| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,802,100 | T→C | pseudogene (426/1178 nt) | ygaY → | pseudogene, major facilitator transporter superfamily;putative transport; Not classified; putative transport protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,802,100 | 0 | T | C | 99.4% | 1349.3 / NA | 342 | pseudogene (426/1178 nt) | ygaY | pseudogene, major facilitator transporter superfamily;putative transport; Not classified; putative transport protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (153/187); minor base A (2/0); total (155/187) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.05e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 358 total aligned reads displayed.
CAGTCAGTCGCTGGCGATGATGATCCTCGGTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGTTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTGGCATTATGGCGTGGTCTGCCACAAATGAAATCAGAAACCCACC > CP009273/2801952‑2802247 | agtcagtcGCTGGCGATGATGATCCTCGGTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTgg > 1:1459886/1‑151 (MQ=255) gtcagtcGCTGGCGATGATGATCCTCGGTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTggg < 2:3230593/151‑1 (MQ=255) cagtcGCTGGCGATGATGATCCTCGGTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCCGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGa < 2:898183/151‑1 (MQ=255) cagtcGCTGGCGATGATGATCCTCGGTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGa > 1:2694324/1‑151 (MQ=255) cgtcGCTGGCGCGGATGATCCTCGGCACGCCATGACCCGGGTTCTACACCGGCGTGGCACACAGTCTGGGTCCGCTGGCACCGACGCGGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAACGTGGGGGGCACTATGAGGAGCGCTCTGCTGCTGGGGAt < 2:4986566/150‑1 (MQ=255) agtcGCTGGCGATGATGATCCTCGGTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCCGTCGTGGCACAAATTCTGGTACCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGAt < 1:47722/151‑1 (MQ=255) tcGCTGGCGATGATGATCCTCGGTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCt < 2:766744/151‑1 (MQ=255) tcGCTGGCGATGATGATCCTCGGTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCt < 1:803783/151‑1 (MQ=255) cGCTGGCGATGATGATCCTCGGTACGGCATTAACCGGTGTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCtt < 2:5344885/151‑1 (MQ=255) cGATGATGATCCTCGGTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCCGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGACAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGc < 1:5645239/151‑1 (MQ=255) cGATGATGATCCTCGGTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGc > 2:5991080/1‑151 (MQ=255) tgatgatCCTCGGTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACg > 2:1209527/1‑151 (MQ=255) gatgatCCTCGGGCCGGCATTAACCGGTTTAGTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGAACTTGCTGGCACgg < 2:371778/151‑1 (MQ=255) catgatCCTCGGTACGGCATTAACAGGATTATTCTCAGTCGAGGCACAAATTCAGCTTCCGCTGGAAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAACGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACgg < 2:1702070/150‑1 (MQ=255) tgatCCTCGGTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGAc < 1:2128408/151‑1 (MQ=255) cTCGGTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTg > 2:2242869/1‑151 (MQ=255) tCGGTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGc > 1:2919232/1‑151 (MQ=255) cGGTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCCGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGcc < 1:4550148/151‑1 (MQ=255) cGGTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGcc > 1:2855473/1‑151 (MQ=255) aCGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGAt > 1:234069/1‑151 (MQ=255) aCGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGAt > 1:2023607/1‑151 (MQ=255) cGGCATTAACCGGTTTATTCTCCGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGAtt < 1:1624578/151‑1 (MQ=255) gCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGc > 1:106013/1‑151 (MQ=255) aTTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTg < 2:5670442/151‑1 (MQ=255) tAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGc > 1:495818/1‑151 (MQ=255) ggTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAAtc > 1:5855848/1‑151 (MQ=255) gTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAAtct < 2:3907448/151‑1 (MQ=255) gTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAAtct < 1:1084553/151‑1 (MQ=255) ttATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTcg < 1:5055882/151‑1 (MQ=255) ttATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTcg > 2:6158525/1‑151 (MQ=255) tATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTcgg < 1:124254/151‑1 (MQ=255) aTTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTcggc > 1:1538216/1‑151 (MQ=255) tctcAGTCGTGGCACTAATTCTTGGTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACGATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCGTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTcggcgg < 2:3578542/151‑1 (MQ=255) tctcAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTcggcgg < 1:959315/151‑1 (MQ=255) ctcAGTCGTGGCACACATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCGGGGGATCTTGCTGGCCCGGACAGTTGCCGGATAGCTGGCGAATCTCggcggc > 2:4485677/1‑151 (MQ=255) ctcAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCggcggc > 1:4212267/1‑151 (MQ=255) tcAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGTCGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGGAAAGTGGTTGGCTGTATTATGAGCGGTCTGGTGCTGGGGATCTTGCTGGCAGGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATGTCGGCGGCt > 2:2912737/1‑151 (MQ=255) cAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTg < 2:2159242/151‑1 (MQ=255) tCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGgcg > 2:3835502/1‑151 (MQ=255) cacaAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGt < 2:1950012/151‑1 (MQ=255) cacaAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGt > 1:2265630/1‑151 (MQ=255) aaaTTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCGGGCTTCACCGGATCAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCtt < 1:5257826/151‑1 (MQ=255) aaTTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCttt < 2:2387190/151‑1 (MQ=255) aTTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCtttt < 1:407743/151‑1 (MQ=255) ttCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTg > 1:704106/1‑151 (MQ=255) ttCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATATTGCTGGCACGTACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTATTg > 1:651048/1‑151 (MQ=255) ttCCGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTg < 1:6205199/151‑1 (MQ=255) tCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCTCGGACAGTTGCCTGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTgg < 2:432180/151‑1 (MQ=255) tGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGt < 2:2827458/151‑1 (MQ=255) gTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTg < 2:296/151‑1 (MQ=255) ccGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCtt < 1:311718/151‑1 (MQ=255) cGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTc > 1:2159573/1‑151 (MQ=255) cGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTc > 2:130155/1‑151 (MQ=255) cGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTc > 1:4839928/1‑151 (MQ=255) cTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCgg > 2:5619332/1‑151 (MQ=255) cGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAAt < 1:4444484/151‑1 (MQ=255) gACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATg > 2:5521275/1‑151 (MQ=255) aCGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATgg < 2:5801844/151‑1 (MQ=255) aCGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGAGTGCTGGCGTCTCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATgg > 2:2654332/1‑151 (MQ=255) aCGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGAGGTTGGCACTCTTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATgg > 2:1816697/1‑151 (MQ=255) cGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGc > 1:2549617/1‑151 (MQ=255) cTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCAc > 1:2046259/1‑151 (MQ=255) tGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGAGTTAATGGCACt > 1:3250814/1‑151 (MQ=255) tGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATATCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTACGGTGTTAATGGCACt > 2:4117033/1‑151 (MQ=255) ggCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTg < 2:1610904/151‑1 (MQ=255) cTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGAt < 2:4370481/151‑1 (MQ=255) ttCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATg < 1:624989/151‑1 (MQ=255) tCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATgg < 1:6081565/151‑1 (MQ=255) tCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATgg < 2:423751/151‑1 (MQ=255) cACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGgc < 1:5423814/151‑1 (MQ=255) cACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGgc < 2:3647445/151‑1 (MQ=255) aCCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGtcg > 2:4007230/1‑151 (MQ=255) aCCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGgcg < 2:689613/151‑1 (MQ=255) aCCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGgcg < 2:5721659/151‑1 (MQ=255) cGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCt > 1:594817/1‑151 (MQ=255) gATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTgg > 2:4646977/1‑151 (MQ=255) aCGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTGGCATTa > 1:3937978/1‑151 (MQ=255) gcgGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTGGCATTAtn < 1:6024386/151‑2 (MQ=255) cgGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTGGCATTATgg < 1:2976457/151‑1 (MQ=255) cgGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGGTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTGGCATTATgg < 2:1476496/151‑1 (MQ=255) gCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACCGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTGGCCTTATGGCg > 2:6284560/1‑151 (MQ=255) aGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTGGCATTATGGCGTGGt > 1:5500076/1‑151 (MQ=255) tGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTGGCATTATGGCGTGGTCt < 2:3109517/151‑1 (MQ=255) ggTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTGGCATTATGGCGTGGTCTg < 1:5315320/151‑1 (MQ=255) ggTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTGGCATTATGGCGTGGTCTg < 2:1080660/151‑1 (MQ=255) ttGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTGGCATTATGGCGTGGTCTGcc > 2:1020207/1‑151 (MQ=255) tGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTGGCATTATGGCGTGGTCTGCca > 1:1813047/1‑151 (MQ=255) gCACTATTATGAGCTGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTGGCATTATGGCGTGGTCTGCcaca > 2:3005871/1‑151 (MQ=255) gCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTGGCATTATGGCGTGGTCTGCcaca < 2:1924434/151‑1 (MQ=255) gCACTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTGGCATTATGGCGTGGTCTGCcaca > 1:2422842/1‑151 (MQ=255) aCTATTATGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTGGCATTATGGCGTGGTCTGCCACaaa < 2:2621425/151‑1 (MQ=255) ttatGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTGGCATTATGGCGTGGTCTGCCACAAATGaa < 2:177883/151‑1 (MQ=255) ttatGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTGGCATTATGGCGTGGTCTGCCACAAATGaa > 1:3411389/1‑151 (MQ=255) tatGAGCGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTGGCATTATGGCGTGGTCTGCCACAAATGaaa < 2:3416261/151‑1 (MQ=255) cGGTCTGCTGCTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTGGCATTATGGCGTGGTCTGCCACAAATGAAATCAGaa > 2:3497131/1‑151 (MQ=255) ctgctgctgGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTGGCATTATGGCGTGGTCTGCCACAAATGAAATCAGAAAccc < 1:3486089/151‑1 (MQ=255) ctgctgctgGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTGGCATTATGGCGTGGTCTGCCACAAATGAAATCAGAAAccc > 1:824368/1‑151 (MQ=255) tgctgcTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTGGCATTATGGCGTGGTCTGCCACAAATGAAATCAGAAACCCa > 2:2423717/1‑151 (MQ=255) tgctgcTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTGGCATTATGGCGTGGTCTGCCACAAATGAAATCAGAAACCCa > 1:4537077/1‑151 (MQ=255) gctgctGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTGGCATTATGGCGGGGTCTGCCACAAATGAAAGCAGAAACCCAc > 1:901564/1‑151 (MQ=255) | CAGTCAGTCGCTGGCGATGATGATCCTCGGTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGACGCTGGCTTCACCGGATAAACGCGGCAAAGTGGTTGGCACTATTATGAGCGGTCTGCTGTTGGGGATCTTGCTGGCACGGACAGTTGCCGGATTGCTGGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGGCGCTGGCATTATGGCGTGGTCTGCCACAAATGAAATCAGAAACCCACC > CP009273/2801952‑2802247 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |