Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_008463 | 3,051,401 | T→C | N373D (AAC→GAC) | PA14_RS13990 ← | SfnB family sulfur acquisition oxidoreductase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_008463 | 3,051,401 | 0 | T | C | 99.8% | 1957.9 / ‑4.7 | 489 | N373D (AAC→GAC) | PA14_RS13990 | SfnB family sulfur acquisition oxidoreductase |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 |
Only 100 of 511 total aligned reads displayed.
AGCGTGTGCGAGGCTCATCGGGCGCTCCTCAGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTTGAGGTTGAACTTGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTTGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCACCGGCCGCG > NC_008463/3051254‑3051547 | aGCGTGTGCGAGGCTCATCGGGCGCTCCTCAGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCggtcga > 2:8882265/1‑150 (MQ=255) aGCGTGTGCGAGGCTCATCGGGCGCTCCTCAGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCggtcga > 1:9560444/1‑150 (MQ=255) aGCGTGTGCGAGGCTCATCGGGCGCTCCTCAGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCggtcga > 1:1487753/1‑150 (MQ=255) cGTGTGCGAGGCTCATCGGGCGCTCCTCAGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCggtcgagg < 1:2448500/150‑1 (MQ=255) tgtgCGAGGCTCATCGGGCGCTCCTCAGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCggtcgaggtt > 2:4896592/1‑150 (MQ=255) tgtgCGAGGCTCATCGGGCGCTCCTCAGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCggtcgaggtt < 2:7077034/150‑1 (MQ=255) tgCGAGGCTCATCGGGCGCTCCTCAGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCggtcgaggttga > 1:3520044/1‑150 (MQ=255) gCGAGGCTCATCGGGCGCTCCTCAGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGaa < 2:2213148/150‑1 (MQ=255) 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ggTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGa > 1:8586855/1‑150 (MQ=255) ggTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGa < 1:6161911/150‑1 (MQ=255) ggTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGa < 1:8094545/150‑1 (MQ=255) gTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGAt > 1:7402153/1‑150 (MQ=255) gTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGa > 2:4168877/1‑150 (MQ=255) gTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGa > 1:8643792/1‑150 (MQ=255) tGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAg > 1:4423036/1‑150 (MQ=255) gCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAgg < 1:828892/150‑1 (MQ=255) cAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGgc > 2:8344164/1‑150 (MQ=255) gtgGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTgc < 1:9881726/150‑1 (MQ=255) gTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTgccgcc > 1:7752778/1‑150 (MQ=255) tGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGccgccg > 1:1851205/1‑150 (MQ=255) tGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGccgccg > 1:4879000/1‑150 (MQ=255) gggCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGAcg > 1:7234389/1‑149 (MQ=255) gggCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACt > 1:3728579/1‑150 (MQ=255) gggCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACt < 1:3946475/150‑1 (MQ=255) ggCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTc < 1:344010/150‑1 (MQ=255) ggCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTc < 2:6503689/150‑1 (MQ=255) gTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGc < 1:10325515/150‑1 (MQ=255) gTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGc < 1:9743121/150‑1 (MQ=255) gcCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCGTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCa > 1:2954327/1‑150 (MQ=255) ccAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCAc < 2:10232265/150‑1 (MQ=255) cAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCAcc < 2:6781426/150‑1 (MQ=255) aGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCACCg > 1:7081392/1‑150 (MQ=255) aGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTGGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCACCg < 2:5014595/150‑1 (MQ=255) gCCGGTCGAGGTTGCCCTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCACCGGcc < 2:10605013/150‑1 (MQ=39) ggtcgaggttgaACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCACCGGCcgcg < 2:10551375/150‑1 (MQ=255) | AGCGTGTGCGAGGCTCATCGGGCGCTCCTCAGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTTGAGGTTGAACTTGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTTGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCACCGGCCGCG > NC_008463/3051254‑3051547 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |