| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_008463 | = 1707447 | 547 (1.090) | 16 (0.040) | 15/270 | 35.3 | 3.1% | coding (830/1758 nt) | PA14_RS07935 | DUF1302 domain‑containing protein |
| ? | NC_008463 | 1707841 = | 490 (1.080) | coding (1224/1758 nt) | PA14_RS07935 | DUF1302 domain‑containing protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 540 total aligned reads displayed.
AGCACCTCGGTGGCCGGCGAGCTGAGCTACCGGCCGAACATGCCGCTACAAATCAACAGCACCGACATGTCGATCGCCGCGATCTACCCGACCACCCTGTTCGGTAACCCGATCTACGACAGCGGCTTCGCCACCCCGCGCGCCGGCGAGGTGATCAACGGCTACGTGCGCAAGCCGGTGACCCAGGCACAGGTGACCGTCACCCAGTTCTTCGACCGGGTACTGGCGGCCGACCGCCTGACCGTGGTCGGCGAAGTCGGCTACAACCACCTCAGCGGGGTCGACGGCGACGACCTGCG > NC_008463/1707692‑1707990 | ccTCGGTGGCCGGCGAGCTGAGCTACCGGCCGAACCTGCCGCTACACATCAACAGCACCGACATGTCGATCGCCGCGATCTACCCGACCACCCTGTTCGGTAACCCGATCTACGACAGCGGCTTCGCCACCCCGCGCGCCGGCGAGGTGa < 1:4373262/150‑1 (MQ=255) ccTCGGTGGCCGGCGAGCTGAGCTACCGGCCGAACATGCCGCTACAAATCACCAGCACCGACATGTCGATCGCCGCGATCTACCCGACCACCCTGTTCGGTAACCCGATCTACGACAGCGGCTTCGCCACCCCGCGCGCCGGCGAGGTGa < 1:9954355/150‑1 (MQ=255) cTCGGTGGCCGTCGAGCTGAGCTACCGGCCGAACATGCCGCAACAAATCCACAGCACCGACATGTCGATCGCCGCGATCTACCCGTCCACCCTGTTCGGTAACCCGATCTACGACAGCGGCTTCGCCACCCCGCGCGCCGGCGAGGTGAt < 1:8898557/150‑1 (MQ=255) cTCGGTGGCCGGCGAGCTGAGCTACCGGCCGAACATGCCGCTACAAATCAACAGCACCGACATGTCGATCGCCGCGATCTACCCGACCACCCTGTTCGGTAACCCGATCTACGACAGCGGCTTCGCCACCCCGCGCGCCGGCGAGGTGAt < 1:6363267/150‑1 (MQ=255) tCGGTGGCCGGCGAGCTGAGCTACCGGCCGAACATGCCGCTACAAATCAACAGCACCGACATGTCGATCGCCGCGATCTACCCGACCACCCTGTTCGGTAACCCGATCTACGACAGCGGCTTCGCCACCCCGCGCGCCGGCGAGGTGATc > 2:2868897/1‑150 (MQ=255) cGGTGGCCGGCGAGCTGAGCTACCGGCCGAACCTGCCGCTACAAATCAACAGCACCGACATGTCGATCGCCGCGATCTACCCGACCACCCTGTTCGGTAACCCGATCTACGACAGCGGCTTCGCCACCCCGCGCGCCGGCGAGGTGATCa < 1:7856680/150‑1 (MQ=255) cGGTGGCCGGCGAGCTGAGCTACCGGCCGAACATGCCGCTACAAATCAACAGCACCGACATGTCGATCGCCGCGATCTACCCGACCACCCTGTTCGGTAACCCGATCTACGACAGCGGCTTCGCCACCCCGCGCGCCGGCGAGGTGATCa < 2:1597399/150‑1 (MQ=255) ggTGGACGGCGTGCTGAGCTACCGGCCGAACATGCCGCTACAAATCAACAGCACCGACATGTCGATCGCCGCGATCTACCCGACCACCCTGTTCGGTAACCCGATCTACGACAGCGGCTTCGCCACCCCGCGCGCCGGCGAGGTGATCaa > 2:5176005/1‑150 (MQ=255) gTGGCCGGCGAGCTGAGCTACCGGCCGAACATGCCGCTACAAATCATCAGCACCGACATGTCGATCGCCGCGATCTACCCGACCACCCTGTTCGGTAACCCGATCTACGACAGCGGCTTCGCCACCCCGCGCGCCGGCGAGGTGATCAAc < 2:4435342/150‑1 (MQ=255) ggCCGGCGAGCTGAGCTACCGGCCGAACATGCCGCTACAAATCAACAGCACCGACATGTCGATCGCCGCGATCTACCCGACCACCCTGTTCGGTAACCCGATCTACGACAGCGGCTTCGCCACCCCGCGCGCCGGCGAGGTGATCAACgg > 2:1688541/1‑150 (MQ=255) ggCCGGCGAGCTGAGCTACCGGCCGAACATGCCGCTACAAATCAACAGCACCGACATGTCGATCGCCGCGATCTACCCGACCACCCTGTTCGGTAACCCGATCTACGACAGCGGCTTCGCCACCCCGCGCGCCGGCGAGGTGATCAACgg < 1:5053977/150‑1 (MQ=255) ccGGCGAGCTGAGCTACCGGCCGAACATGCCGCTACAAATCAACAGCACCGACATGTCGATCGCCGCGATCTACCCGACCACCCTGTTCGGTAACCCGATCTACGACAGCGGCTTCGCCACCCCGCGCGCCGGCGAGGTGATCAACGGCt > 2:8435362/1‑150 (MQ=255) gagctgagctACCGGCCGAACATGCCGCTACAAATCAACAGCACCGACATGTCGATCGCCGCGATCTACCCGACCACCCTGTTCGGTAACCCGATCTACGACAGCGGCTTCGCCACCCCGCGCGCCGGCGAGGTGATCAACGGCTACGTg > 2:11001723/1‑150 (MQ=255) agctgagctACCGGCCGAACCTGCCGCGACAAATCAACAGCACCCACATGTCGATCGCCGCGATCTACCCGACCACCCTGTTCGGTAACCCGATCTACGACAGCGGCTTCGCCACCCCGCGCGCCGGCGAGGTGATCAACGGCTACGTgc < 2:7597974/150‑1 (MQ=255) agctgagctACCGGCCGAACATGCCGCTACAAATCCACAGCACCGACATGTCGATCGCCGCGATCTACCCGACCACCCTGTTCGGTAACCCGATCTACGACAGCGGCTTCGCCACCCCGCGCGCCGGCGAGGTGATCAACGGCTACGTgc < 1:5927263/150‑1 (MQ=255) tgagctACCGGCCGAACATGCCGCTACAAATCAACAGCACCGACATGTCGATCGCCGCGATCTACCCGACCACCCTGTTCGGTAACCCGATCTACGACAGCGGCTTCGCCACCCCGCGCGCCGGCGAGGTGATCAACGGCTACGTGCGCa < 1:8305203/150‑1 (MQ=255) gctACCGGCCGAACATGCCGCTACAAATCAACAGCACCGACATGTCGATCGCCGCGATCTACCCGACCACCCTGTTCGGTAACCCGATCTACGACAGCGGCTTCGCCACCCCGCGCGCCGGCGAGGTGATCAACGGCTACGTGCGCAAGc > 1:2550609/1‑150 (MQ=255) gctACCGGCCGAACATGCCGCTACAAAACACCAGCACCGACATGTCGATCGCCGCGATCTACCCGACCACCCTGTTCGGTATCCCGATCTACGACAGCGGCTTCGCCACCCCGCGCGCCGTCGATGTGATCAACGGCTACGTGCGCAAGc < 1:440221/150‑1 (MQ=255) 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cTACAAATCAACAGCACCGACATGTCGATCGCCGCGATCTACCCGACCACCCTGTTCGGTAACCCGATCTACGACAGCGGCTTCGCCACCCCGCGCGCCGGCGAGGTGATCAACGGCTACGTGCGCAAGCCGGTGACCCAGGCACAGGTg < 1:10060065/150‑1 (MQ=255) aCAAATCAACAGCACCGACATGTCGATCGCCGCGATCTACCCGACCACCCTGTTCGGTAACCCGATCTACGACAGCGGCTTCGCCACCCCGCGCGCCGGCGAGGTGATCAACGGCTACGTGCGCAAGCCGGTGACCCAGGCACAGGTGAc > 2:213390/1‑150 (MQ=255) aCAAATCAACAGCACCGACATGTCGATCGCCGCGATCTACCCGACCACCCTGTTCGGTAACCCGATCTACGACAGCGGCTTCGCCACCCCGCGCGCCGGCGAGGTGATCAACGGCTACGTGCGCAAGCCGGTGACCCAGGCACAGGTGAc > 1:2702441/1‑150 (MQ=255) aaaTCAACAGCACCGACATGTCGATCGCCGCGATCTACCCGACCACCCTGTTCGGTAACCCGATCTACGACAGCGGCTTCGCCACCCCGCGCGCCGGCGAGGTGATCAACGGCTACGTGCGCAAGCCGGTGACCCAGGCACAGGTGACCg > 2:3826858/1‑150 (MQ=255) aaTCAACAGCACCGACATGTCGATCGCCGCGATCTACCCGACCACCCTGTTCGGTAACCCGATCTACGACAGCGGCTTCGCCACCCCGCGCGCCGGCGAGGTGATCAACGGCTACGTGCGCAAGCCGGTGACCCAGGCACAGGTGACCGt < 1:10346990/150‑1 (MQ=255) cAACAGCACCGACAGGTCGATCGCCGCGATCTACCCGACCACCCTGTTCGGTAACCCGATCTACGACAGCGGCTTCGCCACCCCGCGCGCCGGCGAGGTGATCAACGGCTACGTGCGCAAGCCGGTGACCCAGGCACAGGTGACCGTCAc < 1:9409439/150‑1 (MQ=255) aCAGCACCGACATGTCGATCGCCGCGATCTACCCGACCACCCTGTTCGGTAACCCGATCTACGACAGCGGCTTCGCCACCCCGCGCGCCGGCGAGGTGATCAACGGCTACGTGCGCAAGCCGGTGACCCAGGCACAGGTGACCGTCAccc > 2:10583748/1‑150 (MQ=255) aGCACCGACATGTCGATCGCCGCGATCTACCCGACCACCCTGTTCGGTAACCCGATCTACGACAGCGGCTTCGCCACCCCGCGCGCCGGCGAGGTGATCAACGGCTACGTGCGCAAGCCGGTGACCCAGGCACAGGTGACCGTCACCCAg < 1:3056333/150‑1 (MQ=255) gCACCGACATGTCGATCGCCGCGATCTACCCGACCACCCTGTTCGGTAACCCGATCTACGACAGCGGCTTCGCCACCCCGCGCGCCGGCGAGGTGATCAACGGCTACGTGCGCAAGCCGGTGACCCAGGCACAGGTGACCGTCACCCAGt > 2:8353665/1‑150 (MQ=255) gCACCGACATGTCGATCGCCGCGATCTACCCGACCACCCTGTTCGGTAACCCGATCTACGACAGCGGCTTCGCCACCCCGCGCGCCGGCGAGGTGATCAACGGCTACGTGCGCAAGCCGGTGACCCAGGCACAGGTGACCGTCACCCAGt > 1:7293320/1‑150 (MQ=255) 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cGGTAACCCGATCTACGACAGCGGCTTCGCCACCCCGCGCGCCGGCGAGGTGATCAACGGCTACGTGCGCAAGCCGGTGACCCAGGCACAGGTGACCGTCACCCAGTTCTTCGACCGGGTACTGGCGGCCGACCGCCTGACCGTGGTCgg > 1:9737841/1‑150 (MQ=255) gTAACCCGATCTACGACAGCGGCTTCGCCACCCCGCGCGCCGGCGAGGTGATCAACGGCTACGTGCGCAAGCCGGTGACCCAGGCACAGGTGACCGTCACCCAGTTCTTCGACCGGGTACTGGCGGCCGACCGCCTGACCGTGGTCGGCg > 2:1040003/1‑150 (MQ=255) tAACCCGATCTACGACAGCGGCTTCGCCACCCCGCGCGCCGGCGAGGTGATCAACGGCTACGTGCGCAAGCCGGTGACCCAGGCACAGGTGACCGTCACCCAGTTCTTCGACCGGGTACTGGCGGCCGACCGCCTGACCGTGGTCGGCGa < 2:10852432/150‑1 (MQ=255) aCCCGATCTACGACAGCGGCTTCGCCACCCCGCGCGCCGGCGAGGTGATCAACGGCTACGTGCGCAAGCCGGTGACCCAGGCACAGGTGACCGTCACCCAGTTCTTCGACCGGGTACTGGCGGCCGACCGCCTGACCGTGGTCGGCGAAg < 1:2029076/150‑1 (MQ=255) cccGATCTACGACAGCGGCTTCGCCACCCCGCGCGCCGGCGAGGTGATCAACGGCTACGTGCGCAAGCCGGTGACCCAGGCACAGGTGACCGTCACCCAGTTCTTCGACCGGGTACTGGCGGCCGACCGCCTGACCGTGGTCGGCGAAGt < 2:6467287/150‑1 (MQ=255) aCGACAGCGGCTTCGCCACCCCGCGCGCCGGCGAGGTGATCAACGGCTACGTGCGCAAGCCGGTGACCCAGGCACAGGTGACCGTCACCCAGTTCTTCGACCGGGTACTGGCGGCCGACCGCCTGACCGTGGTCGGCGAAGTCGGCTACa > 1:7690972/1‑150 (MQ=255) gACCGCGGCTTCGCCACCCCGCGCGCCGGCGAGGTGATCAACGGCTACGTGCGCAAGCCGGTGACCCAGGCACAGGTGACCGTCACCCAGTTCTTCGACCGGGTACTGGCGGCCGACCGCCTGACCGTGGTCGGCGAAGTCGGCTACAac < 2:3447656/150‑1 (MQ=255) aCAGCGGCTTCGCCACCCCGCGCGCCGGCGAGGTGATCAACGGCTACGTGCGCAAGCCGGTGACCCAGGCACAGGTGACCGTCACCCAGTTCTTCGACCGGGTACTGGCGGCCGACCGCCTGACCGTGGTCGGCGAAGTCGGCTACAacc > 2:534838/1‑150 (MQ=255) aCAGCGGCTTCGCCACCCCGCGCGCCGGCGAGGTGATCAACGGCTACGTGCGCAAGCCGGTGACCCAGGCACAGGTGACCGTCACCCAGTTCTTCGACCGGGTACTGGCGGCCGACCGCCTGACCGTGGTCGGCGAAGTCGGCTACAacc > 2:7775387/1‑150 (MQ=255) cAGCGGCTTCGCCACCCCGCGCGCCGGCGAGGTGATCAACGGCTACGTGCGCAAGCCGGTGACCCAGGCACAGGTGACCGTCACCCAGTTCTTCGACCGGGTACTGGCGGCCGACCGCCTGACCGTGGTCGGCGAAGTCGGCTACAacca > 1:924568/1‑150 (MQ=255) ggCTTCGCCACCCCGCGCGCCGGCGAGGTGATCAACGGCTACGTGCGCAAGCCGGTGACCCAGGCACAGGTGACCGTCACCCAGTTCTTCGACCGGGTACTGGCGGCCGACCGCCTGACCGTGGTCGGCGAAGTCGGCTACAACCACCTc < 2:1905741/150‑1 (MQ=255) tCGCCACCCCGCGCGCCGGCGAGGTGATCAACGGCTACGTGCGCAAGCCGGTGACCCAGGCACAGGTGACCGTCACCCAGTTCTTCGACCGGGTACTGGCGGCCGACCGCCTGACCGTGGTCGGCGAAGTCGGCTACAACCACCTCAGCg < 1:692215/150‑1 (MQ=255) cGCCACCCCGCGCGCCGGCGAGGTGATCAACGGCTACGTGCGCAAGCCGGTGACCCAGGCACAGGTGACCGTCACCCAGTTCTTCGACCGGGTACTGGCGGCCGACCGCCTGACCGTGGTCGGCGAAGTCGGCTACAACCACCTCAGCgg > 2:4951426/1‑150 (MQ=255) cGCCACCCCGCGCGCCGGCGAGGTGATCAACGGCTACGTGCGCAAGCCGGTGACCCAGGCACAGGTGACCGTCACCCAGTTCTTCGACCGGGTACTGGCGGCCGACCGCCTGACCGTGGTCGGCGAAGTCGGCTACAACCACCTCAGCgg > 1:4565879/1‑150 (MQ=255) cGCCACCCCGCGCGCCGGCGAGGTGATCAACGGCTACGTGCGCAAGCCGGTGACCCAGGCACAGGTGACCGTCACCCAGTTCTTCGACCGGGTACTGGCGGCCGACCGCCTGACCGTGGTCGGCGAAGTCGGCTACAACCACCTCAGCgg < 1:5212900/150‑1 (MQ=255) gCCACCCCGCGCGCCGGCGAGGTGATCAACGGCTACGTGCGCAAGCCGGTGACCCAGGCACAGGTGACCGTCACCCAGTTCTTCGACCGGGTACTGGCGGCCGACCGCCTGACCGTGGTCGGCGAAGTCGGCTACAACCACCTCAGCggg > 1:5308928/1‑150 (MQ=255) gCCACCCCGCGCGCCGGCGAGGTGATCAACGGCTACGTGCGCAAGCCGGTGACCCAGGCACAGGTGACCGTCACCCAGTTCTTCGACCGGGTACTGGCGGCCGACCGCCTGACCGTGGTCGGCGAAGTCGGCTACAACCACCTCAGCggg < 2:9304805/150‑1 (MQ=255) ccACCCCGCGCGCCGGCGAGGTGATCAACGGCTACGTGCGCAAGCCGGTGACCCAGGCACAGGTGACCGTCACCCAGTTCTTCGACCGGGTACTGGCGGCCGACCGCCTGACCGTGGTCGGCGAAGTCGGCTACAACCACCTCAGCgtgg < 2:9124186/150‑1 (MQ=255) ccACCCCGCGCGCCGGCGAGGTGATCAACGGCTACGTGCGCAAGCCGGTGACCCAGGCACAGGTGACCGTCACCCAGTTCTTCGACCGGGTACTGGCGGCCGACCGCCTGACCGTGGTCGGCGAAGTCGGCTACAACCACCTCAGCgggg < 2:865058/150‑1 (MQ=255) ccACCCCGCGCGCCGGCGAGGTGATCAACGGCTACGTGCGCAAGCCGGTGACCCAGGCACAGGTGACCGTCACCCAGTTCTTCGACCGGGTACTGGCGGCCGACCGCCTGACCGTGGTCGGCGAAGTCGGCTACAACCACCTCAGCgggg < 1:1648732/150‑1 (MQ=255) cACCCCGCGCGCCGGCGAGGTGATCAACGGCTACGTGCGCAAGCCGGTGACCCAGGCACAGGTGACCGTCACCCAGTTCTTCGACCGGGTACTGGCGGCCGACCGCCTGACCGTGGTCGGCGAAGTCGGCTACAACCACCTCAGCGGGGt < 2:2557035/150‑1 (MQ=255) gCGAGGTGATCAACGGCTACGTGCGCAAGCCGGTGACCCAGGCACAGGTGACCGTCACCCAGTTCTTCGACCGGGTACTGGCGGCCGACCGCCTGACCGTGGTCGGCGAAGTCGGCTACAACCACCTCAGCGGGGTCGACGGCGACGAcc < 1:4720309/150‑1 (MQ=255) gCGAGGTGATCAACGGCTACGTGCGCAAGCCGGTGACCCAGGCACAGGTGACCGTCACCCAGTTCTTCGACCGGGTACTGGCGGCCGACCGCCTGACCGTGGTCGGCGAAGTCGGCTACAACCACCTCAGCGGGGTCGACGGCGACGAcc < 1:7416294/150‑1 (MQ=255) gAGGTGATCAACGGCTACGTGCGCAAGCCGGTGACCCAGGCACAGGTGACCGTCACCCAGTTCTTCGACCGGGTACTGGCGGCCGACCGCCTGACCGTGGTCGGCGAAGTCGGCTACAACCACCTCAGCGGGGTCGACGGCGACGACCTg > 2:7344803/1‑150 (MQ=255) gAGGTGATCAACGGCTACGTGCGCAAGCCGGTGACCCAGGCACAGGTGACCGTCACCCAGTTCTTCGACCGGGTACTGGCGGCCGACCGCCTGACCGTGGTCGGCGAAGTCGGCTACAACCACCTCAGCGGGGTCGACGGCGACGACCTg > 2:814282/1‑150 (MQ=255) aGGTGATCAACGGCTACGTGCGCAAGCCGGTGACCCAGGCACAGGTGACCGTCACCCAGTTCTTCGACCGGGTACTGGCGGCCGACCGCCTGACCGTGGTCGGCGAAGTCGGCTACAACCACCTCAGCGGGGTCGACGGCGACGACCTgc > 1:3294534/1‑150 (MQ=255) ggTGATCAACGGCTACGTGCGCAAGCCGGTGACCCAGGCACAGGTGACCGTCACCCAGTTCTTCGACCGGGTACTGGCGGCCGACCGCCTGACCGTGGTCGGCGAAGTCGGCTACAACCACCTCAGCGGGGTCGACGGCGACGACCTgcg > 2:9558730/1‑150 (MQ=255) | AGCACCTCGGTGGCCGGCGAGCTGAGCTACCGGCCGAACATGCCGCTACAAATCAACAGCACCGACATGTCGATCGCCGCGATCTACCCGACCACCCTGTTCGGTAACCCGATCTACGACAGCGGCTTCGCCACCCCGCGCGCCGGCGAGGTGATCAACGGCTACGTGCGCAAGCCGGTGACCCAGGCACAGGTGACCGTCACCCAGTTCTTCGACCGGGTACTGGCGGCCGACCGCCTGACCGTGGTCGGCGAAGTCGGCTACAACCACCTCAGCGGGGTCGACGGCGACGACCTGCG > NC_008463/1707692‑1707990 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |