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Only 100 of 695 total aligned reads displayed.
AAGAATTAGGTATTGTTGACCTTTTTAAAGAAAAAACTCAAGGGGATGCAGAAGACCTTTCTCATGCCTTGGCATTTACATCACCTAAAAAGATTTACTCTGCAGACTACTCTGATGCAAGCGACGCTGACCTCGTTGTCTTGACTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_009004/1081012‑1081158‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GACCTTGTTGAAAAAAATCTTCGTATTACTAAAGATGTTGTAACTAAAATTGTTGCTTCAGGATTCAAAGGAATCTTCCTCGTTGCTGCTAACCCAGTTGACATCTTGACATACGCAACTTGGAAATTCTCTGGTTTCCCTAAAAAC > NC_009004/1081194‑1081340 |||||||| ATTAGGTATTGTTGACCTTTTTAAAGAAAAAACTCAAGGGGATGCAGAAGACCTTTCTCATGCCTTGGCATTTACATCACCTAAAAAGATTTACTCTGCAGACTACTCTGATGCAAGCGACGCTGACCTCGTTGTCTTGACTTAAGAA > 1:6935233/1‑148 ATTAGGTATTGTTGACCTTTTTAAAGAAAAAACTCAAGGGGATGCAGAAGACCTTTCTCATGCCTTGGCATTTACATCACCTAAAAAGATTTACTCTGCAGACTACTCTGATGCAAGCGACGCTGACCTCGTTGTCTTGACTTAAGAA < 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1:3552199/1‑148 CTTAAGAATTCGACCTTGTTGAAAAAAATCTTCGTATTACTAAAGATGTTGTAACTAAAATTGTTGCTTCAGGATTCAAAGGAATCTTCCTCGTTGCTGCTAACCCAGTTGACATCTTGACATACGCAACTTGGAAATTCTCTGGTTT > 1:209753/1‑148 TTAAGAATTCGACCTTGTTGAAAAAAATCTTCGTATTACTAAAGATGTTGTAACTAAAATTGTTGCTTCAGGATTCAAAGGAATCTTCCTCGTTGCTGCTAACCCAGTTGACATCTTGACATACGCAACTTGGAAATTCTCTGGTTTC < 1:9095957/148‑1 AAGAATTCGACCTTGTTGAAAAAAATCTTCGTATTACTAAAGATGTTGTAACTAAAATTGTTGCTTCAGGATTCAAAGGAATCTTCCTCGTTGCTGCTAACCCAGTTGACATCTTGACATACGCAACTTGGAAATTCTCTGGTTTCCC > 1:7376929/1‑148 AAGAATTCGACCTTGTTGAAAAAAATCTTCGTATTACTAAAGATGTTGTAACTAAAATTGTTGCTTCAGGATTCAAAGGAATCTTCCTCGTTGCTGCTAACCCAGTTGACATCTTGACATACGCAACTTGGAAATTCTCTGGTTTCCC > 1:3871117/1‑148 ATTCGACCTTGTTGAAAAAAATCTTCGTATTACTAAAGATGTTGTAACTAAAATTGTTGCTTCAGGATTCAAAGGAATCTTCCTCGTTGCTGCTAACCCAGTTGACATCTTGACATACGCAACTTGGAAATTCTCTGGTTTCCCTAAA > 1:5414373/1‑148 TTCGACCTTGTTGAAAAAAATCTTCGTATTAGTAAAGATGTTGTAACTAAAATTGTTGCTTCAGGATTCAAAGGAATCTTCCTCGTTGCTGCTAACCCAGTTAACATCTTGACATACGCAACTTGGAAATTCTCTGGTTTCCCTAAAA > 1:10353658/1‑148 TCGACCTTGTTGAAAAAAATCTTCGTATTACTAAAGATGTTGTAACTAAAATTGTTGCTTCAGGATTCAAAGGAATCTTCCTCGTTGCTGCTAACCCAGTTGACATCTTGACATACGCAACTTGGAAATTCTCTGGTTTCCCTAAAAA < 1:9956277/148‑1 |||||||| AAGAATTAGGTATTGTTGACCTTTTTAAAGAAAAAACTCAAGGGGATGCAGAAGACCTTTCTCATGCCTTGGCATTTACATCACCTAAAAAGATTTACTCTGCAGACTACTCTGATGCAAGCGACGCTGACCTCGTTGTCTTGACTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_009004/1081012‑1081158‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GACCTTGTTGAAAAAAATCTTCGTATTACTAAAGATGTTGTAACTAAAATTGTTGCTTCAGGATTCAAAGGAATCTTCCTCGTTGCTGCTAACCCAGTTGACATCTTGACATACGCAACTTGGAAATTCTCTGGTTTCCCTAAAAAC > NC_009004/1081194‑1081340 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |