Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 580,799 | 0 | T | C | 26.2% | 1502.6 / inf | 646 | R97R (CGA→CGG) | ompT | DLP12 prophage; outer membrane protease VII (outer membrane protein 3b) |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (257/218); new base C (107/62); total (364/282) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.67e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 650 total aligned reads displayed.
CGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCGTTATTGAATTTCCAGTCGAGTTGACTGACTTTTCGGCCTCCTTCTTCGGCTAGATAAACACG > CP009273/580650‑580948 | ggTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTc < 1:2583925/150‑1 (MQ=255) tAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCgg > 2:3549917/1‑150 (MQ=255) gTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCga < 1:2229201/150‑1 (MQ=255) aaaaaccagccTTTAACGTTCAAATCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTc < 2:3272645/145‑1 (MQ=255) gagCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATCTTGCCACCTCGGATGCCGAGAGGTGTccc > 2:5242347/1‑149 (MQ=255) aaccagccTTTAACGTTCAAATCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTccag > 1:3660627/3‑150 (MQ=255) cagccTTTAACGTTCAAATCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTccagcca < 2:894305/150‑1 (MQ=255) gccTTTAACGTTCAAATCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTCcagccagc < 1:2865988/150‑1 (MQ=255) ccTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCATGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGACACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCcagca < 2:567404/150‑1 (MQ=255) tttaacgttCAAATCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCagctgc > 1:2635958/8‑150 (MQ=255) tttaacgttCAAATCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCagctgc > 1:312728/8‑150 (MQ=255) tttaacgttCAAATCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCagctgc > 1:3330162/8‑150 (MQ=255) ttaacgttCAAATCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCCTATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCagctgca < 1:4680095/144‑2 (MQ=255) tatTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCga < 2:1778740/150‑1 (MQ=255) tatTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTGACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGTCCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCga > 2:3818157/1‑150 (MQ=255) atTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCgat > 2:671170/1‑150 (MQ=255) atTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCgat < 2:3189352/150‑1 (MQ=255) ctcaaatcaaaTTCCTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCACGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCAGCTGcaccaaca < 2:1559110/149‑5 (MQ=255) aaaTCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCAGCTGCACCaacagat > 1:1458789/3‑150 (MQ=255) aGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCgatagat < 1:2133780/150‑1 (MQ=255) aGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCgatagat < 1:1946357/150‑1 (MQ=255) aGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCgagagat > 2:3783903/1‑150 (MQ=255) gATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCgatagata > 2:2025332/1‑150 (MQ=255) gATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCgatagata > 1:5181974/1‑150 (MQ=255) tCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATc < 2:3583651/150‑1 (MQ=255) aaaTTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTg < 1:1728463/150‑1 (MQ=255) aaTTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTgg > 1:5440687/1‑150 (MQ=255) aaTTCGTTGGCATAATTGAGTGGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTgg < 2:3487691/150‑1 (MQ=255) aTTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGACGCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACGTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTggg > 2:4435697/1‑150 (MQ=255) aTTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTggg < 1:4457527/150‑1 (MQ=255) aTTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCAGCTGCACCaacagataaccatg > 1:278440/1‑144 (MQ=255) cGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCa < 1:4553925/150‑1 (MQ=255) ttGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATc > 1:5011561/1‑150 (MQ=255) gCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCaaa < 1:513993/150‑1 (MQ=255) tAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATcc > 1:1677940/1‑150 (MQ=255) aaTTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATccc > 1:690223/1‑150 (MQ=255) aaTTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATccc > 2:164539/1‑150 (MQ=255) aTTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCa > 2:4343950/1‑150 (MQ=255) ttGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCaa < 1:253474/150‑1 (MQ=255) tGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCaat > 1:3551869/1‑150 (MQ=255) gAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCaatt < 1:373471/150‑1 (MQ=255) gTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCaattaa > 2:4107661/1‑150 (MQ=255) gtATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCa < 2:3965808/150‑1 (MQ=255) tATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCAc > 1:3900471/1‑150 (MQ=255) aGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCttt > 2:4541475/1‑150 (MQ=255) ggTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTtaa < 1:2444240/150‑1 (MQ=255) gtgtCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTtaat > 1:3461349/1‑150 (MQ=255) gcctgcTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCAGCTGCACCAACAGATAACCATGGATTCAGCTCCCAGTTAACGGCGCCTTtaagaa < 1:4299957/145‑1 (MQ=255) tCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTaataat > 1:818558/1‑150 (MQ=255) tACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTg > 2:2563857/1‑150 (MQ=255) cTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCAGCTGCACCAACAGATAACCATGGATTCAGCTCCCAGTTAACGGCGCCTTTAAGAATGGcg < 1:4946038/150‑2 (MQ=255) ttCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCAGCTGCACCAACAGATAACCATGGATTCAGCTCCCAGTTAACGGCGCCTTTAAGAATggcggc > 2:5209382/1‑150 (MQ=255) ttCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGc > 1:1022238/1‑150 (MQ=255) tCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCAGCTGCACCAACAGATAACCATGGATTCAGCTCCCAGTTAACGGCGCCTTTAAGAATGgcggcg > 2:1137550/1‑150 (MQ=255) cATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCAGCTGCACCAACAGATAACCATGGATTCAGCTCCCAGTTAACGGCGCCTTTAAGAATGGCGGCGt < 1:1103144/150‑1 (MQ=255) cATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCAGCTGCACCAACAGATAACCATGGATTCAGCTCCCAGTTAACGGCGCCTTTAAGAATGGCGGCGt < 2:1014300/150‑1 (MQ=255) aTCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCGtt > 2:3110949/1‑150 (MQ=255) aTCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCAACGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCGtt > 2:5061135/1‑150 (MQ=255) tctgTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCAGCTGCACCAACAGATAACCATGGATTCAGCTCCCAGTTAACGGCGCCTTTAAGAATGGCGGCGTTa > 1:5254033/4‑150 (MQ=255) tctgTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCAGCTGCACCAACAGATAACCATGGATTCAGCTCCCAGTTAACGGCGCCTTTAAGAATGGCGGCGTTa > 1:4179143/4‑150 (MQ=255) tctgTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCAGCTGCACCAACAGATAACCATGGATTCAGCTCCCAGTTAACGGCGCCTTTAAGAATGGCGGCGTTa > 2:3910769/4‑150 (MQ=255) tCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCGTTa > 2:4168265/1‑150 (MQ=255) tCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCGTTa > 1:2824167/1‑150 (MQ=255) cGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCGTTAtt < 1:1881672/150‑1 (MQ=255) gTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCGTTATTg > 2:3059083/1‑150 (MQ=255) tCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCAGCTGCACCAACAGATAACCATGGATTCAGCTCCCAGTTAACGGCGCCTTTAAGAATGGCGGCGTTACTgt > 2:1364130/1‑149 (MQ=255) tCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCGTTATTGa > 2:855059/1‑150 (MQ=255) ccATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCAGCTGCACCAACAGATAACCATGGATTCAGCTCCCAGTTAACGGCGCCTTTAAGAATGGCGGCGTTacggta > 1:94561/1‑145 (MQ=255) ccATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCAGCTGCACCAACAGATAACCATGGATTCAGCTCCCAGTTAACGGCGCCTTTAAGAATGGCGGCGTTACTgta > 2:1487073/1‑148 (MQ=255) ccAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCGTTATTGaa > 1:4870265/1‑150 (MQ=255) ccAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCGTTATTGaa < 2:3365957/150‑1 (MQ=255) ccAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCGTTATTGaa < 2:2825737/150‑1 (MQ=255) ccAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCGTTATTGaa < 1:1783529/150‑1 (MQ=255) catgTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCAGCTGCACCAACAGATAACCATGGATTCAGCTCCCAGTTAACGGCGCCTTTAAGAATGGCGGCGTTACTGTAt < 2:4986887/147‑1 (MQ=255) catgTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCAGCTGCACCAACAGATAACCATGGATTCAGCTCCCAGTTAACGGCGCCTTTAAGAATGGCGGCGTTACTGTAt < 1:129997/147‑1 (MQ=255) cAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCGTTATTGAAt > 2:2217437/1‑150 (MQ=255) aGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCGTTATTGAAtt < 2:2118786/150‑1 (MQ=255) ggTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCGTTATTGAAttt > 1:1197622/1‑150 (MQ=255) tCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCGTTATTGAATTTCCa < 1:4073380/150‑1 (MQ=255) ggggTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAGGCCCAATTAATTGCACCTTTATTAATTGCAGCGTTATTGAATTTCCAGTc > 2:4780034/1‑150 (MQ=255) ggggTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCGTTATTGAATTTCCAGTc < 2:5147736/150‑1 (MQ=255) ggggTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCGTTATTGAATTTCCAGTc < 2:3673347/150‑1 (MQ=255) tGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCGTTATTGAATTTCCAGTCGAGTtgac > 1:2031488/1‑150 (MQ=255) ccatccaGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCGTTATTGAATTTCCAGTCGAGTTGACTGACtt > 1:4525468/1‑150 (MQ=255) ccatccaGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCGTTATTGAATTTCCAGTCGAGTTGACTGACtt < 2:1228587/150‑1 (MQ=255) atccaGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCGTTATTGAATTTCCAGTCGAGTTGACTGACtttt > 1:3258298/1‑150 (MQ=255) gTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCGTTATTGAATTTCCAGTCGAGTTGACTGACTTTTCGGcc > 2:2660878/1‑150 (MQ=255) gTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCGTTATTGAATTTCCAGTCGAGTTGACTGACTTTTCGGcc > 1:897622/1‑150 (MQ=255) tGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCGTTATTGAATTTCCAGTCGAGTTGACTGACTTTTCGGcctcct > 1:3009089/1‑150 (MQ=255) accGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGCGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTATAATAATTGCAGCGTTATTGAATTTCCAGTCGAGTTGACTGACTTTTCGGCCTCcttc < 1:618703/148‑1 (MQ=255) aCCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCGTTATTGAATTTCCAGTCGAGTTGACTGACTTTTCGGCCTCCTTCTTCg < 2:2927782/150‑1 (MQ=255) ccctatTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCGTTATTGAATTTCCAGTCGAGTTGACTGACTTTTCGGCCTCCATCTTCgg > 2:2401794/4‑150 (MQ=255) tatTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCATCGTTATTGAATTTCCAGTCGAGTTGACTGACTTTTCGGCCTCCTTCTTCGGCTa < 2:1427042/150‑1 (MQ=255) tatTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCGTTATTGAATTTCCAGTCGAGTTGACTGACTTTTCGGCCTCCTTCTTCGGCTa < 1:3605537/150‑1 (MQ=255) ttGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCGTTATTGAATTTCCAGTCGAGTTGACTGACTTTTCGGCCTCCTTCTTCGGCTAGa < 2:2507571/150‑1 (MQ=255) tGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCGTTATTGAATTTCCAGTCGAGTTGACTGACTTTTCGGCCTCCTTCTTCGGCTAGAt < 1:3838134/150‑1 (MQ=255) gCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGTAGCGTTATTGAATTTCCAGTCGAGTTGACTGACTTTTCGGCCTCCTTCTTCGGCTAGATa < 2:4581794/150‑1 (MQ=255) ccACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCGTTATTGAATTTCCAGTCGAGTTGACTGACTTTTCGGCCTCCTTCTTCGGCTAGATaa < 1:5351798/150‑1 (MQ=255) ccTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCGTTATTGAATTTCCAGTCGAGTTGACTGACTTTTCGGCCTCCTTCTTCGGCTAGATAAaca < 1:1513296/150‑1 (MQ=255) cTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCGTTATTGAATTTCCAGTCGAGTTGACTGACTTTTCGGCCTCCTTCTTCGGCTAGATAAacac > 2:2304183/1‑150 (MQ=255) | CGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCGTTATTGAATTTCCAGTCGAGTTGACTGACTTTTCGGCCTCCTTCTTCGGCTAGATAAACACG > CP009273/580650‑580948 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |