTAGTTACTATGTAAAGGAGTCTGAAATGACTGATACTGTAAGCTTAAAAGTACGAGTTCAAAAACTTGGTACTGCATTATCTAATATGGTAATGCCCAATATTCCTGTTTTAATTGCCTggg > 1:9283007/1‑148 (MQ=255) tGGTAGCGGTTACAATATAATTATATTAGTTACTATGTAAAGGAGTCTGAAATGACTGATACTGTAAGCTTAAAAGTACGAGTTCAAAAACTTGGTACTGCATTATCTAATATGGTAATGCCCAATATTCCTGTTTTAATTGCCTggg < 1:8537208/148‑1 (MQ=255) ggTAGCGGTTACAATATAATTATATTAGTTACTATGTAAAGGAGTCTGAAATGACTGATACTGTAAGCTTAAAAGTACGAGTTCAAAAACTTGGTACTGCATTATCTAATATGGTAATGCCCAATATTCCTGTTTTAATTGCCTgggg > 1:1824506/1‑148 (MQ=255) ggTAGCGGTTACAATATAATTATATTAGTTACTATGTAAAGGAGTCTGAAATGACTGATACTGTAAGCTTAAAAGTACGAGTTCAAAAACTTGGTACTGCATTATCTAATATGGTAATGCCCAATATTCCTGTTTTAATTGCCTgggg < 1:5953023/148‑1 (MQ=255) gTAGCGGTTACAATATAATTATATTAGTTACTATGTAAAGGAGTCTGAAATGACTGATACTGTAAGCTTAAAAGTACGAGTTCAAAAACTTGGTACTGCATTATCTAATATGGTAATGCCCAATATTCCTGTTTTAATTGCCTggggg < 1:7645989/148‑1 (MQ=255) tAGCGGTTACAATATAATTATATTAGTTACTATGTAAAGGAGTCTGAAATGACTGATACTGTAAGCTTAAAAGTACGAGTTCAAAAACTTGGTACTGCATTATCTAATATGGTAATGCCCAATATTCCTGTTTTAATTGCCTgggggg > 1:8007799/1‑148 (MQ=255) aGCGGTTACAATATAATTATATTAGTTACTATGTAAAGGAGTCTGAAATGACTGATACTGTAAGCTTAAAAGTACGAGTTCAAAAACTTGGTACTGCATTATCTAATATGGTAATGCCCAATATTCCTGTTTTAATTGGCTGGGGGgt > 1:2801698/1‑148 (MQ=255) cGGTTACAATATAATTATATTAGTTACTATGTAAAGGAGTCTGAAATGACTGATACTGTAAGCTTAAAAGTACGAGTTCAAAAACTTGGTACTGCATTATCTAATATGGTAATGCCCAATATTCCTGTTTTAATTGCCTGGGGGgtgt > 1:8662774/1‑148 (MQ=255) cGGTTACAATATAATTATATTAGTTACTATGTAAAGGAGTCTGAAATGACTGATACTGTAAGCTTAAAAGTACGAGTTCAAAAACTTGGTACTGCATTATCTAATATGGTAATGCCCAATATTCCTGTTTTAATTGCCTGGGGGgtgt > 1:4871538/1‑148 (MQ=255) | TCATGATGTCGTCAGTTCGAGTCTGACATCCGCAGTAACTAAGTCACCTAAGGGTGACTTTTTTTATTTTATAAATTTCATTAATAAATCTTGGCACCTCCTTTTGTGTCAGGATTTTTATTTACAGTCTTATTGGTAGCGGTTATAATATAATTATATTAGTTACTATGTAAAGGAGTCTGAAATGACTGATACTGTAAGCTTAAAAGTACGAGTTCAAAAACTTGGTACTGCATTATCTAATATGGTAATGCCCAATATTCCTGTTTTAATTGCCTGGGGGGTGTTGA > NC_009004/26310‑26599 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |