Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 580,742 | 0 | C | T | 42.8% | 243.5 / inf | 541 | T116T (ACG→ACA) | ompT | DLP12 prophage; outer membrane protease VII (outer membrane protein 3b) |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (155/154); new base T (114/117); total (270/271) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.62e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 549 total aligned reads displayed.
CCACCTCTGGCTGTAAAGCTATAACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCGTTATT > CP009273/580593‑580891 | accTCTGGCTGTAAAGCTATAACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGt > 2:160837/1‑150 (MQ=255) agcattAAAACTGTAACGGCTTTCCTGATAACCTGCCATAATAGCAAGGCGATAATCAGATTCTTTTAAAAACCAGCCTGTAACGTTCAAATCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGt > 1:6645703/6‑150 (MQ=255) agcattAAAACTGTAACGGCTTTCCTGATAACCTGCCATAATAGCAAGGCGACAATCAGATTCTTTTAAAAACCAGCCTTTAACGTTCAAATCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGt < 1:4696295/145‑1 (MQ=255) attAAAACTGTAACGGCTTTCCTGATAACCTGCCATAATAGCAAGGCGATAATCAGATTCTTTTAAAAACCAGCCTTTAACGTTCAAATCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTcc > 1:6547612/3‑150 (MQ=255) ttAAAACTGTAACGGCTTTCCTGATAACCTGCCATAATAGCAAGGCGATAATCAGATTCTTTTAAAAACCAGCCTTTAACGTTCAATTCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCg > 2:2919136/2‑150 (MQ=255) ttAAAACTGTAACGGCTTTCCTGATAACCTGCCATAATAGCAAGGCGATAATCAGATTCTTTTAAAAACCAGCCTTTAACGTTCAAATCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCg < 2:5633341/149‑1 (MQ=255) gTAAAGCTATAACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCg < 2:3810714/150‑1 (MQ=255) aaactgtaACGGCTTTTCTGATAACCTGCCATAATAGCAAGGCGATAATCAGATTCTTTTAAAAACCAGCCTTTAACGTTCAAATCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCggga > 2:6278962/7‑149 (MQ=255) aaactgtaACGGCTTTCCTGATAACCTGCCATAATAGCAAGGCGATAATCAGATTCTTTTAAAAACCAGCCTTTAACGTTCAAATCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCggga < 2:3727253/144‑2 (MQ=255) aaGCTATAACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCTTCCAGGATCCgggg > 2:6793124/1‑150 (MQ=255) aaGCAATAACTGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGAGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCgggg < 2:5468830/150‑1 (MQ=255) cTATAACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTa > 1:1487792/1‑150 (MQ=255) cTATAACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTa > 2:4094177/1‑150 (MQ=255) tataACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTAc < 2:1089919/150‑1 (MQ=255) ataACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACt < 1:1734684/150‑1 (MQ=255) taACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTg > 1:4219488/1‑150 (MQ=255) cGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGaa > 1:271481/1‑150 (MQ=255) cGGATTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGaa < 2:5916554/150‑1 (MQ=255) gCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGTGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAatc < 2:4803302/150‑1 (MQ=255) cTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAatcc > 1:2134783/1‑150 (MQ=255) cTTTCCTGATAACCTGCCATAATAGCAAGGCGATAATCAGATTCTTTTAAAAACCAGCCTTTAACGTTCAAATCAAATTCGTTGGCATAATTAAGAAGTGTATAAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAatca > 2:6169187/1‑149 (MQ=255) tttCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAatcca < 2:3092078/150‑1 (MQ=255) ttCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAatccat > 1:3476574/1‑150 (MQ=255) ttCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAatccat < 1:182796/150‑1 (MQ=255) ccTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAatccatcc > 2:6002374/1‑150 (MQ=255) cTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAAtccatcca > 1:1631300/1‑150 (MQ=255) cTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAAtccatcca > 2:1775913/1‑150 (MQ=255) tGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAg > 1:5517245/1‑150 (MQ=255) atCCGGCCATGAGACCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGGATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACGGGAATCCATCCAGTCCt < 2:1998827/150‑1 (MQ=255) tGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCa < 1:5671019/150‑1 (MQ=255) gTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCatat < 2:5342363/150‑1 (MQ=255) tcacAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGCGGAGCCAGCCTTTGTTATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGTGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCGTCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCatatg > 2:2405688/4‑149 (MQ=255) aGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCa > 1:2870113/1‑150 (MQ=255) ggTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTc > 1:3170901/1‑150 (MQ=255) gTTCGTTGAGGAGCCAGACTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAAGTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCga < 2:1494551/150‑1 (MQ=255) tCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCgaga < 1:6296092/150‑1 (MQ=255) ttGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGtt < 1:811219/150‑1 (MQ=255) ttGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGtt > 2:23315/1‑150 (MQ=255) caatcctgccTTTAACGTTCACATCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTcc < 2:2206575/143‑1 (MQ=255) ccagccTTTAACGTTCAAATCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATCTTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTccagcc > 1:63360/1‑150 (MQ=255) ccagccTTTAACGTTCAAATCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTccagcc < 2:6487484/150‑1 (MQ=255) ccagccTTTAACGTTCAAATCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTccagcc < 1:848671/150‑1 (MQ=255) ccagccTTTAACGTTCAAATCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATGGAGAGTGGTcaagcc > 2:5211814/1‑150 (MQ=255) cagccTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTccagcca > 1:4010009/1‑150 (MQ=255) gccTTTAACGTTCAAATCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTGTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACGCTTGAGAGTGGTCcagccagc > 2:5800928/1‑150 (MQ=255) tttaacgttCAAATCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCagctgc > 1:4464486/8‑150 (MQ=255) tttaacgttCAAATCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCagctgc > 1:3549615/8‑150 (MQ=255) ttaacgttCAAATCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCagctgca < 1:5768159/144‑2 (MQ=255) ttaacgttCAAATCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCagctgca > 1:6166575/7‑149 (MQ=255) ttaacgttCAAATCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCACCCCCCGACTATTGTGAGTGGTCCAGCCagctgca > 2:920847/7‑149 (MQ=255) tGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGccc > 1:535723/1‑150 (MQ=255) gATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGcccc > 1:4349659/1‑150 (MQ=255) tatTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCga > 2:3048140/1‑150 (MQ=255) 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aCTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGc < 2:1849504/150‑1 (MQ=255) cTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCAGCTGCACCAACAGATAACCATGGATTCAGCTCCCAGTTAACGGCGCCTTTAAGAATGGcg < 1:1277675/150‑2 (MQ=255) cTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCa < 1:974808/150‑1 (MQ=255) tttCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCAGCTGCACCAACAGATAACCATGGATTCAGCTCCCAGTTAACGGCGCCTTTAAGAATGGcgg > 1:3073557/1‑148 (MQ=255) tttCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCAGCTGCACCAACAGATAACCATGGATTCAGCTCCCAGTTAACGGCGCCTTTAAGAATGGcgg > 2:4389047/1‑148 (MQ=255) ttCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCAGCTGCACCAACAGATAACCATGGATTCAGCTCCCAGTTAACGGCGCCTTTAAGAATggcggc > 2:1556928/1‑150 (MQ=255) ttCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCAGCTGCACCAACAGATAACCATGGATTCAGCTCCCAGTTAACGGCGCCTTTAAGAATggcggc < 1:597786/150‑1 (MQ=255) ttCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGc > 2:4043271/1‑150 (MQ=255) tCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCAGCTGCACCAACAGATAACCATGGATTCAGCTCCCAGTTAACGGCGCCTTTAAGAATGgcggcg > 1:3747157/1‑150 (MQ=255) tCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCAGCTGCACCAACAGATAACCATGGATTCAGCTCCCAGTTAACGGCGCCTTTAAGAATGgcggcg > 2:6620084/1‑150 (MQ=255) tCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCAGCTGCACCAACAGATAACCATGGATTCAGCTCCCAGTTAACGGCGCCTTTAAGAATGgcggcg > 1:3272024/1‑150 (MQ=255) tCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCg < 2:210053/150‑1 (MQ=255) aTCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCAGCTGCACCAACAGATAACCATGGATTCAGCTCCCAGTTAACGGCGCCTTTAAGAATGGCGGCGtt > 1:1879233/1‑150 (MQ=255) aTCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCACGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCAGCTGCACCAACAGATAACCATGGCTTCAGCTCCCTGTTAACGGCGCCTTTAAGAATGGCGGCGtt > 2:1438975/1‑150 (MQ=255) aTCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATACTTGCAGCGtt < 1:2459079/150‑1 (MQ=255) tCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCGTTa > 2:6539076/1‑150 (MQ=255) ccGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCGTTAt < 1:4802454/150‑1 (MQ=255) | CCACCTCTGGCTGTAAAGCTATAACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCGTTATT > CP009273/580593‑580891 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |