| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | CP009273 | 4,630,235 | IS30 (+) +2 bp | coding (17‑18/141 nt) | yjjY → | uncharacterized protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 4497276 = | NA (NA) | 359 (0.880) | 164/294 | 0.9 | 99.4% | noncoding (1221/1221 nt) | IS30 | repeat region |
| ? | CP009273 | 4630235 = | 2 (0.000) | coding (17/141 nt) | yjjY | uncharacterized protein | |||||
| * | ? | CP009273 | = 4498496 | NA (NA) | 393 (0.970) | 182/292 | 0.3 | 99.5% | noncoding (316/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | CP009273 | = 4630236 | 2 (0.010) | coding (18/141 nt) | yjjY | uncharacterized protein | |||||
Only 100 of 760 total aligned reads displayed.
ACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACAACATCATTAGCTTGGTCGTGGGTACTTTCCCTCAGGACCCGACAGTGTCAAAAACGGCTGTCATCCTAACCATTTTAACAGCAACATAACAGGCTAAGAGGGGCCGGACACCCAA > CP009273/4630087‑4630385 | cctaaaaagacatgtcttgcccaatatactcaacatgaactagatctggttgctgctcagctaaacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaAt > 1:1037223‑M2/149‑150 (MQ=255)aCTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAAt > 2:2502030/1‑150 (MQ=255) cTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATt < 1:6496160‑M2/150‑2 (MQ=255) taaaaagacatgtcttgcccaatatactcaacatgaactagatctggttgctgctcagctaaacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTg < 2:3551720‑M2/4‑1 (MQ=255) aaagacatgacgtgcccaatatcctcaacatgcactagatctggttgctgctcagctaaacaacagaccgagacagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGt < 1:1922761‑M2/7‑1 (MQ=255) cAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattc < 2:1793235‑M2/150‑10 (MQ=255) acatgtcttgcccaatatactcaacatgaactagatctggttgctgctcagctaaacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTCtt < 1:1617519‑M2/11‑1 (MQ=255) aTAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattg > 2:4365009‑M2/1‑136 (MQ=255) ttgcccaatatactcaacatgaactagatctggttgctgctcagctaaacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagagtgaatctacaATGGAGTTCTTGATGCAc > 2:3727992‑M2/133‑150 (MQ=255) aaGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggt > 1:6366522‑M2/1‑134 (MQ=255) tgtgCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacg < 2:1702679‑M2/150‑22 (MQ=255) tgtgCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacg < 2:1611887‑M2/150‑22 (MQ=255) gCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaa > 1:6215263‑M2/1‑126 (MQ=255) atactcaacatgaactagatctggttgctgctcagctaaacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCa > 2:2666923‑M2/124‑150 (MQ=255) tactcaacatgaactagatctggttgctgctcagctaaacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCaa > 1:521796‑M2/123‑150 (MQ=255) gggTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacag < 1:6813562‑M2/150‑28 (MQ=255) cTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttat > 1:6449492‑M2/1‑119 (MQ=255) atgaactagatctggttgctgctcagctaaacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgactctacaATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTcaaca > 2:783625‑M2/115‑150 (MQ=255) aTGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtga < 1:5373871‑M2/150‑36 (MQ=255) aactagatctggttgctgctcagctaaacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAacaaca < 2:6142312‑M2/39‑1 (MQ=255) tttGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtgaaaa < 1:5087888‑M2/150‑39 (MQ=255) tagatctggttgctgctcagctaaacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACAAcatca > 2:2240779‑M2/109‑150 (MQ=255) gCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtgaaaacat > 1:268062‑M2/1‑109 (MQ=255) agatctggttgctgctcagctaaacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTcaac > 1:4388653‑M2/108‑142 (MQ=255) gatctggttgctgctcagctaaacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACAACATCAtt < 2:4076404‑M2/44‑1 (MQ=255) tACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtgaaaacatgg > 1:4230359‑M2/1‑107 (MQ=255) atctgttttctgctcagattaacaaaagaccgagaaatacactgaagtacaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacctattgaatctacaATTGAGTACTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACAACATCATTa < 2:488022‑M2/45‑1 (MQ=255) tctggttgctgctcagctaaacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACAACATCATTAg > 2:3977057‑M2/105‑150 (MQ=255) ccTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtgaaaacatgggg > 1:2013296‑M2/1‑105 (MQ=255) tggttgctgctcagctaaacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACAACATCATTAGCt < 1:1293870‑M2/48‑1 (MQ=255) cTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACACAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtgaaaacatggggt > 2:2318598‑M2/1‑104 (MQ=255) aaTTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtgaaaacttggggttgc < 2:5248711‑M2/150‑50 (MQ=255) aaTTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtgaaaacatggggttgc > 2:6337012‑M2/1‑101 (MQ=255) tGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtgaaaacatggggttgcgga < 1:2119003‑M2/150‑53 (MQ=255) gCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtgaaaacatggggttgcggag < 1:4826911‑M2/150‑54 (MQ=255) gctcagctaaacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACAACATCATTAGCTTGGTCGTg > 2:1052272‑M2/95‑150 (MQ=255) aaCTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtgaaaacatggggttgcggaggtt < 2:5599905‑M2/150‑57 (MQ=255) agctaaacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACAACATCATTAGCTTGGTCGTGGGTa < 1:3995521‑M2/60‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |