Predicted mutation | ||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_009004 | 1,167,414 | 0 | T | G | 99.7% | 1555.6 / NA | 392 | intergenic (+64/‑55) | LLMG_RS06065/LLMG_RS06070 | hypothetical protein/trypsin‑like peptidase domain‑containing protein |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.97e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 396 total aligned reads displayed.
TGTCCTCCTGGAAGCATTTTGACAGTTTATAGGAGATATAACCCTAATAATGGACAGCACTTTTTCACAAATAATTTTTAGCGAAGCGGCCTACTTAGATAGTATTGGTTGGCAGAACGAAGGAATTGCTTTTGAATTTAATTTTCCTAGTCATTGGGATGGGCCAGTAAGACCGGCTTAAGTAAAGGAAAGATAAGATATGAAAAAACTTAAGATTGTTTTAACAATATTTTTATTAATGTTTGTTAGTGGTGGCTATTCTGTTTTGGCAAATACCCAGTCATTTATT > NC_009004/1167270‑1167558 | cctcctGGAAGCATTTTGACAGTTTATAGGAGATATAACCCTAATAATGGACAGCACTTTTTCACAAATAATTTTTAGCGAAGCGGCCTACTTAGATAGTATTGGTTGGCAGAACGAAGGAATTGCTTCTCAATTTAATTTGCCTAGt > 1:2071026/1‑148 (MQ=255) ctGGAAGCATTTTGACAGTTTATAGGAGATATAACCCTAATAATGGACAGCACTTTTTCACAAATAATTTTTAGCGAAGCGGCCTACTTAGATAGTATTGGTTGGCAGAACGAAGGAATTGCTTTTGAATTTAATTTGCCTAGTCAtt < 1:11632814/148‑1 (MQ=255) tGGAAGCATTTTGACAGTTTATAGGAGATATAACCCTAATAATGGACAGCACTTTTTCACAAATAATTTTTAGCGAAGCGGCCTACTTAGATAGTATTGGTTGGCAGAACGAAGGAATTGCTTTTGAATTTAATTTGCCTAGTCATTg > 1:4629931/1‑148 (MQ=255) ggAAGCATTTTGACAGTTTATAGGAGATATAACCCTAATAATGGACAGCACTTTTTCACAAATAATTTTTAGCGAAGCGGCCTACTTAGATAGTATTGGTTGGCAGAACGAAGGAATTGCTTTTGAATTTAATTTGCCTAGTCATTgg < 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |