Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*NC_0084636,206,2270GA24.2% 122.9 / 55.5 66H128H (CAC→CAT) PA14_RS28350Hcp family type VI secretion system effector
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (20/30);  new base A (5/11);  total (25/41)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.71e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.62e-01
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold.

GCGGCGGTCGCGGCTCAGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTGTGCATGTAGTCCTTGATGTCGAC  >  NC_008463/6206078‑6206250
                                                                                                                                                     |                       
gcggcgGTCGCGGCTCAGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTtg                         <  2:6585858/150‑1 (MQ=35)
 cggcggTCGCGGCTCAGCCGGCGCCCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTtgt                        <  2:5359762/150‑1 (MQ=25)
 cggcggTCGCGGCTCAGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTtgt                        >  1:607565/1‑150 (MQ=35)
 cggcggTCGCGGCTCAGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTtgt                        <  2:3332348/150‑1 (MQ=35)
 cggcggTCGCGGCACAGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTtgt                        <  2:3803663/150‑1 (MQ=25)
  ggcggTCGCGGCTCAGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTtatg                       <  1:5269002/150‑1 (MQ=17)
  ggcggTCGCGGCTCAGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTtatg                       <  1:6773029/150‑1 (MQ=17)
   gcggTCGCGGCTCAGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTGTGc                      >  1:2548529/1‑150 (MQ=37)
   gcggTCGCGGCTCAGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTGTGc                      <  2:8078882/150‑1 (MQ=37)
   gcggTCGCGGCTCAGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTGTGc                      >  1:6817420/1‑150 (MQ=37)
   gcggTCGCGGCTCAGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTATGc                      >  1:2653952/1‑150 (MQ=17)
   gcggTCGCGGCTCAGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTATGc                      >  2:5289628/1‑150 (MQ=17)
   gcggTCGCGGCTCAGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTATGc                      >  1:3073125/1‑150 (MQ=17)
   gcggTCGCGGCTCAGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTATGc                      >  1:3074988/1‑150 (MQ=17)
    cggTCGCGGCTCAGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTGTGCa                     <  1:6002753/150‑1 (MQ=37)
    cggTCGCGGCTCAGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTGTGCa                     <  2:627428/150‑1 (MQ=37)
    cggTCGCGGCTCAGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTATGCa                     <  1:6957932/150‑1 (MQ=17)
    cggTCGCGGCTCAGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTATGCa                     >  1:6595725/1‑150 (MQ=17)
    cggTCGCGGCTCAGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTATGCa                     <  1:7598181/150‑1 (MQ=17)
    cggTCGCGGCTCAGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTATGCa                     <  1:7573102/150‑1 (MQ=17)
    cggTCGCGGCTCAGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTATGCa                     <  2:7463476/150‑1 (MQ=17)
    cggTCGCGGCTCAGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTATGCa                     <  1:3668951/150‑1 (MQ=17)
    cggTCGCGGCTCAGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTATGCa                     <  2:5389205/150‑1 (MQ=17)
     ggTCGCGGCTCAGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTGTGCAt                    <  2:10220596/150‑1 (MQ=37)
     ggTCGCGGCTCAGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTATGCAt                    <  1:3706123/150‑1 (MQ=17)
      gTCGCGGCTCAGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCCCGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTATGCATg                   <  2:2986169/150‑1 (MQ=17)
      gTCGCGGCTCAGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTGTGCATg                   >  2:3068095/1‑150 (MQ=37)
      gTCGCGGCTCAGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTGTGCATg                   >  1:3195886/1‑150 (MQ=37)
      gTCGCGGCTCAGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTGTGCATg                   >  1:3195816/1‑150 (MQ=37)
      gTCGCGGCTCAGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTATGCATg                   <  2:8214328/150‑1 (MQ=17)
       tCGCGGCTCAGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGTAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTATGCATGt                  <  1:10476985/150‑1 (MQ=14)
       tCGCGGCTCAGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTGTGCATGt                  <  1:1198273/150‑1 (MQ=35)
       tCGCGGCTCAGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTGTGCATGt                  <  2:8885450/150‑1 (MQ=35)
       tCGCGGCTCAGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTGTGCATGt                  <  1:9245039/150‑1 (MQ=35)
       tCGCGGCTCAGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTATGCATGt                  <  1:6399090/150‑1 (MQ=14)
        cgcgGCTCAGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGACGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTGTGCATGTa                 >  2:7626890/1‑150 (MQ=25)
        cgcgGCTCAGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTGTGCATGTa                 >  1:3143677/1‑150 (MQ=35)
         gcgGCTCAGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTGTGCATGTAg                >  2:3376047/1‑150 (MQ=34)
          cgGCTCAGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTGTGCATGTAGt               <  1:6516453/150‑1 (MQ=33)
          cgGCTCAGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTGTGCATGTAGt               >  1:10369547/1‑150 (MQ=33)
          cgGCTCAGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGGAGGGGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTGTGCATGTAGt               >  1:2637793/1‑150 (MQ=18)
          cgGCTCAGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTAGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTGTGCATGTAGt               <  2:6207715/150‑1 (MQ=18)
           ggCTCAGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTGTGCATGTAGTc              >  1:2655640/1‑150 (MQ=32)
           ggCTCAGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTGTGCATGTAGTc              >  1:8910313/1‑150 (MQ=32)
            gCTCAGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTGTGCATGTAGTcc             <  1:7006/150‑1 (MQ=32)
            gCTCAGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTGTGCATGTAGTcc             >  1:3472768/1‑150 (MQ=32)
             cTCAGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTTATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTGTGCATGTAGTCCt            <  2:8523559/150‑1 (MQ=17)
             cTCAGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGATGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTGTGCATGTAGTCCt            <  2:8523511/150‑1 (MQ=17)
             cTCAGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTGTGCATGTAGTCCt            <  2:7769734/150‑1 (MQ=32)
             cTCAGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTGTGCATGTAGTCCt            <  2:3893707/150‑1 (MQ=32)
             cTCAGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTGTGCATGTAGTCCt            <  2:8523488/150‑1 (MQ=32)
             cTCAGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTGTGCATGTAGTCCt            <  2:8523501/150‑1 (MQ=32)
                aGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTGTGCATGTAGTCCTTGa         >  2:9426943/1‑150 (MQ=32)
                aGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTGTGCATGTAGTCCTTGa         >  1:9182692/1‑150 (MQ=32)
                aGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGCCCTGGCAGTTGTGCATGTAGTCCTTGa         <  2:204381/150‑1 (MQ=17)
                aGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCGTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTGTGCATGTAGTCCTTGa         <  1:7385714/150‑1 (MQ=17)
                 gCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTGTGCATGTAGTCCTTGAt        <  2:2246609/150‑1 (MQ=32)
                  ccGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTGTGCATGTAGTCCTTGATg       <  1:2945770/150‑1 (MQ=32)
                   cGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTGTGCATGTAGTCCTTGATGt      >  1:9220409/1‑150 (MQ=32)
                   cGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTGTGCATGTAGTCCTTGATGt      <  2:3123344/150‑1 (MQ=32)
                   cGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTGTGCATGTAGTCCTTGATGt      <  2:3061618/150‑1 (MQ=32)
                   cGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTGTGCATGTAGTCCTTGATGt      >  1:9220431/1‑150 (MQ=32)
                   cGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTGTGCATGTAGTCCTTGATGt      <  1:8295432/150‑1 (MQ=32)
                   cGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGACTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTGTGCATGTAGTCCTTGATGt      <  2:6610967/150‑1 (MQ=17)
                    ggCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTGTGCATGTAGTCCTTGATGTc     <  2:9517055/150‑1 (MQ=32)
                      cGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTGTGCATGTAGTCCTTGATGTcga   <  2:8700993/150‑1 (MQ=31)
                      cGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTGTGCATGTAGTCCTTGATGTcga   >  1:3016834/1‑150 (MQ=31)
                      cGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTGTGCATGTAGTCCTTGATGTcga   >  1:3016577/1‑150 (MQ=31)
                       gACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAGGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTGTGCTTGTAGTCCTTGATGTcgac  >  2:1925825/1‑150 (MQ=11)
                       gACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTGTGCATGTAGTCCTTGATGTcgac  <  2:7022104/150‑1 (MQ=11)
                       gACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTGTGCATGTAGTCCTTGATGTcgac  <  2:10770268/150‑1 (MQ=11)
                       gACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTGTGCATGTAGTCCTTGATGTcgac  <  1:7287128/150‑1 (MQ=11)
                       gACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTGTGCATGTAGTCCTTGATGTcgac  <  1:5113257/150‑1 (MQ=11)
                                                                                                                                                     |                       
GCGGCGGTCGCGGCTCAGCCGGCGACCGGGGAGCGCCAGTCGTCGGAGCCGGAGGTGCCGGAGACTTCGTGGGTCCAGGTGATCTTGCGGTAGGTGAAGTGCACGTCTTCCAGGTGGGTGAAGTGGGCGTTGCCCGGGTCCTGGCAGTTGTGCATGTAGTCCTTGATGTCGAC  >  NC_008463/6206078‑6206250

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑