| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_008463 | 3,374,601 | A→G | F41S (TTC→TCC) | PA14_RS15385 ← | aminotransferase class V‑fold PLP‑dependent enzyme |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_008463 | 3,374,601 | 0 | A | G | 99.6% | 2124.8 / NA | 531 | F41S (TTC→TCC) | PA14_RS15385 | aminotransferase class V‑fold PLP‑dependent enzyme |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (197/332); minor base T (0/2); total (197/334) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.32e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 534 total aligned reads displayed.
GCCTGGGCCACGCCCTTGAGGGCCAGGTTGTTGGATTCGGTGGCGCCGGAAGTCCAGACGATCTGCCCGGCGCTGGCGCCGACCAGCGCGGCCACCTGCTCCCTGGCCCGCTCCACTGCCCGCCGCGCCTGGCGGCCGTAGGCATGGAAATTCGACGCGGGATTGCCAAAACACGCCTGGTAGCCGAGACACTCCACCATGGCCCGGATCACGCGCTCGTCCACGGGCGTGGTGGCGGCGTAATCGAAGTACAACGGTAACGAACTCATCGCATTCCCCCAATCGATCGGACGG > NC_008463/3374454‑3374747 | gcCTGGGCCACGCCCTTGAGGGCCAGGTTGTTGGATTCGGTGGCGCCGGAAGTCCAGACGATCTGCCCGGCGCTGGCGCCGACCAGCGCGGCCACCTGCTCCCTGGCCCGCTCCACTGCCCGCCGCGCCTGGCGGCCGTAGGCATGGgaa < 1:8769264/150‑1 (MQ=255) cTGGGCCACGCCCTTGAGGGCCAGGTTGTTGGATTCGGTGGCGCCGGAAGTCCAGACGATCTGCCCGGCGCTGGCGCCGACCAGCGCGGCCACCTGCTCCCTGGCCCGCTCCACTGCCCGCCGCGCCTGGCGGCCGTAGGCATGGGAAtt > 1:6625443/1‑150 (MQ=255) cTGGGCCACGCCCTTGAGGGCCAGGTTGTTGGATTCGGTGGCGCCGGAAGTCCAGACGATCTGCCCGGCGCTGGCGCCGACCAGCGCGGCCACCTGCTCCCTGGCCCGCTCCACTGCCCGCCGCGCCTGGCGGCCGTAGGCATGGGAAtt < 1:10310861/150‑1 (MQ=255) 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cATGGGAATTCGACGCGGGATTGCCAAAACACGCCTGGTAGCCGAGACACTCCACCATGGCCCGGATCACGCGCTCGTCCACGGGCGTGGTGGCGGCGTAATCGAAGTACAACGGTAACGAACTCATCGCATTCCCCCAATCGATcggac > 1:10735365/1‑150 (MQ=255) aTGGGAATTCGACGCGGGATTGCCAAAACACGCCTGGTAGCCGAGACACTCCACCATGGCCCGGATCACGCGCTCGTCCACGGGCGTGGTGGCGGCGTAATCGAAGTACAACGGTAACGAACTCATCGCATTCCCCCAATCGATcggacg > 2:793190/1‑150 (MQ=255) | GCCTGGGCCACGCCCTTGAGGGCCAGGTTGTTGGATTCGGTGGCGCCGGAAGTCCAGACGATCTGCCCGGCGCTGGCGCCGACCAGCGCGGCCACCTGCTCCCTGGCCCGCTCCACTGCCCGCCGCGCCTGGCGGCCGTAGGCATGGAAATTCGACGCGGGATTGCCAAAACACGCCTGGTAGCCGAGACACTCCACCATGGCCCGGATCACGCGCTCGTCCACGGGCGTGGTGGCGGCGTAATCGAAGTACAACGGTAACGAACTCATCGCATTCCCCCAATCGATCGGACGG > NC_008463/3374454‑3374747 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |