| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP022686 | 1,775,833 | T→G | 7.1% | N202T (AAC→ACC) | CIW80_RS08815 ← | N‑acetylneuraminate epimerase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP022686 | 1,775,833 | 0 | T | G | 7.1% | 311.0 / 2.1 | 165 | N202T (AAC→ACC) | CIW80_RS08815 | N‑acetylneuraminate epimerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (76/71); new base G (12/4); total (88/77) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.12e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 172 total aligned reads displayed.
GATCATGCGAAAGCTCCCCCGTCCAGGATCTAACAGAACGAAGCCCCGGTTTTCTCTCCCCTCCCAGTATATAAATTTGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAAGAAATTATATGATTATTTAAAAAATAATCATCAGCAGGTTTACTAAAATAATCCCTGTTGACTTTCTCTGTCAGCGCGGAATTCCCTTTTGATAACTCGACATCTGAAA > NZ_CP022686/1775696‑1775971 | tCATGCGAAAGCTCCCCCGGCCAGGATCTAACAGAACGAAGCCCCGGTTTTCTAGCCCCTCCCAGTATATAAAATTGCTGTTCTGCAAAAATCACCGCTGAACCAGCAGTGCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCCGGttctt > 6:800738/1‑140 (MQ=255) tGCGAAAGCTCCCCCGTCCAGGATCTAACAGAACGAAGCCCCGGTTTTCTCTCCCCTCCCAGTATATAAATTTGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCCa < 7:609119/140‑1 (MQ=255) gCGAAAGCTCCCCCGTCCAGGATCTAACAGAACGCAGCCCCGGGTTTCTCTCCCCTCCCAGTATATAAATTTGCTGTTCTGCAAAAATCAACGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCCAc < 5:1060948/140‑1 (MQ=255) gCGAAAGCTCCCCCGTCCAGGATCTAACAGAACGAAGCCCCGGTTTTCTCTCCCCTCCCAGTATATAAATTTGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCCAc < 1:662542/140‑1 (MQ=255) atgCTCCCCCGTCCAGGATCTAACAGAACGAAGACCCGGTTTTCTCACCCCTCCCAGTATATAAATTTGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGTAATGGAGGCGTTCCAAGGTTCTTCCACTGGt < 7:1049076/138‑1 (MQ=255) cccccGTCCAGGATCTAACAGAACGAAGCCCCGGTTTTCTCTCCCCTCCCAGTATATAAATTTGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTGGTACACTGGtttttt > 1:584903/1‑140 (MQ=255) ccccGTCCAGGATCTAACAGAACGAAGCCCCGGTTTTCTCTCCCCTCCCAGTATATAAATTTGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGGTCTTCCACTGGgtttttt > 8:1089721/1‑139 (MQ=255) cccGTCCAGGATCTAACAGCACGAACCCCCGGTTTTCTCTCCCCTCCCAGTATATAAATTTGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGa < 7:882436/140‑1 (MQ=255) cccGTCCAGGATCTAAAAGAACGAAGCACCGGTTTTCTCTCCCCTCCCTGTATATAAATTTGCTGTTCTTCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGGCGTTCCCAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGa < 8:831364/140‑1 (MQ=255) gTCCAGGATCTAACAGCACGAAGCCCCGGTTTTCGCTCCCCTCCCAGTATATAAAATTGCTGTTCGGCAAAAATACCCGCTGTACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGGTAGTCCCCGGGTGTTTTGAcag > 2:1192993/1‑138 (MQ=255) tCTAACAGAACGAAGCCCCGGTTTTCTCTCCCCTCCCAGTATATAAATTTGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAAg < 6:1118786/140‑1 (MQ=255) cTAACAGAACGAAGCCCCGGTTTTCTCTCCCCTCCCAGTATATAAATTTGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAAGa < 4:28069/140‑1 (MQ=255) aaCAGAACGACGCCCCGGTTTTCTCTCCCCTCCCAGTATATAAATTTGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAAGaaa < 6:398842/140‑1 (MQ=255) aaCAGAACGAAGCCCCGGTTTTCTCTCCCCTCCCATTATATAAATTTGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTGTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAATaaa > 3:456715/1‑140 (MQ=255) aaCAGAACGAAGCCCCGGTTTTCTCTCCCCTCCCAGTATATAAATTTGCTGTTCTGCAAAAATCACCGCTGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTACCAGGTTCGTCCCCTGGTTTTTTGAGGGGTGATAAGtaa > 2:1040714/1‑140 (MQ=255) aaCAGAACGAAGCCCCGGTTTTCTCTCCCCTCCCAGTATATAAATTTGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAAGaaa > 5:597317/1‑140 (MQ=255) aaCAGAACGAAGCCCCGGTTTTCTCTCCCCTCCCAGTATATAAATTTGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAAGaaa > 4:611155/1‑140 (MQ=255) aaCAGAACGAAGCCCCGGTTTTCTCTCCCCTCCCAGTATATAAATTTGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCCACTGGGTTTTTGACGGGTCATAAGaaa > 5:300046/1‑140 (MQ=255) aaCAGAACGAAGCCCCGGTTTTCTCTCCCCTCCCAGTATATAAATTTGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCAACTGGTTTTTTGa < 3:521814/126‑1 (MQ=255) aaCAGAACGAAGCCCCGGTTTTCTCTCCCCTCCCAGTATATAAATTTGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCACAGGGTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAAGaaa > 6:693585/1‑140 (MQ=255) aaCAGAACGAAGCCCCGGTTTTCTCTCCCCTCCCAGTATATAAATTTGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTACCAGGTTATTCAACTGGTTTTTTTAAGGGTCAAAAGaaa > 1:460140/1‑140 (MQ=255) aaCAGAACGAAGCCCCGGTTTTCTCTCCCCTCCCAGTATATAAATTTGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAAAGGAGTCGTTACCAGGTTCGTCCACTGGGTTTTTTAAGCGTCATAACaaa > 1:1035303/1‑140 (MQ=255) aaCAGAACGAAGCCCCGGTTTTCTCTCACCTCCCAGTATATAAATTTGCTGTTCTGCAAAAATCCCCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGGTAGTCCTCTGGGTTTTTGGCGGGGCATAAGaaa > 6:297179/1‑140 (MQ=255) aaCAGAACGAAGCCCCGGGTTTCTCTCCCCTCCCAGTATATAAATTTGCTGTTCTGCAAAAATCACCGCTGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGGTCTGCCACTGGTGTTTTGCCGGGTAATCAGaaa > 7:106267/1‑140 (MQ=255) aCAGAACGAAGCCCCGGTTTTCTCTCCCCTCCCAGTATATAAATTTGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGTATTCGTTACCAGGGTCTTCCACAGGTTTTTTGACGGGGCATAAGAAAt > 4:662249/1‑140 (MQ=255) aaCGAAGCCCCGGTTTTCTCTCCCCTCCCAGTATATAAATTTGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTGCACTGGGTTTTTTACGGGTCATAATAAATtata > 3:992980/1‑140 (MQ=255) aaCGAAGCCCCGGTTTTCTCTCCCCTCCCAGTATATAAATTTGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAAGAAATtata > 1:670643/1‑140 (MQ=255) aaCGAAGCCCCGGTTTTCTCTCCACTCCCAGTATATAAATTTGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCACAGGTTAGTCCACTGGGTTTTTGAAGGGTCATAAGAAATtata > 8:704382/1‑140 (MQ=255) cGAAGCCCCGGTTTTCTCTCCCCTCCCAGTATATAAATTTGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCCGGTTGTTCCACTGGTTTTTTTACGGGTCATAAGAAATAatatt > 7:560517/1‑139 (MQ=255) cGAAGCCCCGGTTTTCTCTCCCCTCCCAGTATATAAATTTGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAAGAAATTATATg > 7:814819/1‑140 (MQ=255) cGGTTTTCTCTCCCCTCCCAGTATATAAATTTGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAAGAAATTATATGATTATTTa < 1:625605/140‑1 (MQ=255) cGGTTTTCTCTCCCCTCCCAGTATATAAATTTGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCACAGGGTCTTACACAGGTTTTTTTAAGGGTCATAAAAAAATATATTATTATTTa > 5:140941/1‑140 (MQ=255) gTTATCTCTCCCCTCCCAGTATCTAAATTTGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCCGCCTTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAAGAAATTATATGATTATTTaaa < 8:965020/140‑1 (MQ=255) ttCTCTCCCCTCCCAGTATATAAATTTGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGGTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAAGAAATTATATGATTATTTaaaaaa < 2:1314814/140‑1 (MQ=255) ccctcccAGTATATAAATTTGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAAGa > 2:605349/1‑111 (MQ=255) cctcccAGTATATAAATTTGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCGGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAAGAAATTATATGATTATTTAAAAAATAatcatc > 6:608784/1‑140 (MQ=255) cctcccAGTATATAAATTTGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGTAGTCGTGACCAGGTTCGTCCACGGGATTTTTGACTGGTCATAAGAAAATATATGTTTTATTAAAAAATAatcatc > 5:841803/1‑140 (MQ=255) ctcccAGTATATAAATTTGCTGTTCTGCAGAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAAGAAATTATATGATTATTTAAAAAATAAtcatca < 8:571649/140‑1 (MQ=255) cccAGTATATAAATTTGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAAGAAATTATATGATTATTTAAAAAATAATCATcagc < 3:583967/140‑1 (MQ=255) aGTATATAAATTTTCTGTTCTGCATAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCAGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAAGAAATTATATGATTATTTAAAAAATAATCATCAGCAgg < 8:32671/140‑1 (MQ=255) aGTATATAAATTTGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAAGAAATTATATGATTATTTAAAAAATAATCATCAGCAgg < 5:423969/140‑1 (MQ=255) aGTATATAAATTTGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAAGAAATTATATGATTATTTAAAAAATAATCATCAGCAgg < 1:1186911/140‑1 (MQ=255) gTATATAAATTTGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTGCCAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAAGAAATTATATGATTATTTAAAAAATAATAATAATCAGGt > 5:490052/1‑140 (MQ=255) gTATATAAATTTGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGa < 4:594322/91‑1 (MQ=255) gTATATAAATTTGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAAGAAATTATATGATTATTTAAAAAATAATCATAAGAAGGt > 4:783337/1‑140 (MQ=255) tataAATTTGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAAGAAATTATATGATTATTTAAAAAATAATCATCAGCAGGTTTa < 2:413221/140‑1 (MQ=255) ataaaaTTTG‑TGTTCGGCAAAAATGATCGATCAACCAGCAGTTCCCGGAACGGGAGTCGGTCCCAGGGTCTGCCACTGGTTTTTTGTTGGTTCATAAGTAATTATATGATAATTTATAAAATATGCATGAGCAGGTTTAc < 2:546152/137‑1 (MQ=255) ataATTTTGCTGTTCTGCAAAACTCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAAGAAATTATATGATTATTTAAAAAATAATCATCAGCAGGTTTAc < 6:334633/140‑1 (MQ=255) ataAATTTGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAAGAAATTATATTATTATTTAAAAAATAATCATCAGCAGGTTTAc > 5:783667/1‑140 (MQ=255) ataAATTTGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAAGAAATTATATGATTATTTAAAAAATAATCATCAGCAGGTTTAc < 5:739675/140‑1 (MQ=255) taAATTTGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAAGAAATTATATGATTATTTAAAAAATAATCATCAGCAGGTTTACt < 8:803668/140‑1 (MQ=255) aaaTTTGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAAGAAATTATATGATTATTTAAAAAATAATCATCAGCAGGTTTACTa > 3:1238882/1‑140 (MQ=255) ttGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAAGAAATTATATGATTATTTAAAAAATAATCATCAGCAGGTTTACTAAaat > 1:296397/1‑140 (MQ=255) ttGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCCACTGGTGTTTTGACGGGTCATAAGAAATTATATGATTATTTAAAAAATAATCATCAGCAGGTTTACTAAaat < 2:988402/140‑1 (MQ=255) tGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTGCCCGCGTCTAGCCATGGGTTTGTGGCGGGTGATTAGCAATTATATTATTATTTAAAAATTAATAATCCGCAGGTTTTCTCAaata > 7:199163/1‑140 (MQ=255) tGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCGCAGGTGCTTCCACTGGGTTTTTGACCGGGCAATACAAATTATATGATAAATAAAAAAAAAATCAACATCAGGTTTACTAAaata > 6:205370/1‑140 (MQ=255) tGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCCGGTTGTTCCACAGGGTTTTTGACGGGTCATAAGAAATTATATGATTATTTAAAAAATAATCATAAGCAGGTGTACTAAaata > 5:382540/1‑140 (MQ=255) tGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAAGAAATTATATGATTATTTAAAAAATAATCATCAGCAGGTTTACTAAaata > 1:1218402/1‑140 (MQ=255) tGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGAAGGGTCATAAGAAATTATATGATTATTTAAAAAATAATCATCAGCAGGTTTACTAAaata > 5:884807/1‑140 (MQ=255) tGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCCACTGGGGTTTTGACGGGTCATAAGAAATTATATGATTATTTAAAAAATAATCATCAGCAGGTTTACTAAaata > 3:745519/1‑140 (MQ=255) tGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCCACGGGTTTTTTGACGGGTCATAAGAAATTATATGATTATTTAAAAAATAATCATCAGCAGGTTTACTAAaata > 3:75080/1‑140 (MQ=255) tGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTGCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAATAAATTATATGTTTATTTAAAAAATAATCATCATCAGGTTGACTTAaata > 4:1013826/1‑140 (MQ=255) tGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTGCGTCCACTGGGTTTTTGACGGGTGATAAGAAATTATATGATTATTTAAAAAATAATCATCAGCAGGTTTACTAAaatt > 3:353934/1‑139 (MQ=255) tGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTACCAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGCCGGGTCATAAGAAATTATATGATTATTTAAAAAATAATAATAAGCAGGTTTAATTAaata > 3:878402/1‑140 (MQ=255) gCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAAGAAATTATATGATTATTTAAAAAATAATCATCAGCAGGTTTACTAAaataa < 3:435585/140‑1 (MQ=255) cTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCGCGGGTCTTGCCCTGGTTTTTTGACGGGTGATAAGAAATTATATGATTATTTAAAAAATAATAATCAGCAGGTTTACTAAaataat > 7:13295/1‑140 (MQ=255) cTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTGTTCCACTGGGTTTTTGTCGGGTGATAAGAAATTATATGATTATTTAAAAAATAATCATCACCAGGTTTAATAAaataat > 2:1014997/1‑140 (MQ=255) cTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCCCCTGGTTTTTTGACGGGGCATAAGAAATTATATGATTATTTAAAAAATAATCATCAGAAGGTTTACTAAaataat > 7:845981/1‑140 (MQ=255) cTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCCCATTGTTTTTTGACGGGTCAAAAGAAATTATAAGATTTATTAAAAAATAATCATCAGCAGGTTTACTAAaataat > 8:93830/1‑140 (MQ=255) cTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAAGAAATTATATGATTATTTAAAAAATAATCATCAGCAGGTTTACTAAaataat < 8:167087/140‑1 (MQ=255) ttcttcAAATATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTGCTTCCACTGGGTTTTTGACGGGTCATAAGTAATTATATGATTATTTAAAAAATAATCATCAGCAGGTTTACTAAAATAATccc < 2:334939/140‑1 (MQ=255) tgcTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAAGAAATTATATGATTATTTAAAAAATAATCATCAGCAGGTTTACTAAAATAATccc < 6:112904/138‑1 (MQ=255) gCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAAGAAATTATATGATTATTTAAAAAATAATCATCAGCAGGTTTACTAAAATAATCCCTGtt < 4:380383/140‑1 (MQ=255) aaaaaTCACCGATGATCCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTAGTTCCCAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAAGAAATTATATGATTATTTAAAAAATAATCATCAGCAGGTTTACTAAAATAATCCCTGTTGa < 6:1240081/140‑1 (MQ=255) aaaaaTCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAAGAAATTATATGATTATTTAAAAAATAATCATCAGCAGGTTTACTAAAATAATCCCTGTTGa < 3:1044125/140‑1 (MQ=255) aaaaaTCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAAGAAATTATATGATTATTTAAAAAATAATCATCAGCAGGTTTACTAAAATAATCCCTGTTGa < 1:1014990/140‑1 (MQ=255) aaaaaTCACCGATGAACCAGCAGGTCCCGGAAATTGAGTCGTTCCCAGGGTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAAGAAATTATATGATTATTTAAAATATAATCATCAGCAGGTTTACTAAAATAATCCCTGTTGa < 3:133362/140‑1 (MQ=255) aaaTCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAAGAAATTATATGATTATTTAAAAAATAATCATCAGCAGGTTTACTAAAATAATCCCTGTTGACt < 1:101347/140‑1 (MQ=255) aCCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAAGAAATTATATGATTATTTAAAAAATAATCATCAGCAGGTTTACTAAAATAATCCCTGTTGACTTTCTCTGTCAgcg < 2:437272/140‑1 (MQ=255) aCCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAAGAAATTATATGATTATTTAAAAAATAATCATCAGCAGGTTTACTAAAATAATCCCTGTTGACTTTCTCTGTCAgcg < 2:670643/140‑1 (MQ=255) gcagTTCCCGGAAATGGAGTCGTTGCCAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAATAAAATATATGAGTATTTAAAAAAAAAACATCAGCAGGTTTTGATAAATAATCCCGGTTGACTTTCTCAGTCAgcgccgg > 2:878311/1‑137 (MQ=255) tCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCCGGTTCTTCCACAGGTTTTTTTACGGGTCATAAGAAATTATATGATTATTTAAAAAATAATCATCAGCAGGTTTACTAAAATAATCACTGTTGACTTTCTCTGTCAGCGCGGAATTcc > 7:530868/1‑140 (MQ=255) cccGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAAGAAATTATATGATTATTTAAAAAATAATCATCAGCAGGTTTAATAAAATAATCCCTGTTTACTTTCTCTGTCAGCGCGGAATTccc > 5:657629/1‑140 (MQ=255) ccGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCCACAGGGTTTTTTACGGGTCATAAGAAATTATATTATTATTTAAAAAATAATCATAAGCAGGTTTACTAAAATAATCCCTGTTGACTTTCTCTGTCAGCGCGGAATTCCCt > 3:1207094/1‑140 (MQ=255) gAAATGGAGTCGTTCCCAGGGTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAAGAAATTATATGATTATTTAAAAAATAATCATCAGCAGGTTTACTAAAATAATCCCTGTTGACTTTCTCTGTCAGCGCGGAATTCCCtttt < 7:225952/140‑1 (MQ=255) aTGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAAGAAATTATATGATTATTTAAAAAATAATCATCAGCAGGTTTACTAAAATAATCCCTGTTGACTTTCTCTGTCAGCGCGGAATTCCCTTTTGAt < 8:777528/140‑1 (MQ=255) aTGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAAGAAATTATATGATTATTTAAAAAATAATCATCAGCAGGTTTACTAAAATAATCCCTGTTGACTTTCTCTGTCAGCGCGGAATTCCCTTTTGAt < 3:117964/140‑1 (MQ=255) aTGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAAGAAATTATATGATTATTTAAAAAATAATCATCAGCAGGTTTACTAAAATAATCCCTGTTGACTTTCTCTGTCAGCGCGGAATTCCCTTTTGAt < 5:1061792/140‑1 (MQ=255) tGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTGCACTGGGTTTTTGAAGGGTCAAAATAAATTATATTATTATTTAAAAAAAAATAAACAGCAGGGTTAATAAAATAATACCGGTTGAATTTCTCTGTCAGCCCGGAATTCCATTTTGATa > 8:663061/1‑140 (MQ=255) tGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAAGAAATTATATTATTATTTAAAAAATAATCATCAGCAGGTTTACTAAAATAATCCCTGTTGACTTTCTCTGTCAGCGCGGAATTCCCTTTTGATa > 8:315566/1‑140 (MQ=255) aGTCGTTCCCAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAAGAAATTATATGATTATTTAAAAAATAATCATCAGCAGGTTTACTAAAATAATACCTGTTGACTTTCTCTGTCAGCGCGGAATTCCCGTTTGTTAACt > 2:701690/1‑140 (MQ=255) cggtCCCAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAAGAAATTATATGATTATTTAAAAAATAATCATCAGCAGGTTTACTAAAATAATCCCTGTTGACTTTCTCTGTCAGCGCGGAATTCCCTTTTGATAACTCGa < 8:627734/137‑1 (MQ=255) cGTTCCCAGGTTCTTCGACTGGTTTTTTGACTGGTCATAAGAAATTATATGATTATTTAAAAAATAATCATCAGCAGGTTTACTAAAATAATCCCTGTTGACTTTCTCTGTCAGCGCGGAATTCCCTTTTGATAACTCGa < 3:659600/140‑1 (MQ=255) cGTTCCCAGGTTCTTCCACTTGTTTTTTGACGGGTCATAAGAAATTATATGATTATTTAAAAAATAATCATCAGCAGGTTTACTAAAATAATCCCTGTTGACTTTCTCTGTCAGCGCGGAATTCCCTTTTGATAACTCGa < 5:608784/140‑1 (MQ=255) cGTTCCCAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAAGAAATTATATGATTATTTAAAAAATAATCATCAGCAGGTTTACTAAAATAATCCCTGTTGACTTTCTCTGTCAGCGCGGAATTCCCTTTTGATAACTCGa < 1:250955/140‑1 (MQ=255) cGTTCCCAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAAGAAATTATATGATTATTTAAAAAATAATCATCAGCAGGTTTACTAAAATAATCCCTGTTGACTTTCTCTGTCAGCGCGGAATTCCCTTTTGATAACTCGa < 1:920190/140‑1 (MQ=255) cGTTCCCAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAAGAAATTATATGATTATTTAAAAAATAATCATCAGCAGGTTTACTAAAATAATCCCTGTTGACTTTCTCTGTCAGCGCGGAATTCCCTTTTGATAACTCGa < 3:413761/140‑1 (MQ=255) cGTTCCCAGGATCTTCCACTGGTTGTTTGACGGGTCATAAGAAATTATATGATTATTTAAAAAATAATCATCAGCAGGTTTACTAAAATAATCCCTGTTGACTTTCTCTGTCAGCGCGGAATTCCCTTTTGATAACTCGa < 6:835041/140‑1 (MQ=255) ccAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAAGAAATTATATGATTATTTAAAAAATAATCATCAGCAGGTTTACTAAAATAATCCCTGTTGACTTTCTCTGTCAGCGCGGAATTCCCTTTTGATAACTCGACATCt < 3:551477/140‑1 (MQ=255) ggTTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGGCATAAGAAATTATATGATTATTTAAAAAATAATCATCAGCAGGTTTACTAAAATAATCCCTGTTGACTTTCTCTGTCAGCGCGGAATTCCCTTTTGATAACTCGACATCTGaa < 7:296142/140‑1 (MQ=255) | GATCATGCGAAAGCTCCCCCGTCCAGGATCTAACAGAACGAAGCCCCGGTTTTCTCTCCCCTCCCAGTATATAAATTTGCTGTTCTGCAAAAATCACCGATGAACCAGCAGTTCCCGGAAATGGAGTCGTTCCCAGGTTCTTCCACTGGTTTTTTGACGGGTCATAAGAAATTATATGATTATTTAAAAAATAATCATCAGCAGGTTTACTAAAATAATCCCTGTTGACTTTCTCTGTCAGCGCGGAATTCCCTTTTGATAACTCGACATCTGAAA > NZ_CP022686/1775696‑1775971 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |