| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,802,100 | T→C | pseudogene (426/1178 nt) | ygaY → | pseudogene, major facilitator transporter superfamily;putative transport; Not classified; putative transport protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,802,100 | 0 | T | C | 99.7% | 1452.9 / ‑4.1 | 360 | pseudogene (426/1178 nt) | ygaY | pseudogene, major facilitator transporter superfamily;putative transport; Not classified; putative transport protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (166/193); total (166/194) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.83e-01 | |||||||||||
Only 100 of 380 total aligned reads displayed.
AGTCAGTCGCTGGCGATGATGATCCTCGGTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGTTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTGGCATTATGGCGTGGTCTGCCACAAATGAAATCAGAAACCCAC > CP009273/2801953‑2802246 | agtcagtcGCTGGCGATGATGATCCTCGGTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTctgctgctg > 1:5612492/1‑150 (MQ=255)agtcagtcGCTGGCGATGATGATCCTCGGTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTctgctgctg < 2:5639360/150‑1 (MQ=255) gtcagtcGCTGGCGATGATGATCCTCGGTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTgg > 1:5230234/1‑150 (MQ=255) gtcagtcGCTGGCGATGATGATCCTCGGTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTgg > 1:1818176/1‑150 (MQ=255) agtcGCTGGCGATGATGATCCTCGGTACGGCATTACCCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGa < 1:1247479/150‑1 (MQ=255) agtcGCTGGCGATGATGATCCTCGGTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGa > 2:4128613/1‑150 (MQ=255) tcGCTGGCGCTGATGATCCTCGGTTCGGCATTAACCGGTTTTTTCTCATTCGTGGCACATATTCTTGTTCCGCTGGCAGCTACGCTGGCTTAACCGGATAAACGCGGCAATGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATc < 2:2025999/150‑1 (MQ=255) ggCGATGATGATCCTCGGTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCt > 1:4143770/1‑150 (MQ=255) gCGATGATGATCCTCGGTACGGCATTCACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTg < 1:3956577/150‑1 (MQ=255) ccTCGGTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGt < 1:4255754/150‑1 (MQ=255) tCGGTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTg < 2:4488928/150‑1 (MQ=255) ggTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCCCAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGcc < 2:253319/150‑1 (MQ=255) ggTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGcc > 2:2325404/1‑150 (MQ=255) gttggtaaTTATCCGTTTTTTTGTCTGTCGTGGGATTTTTTATTGTTGCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCg < 1:3322422/143‑1 (MQ=255) gTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCg < 2:1349194/150‑1 (MQ=255) aCGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGa < 1:4748479/150‑1 (MQ=255) aCGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGa > 1:3659664/1‑150 (MQ=255) aCGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGGTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGa < 1:3927491/150‑1 (MQ=255) cGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGAt < 2:3364549/150‑1 (MQ=255) cATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGc > 1:3481488/1‑150 (MQ=255) aTTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCt > 1:621178/1‑150 (MQ=255) aTTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCt > 2:1791873/1‑150 (MQ=255) aaCCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGTGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGc > 2:1135073/1‑150 (MQ=255) aaCCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGc > 2:6019005/1‑150 (MQ=255) aCCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGGACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCg > 2:5728748/1‑150 (MQ=255) cGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGTTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGaa < 1:6366360/150‑1 (MQ=255) cGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGaa < 2:5103231/150‑1 (MQ=255) ggTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAAt > 2:5849280/1‑150 (MQ=255) ggTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAAt > 1:2030877/1‑150 (MQ=255) ggttATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAAtc > 2:5165170/3‑150 (MQ=255) gTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAAtc < 2:6283307/150‑1 (MQ=255) ttATTCTCAGTCGTGGCACAACTTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAAtctc < 2:5235604/150‑1 (MQ=255) tATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTcg < 2:4980061/150‑1 (MQ=255) aTTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTcgg < 2:4321241/150‑1 (MQ=255) aTTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTcgg > 1:5338825/1‑150 (MQ=255) ttCTCCGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTcggc < 1:5709110/150‑1 (MQ=255) ttCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTcggc < 1:4064646/150‑1 (MQ=255) tctcAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTcggcg < 1:2274618/150‑1 (MQ=255) tcAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCggcggc > 1:113644/1‑150 (MQ=255) gcAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCggcggc < 2:4869563/149‑1 (MQ=255) cGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGgcg < 1:881211/150‑1 (MQ=255) ggCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCGCGGCGGCTGGCGCAc > 2:1602357/1‑150 (MQ=255) acaAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGt > 1:4402649/1‑150 (MQ=255) tCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTg > 1:1500760/1‑150 (MQ=255) tCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTg < 1:2666039/150‑1 (MQ=255) tCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTg < 2:5769666/150‑1 (MQ=255) ggTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGt > 1:364849/1‑150 (MQ=255) gTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGtt > 1:4712428/1‑150 (MQ=255) tCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGc < 2:3403236/150‑1 (MQ=255) ctcTGGCAGCGACGCTGTCTTCACCGGATTAACGCGGCTAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCtt < 1:693896/148‑1 (MQ=255) gCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGTCAAAGTGGTTGGAACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATGGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTc < 1:2330053/150‑1 (MQ=255) cTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCg > 1:4923011/1‑150 (MQ=255) cTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCg < 1:3062396/150‑1 (MQ=255) tGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCgg < 1:4618080/150‑1 (MQ=255) tGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCgg < 2:6170915/150‑1 (MQ=255) gCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGgtg < 2:4410030/150‑1 (MQ=255) gCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGgtg < 1:4770988/150‑1 (MQ=255) aGCGACGCTGGCGTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGtt < 1:986896/150‑1 (MQ=255) cGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTaa < 2:1554858/150‑1 (MQ=255) gACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAAt < 1:29707/150‑1 (MQ=255) aCGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTCTGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATg < 2:3837008/150‑1 (MQ=255) aCGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATg > 2:6440395/1‑150 (MQ=255) cTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGa > 1:5605618/1‑150 (MQ=255) cTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCGTCGGTGTTAATGGCACTGa > 2:1041776/1‑150 (MQ=255) tCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATg > 2:1459589/1‑150 (MQ=255) tCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATg < 1:1786713/150‑1 (MQ=255) cACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATgg < 2:2941962/150‑1 (MQ=255) cACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATgg > 2:2571870/1‑150 (MQ=255) aCCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGgc > 1:2798919/1‑150 (MQ=255) cGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGgcgc > 1:6554646/1‑150 (MQ=255) ggATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCt < 2:4194938/150‑1 (MQ=255) ggATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCt < 2:3854203/150‑1 (MQ=255) gATAAACGCGGCATAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGGTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCAACGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTg < 1:3848936/150‑1 (MQ=255) gATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTg < 2:5408295/150‑1 (MQ=255) aCGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTGGCAtt > 1:1665106/1‑150 (MQ=255) gcgGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGGCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTGCATGGCACTGATGGCGCTGGCATTAt > 2:3708119/1‑150 (MQ=255) aaaGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCTGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTGGCATTATGGCGt < 2:3256210/150‑1 (MQ=255) aaaGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTGGCATTATGGCGt > 1:6673119/1‑150 (MQ=255) aaaGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTGGCATTATGGCGt > 2:6192080/1‑150 (MQ=255) aaaGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTGGCATTATGGCGt < 1:685227/150‑1 (MQ=255) aaGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTGGCATTATGGCGTg > 2:3748500/1‑150 (MQ=255) aGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTGGCATTATGGCGTgg > 1:3154655/1‑150 (MQ=255) gTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTGGCATTATGGCGTGGt < 1:2143606/150‑1 (MQ=255) gTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTGGCATTATGGCGTGGt < 2:3063436/150‑1 (MQ=255) tGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTGGCATTATGGCGTGGTc < 2:6745549/150‑1 (MQ=255) tGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTGTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTGGCATTATGGCGTGGTc < 2:1667582/150‑1 (MQ=255) ggTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTGGCATTATGGCGTGGTCt > 2:760522/1‑150 (MQ=255) ggTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTGGCATTATGGCGTGGTCt < 2:2221671/150‑1 (MQ=255) aCTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTGGCATTATGGCGTGGTCTGCCACaa > 2:191777/1‑150 (MQ=255) cTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTGGCATTATGGCGTGGTCTGCCACaaa < 1:773614/150‑1 (MQ=255) cTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTGGCATTATGGCGTGGTCTGCCACaaa < 2:2762987/150‑1 (MQ=255) tattatGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTGGCATTATGGCGTGGTCTGCCACAAAt < 1:2165262/150‑1 (MQ=255) tattatGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTGGCATTATGGCGTGGTCTGCCACAAAt > 2:3566195/1‑150 (MQ=255) attatGAGCGGTATGGTGCTGGGGAGCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGCTTGCTGTCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTGTTGGGTTGCGCCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTGGCAGTAGGGCGTGGTCTGCCACAAATg > 2:2793183/1‑150 (MQ=255) tGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTGGCATTATGGCGTGGTCTGCCACAAATGAAAt > 1:1001725/1‑150 (MQ=255) tGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCAGGCACGGACAGTAGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTAGCTTCGGTGTTAATTGCACTGATGGCGCTGGCATTATGGCGTGGTCTGCCACAAATGAAAt > 2:6396343/1‑150 (MQ=255) gTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGGTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTGGCATTATGGCGTGGTCTGCCACAAATGAAATCAGaaa > 1:6478838/1‑150 (MQ=255) gTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTGGCATTATGGCGTGGTCTGCCACAAATGAAATCAGaaa < 1:5076526/150‑1 (MQ=255) gTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTGGCATTATGGCGTGGTCTGCCACAAATGAAATCAGaaa > 1:1765651/1‑150 (MQ=255) gctgctGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTGGCATTATGGCGTGGTCTGCCACAAATGACATCAGAAACCCa > 2:2924393/1‑150 (MQ=255) | AGTCAGTCGCTGGCGATGATGATCCTCGGTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGTTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTGGCATTATGGCGTGGTCTGCCACAAATGAAATCAGAAACCCAC > CP009273/2801953‑2802246 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |