| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_008463 | 2,157,924 | C→T | S390N (AGC→AAC) | dacB ← | D‑alanyl‑D‑alanine carboxypeptidase/D‑alanyl‑D‑alanine‑endopeptidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_008463 | 2,157,924 | 0 | C | T | 99.4% | 1992.3 / NA | 482 | S390N (AGC→AAC) | dacB | D‑alanyl‑D‑alanine carboxypeptidase/D‑alanyl‑D‑alanine‑endopeptidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (250/229); minor base G (2/1); total (252/230) | |||||||||||
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| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 482 total aligned reads displayed.
CTGAAGCCGGCGAGGGCGCGCACGGTGTTGAGGGTGCCGGTCTTCACGTGCGCCTCGCCGACCAGTGCGGTGCGCCGCAGGCGTTTGCGCATGGTGCCGTCGAGGCCGGCCAGCGGCAGCGAGGAGATGTACTCCGCTGCATAGGGGCTGTGCCAGGCGGCTTGCAGCATCGCCGCCATCTCACGGGCGCTGACCCGTTCCTGGCGCGACAGTCCCGAGCCGTTCTCCATCACCAGGCGCGGCGCGGTGATGCCCTTGCGCGCCAGCCACTGCCGCACCACCCGCTGCGCGGCC > NC_008463/2157777‑2158070 | cTGAAGCCGGCGAGGGCGCGCACGGTGTTGAGGGTGCCGGTCTTCACGTGCGCCTCGCCGACCAGTGCGGTGCGCCGCAGGCGTTTGCGCATGGTGCCGTCGAGGCCGGCCAGCGGCAGCGAGGAGATGTACTCCGCTGCATAGGGGTtg > 1:5723560/1‑150 (MQ=255) gAAGCCGGCGAGGGCGCGCACGGGGTTGAGGGTGCCGGTCTTCACGTGCGCCTCGCCGACCAGTGCGGTGCGCCGCAGGCGTTTGCGCATGGTGCCGTCGAGGCCGGCCAGCGGCAGCGAGGAGATGTACTCCGCTGCATAGGGGTtgtg > 1:920565/1‑150 (MQ=255) gCCGGCGAGGGCGCGCACGGTGTTGAGGGTGCCGGTCTTCACGTGCGCCTCGCCGACCAGTGCGGTGCGCCGCAGGCGTTTGCGCATGGTGCCGTCGAGGCCGGCCAGCGGCAGCGAGGAGATGTACTCCGCTGCATAGGGGTTGTGCCa < 2:1285986/150‑1 (MQ=255) 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aCTCCGCTGCATAGGGGTTGTGCCAGGCGGCTTGCAGCATCGCCGCCATCTCACGGGCGCTGACCCGTTCCTGGCGCGACAGTCCCGAGCCGTTCTCCATCACCAGGCGCGGCGCGGTGATGCCCTTGCGCGCCAGCCACTGCCGcacca > 2:7634460/1‑150 (MQ=255) aCTCCGCTGCATAGGGGTTGTGCCAGGCGGCTTGCAGCATCGCCGCCATCTCACGGGCGCTGACCCGTTCCTGGCGCGACAGTCCCGAGCCGTTCTCCATCACCAGGCGCGGCGCGGTGATGCCCTTGCGCGCCAGCCACTGCCGcacca > 2:3853153/1‑150 (MQ=255) cTCCGCTGCATAGGGGTTGTGCCAGGCGGCTTGCAGCATCGCCGCCATCTCACGGGCGCTGACCCGTTCCTGGCGCGACAGTCCCGAGCCGTTCTCCATCACCAGGCGCGGCGCGGTGATGCCCTTGCGCGCCAGCCACTGCCGcaccac > 2:6452454/1‑150 (MQ=255) cTGCATAGGGGTTGTGCCAGGCGGCTTGCAGCATCGCCGCCATCTCACGGGCGCTGACCCGTTCCTGGCGCGACAGTCCCGAGCCGTTCTCCATCACCAGGCGCGGCGCGGTGATGCCCTTGCGCGCCAGCCACTGCCGCACCACCCGCt > 1:8174421/1‑150 (MQ=255) tGCATAGGGGTTGTGCCAGGCGGCTTGCAGCATCGCCGCCATCTCACGGGCGCTGACCCGTTCCTGGCGCGACAGTCCCGAGCCGTTCTCCATCACCAGGCGCGGCGCGGTGATGCCCTTGCGCGCCAGCCACTGCCGCACCACCCGCTg < 1:2750079/150‑1 (MQ=255) 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tAGGGGTTGTGCCAGGCGGCTTGCAGCATCGCCGCCATCTCCCGGGCGCTGACCCGTTCCTGGCGCGACAGTCCCGAACCGTTCTCCATCACCAGGCGCGGCGCGGTGATGCCCTTGCGCGCCAGCCACTGCCGCACCACCCGCTGcgcg < 1:9978967/150‑1 (MQ=255) ggggTTGTGCCAGGCGGCTTGCAGCATCGCCGCCATCTCACGGGCGCTGACCCGTTCCTGGCGCGACAGTCCCGAGCCGTTCTCCATCACCAGGCGCGGCGCGGTGATGCCCTTGCGCGCCAGCCACTGCCGCACCACCCGCTGCGCGGc > 1:1489344/1‑150 (MQ=255) | CTGAAGCCGGCGAGGGCGCGCACGGTGTTGAGGGTGCCGGTCTTCACGTGCGCCTCGCCGACCAGTGCGGTGCGCCGCAGGCGTTTGCGCATGGTGCCGTCGAGGCCGGCCAGCGGCAGCGAGGAGATGTACTCCGCTGCATAGGGGCTGTGCCAGGCGGCTTGCAGCATCGCCGCCATCTCACGGGCGCTGACCCGTTCCTGGCGCGACAGTCCCGAGCCGTTCTCCATCACCAGGCGCGGCGCGGTGATGCCCTTGCGCGCCAGCCACTGCCGCACCACCCGCTGCGCGGCC > NC_008463/2157777‑2158070 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |