New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 2811301 | 190 (0.570) | 17 (0.060) | 12/258 | 22.9 | 8.0% | intergenic (‑82/+117) | argQ/argZ | tRNA‑Arg/tRNA‑Arg |
? | CP009273 | 2811851 = | 228 (0.790) | noncoding (58/77 nt) | argV | tRNA‑Arg | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 258 total aligned reads displayed.
GCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAGGGGAGCGCCTTCAGCCTCTCGGCCACCT > CP009273/2811702‑2812000 | aTCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGa > 1:1782164/1‑150 (MQ=255) aTCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGa > 2:2468819/1‑150 (MQ=255) aTCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGa > 1:667779/1‑150 (MQ=255) tCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGaa > 1:2040269/1‑150 (MQ=255) gggAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCt > 2:1079290/1‑150 (MQ=255) gaggaTTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTcc > 1:337483/1‑150 (MQ=255) aggaTTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCA‑TCGCTGAA‑CG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCg > 2:3331539/1‑150 (MQ=255) ggaTTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTGCGTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCA‑TCGCTGTA‑AG‑TAGGTAGATTATGTTGCTTCCGGGAGGATTCGTACCTCCGa > 2:4515721/1‑150 (MQ=18) ggaTTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGa > 2:2948597/1‑150 (MQ=255) gaTTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGAc > 2:256929/1‑150 (MQ=255) aTTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGAcc > 1:3656424/1‑150 (MQ=255) ttACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCg > 2:5327482/1‑150 (MQ=255) tACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTCTAGCAACGGTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGGTATGACCGCCCCCTCTTCCATCCCGGCA‑TCGCGGAC‑AG‑TACGGAGACTGTGGTGCCTCCGGGAGGAGTCGAACGTCCGGCCgg > 2:4807567/1‑149 (MQ=17) aCTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATCCCTTCA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATTTGGTGCATCCGGGAGGAGTCGAACCTCCGACCGCt > 2:2005218/1‑150 (MQ=255) aCTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCt > 1:1158469/1‑150 (MQ=255) aCTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCt > 1:2487382/1‑150 (MQ=255) ctctCCTTGCGGGTCGCCCTACGGCCCGTGGCTCAAGCAACGTTATCCCCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCACTCCCATCCCTCCA‑TCGCTCAC‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTc < 1:514400/150‑1 (MQ=18) cTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTc > 1:3172582/1‑150 (MQ=255) cTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGGCGAATAGGGTGCATCCGGGAGGAGGCGAACCTCCGACCGCTc > 2:792653/1‑150 (MQ=17) tCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAAc > 2:586154/1‑137 (MQ=255) gCCTAGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCCCCTCTTCCATACCTTCA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCCTCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGt < 1:1745899/150‑1 (MQ=255) ccctccGGCCCGCCCTTCGGCCCCTGGCCACAGCACCGCTAGCCCCCCTGGTGCCAGCGCTTATTACCGCCACCACTTCCACACCTTCA‑ACCCCCAA‑AT‑TACGTACAAGATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGtt < 2:3465241/145‑1 (MQ=12) gCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGt > 2:1923436/1‑150 (MQ=255) ccTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTAc > 2:858817/1‑150 (MQ=255) cTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTAct > 2:1610084/1‑150 (MQ=255) gggCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTAt < 2:2323838/150‑1 (MQ=255) ggCCGTTGCTAAAGCACCGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATc > 1:763298/1‑150 (MQ=255) ggCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATc > 1:1253894/1‑150 (MQ=255) gCCGTTGCTTTAGCAACGTTAACCTCCCTGGTGCCTGGGGTTATTACCGCAACCTCTTCCATACCTACA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATcc < 1:358564/150‑1 (MQ=17) ccGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCa > 2:3133144/1‑150 (MQ=255) cGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGTAGTATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAg > 2:2113161/1‑150 (MQ=255) ttGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCt > 1:2855681/1‑150 (MQ=255) gCTAAAGCTACGTTATCATCCCTGGTGCCTGCGGTTATTTCCGCAACCTCTTCCATACCTTCA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGa < 1:2277315/150‑1 (MQ=255) cTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAg > 1:1001543/1‑150 (MQ=255) cAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACgg > 1:1889785/1‑150 (MQ=255) aCGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGAt > 1:1362158/1‑150 (MQ=255) tcctccCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAAt < 2:4091191/150‑1 (MQ=255) tcctccCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAAt > 1:1440560/1‑150 (MQ=255) cctccCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATg > 2:1036742/1‑150 (MQ=255) tccCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGc > 2:3135167/1‑150 (MQ=255) tccCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGc > 1:3712901/1‑150 (MQ=255) cccTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCg > 1:4061423/1‑150 (MQ=255) cccTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCACCCAATTCCATACCTTCA‑TCGAGGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCg < 1:4165434/150‑1 (MQ=17) 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gTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGAtt > 2:516391/1‑150 (MQ=255) ttattaCCGCCACCTC‑TCCATTCCCTCATTGGCGCAT‑AT‑TTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTc < 2:1940948/150‑1 (MQ=14) tattaCCGCCACCTCTTCCATACCTTCA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCg > 1:46127/1‑150 (MQ=255) ccGCCACCTCTTCCATACCTTCA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAAGATGGTGCATCCGGGCGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTCCTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAATTGGCGGTGAGGCGGGGAGTCGAAccc > 2:4914627/1‑150 (MQ=18) cGCCACCTCTTCCATACCTTCA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAAcccc > 1:4735560/1‑150 (MQ=255) gctaCCTCTTCCATACCTTCA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGa < 1:2702193/113‑1 (MQ=255) gctaCCTCTTCCATACCTTCA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGa > 2:2702193/4‑116 (MQ=255) gCCACCTCTTCCATACCTTCA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCg > 1:1595668/1‑150 (MQ=255) cACCTCTTCCATACCTTCA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGa > 2:366855/1‑150 (MQ=255) tctTCGATACCTTCA‑TTGCTGAA‑GGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGc > 2:4186186/1‑150 (MQ=14) tctTCCATACCTTCA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCa > 2:351305/1‑150 (MQ=255) tctTCCATACCTTAA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCa < 2:2220896/150‑1 (MQ=255) ctTCCATACCTTCA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAg > 2:241294/1‑150 (MQ=255) tcgaTACCTTCA‑TTGCTGAAGAT‑TTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCg > 2:5183542/4‑142 (MQ=11) tcgaTACCTTCA‑TTGCTGAAGAT‑TTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCg < 1:5183530/139‑1 (MQ=11) tcgaTACCTTCA‑TTGCTGAAGAT‑TTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGc > 1:4547514/4‑150 (MQ=14) tCCATACCTTCA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCt > 2:4261829/1‑150 (MQ=255) tCCATACCTTCA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCt > 2:5099955/1‑150 (MQ=255) cgaTACCTTCA‑TTGCTGAAGAT‑TTCGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCt > 1:48515/3‑150 (MQ=17) ccATACCTTCA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCtt > 1:2147938/1‑150 (MQ=255) aacccTTCA‑TCGCTCAA‑AG‑TACCTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGAATCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCtatt < 1:806623/147‑1 (MQ=21) cTTCA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGAcc > 2:4378091/1‑150 (MQ=255) cTTCA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATGCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGAcc > 2:2781349/1‑150 (MQ=255) cGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATAc > 1:2423955/1‑150 (MQ=255) gtGAA‑TG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGAACGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTAAGGATGCACATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTAGACCGCATtctc > 2:1820736/2‑150 (MQ=21) gAA‑AG‑TACGTAGTATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTccc < 1:436825/150‑1 (MQ=255) gAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTccc > 1:2324842/1‑150 (MQ=255) gAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGAGTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTccc > 1:1525985/1‑150 (MQ=255) a‑aG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCtt < 1:2098183/150‑1 (MQ=255) aG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTa > 2:708281/1‑150 (MQ=255) aG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTa > 2:4114093/1‑150 (MQ=255) ttcggaGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGc > 1:3817743/6‑150 (MQ=255) tcGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCa < 2:4742625/149‑1 (MQ=255) aCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGc > 2:4131941/1‑94 (MQ=18) cGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAg > 2:3597406/1‑150 (MQ=255) gTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAgg > 1:3992570/1‑150 (MQ=255) gTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAgg > 2:1303634/1‑150 (MQ=255) tttgatatGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAggg < 1:3485473/146‑1 (MQ=255) tAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAggg < 1:3011731/150‑1 (MQ=255) tAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAggg > 2:4601393/1‑150 (MQ=255) aGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAgggg > 1:4765548/1‑150 (MQ=255) gAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAGGGGa > 1:1669009/1‑150 (MQ=255) gagatGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAGGGGAg > 1:1710097/4‑150 (MQ=255) tatGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAGGGGAgcg > 2:3861345/1‑150 (MQ=255) gTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCt > 1:4486060/1‑115 (MQ=255) gTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAGGGGAGCGCCtt > 1:61493/1‑150 (MQ=255) cATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAGGGGAGCGCCTTCAg > 2:1261993/1‑150 (MQ=255) gggAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAGGGGAGCGCCTTCAGCctct < 2:3700149/150‑1 (MQ=255) ggtgtaTTCGTATCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAGGGGAGCGCCTTCAGCCtctc < 1:118621/145‑1 (MQ=255) aggaTTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAGGGGAGCGCCTTCAGCCTCTCgg > 1:871239/1‑150 (MQ=255) gtttCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTCCTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGTGGCGGGGATTCGAGCCCCGGAAGCAGCTGTTGACCGCATAATCCCTTAGCAGGGGGGCGCCGTCAGCCTCTCGGcc > 1:5275048/3‑150 (MQ=25) ttCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAGGGGAGCGCCTTCAGCCTCTCGGCCAc > 2:4966110/1‑150 (MQ=255) | GCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCA‑TCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAGGGGAGCGCCTTCAGCCTCTCGGCCACCT > CP009273/2811702‑2812000 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |