Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_008463 | 2,001,813 | G→C | V67L (GTG→CTG) | pgl → | 6‑phosphogluconolactonase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_008463 | 2,001,813 | 0 | G | C | 99.5% | 1633.6 / NA | 419 | V67L (GTG→CTG) | pgl | 6‑phosphogluconolactonase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/1); new base C (197/220); total (198/221) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 419 total aligned reads displayed.
CAGCGCCGCCGAGCAGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGATCAGGTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGGCGCGCTTCATCGGCCTCTACCAG > NC_008463/2001668‑2001953 | aGCGCCGCCGAGCAGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGAc < 1:4140439/150‑1 (MQ=255) ccgccgAGCAGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTggg > 2:1476119/1‑149 (MQ=255) ccgccgAGCAGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGt < 1:5546832/150‑1 (MQ=255) cgccgAGCAGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTc > 1:8715450/1‑150 (MQ=255) gccgAGCAGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTcg > 1:5862884/1‑150 (MQ=255) ccgAGCAGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTcgc > 1:4510627/1‑150 (MQ=255) cgAGCAGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTcgcg < 1:9998621/150‑1 (MQ=255) cgAGCAGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTcgcg < 1:4870739/150‑1 (MQ=255) aGCAGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGa > 1:7455361/1‑150 (MQ=255) gCCCGCGGCCTGGCCGCCGACGACGCCGGCCGGCTGCGCTCGGCCCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTCGTCGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGGGGCCTTCCTCGAAGCCTTGCGCGAGGAGCCGCTGGACGGGTCGCGGATCAcc < 2:7656760/150‑1 (MQ=255) ggCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCGGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGc < 2:685226/150‑1 (MQ=255) gCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGcc > 2:3344389/1‑150 (MQ=255) tGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTgg < 2:2913495/150‑1 (MQ=255) tGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTgg > 1:4334714/1‑150 (MQ=255) gtccgccgAGGTCGGCGGCAGGTTGCTCTCGGAGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCGGCTGGTGGGGTCAGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGTAGCCTTGTGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGc < 2:423440/148‑1 (MQ=255) cgccgAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCcga < 1:6613564/150‑1 (MQ=255) ggTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTTGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAgcg < 2:2974094/150‑1 (MQ=255) ggTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAgcg > 2:3025539/1‑150 (MQ=255) gTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAgcgc > 2:850657/1‑150 (MQ=255) tCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCt < 2:4775112/150‑1 (MQ=255) tCGCCGGCCGGGTGCGCTCGGCGCGGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCt < 2:2452247/150‑1 (MQ=255) gcGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCt > 1:3722381/2‑150 (MQ=255) cGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTg > 2:8098055/1‑150 (MQ=255) gccggccgGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTgg > 1:2605974/1‑150 (MQ=255) ccggccggTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTggg > 1:3172270/1‑150 (MQ=255) gccggTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGTGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGc > 2:9043610/1‑150 (MQ=255) ccggTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGcc < 2:6277047/150‑1 (MQ=255) ggTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCgg > 1:3375451/1‑150 (MQ=255) gTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGa < 1:6520461/150‑1 (MQ=255) ttGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAg < 1:1155478/150‑1 (MQ=255) ttGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGGCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCGTCCTCGACGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCCGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAg < 2:6652430/150‑1 (MQ=255) ttGCGCTCGGCGCGGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCGTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAg < 2:2238259/150‑1 (MQ=255) tGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGt < 2:3846878/150‑1 (MQ=255) tGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGt < 1:7146120/150‑1 (MQ=255) gcgcTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTc > 1:2924759/1‑150 (MQ=255) cTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCa > 1:1057158/1‑150 (MQ=255) tCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCAt > 2:10404347/1‑150 (MQ=255) gcgcTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGcc > 1:4684780/1‑150 (MQ=255) 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ccGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCa < 2:5383354/150‑1 (MQ=255) cGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCaa < 1:7711200/150‑1 (MQ=255) aGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACg > 1:6030742/1‑150 (MQ=255) gCAGGCCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGc > 1:9070481/1‑150 (MQ=255) ggCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGCTCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGc > 1:8918564/1‑150 (MQ=255) 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gtggggTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCAc < 1:7790193/150‑1 (MQ=255) gtgtCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTg > 1:9270205/1‑150 (MQ=255) tgtCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGc < 1:6145729/150‑1 (MQ=255) tCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTc > 2:8798724/1‑150 (MQ=255) cGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCg > 2:3778871/1‑150 (MQ=255) cGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCg < 1:2463714/150‑1 (MQ=255) ggTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGt > 1:9666472/1‑150 (MQ=255) gTGGGCGCAGTCCGGTGGCCGTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGGTCGCCGCCACCTGCTCCGTg < 2:2287919/150‑1 (MQ=255) gggCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGc < 2:9805010/150‑1 (MQ=255) gggCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGc > 1:10176170/1‑150 (MQ=255) 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tCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCTACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAggcggc > 2:7309803/1‑150 (MQ=255) tCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAggcggc > 2:8539648/1‑150 (MQ=255) gccGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGCCGAGCGCGGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAggcggc < 2:9362673/149‑1 (MQ=255) ccGGGGGCCGTCCTCGACGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGgcggcg < 2:5703185/150‑1 (MQ=255) gTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAg > 1:3262591/1‑150 (MQ=255) tGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAgg > 1:1247260/1‑150 (MQ=255) tGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAgg < 1:5929473/150‑1 (MQ=255) ccgtCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGgcgc < 2:2646070/147‑1 (MQ=255) cTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGgcgcg > 2:6320798/1‑150 (MQ=255) ttCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGgcgcgc > 1:1083456/1‑150 (MQ=255) cTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGGCGCGCTTc > 1:6096947/1‑150 (MQ=255) cTCGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGGCGCGCTTc > 2:10262313/1‑150 (MQ=255) tCGACGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGGCGCGCTTCa < 2:5403018/150‑1 (MQ=255) cGAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGGCGCGCTTCAt > 1:2213553/1‑150 (MQ=255) gAAGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGGCGCGCTTCATc > 2:4583776/1‑150 (MQ=255) aGCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCCGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGGCGCGCTTCATCgg < 2:6503860/150‑1 (MQ=255) gCCTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGGCGCGCTTCATCGGc > 2:6173403/1‑150 (MQ=255) ccTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGGCGCGCTTCATCGGcc < 2:10715896/150‑1 (MQ=255) ccTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGGTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGGCGCGCTTCATCGGcc < 1:9520974/150‑1 (MQ=255) cTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGGCGCGCTTCATCGGCct < 2:2870684/150‑1 (MQ=255) cTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGGCGCGCTTCATCGGCct > 2:9566038/1‑150 (MQ=255) cTTGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGGCGCGCTTCATCGGCct < 2:5583357/150‑1 (MQ=255) ttGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGGCGCGCTTCATCGGCctc < 2:8905666/150‑1 (MQ=255) ttGAGCGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGGCGCGCTTCATCGGCctc < 1:8554552/150‑1 (MQ=255) cGAGGAGCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGGCGCGCTTCATCGGCCTCTACCa < 1:2113454/150‑1 (MQ=255) gaggagCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGGCGCGCTTCATCGGCCTCTACCAg > 1:1591826/1‑150 (MQ=255) gaggagCCGCTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGGCGCGCTTCATCGGCCTCTACCAg > 1:5415250/1‑150 (MQ=255) | CAGCGCCGCCGAGCAGGCCCGCGGCCTGGCCGCCGAGGTCGCCGGCCGGTTGCGCTCGGCGCTGGCCGAGCAGGGCCAGGCGCTGCTGGTGGTGTCCGGTGGGCGCAGTCCGGTGGCCTTCCTCGAAGCCTTGAGCGAGGATCAGGTGGACTGGTCGCGGATCACCCTCAGCCTGGCCGACGAGCGCTGGGTGCCGGAGTCGCATGCCGATAGCAACGCCGGCCTGGTTCGCCGCCACCTGCTCCGTGGCGAGGCGGCGAAGGCGCGCTTCATCGGCCTCTACCAG > NC_008463/2001668‑2001953 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |