| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_008463 | 2,341,570 | Δ1 bp | pseudogene (530/957 nt) | PA14_RS10890 → | DUF58 domain‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_008463 | 2,341,568 | 0 | C | . | 99.2% | 1916.9 / 6.9 | 393 | pseudogene (528/957 nt) | PA14_RS10890 | DUF58 domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/1); new base . (204/185); total (207/186) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
Only 100 of 415 total aligned reads displayed.
GGAATACGCCGACCTGGCAGGCGACGCGGCTGCCGAGGTGCTGCTGTTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCGCCCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAGCCCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCTGGCGAGCACGGGCGTCGACGACTACCAGGGACTGCGCGCCTACCCAGCCGGGCGACT > NC_008463/2341418‑2341716 | ggAATACGCCGACCTGGCAGGCGACGCGGCTGCCGAGGTGCTGCTGTTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTgcgc > 1:7030554/1‑151 (MQ=255)ggAATACGCCGACCTGGCAGGCGACGCGGCTGCCGAGGTGCTGCTGTTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTgcgc < 1:3234572/151‑1 (MQ=255) gAATACGCCGACCTGGCAGGCGACGCGGCTGCCGAGGTGCTGCTGTTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCGcc > 2:10244040/1‑151 (MQ=255) aaTACGCCGACCTGGCAGGCGACGCGGCTGCCGAGGTGCTGCTGTTCCACCCGACCGAGCGTCGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCGcca < 2:2425701/151‑2 (MQ=255) aaTACGCCGACCTGGCAGGCGACGCGGCTGCCGAGGTGCTGCTGTTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCGcca < 2:4989474/151‑2 (MQ=255) aCGCCGACCTGGCAGGCGACGCGGCTGCCGAGGTGCTGCTGTTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCGccagca < 1:6745869/151‑5 (MQ=255) aCGCCGACCTGGCAGGCGACGCGGCTGCCGAGGTGCTGCTGTTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCGccagca > 1:5265015/1‑147 (MQ=255) gCCGACCTGGCAGGCGACGCGGCTGCCGAGGTGCTGCTGTTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAgg < 1:3091071/151‑1 (MQ=255) gACCTGGCAGGCGACGCGGCTGCCGAGGTGCTGCTGTTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGTGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGgcgc > 1:2348736/1‑151 (MQ=255) gACCTGGCAGGCGACGCGGCTGCCGAGGTGCTGCTGTTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGgcgc < 1:7102343/151‑1 (MQ=255) ggCAGGCGACGCGGCTGCCGAGGTGCTGCTGTTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTc > 2:9151731/1‑151 (MQ=255) ggCAGGCGACGCGGCTGCCGAGGTGCTGCTGTTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTc > 2:3076506/1‑151 (MQ=255) cAGGCGACGCGGCTGCCGAGGTGCTGCTGTTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTa < 2:8274311/151‑1 (MQ=255) aGGCGACGCGGCTGCCGAGGTGCTGCTGTTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTAc < 2:642919/151‑1 (MQ=255) aGGCGACGCGGCTGCCGAGGTGCTGCTGTTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTAc > 1:4560564/1‑151 (MQ=255) ggCGACGCGGCTGCCGAGGTGCTGCTGTTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTAcc > 2:9525633/1‑151 (MQ=255) ggCGACGCGGCTGCCGAGGTGCTGCTGTTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTAcc > 1:1485060/1‑151 (MQ=255) gACGCGGCTGCCGAGGTGCTGCTGTTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTc < 2:7069599/151‑1 (MQ=255) 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gTGCTGCTGTTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCg < 1:3829628/151‑1 (MQ=255) gctgctGTTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAg < 1:3442158/151‑1 (MQ=255) tgctgTTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAGcc > 2:7493582/1‑151 (MQ=255) ttCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTcc > 1:2873251/1‑151 (MQ=255) gtCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTcc < 2:118609/150‑1 (MQ=255) tCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTGTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCGGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCt > 2:4505568/1‑151 (MQ=255) ccACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTc < 1:485732/151‑1 (MQ=255) aCCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTcgc < 2:856005/151‑1 (MQ=255) gaccgaGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGGCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCg > 2:2192796/1‑151 (MQ=255) ccgaGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCggg > 1:3641340/1‑151 (MQ=255) ccgaGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTACCCGCGGCCTGCGGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCGCGCGCCggg > 1:9534766/1‑151 (MQ=255) cgaGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGgc < 1:11076909/151‑1 (MQ=255) gaGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGgcg < 2:3783875/151‑1 (MQ=255) aCGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCggag > 2:8470889/1‑151 (MQ=255) cgcgGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCggagg > 1:10090939/1‑151 (MQ=255) gcgGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCggagga < 2:4647916/151‑1 (MQ=255) gacgctggcatCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGATAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTCGTTGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCggagga < 2:3553195/148‑1 (MQ=255) cgGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTGTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGGGCggaggag > 2:7732659/1‑150 (MQ=255) cgGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGAt > 2:6869943/1‑151 (MQ=255) cgGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGAt > 1:10687432/1‑151 (MQ=255) cgGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTATCCCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGAt < 2:3361638/151‑1 (MQ=255) ctgCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAgg > 1:7263257/1‑151 (MQ=255) tgCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGa > 1:8660169/1‑151 (MQ=255) ggCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGTGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGTTGCCGAGGACCa > 1:9098072/1‑151 (MQ=255) cGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAggg < 2:7018737/151‑1 (MQ=255) 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ccTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGgcgcgcg > 2:1618514/1‑151 (MQ=255) cTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCACGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGgcgcgcgc > 1:8765801/1‑151 (MQ=255) tGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCt < 2:6729223/151‑1 (MQ=255) tGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTAGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCt > 2:5608721/1‑151 (MQ=255) gCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCACGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCTg > 2:8661961/1‑151 (MQ=255) 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tCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCTGGCGAGCACGGGCGTcgac < 1:8832755/151‑1 (MQ=255) ccccTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCTGGCGAGCACGGGCGTcgacg > 2:5910827/1‑151 (MQ=255) cccTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCTGGCGAGCACGGGCGTcgacga > 1:4258106/1‑151 (MQ=255) cccTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCTGGCGAGCACGGGCGTcgacga > 2:10931888/1‑151 (MQ=255) ccTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCTGGCGAGCACGGGCGTCgacgac > 1:6560844/1‑151 (MQ=255) cTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCTGGCGAGCACGGGCGTCGACGACt > 1:1531158/1‑151 (MQ=255) cTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCTGGCGAGCACGGGCGTCGACGACt > 1:5605504/1‑151 (MQ=255) tCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCTGGCGAGCACGGGCGTCgacgacga > 2:2795227/1‑149 (MQ=255) tCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCTGGCGAGCACGGGCGTCGACGACTa < 1:4297362/151‑1 (MQ=255) ggCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCTGGCGAGCACGGGCGTCGACGACTAcc < 2:7624805/151‑1 (MQ=255) ggCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCTGGCGAGCACGGGCGTCGACGACTAcc > 1:1900972/1‑151 (MQ=255) ggCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCGGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCCGGGGCGCGCGCTGGCGAGCACGGGCGGCGCCGACTAcc > 1:6246872/1‑151 (MQ=255) ggCCTGCTGGTGGCCTGGACCTGGGTCCACCT‑CAGCCATAAGCCGCTGGTCTACACACGGCCGCTCGCCGGAGAGCCC‑TTCATCACGCCGGGCGCCGAGGATGCCGAGGTCAAGGGGCGCGAGCTGGCGAGCACGGGCGTCGACGACTTcc > 1:5074255/1‑151 (MQ=255) ctgctgGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCTGGCGAGCACGGGCGTCGACGACTACCAgg < 1:9825620/151‑1 (MQ=255) ctgGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCTGGCGAGCACGGGCGTCGACGACTACCAGGGAc > 1:1728455/1‑151 (MQ=255) tggtggCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCTGGCGAGCACGGGCGTCGACGACTACCAGGGACt < 1:10561296/151‑1 (MQ=255) gggggCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCTGGCGAGCACGGGCGTCGACGACTACCAGGGACTg < 2:10439654/148‑1 (MQ=255) ggCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCCGGGGCGCGCGCTGGCGAGCACGGGCGTCGACGACTACCAGGGACTgcgc < 2:5742036/151‑1 (MQ=255) gCTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCTGGCGAGCACGGGCGTCGACGACTACCAGGGACTGCGCGCCTAcca < 1:6108157/151‑2 (MQ=255) cTGGGTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGTTCTACCCTCGGCCGATGGCCGGCGAG‑CCGTTCATCGCGACGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACAAGGGGCGCGCGCTGGCGAGCACGGGCGTCGACGACTACCAGGGACTGCGCGCCTAccag > 2:2626619/1‑149 (MQ=255) gTCGACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCTGGCGAGCACGGGCGTCGACGACTACCAGGGACTGCGCGCCTA‑CCAGCCgg < 1:9686199/151‑1 (MQ=255) gACCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCTGGCGAGCACGGGCGTCGACGACTACCAGGGACTGCGCGCCTA‑CCAGCCGGGCg > 1:3959712/1‑151 (MQ=255) aCCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGCGGATGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCTGGCGAGCCCGGGCGTCGACGACTACCAGGGACTGCGCGCCGA‑CCAGCCGGGCGa > 2:110695/1‑151 (MQ=255) aCCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCTGGCGAGCACGGGCGTCGACGACTACCAGGGACTGCGCGCCTA‑CCAGCCGGGCGa > 2:1471315/1‑151 (MQ=255) aCCTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCTGGCGAGCACGGGCGTCGACGACTACCAGGGACTGCGCGCCTA‑CCAGCCGGGCGa < 2:9071418/151‑1 (MQ=255) ccTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCTGGCGAGCACGGGCGTCGACGACTACCAGGGACTGCGCGCCTA‑CCAGCCGGGCGAc > 2:9431969/1‑151 (MQ=255) cTGCG‑CCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAG‑CCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCTGGCGAGCACGGGCGTCGACGACTACCAGGGACTGCGCGCCTA‑CCAGCCGGGCGACt < 1:4634894/151‑1 (MQ=255) | GGAATACGCCGACCTGGCAGGCGACGCGGCTGCCGAGGTGCTGCTGTTCCACCCGACCGAGCGACGCGGCTGGCTGCGGCCGGGGCGCCTGCGGGTGGAGAGTCGCTTTCCCCTCGGCCTGCTGGTGGCCTGGAGCTGGGTCGACCTGCGCCCAGCAGGCGCTGGTCTACCCTCGGCCGCTGGCCGGCGAGCCCGTTCCTCGCGCCGGGCGCGGAGGATGCCGAGGACCAGGGGCGCGCGCTGGCGAGCACGGGCGTCGACGACTACCAGGGACTGCGCGCCTACCCAGCCGGGCGACT > NC_008463/2341418‑2341716 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |