Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_008463 | 2,158,767 | C→T | G109D (GGC→GAC) | dacB ← | D‑alanyl‑D‑alanine carboxypeptidase/D‑alanyl‑D‑alanine‑endopeptidase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_008463 | 2,158,767 | 0 | C | T | 99.7% | 1542.7 / NA | 354 | G109D (GGC→GAC) | dacB | D‑alanyl‑D‑alanine carboxypeptidase/D‑alanyl‑D‑alanine‑endopeptidase |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 354 total aligned reads displayed.
CGGCAAATGAGGGATGTTGAAGTAGCTGCGGTCGAGTACCAGGTCACCTGTGACCTTGGTCACGCCATTGGCGCGCAGGTCACGCATCAACAGCCAGAGCTTCTCCATGTTCAGTTTCGGATCGCCGCCGCCCTTGAGGTAGAGGTTGCCGTTGAGCACTCCGTTCTTGAGCTGGCCGTCGGTGTAGAACTCGGTCTTCCACTGGTAGGTCGGGCCGAGCATTTCCAGGGCGGCATAGGTGGTGAACAGCTTCATGGTCGAGGCCGGGTTCACCGATACGTCGGCGTTGTAGTA > NC_008463/2158619‑2158912 | cGGCAAATGAGGGATGTTGAAGTAGCTGCGGTCGAGTACCAGGTCACCTGTGACCTTGGTCACGCCATTGGCGCGCAGGTCACGCATCAACAGCCAGAGCTTCTCCATGTTCAGTTTCGGATCGCCGCCGCCCTTGAGGTAGAGGTTGTCg < 1:5267560/151‑1 (MQ=255) gCAACTGAGGGATGTTGAAGTAGCTGCGGTCGAGTACCAGGTCACCTGTGACCTTGGTCACGCCATTGGCGCGCAGGTCACGCATCAACAGCCAGAGCTTCTCCATGTTCAGTTTCGGATCGCCGCCGCCCTTGAGGTAGAGGTTGTCGtt < 1:85987/151‑1 (MQ=255) cataTGAGGGATGTTGAAGTAGCTGCGGTCGAGTACCAGGTCACCTGTGACCTTGGTCTCGCCATTGGCGCGCAGGTCACGCATCAACAGCCAGAGCTTCTCCATGTTCAGTTTCGGATCGCCGCCGCCCTTGAGGTAGAGGTTGTCGTTg < 2:7619599/148‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |