Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_008463 | 3,711,749 | T→C | L37L (TTG→CTG) | cobA → | uroporphyrinogen‑III C‑methyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_008463 | 3,711,749 | 0 | T | C | 99.8% | 1893.8 / NA | 481 | L37L (TTG→CTG) | cobA | uroporphyrinogen‑III C‑methyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (286/194); minor base A (1/0); total (287/194) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 481 total aligned reads displayed.
CCCCCGGCCCATGGCGGCGAATGCCTGAGGAGAACGACGATGAGCGGTAAGGTCTGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATTTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGGTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCGTGGTGCGCCTG > NC_008463/3711602‑3711895 | ccGGCCCATGGCGGCGAATGCCTGAGGAGAACGACGATGAGCGGTAAGGTCTGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTACGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTc > 1:6929261/1‑150 (MQ=255) ggCCCATGGCGGCGAATGCCTGAGGAGAACGACGATGAGCGGTAAGGTCTGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCaa > 2:8111997/1‑150 (MQ=255) ggCCCATGGCGGCGAATGCCTGAGGAGAACGACGATGAGCGGTAAGGTCTGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGAAGGTCGACGATCTGGTCaa < 1:1610020/150‑1 (MQ=255) cccATGGCGGCGAATGCCTGAGGAGAACGACGATGAGCGGTAAGGTCTGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAAcc > 2:184559/1‑150 (MQ=255) ccATGGCGGCGAATGCCTGAGGAGAACGACGATGAGCGGTAAGGTCTGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAAccc < 1:9946725/150‑1 (MQ=255) ccATGGCGGCGAATGCCTGAGGAGAACGACGATGAGCGGTAAGGTCTGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAAccc < 2:6903763/150‑1 (MQ=255) cATGGCGGCGAATGCCTGAGGAGAACGACGATGAGCGGTAAGGTCTGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCg < 2:2904413/150‑1 (MQ=255) acggcggcGCATGCCTGAGGAGAACGACGCTGAGCGGTAAGGTCGGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGCCCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGa < 2:10563370/148‑1 (MQ=255) aTGGCGGCGAATGCCTGAGGAGAACGACGATGAGCGGTAAGGTCTGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGa > 2:10661353/1‑150 (MQ=255) tGGCGGCGAATGCCTGAGGAGAACGACGATGAGCGGTAAGGTCTGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAg > 1:4291349/1‑150 (MQ=255) ggcggcGAATGCCTGAGGAGAACGACGATGAGCGGTAAGGTCTGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGc > 1:9191740/1‑150 (MQ=255) gcggcgAATGCCTGAGGAGAACGACTATGAGCGGTAAGGTCTGGCTGGTGGGTGCGTGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCTGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCa < 2:1410474/150‑1 (MQ=255) gcggcgAATGCCTGAGGAGAACGACGATGAGCGGTAAGGTCTGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCa < 1:2477734/150‑1 (MQ=255) 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cgaTGAGCGGTAAGGTCTGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGccc < 2:1086618/150‑1 (MQ=255) cgaTGAGCGGTAAGGTCTGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGccc < 1:10243222/150‑1 (MQ=255) cgaTGAGCGGTAAGGTCTGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGccc < 1:1342020/150‑1 (MQ=255) cgaTGAGCGGTAAGGTCTGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGccc < 1:4190022/150‑1 (MQ=255) cgaTGAGCGGTAAGGTCTGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGccc < 1:4738900/150‑1 (MQ=255) 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cTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCAt < 2:8939148/150‑1 (MQ=255) tGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATg > 2:2830343/1‑150 (MQ=255) gCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGc > 2:9388232/1‑150 (MQ=255) aGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGccc > 2:98525/1‑150 (MQ=255) aGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGccc > 2:4073088/1‑150 (MQ=255) 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aTGTGGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGAc > 2:8782402/1‑150 (MQ=255) tgtgGTGATGGTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACg < 2:264031/150‑1 (MQ=255) ggTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCgtggt < 1:1147713/150‑1 (MQ=255) ggTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCgtggt < 2:668186/150‑1 (MQ=255) gTCGACGATCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCCTCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCgtggtg < 2:3570736/150‑1 (MQ=255) 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gacgaTCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCGTGGTgcgc > 1:9614040/1‑150 (MQ=255) acgaTCTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGCTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCGTGGTGCGcc > 2:9036089/1‑150 (MQ=255) | CCCCCGGCCCATGGCGGCGAATGCCTGAGGAGAACGACGATGAGCGGTAAGGTCTGGCTGGTGGGTGCGGGTCCCGGCGATCCGGAACTGTTGACCCTGAAGGCAGTTCGCGCCCTGCAGGACGCGGATGTGGTGATGGTCGACGATTTGGTCAACCCGAGCATACTGGAGCACTGTCCGTCCGCCCGGGTGGTCCGGGTCGGCAAACGCGGCGGCTGCCGCTCCACACCGCAGGACTTCATCCAGCGCCTGATGCTGCGGCATGCCCGCCAGGGACGCAGCGTGGTGCGCCTG > NC_008463/3711602‑3711895 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |