| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_009004 | 1,660,056 | (T)7→8 | intergenic (‑602/+100) | LLMG_RS08470 ← / ← recN | TMEM175 family protein/DNA repair protein RecN |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_009004 | 1,660,049 | 1 | . | T | 97.3% | 2087.4 / 35.8 | 552 | intergenic (‑595/+107) | LLMG_RS08470/recN | TMEM175 family protein/DNA repair protein RecN |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (7/8); new base T (238/298); total (245/307) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.43e-01 | |||||||||||
Only 100 of 641 total aligned reads displayed.
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |