| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_008463 | 5,461,009 | 0 | A | G | 34.3% | 761.9 / inf | 461 | N1282N (AAT→AAC) | PA14_RS25000 | MBG domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (166/123); new base G (83/68); total (250/211) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.85e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.12e-04 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 463 total aligned reads displayed.
ATCGGCGTCGCCATAGACCTTGGTCTTGGCATCGGCGATCACATTCAGCAGCGCCTTGGTGATGGTCAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGGTCGGCATCGCCGTAGACCTTGGTCTTGGCATCGGCGATCACATTCAGCAGTGCC > NC_008463/5460862‑5461159 | ggCATCGCCATAGACCTTGGTCTTGCCGTCGGCGATCACATTCAGCAGCGCCTTGGTGATGGTCAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCg < 2:8614044/151‑1 (MQ=255) tcaccATAGACCTTGGTCTTGGCATCGGCGATCACATTCAGCAGCGCCTTGGTGATGGTCAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCgccag < 1:9682184/148‑1 (MQ=25) gCCATAGACCTTGGTCTTGGCATCGGCGATCACATTCAGCAGCGCCTTGGTGATGGTCAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCgccagac > 1:2361959/1‑149 (MQ=39) cgtAGACCTTGGTCTTGGCATCGGCGATCACATTCAGCAGCGCCTTGGTGATGGTCAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCAc < 2:6872603/149‑1 (MQ=21) cATAGACCTTGGTCTTGGCATCGGCGATCACATTCAGCAGCGCCTTGGTGATGGTCAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCAc < 2:4940145/151‑1 (MQ=38) gtAGACCTTGGTCTTGGCATCGGCGATCACATTCAGCAGCGCCTTGGTGATGGTCAGGTTATTGCCATGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCAcg > 1:1630391/2‑151 (MQ=18) aCCTTGGTCTTGGCATCGGCGATCACATTCAGCAGCGCCTTGGTGATGGTCAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGACCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACGTTCTCGCCAGCCACGCGGc > 2:8825135/1‑151 (MQ=14) ccTTGGTCTTGGCATCGGCGATCACATTCAGCAGCGCCTTGGTGATGGTCAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCt < 1:9959061/151‑1 (MQ=35) cTTGGTCTTGGCATCGGCGATCACATTCAGCAGCGCCTTGGTGATGGTCAGGTTCTTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTc < 2:5791319/151‑1 (MQ=18) tGGTCTTGGCATCGGCGATCACATTCAGCAGCGCCTTGGTGATGGTCAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAg < 1:189644/151‑1 (MQ=35) gTCTTGGCATCGGCGATCACATTCAGCAGCGCCTTGGTGATGGTCAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGc > 2:711698/1‑151 (MQ=35) gTCTTGCCGTCGGCGATCACATTCAGCAGCGCCTTGGTTATGGTCAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGc < 1:2566946/151‑1 (MQ=255) tcatgccATCGGCGATCACAATCAGCAGCGCCTGGGTGAGGGTCAGGTTATTGCCCTGGTAGCACAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCt < 1:9406655/145‑1 (MQ=11) ttGGCATCGGCGATCACATTCAGCAGCGCCTTGGTGATGGTCAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGc > 1:8963065/1‑151 (MQ=35) tGGCATCGGCGATCACATTCAGCAGCGCCTTGGTGATGGTCAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCGCAGGCTGcc > 2:8043787/1‑151 (MQ=25) aTCGGCGATCACATTCAGCAGCGCCTAGGTGATGGTCAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCTTAGTTAGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTTATGACGTACACGCCGACATTCTCGCCAGACACGCGGCGCAGGCTGccgccg > 2:1662704/1‑151 (MQ=11) cGATCACATTCAGCAGCGCCTTGGTGATGGTCAGGTTGTTGCCATGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAg > 2:6274063/1‑151 (MQ=14) gATCACATTCAGCAGCGCCTTGGTGATGGTCAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGATCAgg > 1:6715121/1‑136 (MQ=37) acaTTCAGCAGCGCCTTGGTGATGGTCAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACgg > 2:6783234/1‑151 (MQ=38) agcagcGCCTTGGTGATGGTCAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCa < 1:11010506/124‑1 (MQ=38) agcagcGCCTTGGTGATGGTCAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACcgg > 1:6893225/1‑151 (MQ=38) agcagcGCCTTGGTAATGGTCAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCa > 2:11010506/1‑124 (MQ=38) gcagcGCCTTGGTGATGGTCAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACcggc < 1:6044519/151‑1 (MQ=38) gcgcCTTGGTGATGGTCAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGgt < 1:5248620/151‑1 (MQ=38) cgcCTTGGTGATGGTCAGGTTTTTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGgtg < 1:9520795/151‑1 (MQ=37) ccTTGGTGATGGTCAGGTTGTTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTc < 1:6436713/151‑1 (MQ=25) ccTTGGTGATGGTCAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTc > 2:5215955/1‑151 (MQ=40) cTTGGTGATGGTCAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGACCCAGGCCGCCCTGGTTGATGCCATACACGCCGACGTTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCGCCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCg > 1:494895/1‑151 (MQ=11) ttGGTGATGGTCAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGc < 2:6679964/151‑1 (MQ=40) tGGTGATGGTCAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGcc > 1:5360703/1‑151 (MQ=40) tGATGGTCAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGtt > 1:3121554/1‑151 (MQ=40) gATGGTCAGGTTGTTGCCTTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGttc < 1:4076206/151‑1 (MQ=14) ggTCAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGttcttc > 1:10746379/1‑151 (MQ=40) tCAGGTTATTGCCTTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAg < 2:9281117/151‑1 (MQ=25) tCAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAg > 2:3883563/1‑151 (MQ=40) tATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCt > 2:3344316/1‑151 (MQ=255) gaTTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCATGCCCAGTCCTCCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCTCCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCt < 2:3215707/150‑1 (MQ=255) cTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTgg < 2:4401063/151‑1 (MQ=255) cTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACATgg > 2:6220649/1‑151 (MQ=255) ggTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACGTTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCAGCGGTATCGCCATTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTa > 1:2687316/1‑151 (MQ=255) gTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTaa < 2:3743853/151‑1 (MQ=255) gCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTc > 2:238979/1‑151 (MQ=255) cTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCa > 2:10675057/1‑151 (MQ=255) tCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAg > 2:4244400/1‑151 (MQ=255) 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ggTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCt < 1:1089228/151‑1 (MQ=255) gTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTATCGCCGTTCTTCAGGCCACTGACTTGGTagg < 2:2054059/143‑3 (MQ=255) tCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCg < 1:6274063/151‑1 (MQ=255) cggaggtCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGGACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCCCCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCgg < 2:1043472/145‑1 (MQ=255) gTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACGTTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCGCCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTCTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTAACCTGGTACGTCAGGGTCggg > 2:3528134/1‑151 (MQ=11) aattgctgcTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACGTTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCGCCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGGTc > 1:6595643/8‑151 (MQ=2) gTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGGTCg > 1:1452548/1‑151 (MQ=255) gTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGGTCg < 1:10601822/151‑1 (MQ=255) agtgattcTGACCAGGCCCAGGACACCCTTGTTGATTCCGTACAAGCCGACTTTCTCGCCAGCCACGCGTCTCAGGCTGCCGCCGTTGAGCACGGCTCCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGGTCg < 1:3036618/144‑1 (MQ=11) tgcTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACGTTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCGCCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGGTCGGCATc < 1:8651442/150‑1 (MQ=18) tgcTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACGTTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCGCCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGGTCGGCATc > 2:2946215/2‑151 (MQ=18) cgcTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGGTCGGCATc < 1:7128069/151‑1 (MQ=39) tGACCAGACCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCATACACTCCCACGTTCTCGCCAGCCACGCGACTCAGGCTGCCGCCGTTGAGCACGGCACCAGCGGTATCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGTTCGGCTTCGcc > 2:4072853/1‑151 (MQ=11) gACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTAAGCACCGCGCCAGCGGTATCGCCGtt < 2:2702832/105‑1 (MQ=11) gACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACAAGCCTACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGGTCGGCGTCGCCg > 2:2191648/1‑151 (MQ=255) aCCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACGTTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGGTCGGCATCGCCGt > 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gTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGGTCGGCATCGCCGTAGACCTTGGTCTTGGCGTCg > 1:8103619/1‑151 (MQ=38) ttGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGGTCGGCATCGCCGTAGACCTTGGTCTTGGCATCgg > 1:5043694/1‑151 (MQ=38) tGATGCCGTACACGCCGACGTTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCGCCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGGTCGGCATCGCCGTAGACCTTGGTCTTGGCATCGGc < 1:5869042/151‑1 (MQ=18) gCCGTACACGCCGACGTTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCGCCGGTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGGTCGGCATCGCCGTAGACCTTGGTCTTGGCATCGGCGATc > 2:6613331/1‑151 (MQ=16) cGTACACGCCGACGTTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCGCCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGGTCGGCATCGCCGTAGACCTTGGTCTTGGCATCGGCGATcac > 1:5929622/1‑151 (MQ=18) 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ATCGGCGTCGCCATAGACCTTGGTCTTGGCATCGGCGATCACATTCAGCAGCGCCTTGGTGATGGTCAGGTTATTGCCCTGGTAGCTCAGGTCGTAGTTCGCGCTGACCAGGCCCAGTCCACCCTGGTTGATGCCGTACACGCCGACATTCTCGCCAGCCACGCGGCTCAGGCTGCCACCGTTGAGCACGGCACCGGCGGTGTCGCCGTTCTTCAGGCCGCTGACCTGGTAAGTCAGGCTCGGGTCGGCATCGCCGTAGACCTTGGTCTTGGCATCGGCGATCACATTCAGCAGTGCC > NC_008463/5460862‑5461159 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |