New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 2871151 | 428 (1.290) | 11 (0.040) | 11/260 | 23.6 | 3.0% | intergenic (+174/+777) | iap/ygbF | aminopeptidase in alkaline phosphatase isozyme conversion/CRISPR adaptation ssRNA endonuclease |
? | CP009273 | 2871642 = | 337 (1.160) | intergenic (+665/+286) | iap/ygbF | aminopeptidase in alkaline phosphatase isozyme conversion/CRISPR adaptation ssRNA endonuclease | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 433 total aligned reads displayed.
GTTCTACCGCAGAGGCGGGGGAACTCCAAGTGATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCC > CP009273/2871002‑2871300 | ttCTACCGCAGAGGCGGGGGAACTCCAAGTGATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCg > 1:5090323/1‑150 (MQ=255) ttCTACCGCAGAGGCGGGGGAACTCCAAGTGATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCg < 2:1542046/150‑1 (MQ=255) ttCTACCGCAGAGGCGGGGGAACTCCAAGTGATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCGCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGTACTCTCg > 2:4070153/1‑150 (MQ=255) tCTACCGCAGAGGCGGGGGAACTCCAAGTGATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCgg < 1:1020396/150‑1 (MQ=255) cTACCGCAGAGGCGGGGGAACTCCAAGTGATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGACCACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGt > 2:1423611/1‑150 (MQ=255) tACCGCAGAGGCGGGGGAACTCCAAGTGATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGtg > 2:1863192/1‑149 (MQ=255) gCAGAGGCGGGGGAACTCCAAGTGATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAgg > 1:1069050/1‑150 (MQ=255) gCAGAGGCGGGGGAACTCCAAGTGATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAgg < 1:1373851/150‑1 (MQ=255) gagGCGGGGGAACTCCAAGTGATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGt > 2:5378380/1‑150 (MQ=255) gagGCGGGGGAACTCCAAGTGATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGt > 2:2732335/1‑150 (MQ=255) ggCGGGGGAACTCCAAGTGATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTg < 1:5155882/150‑1 (MQ=255) gggggAACTCCAAGTGATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCaa > 2:1170078/1‑150 (MQ=255) gggAACTCCAAGTGATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACTCCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTATATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTAGGTTCAGGCGTTGCagtg > 2:37502/1‑147 (MQ=255) ggAACTCCAAGTGATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAAcc < 1:2477808/150‑1 (MQ=255) gAACTCCAAGTGATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCt < 1:94846/150‑1 (MQ=255) gAACTCCAAGTGATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCt < 2:3586220/150‑1 (MQ=255) gAACTCCAAGTGATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCt < 2:4275562/150‑1 (MQ=255) aaCTCCAAGTGATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTCTCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTg < 1:1916435/150‑1 (MQ=255) aaCTCCAAGTGATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTg > 2:4320344/1‑150 (MQ=255) tCCAAGTGATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑t > 1:1480072/1‑150 (MQ=255) tCCAAGTGATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCAGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGca > 1:1728413/1‑149 (MQ=255) tCCAAGTGATATCCATCATCGCATCCAGTGAGCCCGGTTAATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCAGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTCGAGGAGTAGCAAAccatgcg > 1:3903493/1‑145 (MQ=255) aaGTGATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGGACAGGCGTTGCAGGCCAGGC‑tcca > 2:3032419/1‑147 (MQ=255) tGATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCggg > 2:261611/1‑150 (MQ=255) gATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGc < 2:5043930/150‑1 (MQ=255) atatCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGGCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTGCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCg > 1:1310926/1‑150 (MQ=255) catcatCGCATCCAGTGCGCCCGGTGTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTa > 2:482081/1‑150 (MQ=255) tcGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATcccc < 1:2757284/150‑1 (MQ=255) gCATCCAGTGCGCCCGGTGTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGc < 2:4545447/150‑1 (MQ=255) tCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTaa > 1:4014117/1‑150 (MQ=255) aGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAAcgc < 1:3585014/150‑1 (MQ=255) gTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAAcgcg < 1:1231808/150‑1 (MQ=255) gTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAAcgcg < 1:4281084/150‑1 (MQ=255) gTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGGTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAGcgcg > 1:799333/1‑150 (MQ=255) tGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAGACGTGGC‑TAGCGGGCGGGTTATCCCCGGTAACGCgg > 2:1279807/1‑150 (MQ=255) tGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTGCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCGAACGCgg > 2:3065440/1‑150 (MQ=255) ccGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAAc < 2:1601622/150‑1 (MQ=255) gTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCg < 1:112073/150‑1 (MQ=255) tttATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGTGAACTCGt < 2:485022/150‑1 (MQ=255) ttATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTa > 2:3205651/1‑150 (MQ=255) ccccGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGGGTTGCAATAGTGGC‑TCCCGTGCGGTTTATCCCCGCTAGCGCGGGGAACTCggcgtgc > 1:3774523/1‑144 (MQ=255) ccGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCcat < 1:4390066/150‑1 (MQ=255) gCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCcatca < 1:2994478/150‑1 (MQ=255) tGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTAGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCAtt < 2:653287/150‑1 (MQ=255) gATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTc < 1:4941052/150‑1 (MQ=255) aTGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTcc > 1:339662/1‑150 (MQ=255) tGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCa > 2:2514211/1‑150 (MQ=255) tGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCa < 1:266487/150‑1 (MQ=255) ggggAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCGCGGGTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACAGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTAGTAGTCCATCATTCCACCt > 2:1333299/1‑150 (MQ=255) gggAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTa > 2:4385104/1‑150 (MQ=255) ggAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTAt < 1:4459474/150‑1 (MQ=255) ggAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTAt < 2:5408567/150‑1 (MQ=255) ggAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTAt < 2:4197161/150‑1 (MQ=255) gAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATg < 2:5192404/150‑1 (MQ=255) aaCACCAGCGTCAGGCGTGATATCTCCCCGTCGTTGCAGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCAGTCCACCTATGt < 2:744400/150‑1 (MQ=255) acacCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTc < 1:3953651/150‑1 (MQ=255) cacCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCt < 1:2150180/150‑1 (MQ=255) acCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTg < 1:4893491/150‑1 (MQ=255) aGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTATGGCGTTGAAAAAGTGGC‑TACCCGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCTTAGTCAATCAATCCACCTATGTCAGAAc > 1:591868/1‑150 (MQ=255) gTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCATGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTCTGTCTGAACTcc < 2:492555/150‑1 (MQ=255) tCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCTGTGCTGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTACACCTAGGTCTGAAATccc > 2:386084/1‑150 (MQ=255) tCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTccc > 1:477608/1‑150 (MQ=255) aGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCgg < 1:1794754/150‑1 (MQ=255) ggCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCAGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGt > 1:882778/1‑150 (MQ=255) gCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCGTGCGCGGGGAACTCTCGGTGCTCGC‑ATACACACCCGGCATAGAGGGCGGTTTATCCCCGCTCGCGCGGGGAACTCGCAGACCAAAAATAAACCTATGTAAGAACtaactgat > 2:4947714/1‑143 (MQ=255) cGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACtctcaa > 1:2213461/1‑53 (MQ=255) cGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACtctcaa < 2:2213461/55‑3 (MQ=255) tggaaTCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCGGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTGTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTAt > 1:4952143/4‑150 (MQ=255) taaTCTCAACGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATcc < 1:2271156/149‑1 (MQ=255) tcACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCt < 1:1609980/150‑1 (MQ=255) cACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTg < 1:3015706/150‑1 (MQ=255) cACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTg < 2:123371/150‑1 (MQ=255) aCCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTgg < 2:1498540/150‑1 (MQ=255) aCCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTACATGCGATGCAAACCAGGG‑AACCGGGGGGTGGATACCCGCTAGCGCGGGGAGCTCCGTGTCCATCAATCGACGGAGGGGTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTgg > 2:1743729/1‑150 (MQ=255) cgtcgtTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTCGTCAAGCAATACACCTATGTCTGAGCTCCCGGTTTATCCCCGCTGgcg > 2:2099856/1‑150 (MQ=255) tcgtTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTAAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCTTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGGTTATCCCCGCTGGcgcg > 1:4169292/1‑150 (MQ=255) cgtTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCGAACCTGGC‑TAGCGGGCGGTTTATCCCCGCTAGCGCGGGGAACTCGTAGTCCATCAGTCCACCGGTGTCTGAAATACCGGGTTATACCCGCTGGCgggg > 2:3375605/1‑150 (MQ=255) ttGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCgggg < 2:4582178/150‑1 (MQ=255) tGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTGTGTCGGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGa > 2:3948812/1‑150 (MQ=255) ccGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAAc < 1:4700841/150‑1 (MQ=255) tATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCgg < 2:2969052/150‑1 (MQ=255) ttCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTCGTCCATCATTCCACCTATGTCTGACCTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCggt < 1:7329/149‑2 (MQ=255) tCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCgggg < 2:620409/150‑1 (MQ=255) tCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCgggg > 1:4420890/1‑150 (MQ=255) ccTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTTGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCTGAGACATAAAATCGACCTAGGTCTGAAATCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTGAGGGGGGa > 1:856255/1‑150 (MQ=255) tgctgGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGCgggggctc > 1:2877492/1‑147 (MQ=255) gctgGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATaa > 1:408083/1‑150 (MQ=255) tgGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATg < 2:193526/150‑1 (MQ=255) cgcgGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGttt > 1:3634025/1‑150 (MQ=255) cgcgGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGttt > 1:532336/1‑150 (MQ=255) gcgGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCAACAATCCACCTATGTCTGAACTCCCGGGTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATggtga > 2:4675324/1‑146 (MQ=255) cgGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTTACGCGGGGAACTAGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGTGAACTCCCGGGGGATAATGTTTAc < 2:2691508/150‑1 (MQ=255) gggAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCACGGGGGATAAGGATTACgg > 2:5338818/1‑150 (MQ=255) aaCTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCa < 1:2064145/150‑1 (MQ=255) aaCTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCa < 1:3219084/150‑1 (MQ=255) ctctCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATg < 1:2388964/150‑1 (MQ=255) tctcGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATgc > 1:308120/1‑150 (MQ=255) ctcGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATgcg > 2:2858773/1‑150 (MQ=255) ctcGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATgcg > 1:551445/1‑150 (MQ=255) tcGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCACGGGGGATAATGTTTACGGTCTTgcgc > 1:4658033/1‑150 (MQ=255) | GTTCTACCGCAGAGGCGGGGGAACTCCAAGTGATATCCATCATCGCATCCAGTGCGCCCGGTTTATCCCCGCTGATGCGGGGAACACCAGCGTCAGGCGTGAAATCTCACCGTCGTTGCCGGTTTATCCCTGCTGGCGCGGGGAACTCTCGGTTCAGGCGTTGCAAACCTGGC‑TACCGGGCGGTTTATCCCCGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCC > CP009273/2871002‑2871300 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |