| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_008463 | 2,762,027 | A→G | N126D (AAC→GAC) | PA14_RS12995 → | lysophospholipid acyltransferase family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_008463 | 2,762,027 | 0 | A | G | 99.8% | 1575.8 / NA | 400 | N126D (AAC→GAC) | PA14_RS12995 | lysophospholipid acyltransferase family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (186/213); minor base C (1/0); total (187/213) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.68e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 407 total aligned reads displayed.
CAGCTACGTGATCAACAAGGTGTTCAACGGCGTGCTGGTCGACCGCCAGCGCAGCGATGCCAATGCCAATCCGCTCGAACCCCTCGACCGCGCCCTGGACGGCGGCGATTCGCTGATCATCTTCCCCAAGGGCACCCGCAACCTGAACAACAAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGCCGCATGCTGCCGTTGCCGCTGCTCTGCA > NC_008463/2761879‑2762171 | cAGCTACGTGATCTACAAGGTGTTCAACGGCGTGCGGGTCGACCGCCAGCGCAGCGATGCCAATGCCAATCCGCTCGAACCCCTCGACCGCGCCCTGGACGGCGGCGATTCGCTGATCATCTTCCCCGAGGGCACCCGCAACCTGgacgac < 2:3382407/151‑1 (MQ=255) aGCTACGTGATCAACACGGGGTTCAACGGCGTGCTGGTCGACCGCCAGCGCAGCGATGCCAATGCCAATCCGCTCGAACCCCTCGACCGCGCCCTGGACGGCGGCGAGTCGCTGATCATCTTCCCCGAGGGCACCCGCAACCTGgacgacg > 2:7456367/1‑150 (MQ=255) cTACGTGATCAACAAGGTGTTCAACGGCGTGCTGGTCGACCGCCAGCGCAGCGATGCCAATGCCAATCCGCTCGAACCCCTCGACCGCGCCCTGGACGGCGGCGATTCGCTGATCATCTTCCCCGAGGGCACCCGCAACCTGGACGACGAg < 1:7542912/151‑1 (MQ=255) 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ccgaGGGCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGCCGCATGCTGcc < 1:5692760/148‑1 (MQ=255) aGGGCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGCCGCATGCTGCCGtt < 1:8634983/151‑1 (MQ=255) aGGGCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGCCGCATGCTGCCGtt < 2:1650485/151‑1 (MQ=255) gCACCCGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGCCGCATGCTGCCGTTGcc < 1:481983/151‑1 (MQ=255) cccGCAACCTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGGGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGCCGCATGCTGCCGTTGCCgct < 1:4269555/151‑1 (MQ=255) 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ccTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGCCGCATGCTGCAGTTGCCGCTGCTCTGc > 2:1571881/1‑151 (MQ=255) cTGGACGACGAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGCCGCATGCTGCCGTTGCCGCTGCTCTGCa > 1:9318806/1‑151 (MQ=255) | CAGCTACGTGATCAACAAGGTGTTCAACGGCGTGCTGGTCGACCGCCAGCGCAGCGATGCCAATGCCAATCCGCTCGAACCCCTCGACCGCGCCCTGGACGGCGGCGATTCGCTGATCATCTTCCCCAAGGGCACCCGCAACCTGAACAACAAGGTCAAGCTGTTGCCATTCAAGAGCGGTATCTACCACCTGTCCCTGGCCCACCCGGAGGTCGAGCTGGTGCCGGTCTGGCTGGCCAACCTCAACCGGGTCATGCCCAAGGGCCGCATGCTGCCGTTGCCGCTGCTCTGCA > NC_008463/2761879‑2762171 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |