| Predicted mutation | ||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_008463 | 3,515,863 | 0 | T | C | 99.6% | 1013.5 / ‑5.6 | 270 | intergenic (+617/+267) | PA14_RS16005/PA14_RS16010 | AAA family ATPase/DUF4354 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (119/150); minor base A (1/0); total (120/150) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.44e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 270 total aligned reads displayed.
GTATACAGCCCCTCCCTAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCTTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGCCCCCAGCCCAGGCAACCAAAA > NC_008463/3515715‑3516010 | aGCCCCTCCCTAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGGCCGCACCCCa > 1:8993001/1‑151 (MQ=255) aGCCCCTCCCTAAGCCATAGCCCTTCCCCATAACTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGAAAAACCACAACCTCCCCCGATGCTAACCGCAATAGCTGCGTCTTGAGTGTCGCGGATCGTTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCACAACCCa > 2:4588413/1‑151 (MQ=255) ccccTCCCTAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCCTCACCCCAAc < 1:10038977/151‑1 (MQ=255) 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t‑GGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCGTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGCCCCCAGCCCAGGCAACCaa > 2:8349060/1‑151 (MQ=255) gCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGCCCCCAGCCCAGGCAACCaaaa < 2:10921971/151‑1 (MQ=255) | GTATACAGCCCCTCCCTAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTT‑GGCCTTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGCCCCCAGCCCAGGCAACCAAAA > NC_008463/3515715‑3516010 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |