Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_008463 | 5,116,457 | G→A | A482V (GCC→GTC) | ftsI ← | peptidoglycan D,D‑transpeptidase FtsI |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_008463 | 5,116,457 | 0 | G | A | 85.3% | 2023.2 / 237.8 | 586 | A482V (GCC→GTC) | ftsI | peptidoglycan D,D‑transpeptidase FtsI |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (38/48); new base A (269/231); total (307/279) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.03e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.72e-01 |
Only 100 of 597 total aligned reads displayed.
AGCCCGCCTTGCTCGGCTCGTCGATCACCACGACCATCGCGATGCGCGGATCGGTGGCCGGGGCGAAACCGGCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGGCGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTGCAGCATGCCCTGCACGGTGGAAGCCACTTCCGGCGAGATCACCTGCACGCCATCCGGCACGCGGTCGACTCGGGTCATGCTCAGCGGCA > NC_008463/5116308‑5116607 | cccGCCTTGCTCGGCTCGTCGATCACCACGACCATCGCGATGCGCGGATCGGTGGCCGGGGCGAAACCGGCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCcgacgg > 1:1181883/1‑151 (MQ=255) gCCTTGCTCGGCTCGTCGATCACCACGACCATCGCGATGCGCGGATCGGTGGCCGGGGCGAAACCGGCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGt > 1:1636322/1‑151 (MQ=255) ccTTGCTCGGCTCGTCGATCACCACGACCATCGCGATGCGCGGATCGGTGGCCGGGGCGAAACCGGCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTg > 1:4189863/1‑151 (MQ=255) 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cgaGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTGCAGCATGCCCTGCACGGTGGAAGCCACTTCCGGCGAGATCACCTGCACGCCATCCGGc > 1:10479597/1‑151 (MQ=255) agaCCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGGCGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTGCAGCATGCCCTGCACGGTGGAAGCCACTTCCGGCGAGATCACCTGCACGCCATCCGGCAc > 2:623527/1‑151 (MQ=255) cTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTGCAGCATGCCCTGCACGGTGGAAGCCACTTCCGGCGAGATCACCTGCACGCCATCCGGCACGCgg > 1:2118954/1‑151 (MQ=255) ttGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGGCGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTGCAGCATGCCCTGCACGGTGGAAGCCACTTCCGGCGAGATCACCTGCACGCCATCCGGCACGCGGt < 2:3611212/151‑1 (MQ=255) tGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTGCAGCATGCCCTGCACGGTGGAAGCCACTTCCGGCGAGATCACCTGCACGCCATCCGGCACGCGGTc < 2:702611/151‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |