Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 580,784 | 0 | G | A | 21.6% | 818.6 / 274.5 | 351 | V102V (GTC→GTT) | ompT | DLP12 prophage; outer membrane protease VII (outer membrane protein 3b) |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (133/142); new base A (35/41); total (168/183) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.96e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 352 total aligned reads displayed.
GGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCGTTATTGAATTTCCAGTCGAGTTGACTGACTTTTCGGCCTCCTTCTTC > CP009273/580634‑580933 | ggCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCg > 1:2703913/1‑151 (MQ=255) gCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGa < 1:1720498/151‑1 (MQ=255) cATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCGGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGAcc < 2:3032149/151‑1 (MQ=255) aTGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCa > 2:755685/1‑151 (MQ=255) aTGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCa > 1:5039428/1‑151 (MQ=255) cgTCCCACGCGGTAATTGGTTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCAACCAGTCCTGATCGACCatat < 2:2134856/150‑1 (MQ=255) ccAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCAGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGcc > 2:4276498/1‑151 (MQ=255) aGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCAc < 2:4647222/151‑1 (MQ=255) aGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAAGTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCAc > 2:2353180/1‑151 (MQ=255) ggCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCAcc > 2:3804500/1‑151 (MQ=255) gCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCt < 2:4471083/151‑1 (MQ=255) aaTTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCATGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCt < 2:1269900/151‑1 (MQ=255) tGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGcc < 1:3018942/151‑1 (MQ=255) ttCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCgaga < 2:2612550/151‑1 (MQ=255) tCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGagag < 1:1941616/151‑1 (MQ=255) gTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGtt > 1:287028/1‑151 (MQ=255) aaaaaccagccTTTAACGTTCAAATCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTcc < 1:758303/146‑1 (MQ=255) ccagccTTTAACGTTCAAATCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTccagcca < 1:1255973/151‑1 (MQ=255) ccagccTTTAACGTTCAAAGCACCTTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATAGTCCCCCCCCGACTATTGAGAGGGGTccagcca < 1:1043554/151‑1 (MQ=255) cagccTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTccagccag > 1:5186084/1‑151 (MQ=255) cagccTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTccagccag < 2:2884799/151‑1 (MQ=255) agccTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCAGAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACGTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGGTGACcagccagc > 1:1801306/1‑151 (MQ=255) agccTTTAACGTTCAAATCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTccagccaga > 2:5089325/1‑150 (MQ=255) 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tcaaatcaaaTTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCAGCTGCTCCaacaga > 1:1326424/1‑151 (MQ=255) tCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCgataga > 2:375487/1‑151 (MQ=255) aaaTCAAATTCGTTGGCATAATTAAGACGTGTATCAGGATGCCTGCTTTCATCTGTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCAGCTGCACCaacagata < 1:3517536/149‑1 (MQ=255) aGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCgatagata < 1:3346404/151‑1 (MQ=255) aGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCgatagata > 2:3889866/1‑151 (MQ=255) aGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCgatagata > 1:4761800/1‑151 (MQ=255) gATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGatat < 1:5257946/151‑1 (MQ=255) gATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGatat > 1:4656108/1‑151 (MQ=255) cAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTg < 2:3343987/151‑1 (MQ=255) aaaTTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATCTCTgg > 2:929119/1‑151 (MQ=255) aaaTTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTgg < 1:2142804/151‑1 (MQ=255) aaaTTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTgg > 2:1853936/1‑151 (MQ=255) aTTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTgggg > 2:2988319/1‑151 (MQ=255) aTTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGGTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCGTATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTgggg > 2:1320466/1‑151 (MQ=255) tCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCa < 2:4114089/151‑1 (MQ=255) 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tAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATccc > 1:4354314/1‑151 (MQ=255) tAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATccc < 2:35085/151‑1 (MQ=255) tAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATccc > 1:1600217/1‑151 (MQ=255) aaTTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCa > 2:2176769/1‑151 (MQ=255) aTTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCaa > 2:2421389/1‑151 (MQ=255) 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ctgTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCAGCTGCACCAACAGATAACCATGGATTCAGCTCCCAGTTAACGGCGCCTTTAAGAATGGCGGCGTTact < 1:4498453/149‑3 (MQ=255) gTCCATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCAGCTGCACCAACAGATAACCATGGATTCAGCTCCCAGTTAACGGCGCCTTTAAGAATGGCGGCGTTACTgt > 2:4236359/1‑150 (MQ=255) gTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCGTTATTGa > 2:1450440/1‑151 (MQ=255) tCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCGTTATTGaa > 1:996084/1‑151 (MQ=255) ccATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCAGCTGCACCAACAGATAACCATGGATTCAGCTCCCAGTTAACGGCGCCTTTAAGAATGGCGGCGTTACTGTAt < 1:396512/151‑1 (MQ=255) ccATGTTCCGGGAGTCCCGGAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCAGCTGCACCAACAGATAACCATGGATTCAGCTCCCAGTTAACGGCGCCTTTAAGAATGGCGGCGTTACTGTAt < 1:1099055/151‑1 (MQ=255) aGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCGTTATTGAAttt < 2:5188890/151‑1 (MQ=255) aGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCGTTATTGAAttt < 1:3258164/151‑1 (MQ=255) ggTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCGTTATTGAATTTc < 1:2353290/151‑1 (MQ=255) ccGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCGTTATTGAATTTCCAGt > 2:851676/1‑151 (MQ=255) gagtcccggAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCAGCTGCACCAACAGATAACCATGGATTCAGCTCCCAGTTAACGGCGCCTTTAAGAATGGCGGCGTTACTGTATTtccagtccag < 1:576311/144‑1 (MQ=255) agtcccggAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCAGCTGCACCAACAGATAACCATGGATTCAGCTCCCAGTTAACGGCGCCTTTAAGAATGGCGGCGTTACTGTATTTccagtccagt < 1:2604011/145‑1 (MQ=255) ccggAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCAGCTGCACCAACAGATAACCATGGATTCAGCTCCCAGTTAACGGCGCCTTTAAGAATGGCGGCGTTACTGTATTTCCAGTCCAGTtggc < 1:4299498/149‑3 (MQ=255) ccggAATCCATCCAGTCCTGATCAACCATATTCCCCCCCCGACTATTGAGAGTGGTCCAGCCAGCTGCACCAACAGATAACCATGGATTCAGCTCCCAGTTAACGGCGCCTTTAAGAATGGCGGCGTTACTGTATTTCCAGTCCAGTtggc < 1:877682/149‑3 (MQ=255) tGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCGTTATTGAATTTCCAGTCGAGTtgact > 2:320176/1‑151 (MQ=255) gAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCTGTATTGAATTTCCAGTCGAGTtgactga > 2:2696163/1‑151 (MQ=255) atccatccAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCGTTATTGAATTTCCAGTCGAGTTgactgact < 1:5005254/151‑1 (MQ=255) atccatccAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCGTTATTGAATTTCCAGTCGAGTTgactgact > 1:2498902/1‑151 (MQ=255) atccaGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCGTTATTGAATTTCCAGTCGAGTTGACTGACTTTTc > 2:1556052/1‑151 (MQ=255) aGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCGTTATTGAATTTCCAGTCGAGTTGACTGACTTTTCGGcc > 2:246850/1‑151 (MQ=255) gATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCACATCCCAATTAATTGCACCTTTCATATTTGCAGCGTTCTTGAATTTCCAGTCGAGTTGACTGACTTTTAGGCCTCcttc > 2:2276299/1‑151 (MQ=255) cGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCGTTATTGAATTTCCAGTCGAGTTGACTGACTTTTCGGCCTCCttcttc < 2:166652/151‑1 (MQ=255) | GGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGGCTGCCGAGAGTTGTCCAGCCAGCAGCCCCGATAGATATCTGGGGCATCAAATCCCAATTAATTGCACCTTTAATAATTGCAGCGTTATTGAATTTCCAGTCGAGTTGACTGACTTTTCGGCCTCCTTCTTC > CP009273/580634‑580933 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |