| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | CP009273 | 4,630,235 | IS30 (+) +2 bp | coding (17‑18/141 nt) | yjjY → | uncharacterized protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 4497276 = | NA (NA) | 304 (0.930) | 166/298 | 0.4 | 100% | noncoding (1221/1221 nt) | IS30 | repeat region |
| ? | CP009273 | 4630235 = | 0 (0.000) | coding (17/141 nt) | yjjY | uncharacterized protein | |||||
| * | ? | CP009273 | = 4498496 | NA (NA) | 367 (1.140) | 204/296 | 0.0 | 100% | noncoding (316/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | CP009273 | = 4630236 | 0 (0.000) | coding (18/141 nt) | yjjY | uncharacterized protein | |||||
Only 100 of 679 total aligned reads displayed.
ACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACAACATCATTAGCTTGGTCGTGGGTACTTTCCCTCAGGACCCGACAGTGTCAAAAACGGCTGTCATCCTAACCATTTTAACAGCAACATAACAGGCTAAGAGGGGCCGGACACCCAAT > CP009273/4630087‑4630386 | taaaaagacatgtcttgcccaatatactcaacatgaactagatctggttgctgctcagctaaacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGc > 2:3997323‑M2/147‑151 (MQ=255) tCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgt > 1:449294‑M2/1‑148 (MQ=255) aaagacatgtcttgcccaatatactcaacatgaactagatctggttgctgctcagctaaacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGtt > 1:334632‑M2/144‑151 (MQ=255) ttCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagatt > 1:1452000‑M2/1‑143 (MQ=255) acatgtcttgcccaatatactcaacatgaactagatctggttgctgctcagctaaacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTCTTg < 2:1879769‑M2/12‑1 (MQ=255) catgtcttgcccaatatactcaacatgaactagatctggttgctgctcagctaaacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTCTTGa < 1:282352‑M2/13‑1 (MQ=255) atgtcttgcccaatatactcaacatgaactagatctggttgctgctcagctaaacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTCTTGAt > 1:1006792‑M2/138‑151 (MQ=255) aTAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattgg > 1:2282959‑M2/1‑136 (MQ=255) cGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaaca > 1:3869050‑M2/1‑125 (MQ=255) gggTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagt < 2:4248951‑M2/151‑29 (MQ=255) ggTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagtt > 1:4123445‑M2/1‑122 (MQ=255) gTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagtta < 2:1457561‑M2/151‑31 (MQ=255) tCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttat < 2:3386727‑M2/151‑32 (MQ=255) cTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatg < 2:1293708‑M2/151‑33 (MQ=255) tGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgt < 2:3598211‑M2/151‑34 (MQ=255) acatgaacgagatctggttgctgctcagctaaacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTcaac < 2:1194379‑M2/35‑1 (MQ=255) catgaactagatctggttgctgctcagctaaacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTcaaca > 2:3267623‑M2/116‑151 (MQ=255) catgaactagatccggttgctgctcagctaaacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaacgagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTcaaca < 2:4949171‑M2/36‑1 (MQ=255) aTGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtgaa < 1:2429466‑M2/151‑37 (MQ=255) gCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtgaaaacatg < 2:4105243‑M2/151‑43 (MQ=255) gatctggttgctgctcagctaaacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACAACATCATTa > 2:1054832‑M2/107‑151 (MQ=255) cTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtgaaaacatgg > 1:4393766‑M2/1‑108 (MQ=255) tctggttgctgctcagctaaacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACAACATCATTAGc > 1:3584654‑M2/105‑151 (MQ=255) aCCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtgaaaacatgggg > 1:4708136‑M2/1‑106 (MQ=255) ctggttgctgctcagctaaacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACAACATCATTAGCt < 1:3796527‑M2/48‑1 (MQ=255) tggttgctgctcagctaaacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACAACATCATTAGCtt < 1:1072235‑M2/49‑1 (MQ=255) ggttgctgctcagctaaacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACAACATCATTAGCTTg < 1:3666865‑M2/50‑1 (MQ=255) ttgctgctcagctaaacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACAACATCATTAGCTTGGt > 2:3432679‑M2/100‑151 (MQ=255) ttgctgctcagctaaacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACAACATCATTAGCTTGGt < 1:4838529‑M2/52‑1 (MQ=255) aaTTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtgaaaacatggggttgcg > 2:2432349‑M2/1‑101 (MQ=255) aTTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtgaaaacatggggttgcgg > 2:2041752‑M2/1‑100 (MQ=255) ctgctcagctaaacaacagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACAACATCATTAGCTTGGTCGt < 1:733471‑M2/55‑1 (MQ=255) gCCAACTAAATCGAAACAGGCAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCTTGCTGCTAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtgaaaacatggggttgcggagg > 1:4002041‑M2/1‑97 (MQ=255) cAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtgaaaacatggggttgcggtggtt < 1:2684432‑M2/151‑57 (MQ=255) aaaTCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtgaaaacatggggttgcggaggttttttg < 2:5222147‑M2/151‑62 (MQ=255) aaaTCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtgaaaacatggggttgcggaggttttttg < 1:2886441‑M2/151‑62 (MQ=255) aTCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtgaaaacatggggttgcggaggttttttgaa > 1:2523312‑M2/1‑88 (MQ=255) aTCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtgaaaacatggggttgcggaggttttgtgaa < 2:4148925‑M2/151‑64 (MQ=255) aaaCAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtgaaaacatggggttgcggaggttttttgaatgag > 1:129640‑M2/1‑84 (MQ=255) aaaCAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtgaaaacatggggttgcggaggttttttgaatgag > 1:3738852‑M2/1‑84 (MQ=255) acagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgacaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACACCATCATGAGCTTGGTCGTGGGTACTTTCCCTCa < 2:68183‑M2/70‑1 (MQ=255) acagaccgagaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTCTTGATGAACTTTCCATCAACGTCAACAACATCATTAGCTTGGTCGTGGGTACTTTCCCTCa > 2:259662‑M2/82‑151 (MQ=255) aacccgaagtaCAACAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtgaaaacatggggttgcggaggttttttgaatgaga > 2:3699084‑M2/6‑83 (MQ=255) cAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtgaaaacatggggttgcggaggttttttgaatgagacg < 1:1639465‑M2/151‑71 (MQ=255) aaGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtgaaaacatggggttgcggaggttttttgaatgagacgaaca > 2:432645‑M2/1‑77 (MQ=255) gTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtgaaaacatggggttgcggaggttttttgaatgagacgaacatt > 1:3464577‑M2/1‑75 (MQ=255) agaaagacactgaagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACAACATCATTAGCTTGGTCGTGGGTACTTTCCCTCAGGACCCGa < 2:1347101‑M2/78‑1 (MQ=255) aCAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtgaaaacatggggttgcggaggttttttgaatgagacgaacattta < 1:568905‑M2/151‑79 (MQ=255) aCAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtgaaaacatggggttgcggaggttttttgaatgagacgaacattta > 1:829134‑M2/1‑73 (MQ=255) aaaGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtgaaaacatggggttgcggaggttttttgaatgagacgaacatttacag < 1:494468‑M2/151‑82 (MQ=255) gTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtgaaaacatggggttgcggaggttttttgaatgagacgaacatttacagcag > 2:306534‑M2/1‑67 (MQ=255) tCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtgaaaacatggggttgcggaggttttttgaatgagacgaacatttacagcagt < 1:2178581‑M2/151‑86 (MQ=255) cccTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtgaaaacatggggttgcggaggttttttgaatgagacgaacatttacagcagag < 2:29276‑M2/151‑87 (MQ=255) cccTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtgaaaacatggggttgcggaggttttttgaatgagacgaacatttacagcagag < 1:3896127‑M2/151‑87 (MQ=255) aagttcaaaacaccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACAAAATCATTAGCTTGGTCGTGGGTACTTTCCCTCAGGACCCGACAGTGTCaaaaa > 2:573410‑M2/62‑151 (MQ=255) tGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtgaaaacatggggttgcggaggttttttgaatgagacgaacatttacagcagaggaa > 1:1212917‑M2/1‑62 (MQ=255) gACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtgaaaacatggggttgcggaggttttttgaatgagacgaacatttacagcagaggaaa < 1:3536964‑M2/151‑91 (MQ=255) tgATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtgaaaacatggggttgcggaggttttttgaatgagacgaacatttacagcagaggaaaaagcctct > 2:4208657‑M2/1‑53 (MQ=255) caccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACAACATCATTAGCTTGGTCGTGGGTACTTTCCCTCAGGACCCGACAGTGTCAAAAACGGCTGTCAt < 1:3300184‑M2/100‑1 (MQ=255) caccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACAACATCATTAGCTTGGTCGTGGGTACTTTCCCTCAGGACCCGACAGTGTCAAAAACGGCTGTCAt > 2:2246446‑M2/52‑151 (MQ=255) gATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtgaaaacatggggttgcggaggttttttgaatgagacgaacatttacagcagaggaaaaagcctctg > 1:4223303‑M2/1‑52 (MQ=255) ccgaaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACAACATCATTAGCTTGGTCGTGGGTACTTTCCCTCAGGACCCGACAGTGTCAAAAACGGCTGTCATcc < 2:2691863‑M2/102‑1 (MQ=255) aaagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACAACATCATTAGCTTGGTCGTGGGTACTTTCCCTCAGGACCCGACAGTGTCAAAAACGGCTGTCATCCTaa > 1:1888988‑M2/47‑151 (MQ=255) aagagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatatacaATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCAACAACGTCAACAACATCATTAGCTTGGTCGTGGGTACTTTCCCACAGGACCCGACAGTGACAAAAACGGCTGTCATCCTAAc > 2:4785222‑M2/46‑151 (MQ=255) tgctgcAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtgaaaacatggggttgcggaggttttttgaatgagacgaacatttacagcagaggaaaaagcctctgtttttg > 1:3028295‑M2/1‑46 (MQ=255) gagataattgaaaggggtgttgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACAACATCATTAGCTTGGTCGTGGGTACTTTCCCTCAGGACCCGACAGTGTCAAAAACGGCTGTCATCCTAACCa > 2:4997711‑M2/44‑151 (MQ=255) tgcAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtgaaaacatggggttgcggaggttttttgaatgagacgaacatttacagcagaggaaaaagcctctgtttttgaac < 1:3196626‑M2/151‑109 (MQ=255) cAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtgaaaacatggggttgcggaggttttttgtatgagacgaacatttacagcagaggaaaaagcctctgtttttgtacta < 2:1968690‑M2/151‑111 (MQ=255) 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ggCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtgaaaacatggggttgcggaggttttttgaatgagacgaacatttacagcagaggaaaaagcctctgtttttgaactatggaagaacggaaca < 2:3527408‑M2/151‑126 (MQ=255) tgcattgacagattgaatctacaATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACAACATCATTAGCTTGGTCGTGGGTACTTTCCCTCAGGACCCGACAGTGTCAAAAACGGCTGTCATCCTAACCATTTTAACAGCAACATAACAg < 1:923060‑M2/128‑1 (MQ=255) gCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtgaaaacatggggttgcggaggttttttgaatgagacgaacatttacagcagaggaaaaagcctctgtttttgaactatggaagaacggaacag > 1:4273074‑M2/1‑25 (MQ=255) cattgacagattgaatctacaATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACAACATCATTAGCTTGGTCGTGGGTACTTTCCCTCAGGACCCGACAGTGTCAAAAACGGCTGTCATCCTAACCATTTTAACAGCAACATAACAGGc > 2:3007823‑M2/22‑151 (MQ=255) cattgacagattgaatctacaATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACAACATCATTAGCTTGGTCGTGGGTACTTTCCCTCAGGACCCGACAGTGTCAAAAACGGCTGTCATCCTAACCATTTTAACAGCAACATAACAGGc < 1:5233155‑M2/130‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |