| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | CP009273 | 4,630,235 | IS30 (+) +2 bp | coding (17‑18/141 nt) | yjjY → | uncharacterized protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 4497276 = | NA (NA) | 383 (0.960) | 178/298 | 0.5 | 100% | noncoding (1221/1221 nt) | IS30 | repeat region |
| ? | CP009273 | 4630235 = | 0 (0.000) | coding (17/141 nt) | yjjY | uncharacterized protein | |||||
| * | ? | CP009273 | = 4498496 | NA (NA) | 447 (1.130) | 199/296 | 0.1 | 100% | noncoding (316/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | CP009273 | = 4630236 | 0 (0.000) | coding (18/141 nt) | yjjY | uncharacterized protein | |||||
Only 100 of 835 total aligned reads displayed.
AACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACAACATCATTAGCTTGGTCGTGGGTACTTTCCCTCAGGACCCGACAGTGTCAAAAACGGCTGTCATCCTAACCATTTTAACAGCAACATAACAGGCTAAGAGGGGCCGGACACCCAAT > CP009273/4630086‑4630386 | tcctaaaaagacatgtcttgcccaatatactcaacatgaactagatctggttgctgctcagctaaacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaAt < 2:51348‑M2/2‑1 (MQ=255) ctaaaaagacatgtcttgcccaatatactcaacatgaactagatctggttgctgctcagctaaacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTg > 2:4132622‑M2/148‑151 (MQ=255) ctaaaaagacatgtcttgcccaatatactcaacatgaactagatctggttgctgctcagctaaacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTg > 1:3531903‑M2/148‑151 (MQ=255) cGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgta < 2:3056558‑M2/151‑5 (MQ=255) gTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtag > 1:2737905‑M2/1‑146 (MQ=255) cTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagat > 1:4349798‑M2/1‑144 (MQ=255) aagacatgtcttgcccaatatactcaacatgaactagatctggttgctgctcagctaaacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTc > 1:1894729‑M2/143‑151 (MQ=255) gacatgtcttgcccaatatactcaacatgaactagatctggttgctgctcagctaaacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTCtt < 1:1551586‑M2/11‑1 (MQ=255) acatgtcttgcccaatatactcaacatgaactagatctggttgctgctcagctaaacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTCTTg > 1:2039151‑M2/140‑151 (MQ=255) catgtcttgcccaatatactcaacatgaactagatctggttgctgctcagctatacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaatgagttaattgtttgtggtgttgctttgtcagtttgattcttcaTTTGGGTTCTtgt > 2:4240343‑M2/139‑150 (MQ=255) catgtcttgcccaatatactcaacatgaactagatctggttgctgctcagctaaacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTCTTGa > 2:5035696‑M2/139‑151 (MQ=255) aaCGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaa < 1:301616‑M2/151‑12 (MQ=255) atntcttgcccaatatactcaacatgaactagatctggttgctgctcagctaaacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTCTTGAt > 1:1954099‑M2/138‑151 (MQ=255) aCGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaat < 1:2222713‑M2/151‑13 (MQ=255) gATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACATGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattg > 2:3691566‑M2/1‑137 (MQ=255) ttgcccaatatactcaacatgaactagatctggttgctgctcagctaaacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTCTTGATGCACt > 1:3832464‑M2/133‑151 (MQ=255) cccaatatactcaacatgaactagatctggttgctgctcagctaaacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTCTTGATGCACTTTc < 1:3305000‑M2/22‑1 (MQ=255) aaTGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaac < 2:4512960‑M2/151‑21 (MQ=255) aaTGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaac < 1:135452‑M2/151‑21 (MQ=255) aTGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGCCCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacg > 1:1311413‑M2/1‑130 (MQ=255) gtgCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtccacgca < 2:6115226‑M2/151‑24 (MQ=255) cGGGGTCTGCATGTTTGCTAACTAAATTGCCAACTATATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaagtggtcaacgcaaca < 2:2494517‑M2/151‑27 (MQ=255) tactcaacatgaactagatctggttgctgctcagctaaacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAAc > 2:2825458‑M2/123‑151 (MQ=255) ggggTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacag > 1:1236448‑M2/1‑124 (MQ=255) gggTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagt > 1:1782573‑M2/1‑123 (MQ=255) cTGCATGTTTGCTACCTAACTTGACAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatg > 2:896961‑M2/1‑119 (MQ=255) ctagatctggttgctgctcagctaaacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgacagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACAAcatca < 1:6311014‑M2/42‑1 (MQ=255) ctagatctggttgctgctcagctaaacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACAAcatca > 2:6241588‑M2/110‑151 (MQ=255) tGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtgaaaacat < 1:6097492‑M2/151‑42 (MQ=255) tGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtgaaaacat < 1:5553906‑M2/151‑42 (MQ=255) gatctggttgctgctcagctaaacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACAACATCATTa < 2:3416773‑M2/45‑1 (MQ=255) atctggttgctgctcagctaaacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACAACATCATTAg < 1:78561‑M2/46‑1 (MQ=255) atctggttgctgctcagctaaacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACAACATCATTAg < 1:2141337‑M2/46‑1 (MQ=255) tctggttgctgctcagctaaacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACAACATCATTAGc > 2:1147843‑M2/105‑151 (MQ=255) ccTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtgaaaacatggggt < 1:5153583‑M2/151‑47 (MQ=255) tggttgctgctcagctaaacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACAACATCATTAGCtt < 2:1858031‑M2/49‑1 (MQ=255) tggttgctgctcagataaacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCATCGTCAACAACATCATTAGCtt < 2:194807‑M2/49‑1 (MQ=255) tAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtgaaaacatggggttg < 2:2583419‑M2/151‑49 (MQ=255) ggttgctgctcagctaaacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACAACATCATTAGCTTg < 2:5596663‑M2/50‑1 (MQ=255) gttgctgctcagctaaacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACAACATCATTAGCTTgg < 2:434380‑M2/51‑1 (MQ=255) aaTTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtgaaaacatggggttgcg > 2:5430047‑M2/1‑101 (MQ=255) tgctcagctaaacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACAACATCATTAGCTTGGTCGTg > 2:576490‑M2/96‑151 (MQ=255) aCTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtgaaaacatggggttgcggaggtttt < 1:2321151‑M2/151‑59 (MQ=255) ctaaacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACAACATCATTAGCTTGGTCGTGGGTACtt < 2:5812341‑M2/63‑1 (MQ=255) aaaTCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtgaaaacatggggttgcggaggttttttg < 2:4926200‑M2/151‑62 (MQ=255) aaaTCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtaaacgcaacagttatgtgaaaacatggggttgcggaggttttttg < 2:660507‑M2/151‑62 (MQ=255) aaaCAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtgaaaacatggggttgcggaggttttttgaatgag < 2:6357825‑M2/151‑68 (MQ=255) aaaCAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCAGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtgaaaacatggggttgcggaggttttttgaatgag > 2:1026158‑M2/1‑84 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |