Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_008463 | 96,452 | +A | pseudogene (182/723 nt) | tagH ← | type VI secretion system‑associated FHA domain protein TagH |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_008463 | 96,451 | 1 | . | A | 97.4% | 1951.9 / 36.2 | 493 | pseudogene (183/723 nt) | tagH | type VI secretion system‑associated FHA domain protein TagH |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (2/11); new base A (233/246); total (236/257) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.24e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 526 total aligned reads displayed.
CTGCACAGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGTTGTCCAGCGTGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGACAGCGATAGGTGCGTCGGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTC‑A‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTG > NC_008463/96301‑96596 | cTGCACCGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTc > 1:7759943/1‑151 (MQ=255) caccGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTC‑aac < 2:9057114/151‑3 (MQ=255) caccGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTC‑aac < 2:6761362/151‑3 (MQ=255) ccggCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTC‑aactg > 2:4268123/3‑147 (MQ=255) cggCTGGATCCTGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGTTGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTC‑aactgg > 1:9984600/2‑146 (MQ=255) cggCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTC‑aactgg > 1:8385592/2‑146 (MQ=255) cggCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTC‑aactgg > 2:6957119/2‑146 (MQ=255) ggCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTggg > 1:384963/1‑151 (MQ=255) tGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCa > 1:8769204/1‑151 (MQ=255) ggATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCAt > 2:2116538/1‑151 (MQ=255) gATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATg < 1:4826324/151‑1 (MQ=255) tCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGcc < 2:3426397/151‑1 (MQ=255) cATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCg < 1:4619928/151‑1 (MQ=255) cATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCg < 2:3276241/151‑1 (MQ=255) aTGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCgg > 2:7639344/1‑151 (MQ=255) tGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGgc < 1:9279431/151‑1 (MQ=255) tGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGcgccgc > 1:2934186/1‑151 (MQ=255) gcCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCa < 1:1924582/151‑1 (MQ=255) gcCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCa > 1:10287706/1‑151 (MQ=255) cATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAgg < 1:4330613/151‑1 (MQ=255) cATGCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAgg > 1:2320902/1‑151 (MQ=255) gCGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAAc < 1:8877831/151‑1 (MQ=255) cGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACg < 2:8709825/151‑1 (MQ=255) cGGAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACg > 1:5677357/1‑151 (MQ=255) ggAACTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGc > 2:10517313/1‑151 (MQ=255) aaCTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGccg > 1:5110106/1‑150 (MQ=255) aaCTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCt > 1:6695587/1‑151 (MQ=255) aaCTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCt > 1:6788897/1‑151 (MQ=255) aaCTCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCt > 1:2813120/1‑151 (MQ=255) tCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTgca < 1:3635977/151‑1 (MQ=255) tCGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTgca < 2:4019090/151‑1 (MQ=255) cGCCCTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTgcag > 2:7771613/1‑151 (MQ=255) cccTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTgcagca < 2:434433/151‑1 (MQ=255) ccTTCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGcagcag < 2:3656708/151‑1 (MQ=255) ttCAGGCTGGCCCGCGCGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGt > 1:10440665/1‑151 (MQ=255) tggcccgcgcgcgcAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCgccgcc < 2:10246767/145‑1 (MQ=255) ggcccgcgcgcgcAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGccgccg > 1:9415151/6‑151 (MQ=255) gcccgcgcgcgcAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCGACAA‑CTGGGTCATGCCCGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCgccgg > 1:10175884/5‑151 (MQ=255) cccgcgcgcgcAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCgccggc > 2:2592916/4‑151 (MQ=255) cgcgcgcgcAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCgccggccg > 2:5341458/2‑151 (MQ=255) cgcgcgcgcAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGAGAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCgccggccg < 2:1801620/150‑1 (MQ=255) cgcgcgcAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTc < 2:3039946/148‑1 (MQ=255) cgcAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCgcgg < 2:3884635/151‑1 (MQ=255) gcagcaCGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCgcggc < 1:3448710/151‑1 (MQ=255) gcagcaCGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCGTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCgcggc > 2:8387093/1‑151 (MQ=255) agcaCGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCgcggcgg > 1:723588/1‑151 (MQ=255) gcaCGACCACCAGTCCTTCCCCCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCgcggcggc < 1:755656/151‑1 (MQ=255) aCGTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGgcgc > 1:1316526/1‑151 (MQ=255) gTCCACCAGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCGTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCTA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGgcgcgt > 1:182509/1‑149 (MQ=255) caccaGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGcc < 2:5002801/151‑1 (MQ=255) aGTCCTTCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCgggg < 2:1167571/151‑1 (MQ=255) ttCCACCAGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTc < 2:5968851/151‑1 (MQ=255) ccaGGCCGCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGgcgc < 1:1068540/151‑1 (MQ=255) caggccgCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGcgcc > 2:8123651/7‑151 (MQ=255) caggccgCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGcgcc > 2:5215088/7‑151 (MQ=255) caggccgCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGcgcc < 2:8497972/145‑1 (MQ=255) cgCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCAc < 2:2385684/150‑1 (MQ=255) cgCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCAc < 1:6152348/150‑1 (MQ=255) gCGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACg > 2:6459144/1‑151 (MQ=255) cGATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGACGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACgc > 1:6394214/1‑151 (MQ=255) gATAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACgct < 1:4389089/151‑1 (MQ=255) tAGCTGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACgctgg < 2:1337842/151‑1 (MQ=255) agctGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACgctggc > 2:1695977/4‑151 (MQ=255) agctGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACgctggc < 2:7923826/148‑1 (MQ=255) gctGCGGCCGATGGCGTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTC‑ACCTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACgctggct < 2:4877162/149‑1 (MQ=255) ctGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACgctggctg < 2:1435832/150‑1 (MQ=255) tGCGGCCGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGAGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACgctggctgg < 1:7082982/151‑1 (MQ=255) ggccgagggCTTCCATCTGCGCTTCGCCGCCGGCCTGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGACGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGGTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACgctggctggctg < 2:9778937/144‑1 (MQ=255) gccgATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACgctggctggctgg > 1:1003784/4‑150 (MQ=255) gATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggc > 2:567178/1‑151 (MQ=255) gCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtg < 1:2046295/151‑1 (MQ=255) gCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggcggtg > 1:3289069/1‑151 (MQ=255) cTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtgg > 1:2503861/1‑151 (MQ=255) ttCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggc > 2:6283203/1‑151 (MQ=255) ttCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGATGGCtggctgtggctggggc > 1:3197296/1‑151 (MQ=255) tCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggct > 2:5586852/1‑151 (MQ=255) tCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggct < 2:10790935/151‑1 (MQ=255) ccATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctg < 2:6100424/151‑1 (MQ=255) cTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggc < 2:7154214/151‑1 (MQ=255) tGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggct < 1:5243105/151‑1 (MQ=255) cTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtgg > 1:9823992/1‑151 (MQ=255) ttCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggc > 1:10531739/1‑151 (MQ=255) cGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CAGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCTGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctggggctgtggctgtggctttggctg < 2:8916137/151‑1 (MQ=255) ggCGCCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgt > 1:2994060/1‑151 (MQ=255) cgcCGGCCGGGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtgg < 2:7474210/151‑1 (MQ=255) ccggccggGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggct < 1:4137649/151‑1 (MQ=255) ccggccggGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggct < 1:11067191/151‑1 (MQ=255) cggccggGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCAGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctg > 1:10864261/1‑151 (MQ=255) cggccggGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCGTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggcgg > 1:5658394/1‑149 (MQ=255) gccggGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtg < 2:6416371/151‑1 (MQ=255) ccggGTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtgg > 1:5491013/1‑151 (MQ=255) gggTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggct < 2:9465615/151‑1 (MQ=255) gggTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggct < 2:4741594/151‑1 (MQ=255) gggTCGACCTTC‑ACCTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggct < 1:9684297/151‑1 (MQ=255) ggTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctg > 1:6503407/1‑151 (MQ=255) ggTCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctg < 1:1607407/151‑1 (MQ=255) tCGACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtg < 1:5799124/151‑1 (MQ=255) gACCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtgggtgtggctgtggc > 2:3148002/1‑151 (MQ=255) aCCTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggct < 2:2934186/151‑1 (MQ=255) ccTTCAA‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctgtggctg > 2:9602068/1‑151 (MQ=255) | CTGCACAGGCTGGATCATGGTCTGCGCCATGCGGAACTCGCCCTTCAGGTTGTCCAGCGTGCGCAGCACGTCCACCAGTCCTTCCACCAGACAGCGATAGGTGCGTCGGATGGCTTCCATCTGCGCTTCGGCGCCGGCCGGGTCGACCTTC‑A‑CTGGGTCATGCCGGCGCCGCGCAGGAACGCCTGCAGCAGGTCGCCGCCGGCCGTCGCGGCGGCGCTTGCCGGGGGCGTCGGCGCCGCCACGCTGGCTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTGTGGCTG > NC_008463/96301‑96596 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |