Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 580,727 | 0 | G | A | 34.7% | 510.4 / inf | 450 | H121H (CAC→CAT) | ompT | DLP12 prophage; outer membrane protease VII (outer membrane protein 3b) |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (147/147); new base A (79/77); total (226/224) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.21e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 471 total aligned reads displayed.
CTGTAGATATAGGAACCACCTCTGGCTGTAAAGCTATAACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAAT > CP009273/580578‑580876 | cTGTAGATATAGGAACCACCTCTGGCTGTAAAGCTATAACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAggg < 2:1248552/150‑1 (MQ=255) cTGTAGATATAGGAACCACCTCTGGCTGTAAAGCTATAACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAggg < 1:2906659/150‑1 (MQ=255) cTGTAGATATAGGAACCACCTCTGGCTGTAAAGCTATAACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAggg < 2:5056704/150‑1 (MQ=255) tGTAGATATAGGAACCACCTCTGGCTGTAAAGCTATAACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTTATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGgt < 2:5548080/150‑1 (MQ=255) tAGATATAGGAACCACCTCTGGCTGTAAAGCTATAACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGgtgt > 1:3369259/1‑150 (MQ=255) tataGGAACCACCTCTGGCTGTAAAGCTATAACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTAc < 1:5794554/150‑1 (MQ=255) gAACCACCTCTGGCTGTAAAGCTATAACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCGAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCa < 1:6024881/150‑1 (MQ=255) ccaccTCTGGCTGTAAAGCTATAACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATcc < 1:5919039/150‑1 (MQ=255) accTCTGGCTGTAAAGCTATAACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGt < 2:1544217/150‑1 (MQ=255) cactGGCTGTAAAGCTATAACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTcc < 2:5165659/148‑1 (MQ=255) tctGGCTGTAAAGCTATAACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCa < 1:4803965/150‑1 (MQ=255) tGGCTGTAAAGCTATAACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAgg < 1:6724056/150‑1 (MQ=255) tGGCTGTAAAGCTATAACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAgg < 1:5148002/150‑1 (MQ=255) agcattAAAACTGTAACGGCTTTCCTGATAACCTGCCATAATAGCAAGGCGATAATCAGATTCTTTTAAAAACCAGCCTTTAACGTTCAAATCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGt < 1:2397141/145‑1 (MQ=255) ttAAAACTGTAACGGCTTTCCTGATAACCTGCCATAATAGCAAGGCGATAATCAGATTCTTTTAAAAACCAGCCTTTAACGTTCAAATCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCg > 2:4034800/2‑150 (MQ=255) ttAAAACTGTAACGGCTTTCCTGATAACCTGCCATAATAGCAAGGCGATAATCAGATTCTTTTAAAAACCAGCCTTTAACGTTCAAATCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCg < 2:5633341/149‑1 (MQ=255) gTAAAGCTATAACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCg < 2:3810714/150‑1 (MQ=255) tAAAACTGTAACGGCTTTCCTGATAACCTGCCATAATAGCAAGGCGATAATCAGATTCTTTTAAAAACCAGCCTTTAACGTTCAAATCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCgg < 2:967380/150‑1 (MQ=255) aaactgtaACGGCTTTCCTGATAACCTGCCATAATAGCAAGGCGATAATCAGATTCTTTTAAAAACCAGCCTTTAACGTTCAAATCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCggga < 1:5401476/144‑2 (MQ=255) aaactgtaACGGCTTTCCTGATAACCTGCCATAATAGCAAGGCGATAATCAGATTCTTTTAAAAACCAGCCTTTAACGTTCAAATCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCggga > 1:1576457/7‑149 (MQ=255) tcTATAACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGtt < 2:5235101/149‑1 (MQ=255) tataACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTAc > 2:1997089/1‑150 (MQ=255) ataACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACt < 1:1734684/150‑1 (MQ=255) taACGGCTTTCCTGATAACCTGCCATAATAGCAAGGCGATAATCAGATTCTTTTAAAAACCAGCCTTTAACGTTCAAATCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCgggagtcccg < 2:4146383/150‑8 (MQ=255) aaCGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTgg > 2:1391830/1‑150 (MQ=255) aaCGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTgg > 1:2579914/1‑150 (MQ=255) cGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGaa < 1:1082093/150‑1 (MQ=255) ggCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAat > 1:4242865/1‑150 (MQ=255) cTTTCCTGATAACCTGCCATAATAGCAAGGCGATAATCAGATTCTTTTAAAAACCAGCCTTTAACGTTCAAATCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAatcc < 1:4168009/150‑1 (MQ=255) tttCCTGATAACCTGCCATAATAGCAAGGCGATAATCAGATTCTTTTAAAAACCAGCCTTTAACGTTCAAATCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAatcca > 2:3059051/1‑150 (MQ=255) tttCCTGATAACCTGCCATAATAGCAAGGCGATAATCAGATTCTTTTAAAAACCAGCCTTTAACGTTCAAATCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAatcca > 2:1474135/1‑150 (MQ=255) tttCCTGATAACCTGCCATAATAGCAAGGCGATAATCAGATTCTTTTAAAAACCAGCCTTTAACGTTCAAATCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAatcca > 1:3978637/1‑150 (MQ=255) ttCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAatccat > 2:2913911/1‑150 (MQ=255) ttCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAatccat > 1:3513516/1‑150 (MQ=255) ttCCTGATAACCTGCCATAATAGCAAGGCGATAATCAGATTCTTTTAAAAACCAGCCTTTAACGTTCAAATCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAatccat < 1:553852/150‑1 (MQ=255) tCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAatccatc < 1:229404/150‑1 (MQ=255) cTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAAtccatcca < 2:3210031/150‑1 (MQ=255) cTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAAtccatcca > 2:1775913/1‑150 (MQ=255) tCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTg > 1:1811642/1‑150 (MQ=255) gCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTGTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCg > 2:2289510/1‑150 (MQ=255) ccATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGa < 2:6209537/150‑1 (MQ=255) aGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCata < 1:3623732/150‑1 (MQ=255) tcacAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGCGGAGCCAGCCTTTGTTATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGTGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCGTCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCatatg > 2:2405688/4‑149 (MQ=255) tCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATAtt < 1:2213142/150‑1 (MQ=255) cccAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTg > 2:1595111/1‑150 (MQ=255) cGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCt > 1:6540954/1‑150 (MQ=255) cGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCt < 2:1092005/150‑1 (MQ=255) gTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCg < 1:5060844/150‑1 (MQ=255) gTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCg < 1:1851594/150‑1 (MQ=255) gTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCga < 1:3302491/150‑1 (MQ=255) gTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGt < 1:921808/150‑1 (MQ=255) gTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGt > 2:5356455/1‑150 (MQ=255) ttGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGtt < 1:814307/150‑1 (MQ=255) aaaaaccagccTTTATCGTTCAAATCAAATTCGTTGGCATATTTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTc < 2:6367764/145‑1 (MQ=255) ggagCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTGGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTcc < 2:464009/150‑1 (MQ=255) caatcctgccTTTAACGTTCACATCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTcc < 2:2206575/143‑1 (MQ=255) gagCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTcca > 2:2059662/1‑150 (MQ=255) agccagccTTTGATATTCAGATCATATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTcctg > 2:3408472/1‑148 (MQ=255) agccagccTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTccag > 2:3718123/1‑150 (MQ=255) aaccagccTTTAACGTTCAAATCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTccag > 2:1810801/3‑150 (MQ=255) accagccTTTAACGTTCAAATCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTccagc > 1:5042938/2‑150 (MQ=255) ccagccTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTccagcc < 1:644245/150‑1 (MQ=255) ccagccTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTccagcc > 1:2011184/1‑150 (MQ=255) ccagccTTTAACGTTCAAATCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTccagcc > 1:1660514/1‑150 (MQ=255) ccagccTTTAACGTTCAAATCAAATTCGTAGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTccagcc > 2:1086872/1‑150 (MQ=255) cagccTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTccagcca > 2:300460/1‑150 (MQ=255) cagccTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTccagcca > 2:6754963/1‑150 (MQ=255) tttaacgttCAAATCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCagctgc > 1:4661091/8‑150 (MQ=255) tttaacgttCAAATCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCagctgc > 1:6295385/8‑150 (MQ=255) tttaacgttCAAATCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATGGAGAGTGGTCCAGCCagctgc > 1:4464515/8‑150 (MQ=255) tttGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCagcagc > 2:2581276/1‑150 (MQ=255) ttaactttCAAATCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCTGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCagctgca < 1:3232201/144‑2 (MQ=255) ttaacgttCAAATCAAATTCGGTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACGATTGAGAGTGGTCCAGCCagctgca > 1:6166774/7‑149 (MQ=255) tGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGccc < 1:5644276/150‑1 (MQ=255) tatTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCga < 2:6807861/150‑1 (MQ=255) tatTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCga > 2:4913105/1‑150 (MQ=255) gttCAAATCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCAGCTGcaccaac > 1:787141/2‑147 (MQ=255) ttCAGATCAATTTCGTTGGGATAATTGCGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCGGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATAGAGGCTCTTGCGCCCTCGGCTGAGGTGAGTTGTCCAGCCGGCAGCCCCgatc > 1:5755212/1‑149 (MQ=255) ttCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCgata < 1:2763752/150‑1 (MQ=255) ttCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCgata > 2:5756967/1‑150 (MQ=255) tcaaatcaaaTTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCAGCTGcaccaacag > 1:4836104/1‑145 (MQ=255) caaaTCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCAGCTGCACCaacaga < 1:3107919/147‑1 (MQ=255) aaaTCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCAGCTGCACCaacagat < 2:2540423/148‑1 (MQ=255) aaTCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCAGCTGCACCaacagata < 1:6614724/149‑1 (MQ=255) tCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATc < 2:6426451/150‑1 (MQ=255) tCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCAGCTGCACCaacagataac > 2:4352008/1‑148 (MQ=255) aaaTTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCAGCTGCACCaacagataacca < 2:864220/150‑5 (MQ=255) ttCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCCGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTgggg < 1:3388362/150‑1 (MQ=255) ttCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTCTTGAGAGTGGTCCAGCCAGCTGCACCaacagataaccatgg > 2:6034908/1‑143 (MQ=255) gTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCAt < 1:1037819/150‑1 (MQ=255) tGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCa < 1:118414/150‑1 (MQ=255) ggCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCCGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCaa > 2:4794615/1‑150 (MQ=255) aTAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATc < 2:6526826/150‑1 (MQ=255) tAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATcc < 2:3527773/150‑1 (MQ=255) aTTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCa < 1:6327113/150‑1 (MQ=255) gTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCaattaa < 2:5968915/150‑1 (MQ=255) ctATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGAGATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCa < 2:2657040/149‑1 (MQ=255) tCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCt > 2:5851983/1‑150 (MQ=255) gtgtCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTtaat < 1:1407838/150‑1 (MQ=255) gtgtCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTtaat < 1:3775325/150‑1 (MQ=255) | CTGTAGATATAGGAACCACCTCTGGCTGTAAAGCTATAACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAAT > CP009273/580578‑580876 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |