| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_008463 | 3,051,413 | T→C | K369E (AAG→GAG) | PA14_RS13990 ← | SfnB family sulfur acquisition oxidoreductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_008463 | 3,051,413 | 0 | T | C | 99.8% | 2036.3 / NA | 508 | K369E (AAG→GAG) | PA14_RS13990 | SfnB family sulfur acquisition oxidoreductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (264/243); minor base A (0/1); total (264/244) | |||||||||||
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| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 508 total aligned reads displayed.
GGCTCATCGGGCGCTCCTCAGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTTGAGGTTGAACTTGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTTGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCACCGGCCGCGCGGCCACTTCGTC > NC_008463/3051265‑3051560 | tCATCGGGCGCTCCTCAGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGa < 1:7800358/151‑1 (MQ=255) tCGGGCGCTCCTCAGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCg < 2:2194547/151‑1 (MQ=255) cGGGCGCTCCTCAGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGt < 1:5005166/151‑1 (MQ=255) 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cgcCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCa > 1:3276406/1‑151 (MQ=255) gcCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCAc > 2:5781824/1‑151 (MQ=255) gcCAGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCAc > 1:9697529/1‑151 (MQ=255) aGTGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCACCgg > 2:698439/1‑151 (MQ=255) tGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCACCGGcc < 1:10388024/151‑1 (MQ=255) tGCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCACCGGcc < 2:7680854/151‑1 (MQ=255) gCCGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCACCGGCcg < 1:1295384/151‑1 (MQ=255) cGGTCGAGGTTGAACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCACCGGCcgcg > 2:4800491/1‑151 (MQ=255) ggtcgaggttgaACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCACCGGCcgcgc > 1:7643841/1‑151 (MQ=255) cgaggttgaACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCACCGGCCGCGCGGc > 2:8921063/2‑151 (MQ=255) gaggttgaACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCACCGGCCGCGCGGcc < 2:6165690/151‑1 (MQ=255) aggttgaACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCACCGGCCGCGCGGCCa < 1:8106425/151‑1 (MQ=255) ggttgaACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCACCGGCCGCGCGGCCAc < 1:5920065/151‑1 (MQ=255) gttgaACTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCCCCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCACCGGCCGCGCGGCCACt > 2:2517040/1‑151 (MQ=255) aCTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCACCGGCCGCGCGGCCACTtcgtc < 1:6523986/151‑1 (MQ=255) aCTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCACCGGCCGCGCGGCCACTtcgtc < 2:952790/151‑1 (MQ=255) aCTCGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTCGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGAGCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCACCGGCCGCGCGGCCACTtcgtc > 2:10447151/1‑151 (MQ=255) | GGCTCATCGGGCGCTCCTCAGATCCATGAGTGACGCGCCGGACGGGCGCCGTTCAGGTAGTAGTCGCCGACCGCGTGGACCTTCCAGCGTACCGGGTCGTGCAGGGTGTGGGTGCGGGCGTTGCGCCAGTGCCGGTTGAGGTTGAACTTGGCGAGCGTGGCGCGGCTGCCGGCCAGCTTGAAGAGCTTCTCGCTGGCGGCCAGGCTGATCTCGGTGCTCAGCACCTTGGCCTCGGCCACGGCGATCGAGGCGCGTGCCGCCGACTCGGCGTCCACCGGCCGCGCGGCCACTTCGTC > NC_008463/3051265‑3051560 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |