Predicted mutation | ||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_008463 | 966,217 | 0 | T | C | 99.8% | 1587.1 / NA | 403 | intergenic (+77/‑568) | PA14_RS04485/PA14_RS04490 | fimbrial protein/response regulator transcription factor |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.62e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 404 total aligned reads displayed.
TCGGCGCGGAGGGCGAATTGAAGGCCGGGGTCGCCGACGGCGCCGCCGAGTTCACGTTTACCTTCCCCTGAGCGGCGCCGCCGCTCTTTCCCCGGCGTTTCCCGCCCCGCCTCGGGAAGCGCCGTCGGCCGCTTTCGCGCCAGCCCTTGCGAAGGCTCGGCCCCTCACCTCCAGTGGTTGCAGATCGCCGAAGGCGCTCTGCATATCGCTCCGCTGCTCGTCCTGGGTCTCGTGCGCACATGCCATTCCCGCACGCGGAATACCGATATTGCGTATGGGCGAAGGCTTTCTGAG > NC_008463/966070‑966363 | gcgcGGTGGGCGAATTGAAGGCCGGGGTCGCCGACGGCGCCGCCGAGTTCACGTTTACCTTCCCCTGAGCGGCGCCGCCGCTCTTTCCCCGGCGTTTCCCGCCCCGCCTCGGGAAGCGCCGTCGGCCGCTTTCGCGCCAGCCCTCGCGaa < 1:2758877/150‑1 (MQ=255) gcgcGGAGGGCGAATTGAAGGCCGGGGTCGCCGACGGCGCCGCCGAGTTCACGTTTACCTTCCCCTGAGCGGCGCCGCCGCTCTTTCCCCGGCGTTTCCCGCCCCGCCTCGGGAAGCGCCGTCGGCCGCTTTCGCGCCAGCCCTCGCGaa > 2:1980077/1‑150 (MQ=255) cgcgGAGGGCGAATTGAAGGCCGGGGTCGCCGACGGCGCCGCCGAGTTCACGTTTACCTTCCCCTGAGCGGCGCCGCCGCTCTTTCCCCGGCGTTTCCCGCCCCGCCTCGGGAAGCGCCGTCGGCCGCTTTCGCGCCAGCCCTCGCGAAg < 2:9915089/150‑1 (MQ=255) 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aaTTGAAGGCCGGGGTCGCCGACGGCGCCGCCGAGTTCACGTTTACCTTCCCCTGAGCGGCGCCGCCGCTCTTTCCCCGGCGTTTCCCGCCCCGCCTCGGGAAGCGCCGTCGGCCGCTTTCGCGCCAGCCCTCGCGAAGGCTCGGCCCCt > 2:565715/1‑150 (MQ=255) aTTGAAGGCCGGGGTCGCCGACGGCGCCGCCGAGTTCACGTTTACCTTCCCCTGAGCGGCGCCGCCGCTCTTTCCCCGGCGTTTCCCGCCCCGCCTCGGGAAGCGCCGTCGGCCGCGTTCGCGCCAGCCCTCGCGAAGGCTCGGCCCCTc > 1:9020102/1‑150 (MQ=255) ttGAAGGCCGGGGTCGCCGACGGCGCCGCCGAGTTCACGTTTACCTTCCCCTGAGCGGCGCCGCCGCTCTTTCCCCGGCGTTTCCCGCCCCGCCTCGGGAAGCGCCGTCGGCCGCTTTCGCGCCAGCCCTCGCGAAGGCTCGGCCCCTCa < 1:3011269/150‑1 (MQ=255) gAAGGCCGGGGTCGCCGACGGCGCCGCCGCGTTCACGTTTACCTTCCCCTGAGCGGCGCCGCCGCTCTTTCCCCGGCGTTTCCCGCCCCGCCTCGGGAAGCGCCGTCGGCCGCTTTCGCGCCAGCCCTCGCGAAGGCTCGGCCCCTCAcc > 2:4453749/1‑150 (MQ=255) ggCCGGGGTCGCCGACGGCGCCGCCGAGTTCACGTTTACCTTCCCCTGAGCGGCGCCGCCGCTCTTTCCCCGGCGTTTCCCGCCCCGCCTCGGGAAGCGCCGTCGGCCGCTTTCGCGCCAGCCCTCGCGAAGGCTCGGCCCCTCACCTcc > 1:647154/1‑150 (MQ=255) 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ccTCGGGAAGCGCCGTCGGCCGCTTTCGCGCCAGCCCTCGCGAAGGCTCGGCCCCTCACCTCCAGTGGTTGCAGATCGCCGAAGGCGCTCTGCATATCGCTCCGCGGCTCGTCCTGGGTGTCGGGCGCACCTGCCATTACCGCACGCGGa > 1:6984617/1‑150 (MQ=255) cTCGGGAAGCGCCGTCGGCCGCTTTCGCGCCAGCCCTCGCGAAGGCTCGGCCCCTCACCTCCAGTGGTTGCAGATCGCCGAAGGCGCTCTGCATATCGCTCCGCTGCTCGTCCTGGGTCTCGTGCGCACATGCCATTCCCGCACGCGGaa < 1:7238831/150‑1 (MQ=255) tCGGGAAGCGCCGTCGGCCGCTTTCGCGCCAGCCCTCGCGAAGGCTCGGCCCCTCACCTCCAGTGGTTGCAGATCGCCGAAGGCGCTCTGCATATCGCGCCGCTGCTCGTCCTGGGTCTCGTGCGCACATGCCATTCCCGCACGCGGAAt > 2:716575/1‑150 (MQ=255) cGGGAAGCGCCGTCGGCCGCTTTCGCGCCAGCCCTCGCGAAGGCTCGGCCCCTCACCTCCAGTGGTTGCAGATCGCCGAAGGCGCTCTGCATATCGCTCCGCTGCTCGTCCTGGGTCTCGTGCGCACATGCCATTCCCGCACGCGGAATa < 2:3697112/150‑1 (MQ=255) aGCGCCGTCGGCCGCTTTCGCGCCAGCCCTCGCGAAGGCTCGGCCCCTCACCTCCAGTGGTTGCCGATCGCCGAAGGCGCTCTGCATATCGCTCCGCTGCTCGTCCTGGGTCTCGTGCGCCCCTGCCATTCCCGCAAGCGGAATACCGat > 2:6187281/1‑150 (MQ=255) aGCGCCGTCGGCCGCTTTCGCGCCAGCCCTCGCGAAGGCTCGGCCCCTCACCTCCAGTGGTTGCAGATCGCCGAAGGCGCTCTGCATATCGCTCCGCTGCTCGTCCTGGGTCTCGTGCGCACATGCCATTCCCGCACGCGGAATACCGat < 2:6098898/150‑1 (MQ=255) gcgcCGTCGGCCGCTTTCGCGCCAGCCCTCGCGAAGGCTCGGCCCCTCACCTCCAGTGGTTGCAGATCGCCGAAGGCGCTCTGCATATCGCTCCGCTGCTCGTCCTGGGTCTCGTGCGCACATGCCATTCCCGCACGCGGAATACCGata < 2:5189323/150‑1 (MQ=255) gcgcCGTCGGCCGCTTTCGCGCCAGCCCTCGCGAAGGCTCGGCCCCTCACCTCCAGTGGTTGCAGATCGCCGAAGGCGCTCTGCATATCGCTCCGCTGCTCGTCCTGGGTCTCGTGCGCACATGCCATTCCCGCACGCGGAATACCGata < 2:10606397/150‑1 (MQ=255) ccGTCGGCCGCTTTCGCGCCAGCCCTCGCGAAGGCTCGGCCCCTCACCTCCAGTGGTTGCAGATCGCCGAAGGCGCTCTGCATATCGCTCCGCTGCTCGTCCTGGGTCTCGTGCGCACATGCCAATACCGCACGCGGAATAACGATATTg > 2:10622832/1‑150 (MQ=255) ccGTAGGCCGCGTTCGCGCCCGCCCTCGCGAAGGCTCGGCCCCACCCCTCCACTGGTTGCAGATCGCCGACGGCGCTCTGCATATCGCTCCGCGGCTCGTCCTGGGTCTCGTGCGCCCATGCCAGTCCCGCACGCGGAAGACCGATATTg < 2:2066071/150‑1 (MQ=255) tCGGCCGCTTTCGCGCCAGCCCTCGCGAAGGCTCGGCCCCTCACCTCCAGTGGTGGCAGATAGCCGAAGGCGCGCTGCCTATCGCTCCGCGGGGCGGCCGGGGTGGCGGGCGCACATGCCCTTCCCCCCCCCGGCCTAACGGTATTGGGt > 1:10039452/1‑150 (MQ=255) cGGCCGCTTTCGCGCCAGCCCTCGCGAAGGCTCGGCCCCTCACCTCCAGTGGTTTCAGATCGCCGAAGGCGCTCTGCATATAGCTCCGCTGCTCGTCCTGGGTCACGTGCGCACGTGCCATTACCGCACGCGGAATACCGATATTGCGTa > 2:3890517/1‑150 (MQ=255) ggCCGCTTTCGCGCCAGCCCTCGCGAAGGCTCGGCCCCTCACCTCCAGTGGTTGCAGATCGCCGAAGGCGCTCTGCATATCGCTCCGCTGCTCGTCCTGGGTCTCGGGCGCACATGCCAATACCGCACGCCGAATACCGATATTGCGTAt > 2:1184323/1‑150 (MQ=255) cGCTTTCGCGCCAGCCCTCGCGAAGGCTCGGCCCCTCACCTCCAGTGGTTGCAGATCGCCGAAGGCGCTCTGCATATCGCTCCGCTGCTCGTCCTGGGTCTCGTGCGCACATGCCATTCCCGCACGCGGAATACCGATATTGCGTATggg < 1:9585426/150‑1 (MQ=255) gCTTTCGCGCCAGCCCTCGCGAAGGCTCGGCCCCTCACCTCCAGTGGTTTCAGATCGCCGAAGGCGCGCTGCATAACGCTCCCCTGCGCGTCCTGGGTCTCGTGCGCCCATGCCAATACCGCACGCGGAATACCGATATTGAGTATgggg > 1:6213372/1‑149 (MQ=255) tttCGCGCCAGCCCTCGCGAAGGCTCGGCCCCTCACCCCCAGTGGTTGCAGATCGCCGAAGGCGCTCTGCATATCGCTCCGCTGCTCGTCCTGGGTCTCGTGCGCACATGCCATTCCCGCACGCGGAATACCGATATTGCGTATGGGCGa < 2:7078208/150‑1 (MQ=255) ttCGCGCCAGCCCTCGCGAAGGCTCGGCCCCTCACCTCCAGTGGTTGCAGATCGCCGAAGGCGCTCTGCATATCGCTCCGCTGCTCGTCCTGGGTCTCGTGCGCACATGCCATTCCCGCACGCGGAATACCGATATTGCGTATGGGCGaa < 1:249256/150‑1 (MQ=255) gcCAGCCCTCGCGAAGGCTCGGCCCCTCACCTCCAGTGGTTGCAGATCGCCGAAGGCGCTCTGCATATCGCTCCGCTGCTCGTCCTGGGTCTCGTGCGCACATGCCATTCCCGCACGCGGAATACCGATATTGCGTATGGGCGAAGGCtt < 1:2104527/150‑1 (MQ=255) ccAGCCCTCGCGAAGGCTCGGCCCCTCACCTCCAGTGGTTGCAGATCGCCGAAGGCGCGCTGCATATCGCTCCGCTGCGCGTCCGGGGTCTCGTGCGCACATGCCATTCCCGCACGCGGAATACCGATATTGCGTATGGGCGAAGGCttt > 2:751375/1‑150 (MQ=255) ccAGCCCTCGCGAAGGCTCGGCCCCTCACCTCCAGTGGTTGCAGATAGCCGAAGGCGCTCTGCATATAGCTCCGCTGCGCGGCCGGGGTCTCGTGCGCACATGCCAATACCGCACGCGGAATACCGATATTGCGTATGGGCGAAGGCgtt > 1:6813655/1‑150 (MQ=255) aGCCCTCGCGAAGGCTCGGCCCCTCACCTCCAGTGGTTGCAGATCGCCGAAGGCGCTCTGCATATCGCTCCGCTGCTCGTCCTGGGTCTCGTGCGCACATGCCATTCCCGCACGCGGAATACCGATATTGCGTATGGGCGAAGGCTTTCt < 2:4732922/150‑1 (MQ=255) aGCCCTCGCGAAGGCTCGGCCCCTCACCTCCAGTGGTTGCAGATCGCCGAAGGCGCTCTGCATATAGCTCCGCTGCTCGTCCTGGGTCTCGTGCGCACATGCCAATCCCGCACGCGGAATACCGATATTGCGTATGGGCGAAGGCTGTCt > 2:3297015/1‑150 (MQ=255) | TCGGCGCGGAGGGCGAATTGAAGGCCGGGGTCGCCGACGGCGCCGCCGAGTTCACGTTTACCTTCCCCTGAGCGGCGCCGCCGCTCTTTCCCCGGCGTTTCCCGCCCCGCCTCGGGAAGCGCCGTCGGCCGCTTTCGCGCCAGCCCTTGCGAAGGCTCGGCCCCTCACCTCCAGTGGTTGCAGATCGCCGAAGGCGCTCTGCATATCGCTCCGCTGCTCGTCCTGGGTCTCGTGCGCACATGCCATTCCCGCACGCGGAATACCGATATTGCGTATGGGCGAAGGCTTTCTGAG > NC_008463/966070‑966363 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |