New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 1282540 | 249 (0.640) | 19 (0.060) | 15/260 | 29.3 | 7.6% | noncoding (153/171 nt) | rttR | rtT sRNA, processed from tyrT transcript |
? | CP009273 | 1283013 = | 247 (0.730) | noncoding (66/85 nt) | tyrT | tRNA‑Tyr | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 250 total aligned reads displayed.
GGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGC‑GGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTT > CP009273/1282390‑1282690 | cGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCAGGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACt > 2:1966015/1‑151 (MQ=255) ttGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTAcaca > 1:4473117/1‑151 (MQ=255) tGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAg > 2:5292357/1‑151 (MQ=255) gCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGTGAGTTCAGGGACGTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAgc > 1:1540203/1‑151 (MQ=255) ccTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAACGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAgcg < 2:4419624/151‑1 (MQ=255) ccTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAAAATTTGATTGCGGATTCGCTTGTGAGTTAAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACACAgcg > 1:782721/1‑151 (MQ=255) tGCGGCTACGCTCTCTCGCTGAAGATCGAGCCGAACCTTTGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCATATTTATTTATTTCGGATTAGCTTGAGTGTTCTTTTACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCt < 1:2888855/151‑1 (MQ=14) gCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTTGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATAATTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTg < 2:3782095/151‑1 (MQ=255) gCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTg < 2:1374740/151‑1 (MQ=255) ccGGCCACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGACCCGTAGTCGACGCGTCTCCTCCTGCCCCGCATGGGCAGAAGATTTGATTGCGGACTCGCGTGAGAGTTCAGGGACTGTGGAAAGGGACGGGGGTGGGGGAAGGATTACTCAgcgcgg < 2:5408489/150‑3 (MQ=17) gCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTgcgc > 1:2716683/1‑151 (MQ=255) gCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTGAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCACGCTTGGGCAGACTATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGTGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTgcgc < 2:5070085/151‑1 (MQ=255) aaCGCTCTCTCGCTGACGCTCGATACGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCAACCTTCCCCGCTGAGGCAGAAAATTGGAATTCTGAAACGATTTAGAGATCAGGGGCTGTTGATAGTGCTGATGGTGGGGGAGGGAGTACTCAGCGAGgcgcgc > 2:622279/1‑151 (MQ=255) cggtctctcGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGCAAGTGCTGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCtt < 2:1016741/148‑1 (MQ=255) ctctctCGCTGTCGCTCCAGCCGAACCTTCGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGATTGAGAGTTCCGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCg < 1:2067382/151‑1 (MQ=255) cctctcGCTGACGCTCGATCCGAACCGTCGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGTTTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGc < 2:6077247/150‑1 (MQ=255) ctcGCTGTCGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCt < 2:1841312/151‑1 (MQ=255) ctcGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCt < 1:2145118/151‑1 (MQ=255) tcGCTGTCGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCtt < 2:743644/151‑1 (MQ=255) tcGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCATCGCCCtt > 2:4545907/1‑151 (MQ=255) gCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCCTCAGCGCGGCGCGCTTCGCCCGTCg > 2:2207534/1‑151 (MQ=255) gCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCATCGCCCTTCg > 1:5580871/1‑151 (MQ=255) cTGGCGCTCGAGCCGAACCTTCGTCGAAGCTTCTCATCCGTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGTAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCgg < 1:3834234/151‑1 (MQ=255) 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cTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGAGCTGCGCGCATCGCCCATCTGGTCGtt > 1:5051045/1‑151 (MQ=255) cTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATACTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTAAGGGACTTTTGAAATTGATGGTGGGGGGGGACGGATTACTAAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCggt > 1:4324692/1‑149 (MQ=17) cTCCAGCCGAACCTTTGTCGAAGCGTCTCATCCTTCCCCGCGTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGtt < 2:6264347/151‑1 (MQ=255) gAGCCGCACCTACGTCGAAGCTTCTCCTCCTTCCCCGCCTGGGCAGAATACTTGATTGCCGCTTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTAAGAAAGTGATGGTGGTGGGGGACGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGcc < 2:3255226/151‑1 (MQ=14) cGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGC‑g > 1:5694582/1‑151 (MQ=255) cGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGC‑g < 1:5644623/151‑1 (MQ=255) gAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGAGCTTCGCCCGTCGGGTCGTTGccggagg > 2:1400486/1‑146 (MQ=255) cTTACTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATATGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGC‑GGCAAc < 1:3787352/151‑1 (MQ=255) aGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCGGCGAGCATCGCCCGACGGGTCGTTGCCTGC‑CGCAAAGca > 2:3742157/1‑150 (MQ=14) gAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGC‑GGCAACGctctct > 1:402274/1‑151 (MQ=40) 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ttCCCCGCATGGGCAGAAGATTTGATTGCGGATTCGCTTGTGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGC‑GGCAACGCTCTCTCGCTTGCGCGCGAg > 2:215287/1‑151 (MQ=255) ccccGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGC‑GGCAACGATCTCTCGCTGGCGCTCGAGTc > 1:13138/1‑151 (MQ=255) cccGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGC‑GGCAACGCTCTCTAGCTGGCGCTCGAGTCg > 2:731554/1‑151 (MQ=255) ccGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGC‑GGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGa > 2:110499/1‑151 (MQ=255) cttGGGCAGAATATTAGATTCCCGATTCGCATGAGATTACACGGACTTTTGAAAGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGC‑GGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAAcc < 2:2839087/149‑1 (MQ=14) 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gggCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGC‑GGCAACGCTCTCTCGCGGGCGCTCGAGTCGAACCATg > 1:4802819/1‑151 (MQ=255) cAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGC‑GGCAACGCGCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGTAACTTGGTc > 2:256969/1‑151 (MQ=255) ataataatTTATTTCGGATTCGCTTGAGTGTTCTCTTACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGC‑GGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCg < 1:1744234/149‑1 (MQ=14) gAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGC‑GGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTAGTCGa > 2:2250139/1‑151 (MQ=255) atatTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGC‑GGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAg > 1:1038784/1‑151 (MQ=255) tatTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCATCTCCCTTCTGGTCG‑AGTCGGCGGGCAACGCTCTCTCGCTAGCCCTCGAGTCGTACCGTGGTAGAAGc > 2:24452/1‑151 (MQ=14) atTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGC‑GGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCt > 1:2236275/1‑151 (MQ=255) atTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTGGCCTGA‑GGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAggt > 2:4066539/1‑149 (MQ=255) agttGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCGGC‑GGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGCGTCGCACCTTGGTCGaaccg > 1:4446154/3‑148 (MQ=255) aTTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGC‑GGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCa > 2:4804521/1‑151 (MQ=255) 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aTTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGC‑GGCAACGCGCTCTCGCTGGCGCGCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCATCTCATCCTTcc > 2:4646102/1‑151 (MQ=255) tCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCTCTGCGCGCATCACCCAACGGGTCCATGCATGA‑GGCAACGGACTCTCGCTAACCCACGAATCGAACCATAGTAGAAGCTTCTAATCCTTcacc > 2:5801544/1‑151 (MQ=2) cGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGC‑GGCAACGCTCTCACGCTGGCGCTCGAGTCGAACCGTGGTCGAAGCTTCTCATACTTCCCCg > 1:3063799/1‑151 (MQ=255) gCTTGAGTGTTCCGGGCCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGC‑GGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCGTCTCATCCTTCCCCGc < 2:1318670/151‑1 (MQ=255) tGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGATGCCTGC‑GGCAAAGCTCTCTCGCAGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATg > 2:4690942/1‑151 (MQ=255) agagTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAATACGCAGAGCTGCGCGGATCGCCCTACTGGTACTAGCCTGC‑GACAACGCGCTCTCGCGGGCGCACGAGTCGAACCGTGGTCGAAGCTTCTCTTCCTGCGCCGCGTggg > 2:2871413/1‑151 (MQ=14) tgcttatttttGGAAGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGC‑GGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAat < 2:3472798/144‑1 (MQ=255) aaggaaGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGC‑GGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTg > 2:2981798/5‑151 (MQ=14) tGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGC‑GGCAACGCACTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTAGAACCTTCTCAACCATCCCCGCAAGGGCAGAATATTTAATTGc > 1:4508622/1‑151 (MQ=14) gaaGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGC‑GGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCgg < 1:6279246/150‑1 (MQ=18) tGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCAGC‑GGCAACGCTCTATCGCAGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAATCATATCAACCGTCCCCGCATGGGGAGAATATTTAATTTCGGAGTc > 1:668464/1‑151 (MQ=11) cgATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGC‑GGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTc < 1:2604737/150‑1 (MQ=25) gATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGC‑GGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCg > 1:4094240/1‑151 (MQ=14) aTGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGC‑GGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCGTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAAGATTTAATTTGGGATTCgg > 1:512887/1‑150 (MQ=11) aTGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGC‑GGCAACGCTCTCGCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGTATATTTAATTTCGGAGTCGt > 2:312082/1‑151 (MQ=255) aTGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGC‑GGCAACGCACACACGCTGGCGCTCGAGTAGAACCTAGGTCGAAGCATAACAAACATCCCCCCCTGGGCAGAAAAATTAAATTCGGaatagg > 1:5927341/1‑146 (MQ=11) tggtggtggGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCGTGC‑GGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCGCGAGTCGTACCGTGGTGGAAGCTTCTAATCCGTCCCCGGATGGGCAGAGTATTTAATTGAGGATTGGtg > 1:1213156/1‑150 (MQ=11) gtggtggGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGC‑GGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTgg < 2:2591760/151‑1 (MQ=38) gtggtggGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGC‑GGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTgg < 1:5446634/151‑1 (MQ=38) tggtggGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGC‑GGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTggg < 1:6088550/151‑1 (MQ=38) gggggAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGC‑GGGAACGCTCTATCGGTGGCGCTGGTGGGGAAGCTTGGTCGAAGCGTCTCATCCTTCACCGCATGGGCAGGATATTTAATTGCGGATTCGTTgggtatt > 2:2514180/1‑147 (MQ=14) gggAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGC‑GGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTc < 1:1090082/151‑1 (MQ=255) ggAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGC‑GGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCAACCTTCCCCGCATGGGCAGAAAATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGttaa > 2:5897232/1‑149 (MQ=255) gAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGC‑GGCAACGCGCACTCGCTGGCGCTCCAGTCGAACCGTGGTCGAAGCATCTAAACCTTCCCCCCATGGGCAGAATATTTTATTGCGGCTTCGGTTGGGACTTCAg > 1:4736698/1‑151 (MQ=11) ggATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGC‑GGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCTAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGa < 2:5468849/151‑1 (MQ=255) ggATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGC‑GGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGa < 1:1897489/151‑1 (MQ=255) tACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGC‑GGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGACGAACCTTTGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACttt < 1:1181779/151‑1 (MQ=255) | GGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGC‑GGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTT > CP009273/1282390‑1282690 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |