| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_008463 | 3,390,474 | Δ1 bp | pseudogene (440/1997 nt) | PA14_RS15455 → | alkaline phosphatase D family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_008463 | 3,390,472 | 0 | G | . | 99.8% | 2329.1 / ‑2.4 | 472 | pseudogene (438/1997 nt) | PA14_RS15455 | alkaline phosphatase D family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base . (244/226); minor base C (1/0); total (245/227) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 493 total aligned reads displayed.
CCTGCGCCTCGCCGCCGACGGCGGGGAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCCGGGCGGCCGATGGGCCTGCTGCAGGTAGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCCGACGACGTCGCCGGGCCGATGCTGGTGGCCATCCATGGG > NC_008463/3390322‑3390618 | ccTGCGCCTCGCCGCCGACGGCGGGGAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCCg > 1:7280755/1‑151 (MQ=255)ccTGCGCCTCGCCGCCGACGGCGGGGAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCCg < 1:10804521/151‑1 (MQ=255)ccTGCGCCTCGCCGCCGACGGCGGGGAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCCg < 1:2612072/151‑1 (MQ=255) cTGCGCCTCGCCGCCGACGGCGGGGAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCCgg > 2:4171713/1‑151 (MQ=255) tGCGCCTCGCCGCCGACGGCGGGGAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCCggc < 2:8516669/151‑2 (MQ=255) gcCTCGCCGCCGACGGCGGGGAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCCggcggc > 1:1578695/1‑147 (MQ=255) aCGGCGGGGAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCTCCC‑GGCGGCCGAT‑GGCctgct > 1:6926725/1‑151 (MQ=255) aCGGCGGGGAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCctgct > 1:1999421/1‑151 (MQ=255) ggcggGGAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCtgctgc < 1:4709808/151‑1 (MQ=255) gcggGGAGCCCGCGGGCATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCa < 2:2876429/151‑1 (MQ=255) cggGGAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAg < 1:385236/151‑1 (MQ=255) ggggAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAgg > 2:8667980/1‑151 (MQ=255) ggggAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAgg > 2:5852049/1‑151 (MQ=255) ggAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGtc < 1:10181314/151‑2 (MQ=255) ggAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGtc < 1:8147993/151‑2 (MQ=255) ggAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGtc < 1:2260884/151‑2 (MQ=255) ggAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGtc < 1:2578691/151‑2 (MQ=255) ggAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGtc < 1:11006974/151‑2 (MQ=255) ggAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGtc < 2:6594826/151‑2 (MQ=255) gAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGtcg > 2:11331785/1‑149 (MQ=255) gCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGAc > 1:3717609/1‑151 (MQ=255) cccGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGAcc > 1:3129215/1‑151 (MQ=255) cccGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGAcc > 2:4764372/1‑151 (MQ=255) cccGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGAcc < 1:6761168/151‑1 (MQ=255) gcgGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGgc > 2:11080442/1‑151 (MQ=255) gggAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGgctg < 1:7979755/151‑1 (MQ=255) gAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGgctgct < 2:2742627/151‑1 (MQ=255) aaTCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGctgctg < 2:5205495/151‑1 (MQ=255) tCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTgga > 2:1946001/1‑151 (MQ=255) gCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCA‑CCAGGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTggagg < 1:1069520/151‑1 (MQ=255) ccGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTggagga > 2:3585551/1‑151 (MQ=255) cGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGaa > 1:3991578/1‑151 (MQ=255) aaTGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGaaaa > 2:6800305/1‑151 (MQ=255) 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cgcATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCa < 2:2175696/151‑1 (MQ=255) gcATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAg > 2:5645614/1‑151 (MQ=255) gcATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCAGCTGCAg > 1:515198/1‑151 (MQ=255) cATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAgg > 2:10078844/1‑151 (MQ=255) cATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAgg < 2:4473578/151‑1 (MQ=255) tCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGcc > 1:6142818/1‑151 (MQ=255) cTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCg < 1:5481651/151‑1 (MQ=255) tctACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAg < 1:8363020/151‑1 (MQ=255) ctACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCATTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAACgc > 2:1314817/1‑151 (MQ=255) ctACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAgc < 2:3898925/151‑1 (MQ=255) ctACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAgc < 2:4263904/151‑1 (MQ=255) aCCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAgccg > 1:6499191/1‑151 (MQ=255) ccGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGccc < 2:1884635/151‑1 (MQ=255) ccGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGccc > 2:8801425/1‑151 (MQ=255) ccGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGccc < 1:3316383/151‑1 (MQ=255) 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ccAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTg > 1:564360/1‑151 (MQ=255) ccAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTg < 1:5745805/151‑1 (MQ=255) cAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGc > 1:9850335/1‑151 (MQ=255) cAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGc > 2:961173/1‑151 (MQ=255) cgcCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCtgatg < 1:10260970/151‑1 (MQ=255) cgcCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGGTGCtgatg > 1:10019433/1‑151 (MQ=255) gcCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCtgatga > 2:7919828/1‑151 (MQ=255) gcCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCtgatga < 2:10190982/151‑1 (MQ=255) cAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCtgatgatg > 1:4374211/1‑151 (MQ=255) aGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCtgatgatga < 1:5914651/151‑1 (MQ=255) gCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAg < 2:8359590/151‑1 (MQ=255) cTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAgcg < 1:4605006/151‑1 (MQ=255) cTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAgcg < 1:5854122/151‑1 (MQ=255) tGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAgcgg > 1:121855/1‑151 (MQ=255) ggTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCAGGGCTCCGGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCGGGCGTTGCTGATTTTGAgcggc < 2:8919404/151‑1 (MQ=255) cTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGAcc < 1:949946/151‑1 (MQ=255) cTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGAcc > 2:6292740/1‑151 (MQ=255) aaGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAgg > 2:7222180/1‑151 (MQ=255) aaGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAgg < 1:8721543/151‑1 (MQ=255) cACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTa < 1:295323/151‑1 (MQ=255) ctcGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCcg > 1:9614492/1‑151 (MQ=255) ctcGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCcg > 2:10974759/1‑151 (MQ=255) gTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCCTCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCCGACGACGTc < 2:6855145/151‑1 (MQ=255) gCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCCGACGACGTCGcc < 1:8964802/151‑1 (MQ=255) gCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTGGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCCGACGACGTCGcc > 2:1687228/1‑151 (MQ=255) tCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCCGACGACGTCGCCgg < 2:7452064/151‑1 (MQ=255) tCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCCGACGACGTCGCCgg > 2:2361951/1‑151 (MQ=255) aCGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCCGACGACGTCGCCGGGcc < 1:3528594/151‑1 (MQ=255) aCGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCCGACGACGTCGCCGGGcc > 1:7681846/1‑151 (MQ=255) gCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTAc < 1:11171856/128‑1 (MQ=255) 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cGCATCACCC‑GGCGGCCGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCCGACGACGTCGCCGGGCCGATGCTGGTGGccatcca < 1:4275811/151‑1 (MQ=255) gCATCACCC‑GGCGGACGAT‑GGCCTGCTGCAGGTCGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCCGACGACGTCGCCGGGCCGATGCTGGTGGccagccat > 2:534487/1‑151 (MQ=255) | CCTGCGCCTCGCCGCCGACGGCGGGGAGCCCGCGGGAATCGCCGAATGGGCGCCGCATCTGCTCTACCCCGGTCGCCAGCGCGCCAGCCTGGTGCTCAAGCCACGTCTCGACCAGTTGCTCCACGGCTCCTGCCGCAAGCCGCATCACCCGGGCGGCCGATGGGCCTGCTGCAGGTAGACCGGCTGCTGGAGGAAAACCTGCTGCAGGCCGAAAGCCGCCCGGCGTTGCTGATGATGAGCGGCGACCAGGTCTACGCCGACGACGTCGCCGGGCCGATGCTGGTGGCCATCCATGGG > NC_008463/3390322‑3390618 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |