| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 2811716 | 275 (0.710) | 17 (0.050) | 12/260 | 31.2 | 6.9% | intergenic (‑83/+116) | argY/argV | tRNA‑Arg/tRNA‑Arg |
| ? | CP009273 | 2811851 = | 221 (0.660) | noncoding (58/77 nt) | argV | tRNA‑Arg | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 277 total aligned reads displayed.
TGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAGGGGAGCGCCTTCAGCCTCTCGGCCACCTC > CP009273/2811701‑2812001 | gCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCg > 1:2599172/1‑151 (MQ=255) tCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAAc > 2:4452896/1‑151 (MQ=255) gggAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGATATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑CG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTc > 2:2344838/1‑151 (MQ=255) gaggaTTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCg < 1:4873538/151‑1 (MQ=255) gaggaTTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCg > 2:3112141/1‑151 (MQ=255) gaTTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGAcc < 1:339942/151‑1 (MQ=255) gaTTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGAcc > 1:2850090/1‑151 (MQ=255) cTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCg > 2:4605063/1‑151 (MQ=255) cTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGCCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCg < 1:1862055/151‑1 (MQ=255) tCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCgg > 1:1966334/1‑151 (MQ=255) cGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AG‑TACGTAGACTATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCGCGGt > 1:3830503/1‑151 (MQ=255) cTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCg < 2:5396393/151‑1 (MQ=255) cTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCAGCGCTGAA‑CG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCg > 2:3916911/1‑151 (MQ=255) cTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCAACCTCTTCCATACCTTCATAGCTGAA‑AT‑TACGTAGAATATGGTGCATACGGGAGGATTCGAAACTCCGACCGCACGGTTCg > 2:841677/1‑151 (MQ=11) tGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCGATACCTTCATCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTa < 1:3703695/151‑1 (MQ=255) gCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCAACCTCTTCCATACCTTCATAGCTGAA‑AG‑TACGTAGTAAAAGGTGCATCCGGGAGGAATAGAACCTACGACCGCGCGGTtagtag > 1:5317259/1‑151 (MQ=14) cGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGc > 1:6132008/1‑151 (MQ=255) cGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGc > 2:2089601/1‑151 (MQ=255) ggCTCGCCCTTCGGGCCTTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTAATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGcc < 1:5446346/151‑1 (MQ=255) ggCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AG‑TAAGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGcc > 1:5817913/1‑151 (MQ=11) gCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATACCGCAACCTCTTCCATACCTTCATAGCTGAA‑AG‑TAAGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGGTTAGAACCTCCGTCCGCGCGGTTAGTAGCCg > 1:6089756/1‑151 (MQ=11) gCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTa > 2:5947618/1‑151 (MQ=255) cccTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGttg > 1:5591014/1‑149 (MQ=255) cccTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTAc > 1:3156968/1‑151 (MQ=255) cGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTAt < 2:2309134/151‑1 (MQ=255) ggCCGTTGCTAAAGCAACGTTAACGTCCCAGGTGCCTCCGTTTATTACCGCCACATCTTACTTCCCTTCTTCCGTGAT‑AT‑TACGTATTATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATcc < 1:5146132/151‑1 (MQ=17) ccttagCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAg < 1:1714558/146‑1 (MQ=255) cGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGc > 1:4070699/1‑151 (MQ=255) cGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGc > 1:2902971/1‑151 (MQ=255) gTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCt > 1:5729990/1‑151 (MQ=255) gTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCt > 2:1361485/1‑151 (MQ=255) cTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGc > 1:5755104/1‑151 (MQ=255) cTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGc > 1:6204371/1‑151 (MQ=255) aaaGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTa > 1:2346088/1‑151 (MQ=255) aaGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTAc > 1:111243/1‑151 (MQ=255) cAACTTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGa > 2:3054179/1‑151 (MQ=255) gTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCa > 2:3849222/1‑151 (MQ=255) gTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCa > 2:3879782/1‑151 (MQ=255) tATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑TG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCaaa > 2:3380771/1‑151 (MQ=255) ctccCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGc > 2:736862/1‑151 (MQ=255) tccCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCTACGCTGAT‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCg < 1:820111/151‑1 (MQ=255) tccCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCg > 1:3022489/1‑151 (MQ=255) tccCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCg < 1:1279634/151‑1 (MQ=255) tccCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGAAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCg > 2:1943751/1‑151 (MQ=255) cTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTg > 1:6188642/1‑151 (MQ=255) gcgTGCCAGCGGATATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCTTCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTACATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGa < 2:5864263/149‑1 (MQ=255) ggTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAg < 1:4313120/151‑1 (MQ=255) ggTGCATGCGGTTATTACCGCAACCTCTTCAATACCTTCATGGCTGAT‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAg < 1:4787833/151‑1 (MQ=255) gCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCg > 2:1759076/1‑151 (MQ=255) ggTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGAtt > 2:5472867/1‑151 (MQ=255) tattaCCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGa > 2:2644623/1‑151 (MQ=255) gctaCCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGAT‑TTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCg > 2:5247719/4‑151 (MQ=11) gCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCgg > 2:1632652/1‑151 (MQ=255) cACCTCTTCCATCCCTACATCGCTGAT‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGAt < 1:465372/151‑1 (MQ=255) ccTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGc > 1:1143287/1‑151 (MQ=255) ctctTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCa > 1:4500673/1‑151 (MQ=255) ctTCGATACCTTCATTGCTGAA‑GGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAAcc > 2:289259/1‑141 (MQ=11) ctTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGc < 1:75563/151‑1 (MQ=255) caatcccTACATCGCTCAT‑AT‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCttt < 1:3059667/146‑1 (MQ=21) aTACCTTCATTGCTGAAGAT‑TTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCtttt > 1:2500611/1‑151 (MQ=17) tACCTTCATCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAATTGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGa > 2:2923287/1‑151 (MQ=255) aCCTTCATTGCTGAAGAT‑TTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCtt > 1:2722141/1‑147 (MQ=14) aCCTTCATTGCTGAAGAT‑TTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCtt < 2:2722141/147‑1 (MQ=14) 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aCGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAg > 2:677767/1‑151 (MQ=255) cGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAgg > 2:4189771/1‑151 (MQ=255) gTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAggg > 2:3334670/1‑151 (MQ=255) taagagatGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTTAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCGTACTCCCTTAGCAgggg > 2:4890851/7‑151 (MQ=255) aGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAGGGGa < 2:1493885/151‑1 (MQ=255) gAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAGGGGAg > 2:5572011/1‑151 (MQ=255) gAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAGGGGAg < 2:2500611/151‑1 (MQ=255) gAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATACGAACCCCTGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAGGTGAg > 2:3498283/1‑151 (MQ=255) atGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAGGGGAGCGcc < 1:2227820/151‑1 (MQ=255) tGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAGGGGAGCGCCt > 2:4832845/1‑151 (MQ=255) tGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAGGGGAGCGCCTTCa < 1:4516904/151‑1 (MQ=255) gCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAGGGGAGCGCCTTCAg > 2:4338221/1‑151 (MQ=255) gCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGATGTGATGCGGGGATTCGAACCCCTGATGCAGCTGATAAACGCATACTCCCTAAGCGGTGGAGCGccagcag > 2:5683476/1‑146 (MQ=18) aTCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGa > 2:1981586/1‑104 (MQ=255) aTCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGa < 1:1981586/104‑1 (MQ=255) tCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAGGGGAGCGCCTTCAGCct < 1:3171446/151‑1 (MQ=255) ccGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAggg > 2:4241640/1‑135 (MQ=255) ccGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAggg < 1:4241640/135‑1 (MQ=255) cGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAGGGGAGCGCCTTCAGCctct > 2:3239334/1‑151 (MQ=255) cGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAGGGGAGCGCCTTCAGCctct > 2:2633408/1‑151 (MQ=255) gggAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAGGGGAGCGCCTTCAGCCtctc > 2:3628886/1‑151 (MQ=255) ggaggaTTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTTAGGCGGGGAGACGAAAACAGGATGCAGCTAGTGAACGCGTACACACTAAGCGGGGGAGCGCCATCGGCCTCTCg > 2:1928901/1‑151 (MQ=18) ggaggaTTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAGGGGAGCGCCTTCAGCCTCTCg > 2:4653387/1‑151 (MQ=255) gaggaTTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAGGGGAGCGCCTTCAGCCTCTCgg > 1:2053046/1‑151 (MQ=255) aggaTTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAGGGGAGCGCCTTCAGCCTCTCGGc > 1:1616670/1‑151 (MQ=255) aTTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAGGGGAGCGCCTTCAGCCTCTCGGCCAc > 2:5163359/1‑151 (MQ=255) aTTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAGGGGAGCGCCTTCAGCCTCTCGGCCAc > 1:867409/1‑151 (MQ=255) | TGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAGGGGAGCGCCTTCAGCCTCTCGGCCACCTC > CP009273/2811701‑2812001 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |